Oenanthe melanoleuca (Eastern black-eared wheatear): 130263792
Help
Entry
130263792 CDS
T09236
Symbol
IGFN1
Name
(RefSeq) immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1
Organism
oma
Oenanthe melanoleuca (Eastern black-eared wheatear)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
I-set
fn3
Ig_3
ig
Ig_2
THB
Pur_ac_phosph_N
Tissue_fac
C2-set_2
Receptor_2B4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130263792
NCBI-ProteinID:
XP_056367568
LinkDB
All DBs
Position
26:complement(5542714..5568211)
Genome browser
AA seq
2610 aa
AA seq
DB search
MSHQTVKIFKKSAIPGVVITQFVNEVPQGCSAPDFEKKPLTLTLQEGKNAIFRAVVKGVP
APEVKWSRTRKGMDDPAKYEMSFNSATNEFILQIRSLVLDDSDLYRCCAVNAYGEASCCA
GLRIIQVGFKRKAKYVPVHAADELKKTLQDSRKLLRKRVVAPKPKPLDKEAVWQLLLHAD
RRDYEKICMKYGIVDFRGMLKKLQEMRQDTETEQDKLIHSLKNFEHIKVNKEGNATFSLE
MELKNSNSNVYLLKDGERLRYGTGDEYRKHCLRRAGRRFCFTVNDVQPEDAGVYQVRVED
VPVFSTELDAQAIPVRFRQPLADVRCAEAGDAEFQCELCSPCHQPLWLHRSHPLQASHKH
EMSVSPDGLRHRLVVRSVGPSDSGLYTLDAGQGSSSAWLLVEYAKGKRRQDEGEKIERET
SEWLKETMADNERARKLRRQEQAAAAGDHPSFSTSSAVEKSGWCRTGQGSSQSRGQGHSI
DSDDGSQRFLGKEGLRKTHINGEVGSGQFSGAGLDGDSAASDGSIFGLKGLEGRSRLRAV
HSMDSVSGRAGPGGADGHPTVGDVNGAGINREGQTGTPYGKDGLTPHASGQLGLTGRSGS
LYGPGGLPGGDGAIPGAGGNSTGEMEALYGPDGQALGTGAGGAGAGGFGSAYGKDGLPAG
AGFGGAGAGGFGVPYGKDGFPIGGGVGGAGAGGLGSPYGKDGLPAGAGAGGAGGAGGLGS
PYGKDGLPAGAGGAGAGFGEALYGPDGQPLGPGAGAGGFGAPYGKDGLPAGAGFGGAGAG
GFGVPYGKDGFPVGAGGGAGAGGFGAPYGKDGLPAGAGFGGAPGGGFGGAGSPYGKDGLP
AGADAAGAGGFGSPYGKDGLPAGAGAGGAGGVGGPYGKDGLPVGAGFGGAGAGGFGSPYG
KDGFPIGAGVGGAGGAGGFGSPYGKDGLPVGAGFGGAGPGGGFGGAGSPYGKDGLPAGAD
AAGAGGFGEALYDGQPLGAGVGGTAGAGGFGSPYGKDGLPAGAGAGGAGGVGGPYGKDGL
PAGAGFGGAGAGGLGSPYGKDGFPIGAGVGGAGGAGGLGSPYGKDGLPAGAGAGGFGEAL
YGPDGRPLGAGVGGGVGAGGYGVPHGKDGLPAGAGAGGAGGAGGLGPPYGKDGLPAGAGG
AGAGFREALYGPDGQPLGAGGAVSASAGGIGAPYGKDGLPLGAGAGVTGAGGVGGPYGKD
GLPVVSGAGVSGSGGVGGPYGKDGLPAGAGAGVVGGPYGKDGLPAGAGAGVVGGPYGKDG
LPMGAGAGVVGGPYGKDGLPAGAGAGVVGGPYGKDGLPLGSGAGVTGAGGIGGPYGKDGL
PVGAGAGVSGSGVVGGPYGKGGLPAGAGAGVSGSGVVGGPYGKDGLPAGADVGGPYGKDG
LPLGAGAGVSGSGVVGGPYGKDGLPAGAGVGGPYGKDGLPAGAGVGGPYGKDGLPVGAGA
GVSGSGGVGGPYGKDGLPAGAGAGVVGGPYGKDGLPAGAGVSGSGGVGGPYGKDGLLAGA
GVSGSGGVGGPYGKDGLLAGAGVSGSGGVGGPYGKDGLLAGAGVSGSGGVGGPYGKDGLL
AGAGVGGPYGKDGLPAGAGAVAGAAHFPLGDEGAMGSGHGVDATLSRAPGHAGGEGFFGE
GSALWGAGPPSGKDRGSAVGMAGTGGVGRLGGDEWDSVNGKAGVGGVGGAGGPGGEYGLD
AHLGRSSRGETGKGSASDIRGPGNKGSAGDRGSLSGPGGARAEDRDFRQLGSLYSAFGGA
GSKSHDRSVDGSSSGGFGQGPLSYGQMSGPGSEPPSANQRNQEPDLDLKANDSLNKTESA
GKKRRSVLDDLKVPRCYLNKQLATVRVLKGEPAELSCTVSRDNVAGTWFKDGLKLTSMDG
VVFEKKGLVHKLIINKADDIHAGKYRFEGGDVKTEASIFVEDPPQVDKVLLKNLTSVPTV
AKAGEGVKLRIPFEGRGPIRAAWLKDRMELGSDTRVRVDKTDTCTTLSISSCDRRDCGDY
KVRLKNDSGVLEINLKLMVIDKPQPPAGPIKIVERSADNITIQWKPPKDDGGKPVQRYLV
ERQQVGRNDWETLGETPRSCTSFTTSKVEEDMSYYFRVRAVNAEGVSDALESEEVKAAGK
ASPGAPDPPEIISTSRDTITISWKAPCKSGASQIMGYIVQKRKKGTVTWLPVTNVPVKDK
KLKVPGLKKGVQYEFRVAAVNAAGTGQPSDPSQPACARDPAQSPGQVQDLKVSSSDSTSV
TLTWSKPEVQDGNDVKGYEVEMRPWNSLTWTKCFTLPADSTSCRVQGLQAREKLLLRVRA
LSDRGPGEALELEACAGAAAPVVSPRLLIDDTVKSFLVIKAGNPIRVKIPFEGSPEPVVT
WLKDGLPLPSQAVVSTEDGSTQLLLRAAEFSDSGTYTVQLGDELGKRETFSFQVQIADIP
QPPGAIQLEENVPSTVTVTWEPSASEQWDKNLYYTVLKRESQKGLWHVLGDLIYNNKFTF
TRLVPGRDYYFRVVAKNDLGASDPSDTVQPWRIWKKKAEFRVKAQEYRGVNQKQPPRFLV
PLRSHVVVTGSECHMSCAVGGHPPPKITWYKDSRDLSRDPNYFCTNDFGVCSLVVLGVTK
QDEGEYMVQASNDVGRAYSKAFLAIRDSSL
NT seq
7833 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagccatcagacagtaaaaatcttcaagaaatctgctatcccaggagttgtcatcact
cagtttgtgaatgaggttccacagggatgcagtgcacctgattttgagaagaaaccactc
actctgacactgcaggaaggtaaaaatgccattttcagagctgtggtcaaaggtgtccca
gctcctgaggtgaaatggtcacggacacggaaaggaatggatgatcctgccaaatatgaa
atgtccttcaacagtgctacaaatgaattcattctgcagatcaggagcctggttctggat
gacagtgatctgtatcgctgctgtgctgtcaatgcctacggggaggcctcgtgctgtgct
ggcctcaggatcatccaagttggctttaagagaaaggcgaaatatgttcctgttcatgct
gctgatgagctcaagaagacactgcaggactccaggaagctgctgaggaagagggttgta
gcaccaaaaccaaagcccctggacaaagaagctgtgtggcaactgttgctgcatgcagat
aggagagattatgagaaaatctgtatgaaatatggaattgttgacttccgtgggatgctg
aagaagctgcaggagatgaggcaggacacagagactgaacaagacaagttaattcacagt
cttaaaaactttgaacacatcaaagtcaacaaggagggaaatgctacgttcagcctggag
atggagctgaaaaacagcaacagcaacgtttacctgctcaaggacggcgagcggctgcgc
tacgggacgggggacgagtacaggaagcactgcctgaggagggcgggcaggaggttctgc
ttcactgtcaacgacgtgcagcccgaggacgcgggcgtctaccaggtcagggtggaggat
gtccctgtcttctctactgagctggatgctcaagccatcccggtgcggttccggcagccg
ctggcggacgtgcgctgcgccgaggccggcgacgccgagttccagtgcgagctgtgctcg
ccctgccaccagcccctgtggctgcacaggagccaccccctgcaggccagccacaagcac
gagatgtccgtgagccccgatgggctgaggcaccggctggtggtgaggagcgtggggccg
tcggacagcgggctgtacacgctggacgcggggcagggctccagcagcgcctggctgctc
gtggagtatgccaaaggaaagaggagacaggatgaaggagaaaagattgaaagggagaca
tctgagtggctgaaagaaaccatggcagacaacgaaagggcgaggaagctccggcgccaa
gaacaggctgctgctgctggagatcatccttccttttccacatcctctgctgtggagaaa
agtggctggtgcagaactggtcaaggcagcagtcaaagcaggggccaagggcactccatt
gattctgatgatggaagccaaagatttctgggaaaagaagggctacgtaaaacccacata
aatggagaggtggggtctgggcagttttcaggagcaggtctagatggagattcagcagcc
tctgatggcagcatctttggactaaaaggcttagaaggcagaagtaggttaagggctgtc
catagcatggactctgtatcaggcagagcaggtcctggtggggcagatgggcatcccact
gtgggtgatgtgaacggagcaggaatcaacagagagggacaaacagggactccctatggc
aaggatggcctgacacctcatgccagtggtcagttagggctgacaggaagatctggctcg
ctgtatgggccaggaggccttccaggtggagatggggctatacctggtgctggtggcaat
tccacaggagaaatggaggctttgtatggtccagatggtcaggcactgggaacaggtgct
ggtggtgctggtgcagggggatttggatctgcctatggaaaggatggtctcccagctggg
gctggttttggtggtgctggtgcagggggatttggagttccctatggaaaggatggtttt
cccattggaggaggtgttggtggggctggtgcagggggacttggatctccctatggaaag
gatggtctcccagctggggctggtgctggtggggctggtggtgcagggggacttggatct
ccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtggtgctggagcaggatttggagaa
gctttgtatggtccagatggccagccacttggacctggtgctggtgcagggggatttgga
gctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggttttggtggtgctggtgcaggg
ggatttggagttccctatggaaaggatggtttcccagttggagcaggtggtggtgctggt
gcagggggatttggagctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggttttggt
ggtgctccaggtggtggttttggaggtgctggatctccttatggaaaggatggtctgcca
gctggagcagatgctgctggtgcaggaggatttggctctccatatggaaaggatggtctc
ccagctggagcaggtgctggtggagcagggggagttgggggtccctatggaaaggatggt
ctcccagttggggctggttttggtggtgctggtgcagggggatttggatccccatatgga
aaggatggttttcccattggagcaggtgttggtggggctggtggtgcagggggatttgga
tctccctatggaaaggatggtctcccagttggggctggttttggtggtgctggtccaggt
ggtggttttggaggtgctggatctccttatggaaaggatggtctgccagctggagcagat
gctgctggtgcaggaggatttggggaggctttatatgatggtcagccacttggagcaggt
gttggtggtactgctggtgcaggaggatttggctctccatatggaaaggatggtctccca
gctggagcaggtgctggtggagcagggggagttgggggtccctatggaaaggatggtctc
ccagctggggctggttttggtggtgctggtgcagggggacttggatctccctatggaaag
gatggttttcccattggagcaggtgttggtggggctggtggtgcagggggacttggatct
ccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtgcagggggatttggagaagctttg
tatggtccagatggtcggccacttggagctggtgttgggggtggtgttggtgcaggggga
tatggagttccccatggaaaggatggtctcccagctggggctggtgctggtggggctggt
ggtgcagggggacttggacctccctatggaaaggatggtctcccagctggggctggtggt
gctggtgcaggatttagagaggctttgtatggtccagatggccagccacttggagcaggt
ggtgctgtttctgcaagtgctgggggaattggagctccctatggaaaggatggtctccca
cttggagcaggtgctggtgttactggtgcagggggtgttgggggtccctatggaaaggat
ggtctcccagttgtttctggagcaggtgttagtggctcagggggagttgggggtccctat
ggaaaggatggtctcccagctggagcaggtgcaggggtggttgggggtccctatggaaag
gatggtctcccagctggagcaggtgctggggtggttgggggtccctatggaaaggatggt
ctgccaatgggagcaggtgctggggtggttgggggtccctatggaaaggatggtctccca
gctggagcaggtgcaggggtggttgggggtccctatggaaaggatggtctcccacttgga
tcaggtgctggtgttactggtgcagggggcattgggggtccctatggaaaggatggtctg
ccagtgggagcaggtgctggggtaagtggctcaggggtggttgggggtccctatggaaag
ggtggtctcccagctggagctggtgctggggtaagtggttcaggggtggttgggggtccc
tatggaaaggatggtctcccagctggagcagatgttgggggtccctatggaaaggatggt
ctcccacttggagcaggtgctggtgttagtggctcaggggtggttgggggtccctatgga
aaggatggtctcccagctggagcaggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctccca
gctggagcaggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctgccagtgggagcaggtgct
ggggtaagtggctcagggggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagctgga
gcaggtgcaggggtggttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagctggagcaggt
gttagtggctcagggggtgttgggggtccttatggaaaggatggtctcctggctggggct
ggtgttagtggctcagggggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctcctggctgga
gctggtgttagtggctcagggggtgttgggggtccctatgggaaggatggtctcctggct
ggggctggtgttagtggctcagggggtgttgggggtccctatgggaaggatggtctcctg
gctggagcaggtgttgggggtccctatggaaaggatggtctcccagctggagctggggct
gtggcaggagctgctcatttccctcttggagatgagggggcaatgggatctggccatggt
gtggatgccacactgagcagagctccaggacatgcaggaggagagggcttctttggggaa
ggctctgcactgtggggtgcagggcctccctctggcaaggacagagggtcagctgtaggc
atggctggtacaggtggggttgggaggctgggaggggatgaatgggactcagtcaatggt
aaagcaggtgtaggaggtgtgggaggtgccggtgggccaggtggtgagtatgggctggat
gcacatcttggcagatcttcgagaggtgaaactggaaagggctctgccagtgacatcaga
gggccagggaacaaaggttcagctggtgacagagggtctctgtcaggtccaggaggagcc
agggcagaggacagagatttcaggcagttgggctccctatattctgcctttggaggggca
gggagtaaatcccatgacagatctgttgatgggagtagttcaggtggatttggtcaaggt
ccactgagttatggccagatgtcaggtcctggtagtgaacctccttcagcaaatcagaga
aaccaggaacctgacctggatcttaaagcaaatgattccctgaacaagacggaaagcgca
ggaaaaaagagacggagtgtcctggatgatctcaaagtgccacgctgttacctcaacaag
cagctggcaaccgtgcgagtgctgaagggggagccagctgagctgtcctgcaccgtcagc
agggacaacgtggcaggaacctggtttaaggatggcctgaagttaacaagcatggatgga
gtcgtctttgaaaagaaaggtcttgtccacaaactgatcattaacaaagcagatgatatt
catgctgggaaatacaggtttgaaggtggagatgtgaaaactgaagcttcaatttttgtt
gaagatcctccccaggtggacaaagtcctcctcaagaacttgaccagtgtccccacggtg
gccaaggctggggagggggtgaagctgcggatcccgttcgagggccgggggcccatcagg
gcagcgtggctgaaggacaggatggagctgggcagtgacaccagggtccgtgtggacaag
acagacacctgcaccacgctgtccatctccagctgcgacaggagggactgtggcgattac
aaagtcaggctcaagaacgacagtggtgtcctggagatcaacctcaagctcatggtgata
gacaagccacagcccccagcaggacccatcaaaattgtggaaaggtctgctgacaacatc
acgatccagtggaagcccccaaaggacgacgggggcaaaccagtgcaaaggtacctcgtg
gagaggcagcaggtgggcaggaacgactgggagactttgggagaaacccccaggagctgc
accagcttcaccaccagcaaagtggaggaggacatgagctactacttcagggtgagggct
gtgaatgctgagggagtgagcgacgcgctggagtcagaggaggtgaaggctgctggtaaa
gcttcccctggtgccccagatccccctgagatcatcagtaccagcagggacaccatcacc
atatcctggaaagctccttgtaaatctggcgcttcccaaattatgggatacattgttcag
aaacgcaagaagggcactgtgacctggctgccagtcaccaatgtgcctgtcaaagacaag
aagctgaaggtgcccggcctcaagaagggagtgcagtacgagttccgtgtggcagctgtc
aatgctgctggcacggggcagcccagtgacccctcccagcccgcctgtgcccgggacccc
gcccaatctccaggccaagtgcaggaccttaaagtgagcagcagcgacagcaccagtgtc
accctgacatggagcaaacctgaagtacaagatgggaatgacgtgaaaggctatgaggtg
gagatgaggccctggaacagcctcacctggaccaagtgcttcaccctccctgcagacagc
acctcgtgcagggtgcagggcctgcaggcccgggagaagctgctcctgcgcgtcagggcc
ctcagcgaccgcggccccggcgaggccctggagctggaggcctgtgctggagctgctgct
cccgtggtctctcccaggttgctgatagatgacacagtgaaaagcttcctggttataaaa
gcagggaatcccatccgggtgaagattccctttgagggatctcctgagccagtggtgacc
tggttaaaggatgggctgccccttcccagccaggctgtggtgagcactgaggatgggagc
acccagctgctgctcagggcagccgagttcagtgacagcggcacctacactgtgcagctg
ggggatgagctggggaagagggaaaccttcagcttccaggttcaaattgcagatatccct
cagccccctggagccatccagctggaggagaacgttcccagcacagtcacagtgacctgg
gagccctcagcatccgagcagtgggacaagaacctctattacacagtcctgaaacgggaa
tcccagaagggtctgtggcacgtgctgggggacctcatctacaacaacaagttcaccttc
accaggctggtcccaggcagggattattacttcagggttgtggcaaaaaatgacctggga
gccagtgatccatcagatactgtgcagccctggaggatctggaaaaaaaaggctgagttt
cgagtgaaagcacaggaatacaggggagttaaccagaagcagcccccgaggttcctggtg
ccgctcaggtcccacgtggtggtgacgggcagcgagtgccacatgagctgcgccgtcggg
ggccatcccccccccaaaatcacatggtacaaggacagcagagacctctccagagacccc
aactacttctgcaccaacgacttcggcgtgtgctccctggtggtgctgggggtcaccaag
caggacgagggggagtacatggtgcaagccagcaacgacgtggggcgtgcctacagcaaa
gccttcctggccatcagagactcctccctgtag
DBGET
integrated database retrieval system
