Osmia lignaria (orchard mason bee): 117606083
Help
Entry
117606083 CDS
T09775
Name
(RefSeq) retinal-specific phospholipid-transporting ATPase ABCA4-like
KO
K05643
ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3
Organism
olg
Osmia lignaria (orchard mason bee)
Pathway
olg02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
olg00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
117606083
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
olg02000
]
117606083
Transporters [BR:
olg02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCA (ABC1) subfamily
ABCA1, 2, 3, 4, 7, 12, 13 subgroups
117606083
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
AAA_21
ABC2_membrane_3
SMC_N
R1_ABCA1
DUF4162
AAA_29
AAA_23
AAA_15
RsgA_GTPase
MukB
AAA_30
EutB
RGS-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117606083
NCBI-ProteinID:
XP_034183985
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1673 aa
AA seq
DB search
MANNMRTFALLLYKNLLIRCRHWKTTIFIQCLIPIALFVLIQAVRDFSVQPPRVINESTY
YPIYTKDELTLINRDLTFLYFVPQNSYTKNIVHNTRMCLGLPQESVAGFSSEDDMINAYT
ILHAEAPAVEVLALVFEQYNTTAIKYKIRHPIDIPKTLFQNTFDQSTIYFNLIPFVQLQM
CVDDSFINHTSHSMIERMVSIQRMPYPPYVKIDESDILLRVGICMFAVIAFLIPLCIETN
YATKEKYIGVNVLMAMNGVKHYQNLLSWLITGILFSIFYIVPIIILFKNTFSGNVDPYLY
HSNTFIFWLIFTVHIAHLISFGMHVAAYFSKPRFVITTLSVIYTASFSLHGNLVKVGVLS
IIPYLGILFPNIFLYRFLEEVNAYETRLIGIQWSNMFIAGDTQYNIGGCVGFILLFSLLG
TLLHFSLALYINAIFPGKYGVRKKPFYFLKYLRKNKVYLDEDMEDFDYDKEDNENFEPVT
KGALTPGIQIRNLKKTYNTSCFRKSAVHALKGISVDLYKGQITALLGHNGAGKTTLMSIL
TGVISPTEGKVLINGRNIAKHLEVIRNDLGLCPQENMVFPDLSVFEQLEFFGLLKGINKT
RKEIRQNINMLLDKLKLNEKRNVLPSTLSGGQKRRLCLGMALVGDASIIILDEPTSGMDP
ETRRDIWDVILKIRGKKTILISTHNMEEADILGDRVAIVHGGRLKCYGTTMFLKKQYGYG
HLEVTLSTKSWCNSEKVINKFDARTQQINVDSEKIVLSVPNTDTLPQILDKIENQKKKLG
VTGISVSLITLEEVFLKVIKKEEKEKHLNEIFYSPLQKVQGWSLCMQTILALYHKKLTYT
KKNITHTLLTLFLPILSVVLMALSYNTPRDSTDVFPLELDMYRHPKALYSSKAEKCGMHY
KDSVDYFGGFAEEVQQNTSVSQALLDHALQDIASYRNNYIVSAEFNVSDDNAAILANGFY
SGIAVHSVPLTVNLLSNALIKRFAGDEYSIRVSSQQLPNPLSATILMPEAESLSRVLVFC
SFFFPTVALFVIHPFQEMETRVKQLQRMTGVTSFSYWGTMFSFDFLILTMSIVIIMLGFY
IMDIILDIRLYYRTETLIMILLLVLFGINSLFITYIFSFVNKSRNTVVTILSLVPVGFVL
FQYLLHEVVHSFDRLRILHAIQKRIFRLIPHVSLFHGQLSFFNVAVQNARCRRLPKRLQD
VVCLGFKDVCCDLDCVDGVCRNQLPYFSNDNSDMSLTECVVYLSVTPLIYFAVLIILEER
LIDKLYAKMFDQKLKNACVIKDEEVEKEKYAVALEIKKLTNSNAVFPEGVGRTISGKEKG
TTTSTVKLNALESPETNDDSLFLVYELSKYYGKLMAVQEINFRVKQRECFGLLGVNGAGK
STTFRMLTGEEMPNSGIMYLGNSEIRTDRKNYLAQMGYCPQTDALLSSLNSFDHLRLFAL
LRGIPSSKVDLEVNKWINRLNLNACMHQPSGTYSGGNKRRLNIAMALIGNPTLVLLDEPT
TGVDPAARRSLWNILQSCQAMGQAIILTSHSMEECEALCNRLVIMVKGQLVCIGASQELK
QRFGAGYDIHVKLNPNRSDDDVSNIKSIMESSLTCEIRDENLGLIAYHVNDSGTTWEKMY
STMNNLTERYSCIEDYAVLSATLEQLFIQFARGTELRRCEEPLVDYSTQAAVV
NT seq
5022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaataacatgaggacttttgctttacttttatataaaaatttattaatacgatgc
agacattggaagacaacaatatttatacaatgtttgatacctattgctttgtttgtattg
atacaagctgtgagagattttagtgtacaaccacctagagtgattaatgaaagtacatat
tatcctatatacaccaaagatgaattgactttgataaacagggatttgacatttttatac
tttgtgccacagaattcatatacaaagaatattgtgcataacaccagaatgtgtttggga
ttaccacaagaaagtgtagctggattttcatctgaagatgatatgattaatgcttataca
attctacatgctgaagctcctgctgttgaagtgttagctcttgtgtttgaacaatacaat
acaactgccataaaatataaaatcaggcatcccatagatattccaaaaacattgttccaa
aacacatttgatcagtctacaatatattttaatcttataccatttgtacaattgcaaatg
tgtgttgatgattcttttataaatcacacatcacattccatgattgaaagaatggtgtcc
atacaaagaatgccatatcctccatatgttaaaatagatgaatcagatatattactaaga
gtgggaatatgtatgtttgcagtcattgcatttttaattccactatgtatagaaacaaat
tatgcaacaaaagaaaaatatattggagtaaatgttttaatggcaatgaatggagtaaaa
cattaccaaaatctactaagttggttaattactggcatattgttcagtattttttatata
gttccaataataatattatttaaaaatactttctctggaaatgtagatccatatttgtat
catagcaacacttttatattttggctaatatttacagtacatattgcccatttaatatca
tttggtatgcatgttgctgcatatttttcaaaaccgcgtttcgtaataactacactgtca
gttatttacactgcttctttctcacttcatggaaatttagtaaaagtaggagtattatcg
ataataccgtatttgggaatattgtttccaaatatatttctgtatagattcctggaagaa
gtcaatgcatatgaaactcgattaatcggtattcagtggtcaaatatgtttattgcgggg
gatacacaatataatattggtggatgtgttggatttatattacttttttctctgttgggt
actttgttacacttttccttagcattatacatcaatgctatattcccaggaaaatacgga
gtacgtaaaaagccattttattttctaaagtatttgaggaaaaataaagtatatcttgat
gaggatatggaagattttgattatgataaagaagataatgagaactttgaacctgtaaca
aaaggtgcacttactcctggaattcagatccgtaatcttaagaaaacgtataatactagc
tgttttcgaaaatcggcagtccatgcattgaaaggtatttcagtcgatttatataaagga
caaataacagctttattaggacataatggagctggaaaaactacacttatgtccatttta
acaggtgtaataagtcctactgaaggaaaggttcttataaatggcagaaatattgcaaaa
catttagaagttattagaaatgatttgggattatgtccacaagaaaatatggtttttcct
gatttgagtgtgttcgaacaattggaatttttcggtctattgaaaggtataaataaaacg
aggaaagaaattcgacaaaatattaatatgctccttgataaattaaaattgaatgaaaaa
aggaacgttcttccaagtacattatctggagggcaaaagagaagactgtgtcttgggatg
gctctcgtcggggatgctagtattataattttggatgaaccaacatcaggaatggatcct
gaaactagaagagatatctgggatgttatattaaaaataagagggaagaaaacaattttg
attagtacacacaacatggaagaagctgacatacttggggacagagttgctattgtacac
ggaggtcgattaaaatgttatggtacaaccatgtttttaaaaaagcaatatggctatggt
catttagaagtcactttatcaactaagtcatggtgtaattcagaaaaagttataaataag
ttcgatgcaagaacacaacaaataaatgtggacagtgaaaagattgttttaagtgtacca
aacactgacacattaccacaaattctagataaaatcgaaaatcagaaaaagaaattgggc
gttactggaatcagcgtttcacttattactttagaagaagtatttttaaaagtgattaag
aaagaagagaaagaaaaacatttaaatgaaatattctattccccattgcaaaaagtacaa
ggatggtccttatgtatgcaaacaattttggcactgtatcataaaaaattaacttacact
aaaaaaaatataacccatacattgttgacactgtttttaccaattttatcggtcgtatta
atggctttgagctataatacgcctcgcgattcgacggatgtatttccgcttgaacttgat
atgtatagacatcctaaagctctatattcgtctaaagctgaaaaatgtggtatgcattat
aaagattcagtagattattttggtgggtttgcagaagaagtgcagcaaaatacaagtgtt
tcacaagctttattggatcatgctcttcaagatattgcctcatatcgtaacaattatatt
gtttccgcggaatttaatgtttccgacgataatgccgctatactcgctaatggtttttat
tctggtattgcggttcacagtgtaccattaactgtgaatctgttatcgaacgcgttaatc
aaacgttttgctggtgacgaatactctatccgtgtttcaagccagcagttaccaaaccct
ttatctgcaacaatattaatgccagaagcggaatcattgtcacgagtattggtgttttgt
agcttcttcttccctactgtagcactttttgttatccatccttttcaagaaatggaaact
agagtaaagcagcttcaaagaatgacgggagtcacgtctttctcatactggggcacgatg
ttttctttcgattttttaattctcacaatgtctatagttattatcatgctaggcttttat
atcatggatattatcttagatattcgcctgtattaccgcacagaaacactgattatgata
ctattattagtattatttgggattaattctttatttataacatacatctttagttttgtc
aataaatcaagaaatactgtggtaaccatattgagtcttgtacctgttggatttgttttg
tttcaatatcttctgcacgaagtggtacatagttttgaccgtttgaggattctacatgca
atacagaaacggatattccgtctgatacctcatgtaagcctatttcatggtcaattatct
ttcttcaacgtagctgtacaaaatgcgagatgccgtcgattaccaaaacgattgcaggat
gtagtttgcctgggttttaaggatgtttgttgtgatttggattgcgtagatggagtctgt
aggaaccagcttccgtatttttctaacgataacagtgatatgagcctgacagaatgcgtt
gtatatttgtcggtcacgccattaatatattttgctgtacttattattttagaagaacga
ttgatcgacaaattatacgctaaaatgttcgatcaaaaattaaaaaatgcctgtgttata
aaagatgaagaggtagaaaaggagaaatatgcagtagcattagaaataaagaagctaacg
aatagtaatgcagtatttccggaaggtgtaggaaggacaatcagtgggaaagaaaaagga
acgacaacgtctaccgtcaaattgaatgctctcgaaagtccagaaactaatgacgatagt
ctgttcttggtttatgaattaagcaaatattatggaaaattaatggcagtacaagaaatc
aattttcgagtgaagcaacgagaatgttttggattacttggcgttaatggtgccggaaag
agcaccacgtttagaatgttgaccggcgaagaaatgccaaacagtggtatcatgtactta
ggaaattcagaaatacgtacagataggaagaattaccttgctcaaatgggctattgtcca
caaactgacgcactactcagttctttgaattcattcgatcatttgcgattgttcgccttg
cttcgtggtataccgagttccaaggtggacttagaagtcaataaatggatcaatcgtctg
aatttaaatgcttgcatgcatcaaccaagtggtacttacagcggtgggaataaacgacgt
ttgaacatcgcaatggctttaattggaaatccgactctcgttctgttggatgaaccaaca
acgggcgtcgaccctgctgctaggagatcattgtggaatattctccaatcctgccaagca
atgggacaagctattatacttacttctcacagcatggaagaatgcgaggctctgtgcaat
aggctagtcattatggtgaaaggtcaattggtttgcattggtgcaagccaggaattgaag
caacgattcggcgctggttacgatattcacgttaaattaaatcccaaccgatcggatgac
gatgtgagcaatataaaatcaattatggaatcatctttaacgtgtgaaatcagagatgag
aatttgggattaattgcttatcatgtaaatgattctggaacgacgtgggaaaaaatgtac
agcacaatgaataatctgactgaacggtacagttgtatcgaagattatgccgttttatcg
gctaccttggaacagctattcattcaattcgccaggggaactgaattaaggaggtgcgaa
gaacctctggtagactacagtactcaagcagcggttgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
