Oryzias latipes (Japanese medaka): 101171596
Help
Entry
101171596 CDS
T02443
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1
KO
K02599
Notch 1
Organism
ola
Oryzias latipes (Japanese medaka)
Pathway
ola04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ola00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
101171596
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
Ank
EGF_2
Notch
NOD
NODP
Ank_4
Ank_5
Ank_3
EGF_3
cEGF
Gurken_M
JAG1-like_EGF2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101171596
NCBI-ProteinID:
XP_020563234
LinkDB
All DBs
Position
12:8849301..8871959
Genome browser
AA seq
2476 aa
AA seq
DB search
MHRFLAKLCLLIPAIVLSQGLKCSLPTESCLNGGRCVATSSGNGECRCPSDYIGNRCQYP
SPCSPSPCRNGGRCRAVSRGNTFDFLCECPLGFTDRLCLTPTNHACMSAPCRNGGTCELI
ALTDFRCQCPPGWTGKSCQTPNPCASNPCANGGQCSSLDSTYRCTCPPNFHGQTCKLDVN
ECAQTPYLCLNGGICVNEVGSYHCRCPQEYTGQHCQTPYVPCSPSPCQNGGTCVQKGDTT
YDCSCLPGFMGQHCEHNIDDCPGHNCQNGGVCADGVNTYNCQCPPHYTGQYCTENVDECE
MMPNVCQNGGTCHDTHGSYHCVCVNGWTGDDCSKNIDDCAAAACFHGATCHDRVASFFCE
CPHGRTGLLCHLDDACISNPCQKGSNCDTNPVNGKAICTCPPGYTGSACNLDIDECALGA
NPCEHGGRCLNTLGSFQCKCLQGYEGPRCEMDVNECMSNPCQNDATCLDQIGGFHCICMP
GYEGVFCHIDTDECASQPCLNNGKCIDKINSFYCECPKGFSGNLCQVDIDECASTPCRNG
AKCTDGPNKYNCECAEGYTGQHCEIDINECYSDPCHYGTCKDGLASFTCYCRPGYTGRLC
ETNINECLSQPCKNGGTCQDRENSYICSCPKGTAGFNCEINLDDCKSQPCDYGRCIDKIN
GYECACRPGYTGTMCNINIDDCAINPCHNGGTCIDGINSFTCLCPEGYNDATCLSQVDEC
SSNPCIHGLCQDLINGYKCTCDSGWSGQNCDINKNECDSNPCMNGGTCKDMTSGYHCTCR
VGFTGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGENCETLLAPCSSRPCKN
GGVCKEAEDYQSFSCICPEGWQGQTCEIDINECVKSPCWNGAFCLNTMGGYQCKCQPGFT
GQKCETDIDDCKPNPCSNGGLCHDGISSFTCTCLPGFRGGRCEQDINECESNPCKNGANC
TDCVNSYTCTCPTGFSGINCEINTNDCTDSSCFNGGTCVDGINSFTCLCLTGFTGSYCQF
DINECDSKPCLNGGTCLDGYGTYKCTCPHGYTGVNCQHLVRWCDSSPCKNGGTCWQQGAS
YTCQCQTGWTGLYCDIPSVSCEVAAKQQGVEVNQLCRNSGQCLDAGSTHHCRCQAGYTGS
YCQEQVDECSPNPCQNGATCTDYLGGYSCECVPGYHGVNCSKEINECQSQPCQNGGTCID
LINTYKCSCPRGTQGVHCEMNLDDCNPFNDPFTNEPKCFNNGRCVDRIGGYQCMCPPGYV
GERCEGDVNECLSDPCDPRGSYNCIQLMNSYRCECRTGYTGQRCDKVFDGCKGRPCRNGG
TCAVASNTPHGFICKCPPGFTGSSCEYDSHSCGSLNCKNGGTCVSGHLGPRCLCPSAFTG
PECETPTDSLCISNPCYNGGTCQTTPNAPFFKCSCPSNFNGLLCHILDYSFVGGFGRDIT
PPPEVEVSCGIPQCDEWAGNHICDSLCNNHACGWDGGDCSLNFDDPWKNCSAALQCWRYF
NDGKCDGQCNSPGCLYDGFDCQGQEGQCNPLYDQYCKDHYADGHCDQGCNNAECEWDGLD
CANNMPEKLADGHLVLVVHIPPEVLKNRSSSFLRELSSVLHTNVVFRRDAKGEPMIFPYY
GNEQDLVKHSMLKRSADGWPEWASVPANVLDQMKESVSSVVTSRRRRELDPVQVKGSIVY
LEIDNRQCYQQSSECFQSATDVAAFLGALASSGHLKVPYIEAVTSVRPPGSTSELYPMYI
IFLGLAALGFICLGVLVSRKRRREHGQLWFPEGFKVSEPSKKKRREPLGEDSVGLKPMKN
SDINLMDDNQNEWGDDDPDCRRYRLEEQAMLDLCDHTDQRKWTQQHLDAADLRIASIAPT
PPQGEIENDCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEEEDPSVEIISDFIYQGANL
HNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLESSADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQIL
IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMAEELINSHADPNATDDSGKSALHWAAAVNN
VEAALVLLKNGANKDMQDNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANREITDHLDQLPRDI
AQERMHHDIVRLLDEYNVVRSPGLHSAPVNTSTLSPPLCSPNDYLSNLKPGQSVKKVRKI
SSSGKGGKDGCKDKLKKKKSLDGKSNLLDTSAVLSPVESLESPHAYLSDVASPPMPSPFQ
QSPPMSLNQLQGNGDSHIGQVSMGKDLGCISFDPTPPRLSHLPVPTSNTQGTTSISNRGG
QCDWVSRMHHDVSQQGSYTQAATHNMLGPLHGVSTATLSQIMGYQNVQTSHLSSPSHMLQ
QVHSRQLQHQNSNSTGAGQTLSQNFPTIELNGSELPQNSSSGRSVPIHTVMPQETQMLGT
QFLTPPSQHSYSAPMDNTPSHQLQVPDHPFLTPSPGSPDQWSSSSPHSNLSDWSEGISSP
PTSIHSQMNLIPDQFK
NT seq
7431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatcgtttcttagcgaaactgtgtcttctcattccggcgatcgtcctctcacaaggt
ctaaaatgctccctacccactgaatcatgcctaaatggagggagatgtgtggccacctct
agtggcaatggagaatgcaggtgtcccagtgactatattggcaaccggtgccagtatccc
agcccatgcagcccttcaccctgccgcaatggtggaagatgccgtgcagtttcccgtggc
aacacctttgactttctctgtgagtgtcccctgggttttaccgacaggctgtgcctcacc
cccaccaaccacgcctgcatgagcgccccgtgtcgcaatggaggaacgtgtgaacttatt
gctctcactgatttccgatgccaatgtccaccaggatggacaggaaaatcttgccaaact
cccaacccatgtgcttccaatccatgtgcaaacggtggacaatgttcatctttagattcc
acctacaggtgcacatgccctcccaacttccatggccaaacttgcaagctggatgtgaat
gagtgtgcccagaccccgtatctctgtctaaatggtggcatttgtgtaaatgaggttggc
tcttaccactgccgctgcccacaagagtatactggccagcactgtcaaaccccttacgtg
ccctgcagcccctcaccatgtcagaatggaggcacttgtgtccagaaaggagataccacc
tacgactgcagctgccttccaggcttcatgggtcagcactgtgagcacaacattgatgat
tgtccaggacacaactgtcagaatggtggggtatgtgcagatggagtcaacacctacaac
tgccagtgtccgcctcattacacaggacaatactgcacagaaaatgtagacgagtgtgag
atgatgcccaatgtatgtcaaaatggagggacatgccacgacacccacggcagctaccac
tgcgtctgtgtcaacgggtggacaggtgacgattgcagcaaaaacattgacgactgcgcc
gctgctgcttgctttcatggtgctacgtgccatgatcgtgtagcctcattcttttgcgag
tgtcctcatggccgtactgggctgctgtgccatttggatgatgcctgcatcagcaacccc
tgccaaaaaggttcaaactgtgacacaaatcccgtgaatggaaaggcgatttgtacatgt
ccaccaggttacacaggatctgcctgcaacttggatattgacgagtgtgcccttggtgcc
aacccttgtgagcatggtggtcgctgcctcaacacattaggctctttccagtgcaagtgt
ctgcaagggtatgaaggacctcgctgtgagatggatgtgaatgaatgcatgtccaacccc
tgccaaaatgacgctacctgtcttgaccaaattggaggattccactgcatctgtatgcca
ggatacgaaggtgtgttttgccatattgacactgacgagtgcgccagtcagccttgtctc
aacaatggcaaatgcatcgacaagatcaactctttctactgcgagtgccccaaagggttt
tcaggaaacctgtgtcaggtggatattgatgagtgtgccagtacaccctgcaggaatggc
gccaaatgtacagacggtcccaacaagtataattgtgaatgtgctgaaggttacacaggc
caacactgtgagattgacatcaacgagtgctactctgatccttgccactatggcacttgt
aaagatggtcttgcgtctttcacctgctactgccgccctggctacactggccgcttgtgc
gaaaccaacatcaatgaatgtctcagccagccttgtaagaacggtggcacctgccaggac
agggagaactcctacatctgctcctgccctaaagggaccgcaggtttcaattgtgagatc
aacctggacgattgcaaaagccagccctgcgactatgggaggtgtatcgacaaaatcaat
ggctatgagtgtgcatgcaggccaggttacacaggcacaatgtgcaacattaacatcgat
gactgtgccatcaacccatgccacaacgggggcacatgcattgatggcatcaacagcttc
acttgcctctgtccagagggctacaacgatgccacctgtttgtcgcaggttgacgaatgc
agcagcaacccttgtatccacggcctttgtcaagacctcattaatggctataaatgtacc
tgtgactccggatggagcggtcaaaactgtgatatcaacaagaacgaatgcgattccaac
ccctgcatgaacgggggcacgtgcaaggacatgaccagtggataccactgcacatgcaga
gtcggcttcactggacccaactgccaaactaacatcaatgagtgtgcctccaacccctgc
ctcaaccaggggacttgcattgacgatgtggccggatacaagtgcaactgtttgctgcct
tacaccggtgaaaactgcgaaaccctgctggccccctgcagttcccgtccctgtaaaaat
ggtggtgtgtgcaaggaggctgaagactaccagagcttttcttgcatctgccctgaagga
tggcaaggccaaacatgtgaaattgacatcaacgaatgtgtgaaaagtccgtgctggaac
ggtgctttttgcctcaacaccatggggggctaccagtgcaagtgtcaaccaggtttcaca
ggccaaaaatgtgaaacagacatcgatgactgcaaaccaaacccctgcagtaatggaggt
ctgtgccacgatgggatcagcagtttcacatgcacatgtctgcctggctttcgtggcggc
aggtgtgagcaggacataaatgagtgtgaaagtaacccctgtaagaatggggccaactgc
actgactgtgtcaacagctacacctgcacctgccctacagggtttagtggcatcaactgt
gagatcaacaccaacgattgcactgacagctcgtgcttcaacggtggtacttgtgtggat
ggaatcaattccttcacttgcctgtgtctcactggattcactggaagctattgccaattt
gatatcaatgagtgtgattccaagccttgcctcaatggaggaacttgtcttgatggttat
gggacgtataagtgcacctgtcctcatggctacacaggagtaaactgtcagcatcttgtc
cgatggtgtgactcctccccctgtaagaacggaggaacatgctggcagcagggagcttct
tacacatgtcaatgccagactgggtggactggcctgtattgtgacatcccgagtgtttct
tgtgaggttgctgccaaacagcaaggtgtggaggtgaaccagctgtgcaggaattcaggc
cagtgtttggatgctggaagcacacatcactgccgttgccaggctggttacactgggagt
tattgccaagaacaggtggatgagtgctcacccaacccttgccagaatggagcaacctgt
accgactatcttggaggttacagttgtgagtgtgtccctggttaccatggtgttaactgc
tccaaagagatcaatgaatgccagtctcaaccctgccagaatggtggtacctgcattgat
cttatcaacacctacaaatgctcttgtcctagaggaacacagggtgtccattgtgagatg
aacttggatgattgcaaccccttcaacgatcctttcacaaatgagcccaagtgctttaac
aatggcaggtgtgtggaccgcattggaggctaccagtgcatgtgccctccaggctatgtt
ggtgaacggtgcgaaggcgatgtaaatgagtgtctgtcggatccctgcgaccccagaggg
tcctacaactgcattcagctaatgaacagttaccgctgtgaatgccgtactggctataca
ggacagcgttgtgacaaggttttcgatggctgtaaaggacgaccctgcagaaatggagga
acttgtgcagttgccagcaacacaccccatggtttcatctgcaaatgcccacctggcttt
actggttcctcttgcgaatacgactcccactcttgtggaagtctgaactgcaagaacggt
ggtacatgtgtgtcgggtcacctaggtccccgctgcctgtgtccttcagcttttactggg
ccagagtgtgaaacccccacagacagcctttgcatttccaatccctgttacaatggcggt
acgtgccagaccacccctaacgctcccttcttcaagtgcagctgccccagcaacttcaac
ggccttctttgccacatactggattactcctttgtcggggggtttggccgagatatcacc
ccacctccagaggtggaggtaagctgtgggattccacagtgtgatgagtgggctggcaat
cacatctgcgactcactgtgcaacaaccatgcctgtggctgggatggaggagactgctct
cttaattttgatgatccttggaagaactgctctgctgctctgcagtgctggcgttacttc
aatgatgggaagtgtgacggccagtgtaacagcccaggatgcctctatgatggctttgac
tgccaaggacaagaagggcagtgcaatccattatatgatcagtattgcaaggaccattac
gctgacggtcactgcgaccaaggctgtaacaacgcagaatgtgaatgggatggcctggat
tgcgccaacaacatgccagagaagctggcagatggacatttagttctggtggtccacatt
cccccagaagtgcttaaaaaccgctcatcatcattcctcagagagctcagcagtgtcctc
cacaccaacgtggtgtttcgccgcgatgccaaaggagagcccatgattttcccttactac
gggaatgaacaggacctggtcaaacacagcatgcttaaacgctctgcagacggctggccg
gagtgggcctcggtacccgccaatgtcttggatcagatgaaggagagtgtctcctctgtg
gttacttcaaggagacgcagagaactggatccagtacaagtcaaagggtctattgtgtac
cttgagattgacaaccggcagtgttaccagcagtcctctgaatgctttcagagcgccaca
gacgttgctgcattccttggagcattggccagcagtggacatctcaaagttccttatatt
gaagctgtcacaagtgtgaggccacctggatccacttctgagctctacccaatgtacata
atcttcctgggcttggcagctcttggttttatatgcttaggtgttctggtgtcccgcaaa
cggcggcgagagcatggccagctctggtttccagaaggatttaaagtatctgaacctagc
aaaaagaaacgcagagagccattgggggaagactctgttggactgaaacctatgaaaaac
tctgacatcaatcttatggatgacaatcaaaatgaatggggtgatgatgatccagactgt
aggcgctataggttggaggagcaggccatgttagatttatgtgatcacaccgatcaaagg
aaatggacccaacaacacctggatgccgctgacctgcggattgcatccattgctcctacg
cctcctcagggagaaatagagaatgactgcatggatgtcaacgtccggggaccagatggg
ttcacccctttgatgattgcctcctgcagtggtggaggattggagaccggtaacagtgag
gaagaggaggatccttcagtagaaataatatcagacttcatctatcagggagccaacctc
cacaaccagactgacagaacgggggagactgccctccacctggcagcccgttatgctcga
tcagatgctgccaaacgcctcttggaatcaagtgctgatgccaacgttcaagacaacatg
ggtcgcactccccttcatgctgctgtagctgctgatgcacaaggagtattccagattttg
atcagaaatcgggccaccgatttagacgcccgcatgcatgacggaacaacacctttaata
cttgctgctcgcttggcggtggagggaatggccgaggagctcatcaactctcacgctgat
cccaatgccacagatgactctggcaaatctgctcttcactgggctgctgctgtaaacaat
gtggaggctgccttggtcttgttgaagaatggtgccaacaaggatatgcaagataacaag
gaggagacaccactgttccttgcagcccgtgaaggcagttacgagacagcaaaggtactt
ctggatcactttgccaaccgtgaaattacagaccacctcgaccagctgccccgggatatc
gcccaggaacgcatgcaccatgacattgttcgtcttctggatgagtacaatgtggtacga
agtccaggtctccacagtgcccccgtaaacacctccaccctttcgcccccgctctgctct
cccaatgactatctcagcaacctgaagccaggccagtctgtgaaaaaggttcgtaaaatt
agctccagtggaaaaggaggaaaagatgggtgcaaagacaagctgaaaaagaagaagtct
ttggatgggaagagtaacttgttggatacatcagcagttctctcccctgttgaatccctt
gagtctccccatgcctatctgtcagacgtggcttctcctcccatgccttcccccttccag
cagtccccacctatgtccttgaatcaactgcaaggcaacggggactcccacataggccag
gtgagcatgggcaaagatttgggttgcatttcttttgacccaacaccacctcgcctatcc
cacctgcctgtgcccacctccaatactcagggcacaacatccatcagcaaccgaggaggt
cagtgcgactgggtctccaggatgcatcatgatgtaagtcagcaaggaagctacacccaa
gcagcgacacacaacatgctgggtcccctgcatggagttagcactgccactttgtctcag
ataatgggctaccagaatgtgcagaccagtcacctgagttcaccctcacacatgctgcag
caggttcactcacggcagctgcagcaccagaactcaaactccactggagctggtcaaacc
ctcagccagaactttcccaccattgaactgaacggctccgaactgccgcaaaacagcagc
tcaggccggtcagtgccaatccacaccgtgatgccccaggagacgcagatgttgggaact
cagtttcttacccctccttcccagcacagctattcagccccaatggacaacactcccagc
caccagctccaggtccccgaccacccgtttctcaccccttcccctgggtcccccgaccag
tggtccagctcgtctccacattccaacctgtccgattggtcagagggcatctccagccca
cccacaagtatccactcacagatgaatctcatcccagaccagtttaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
