Orbus mooreae: RHO11_04210
Help
Entry
RHO11_04210 CDS
T10515
Symbol
lptD
Name
(GenBank) LPS assembly protein LptD
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
omo Orbus mooreae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
omo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
omo02000
]
RHO11_04210 (lptD)
Transporters [BR:
omo02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RHO11_04210 (lptD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptD
LptD_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVD62339
LinkDB
All DBs
Position
891335..893698
Genome browser
AA seq
787 aa
AA seq
DB search
MKKLTPSFIAAAVTLSIYSQSSFADTEQKATSTNQCLVDVPKYNRPLVDGDINSLPIEVS
SDSFQVNLPNQAIYSGNVSATQGNRLVNSDQITLDQTKNRNMLLRGNIFYEDPMIEMKGD
QAEMDLDTNEIQIQNSQYHLVGRLGRGSADNVQFTNNRYIVLDNGSFTSCPVNNSSWNIE
GSKIIYDNQEQLLEVWDAKFRLGKVPVLYLPYLQLPTGDKRRSGLLMPEFAYDSIGGFDI
SQPIYWNIAPNYDVTFTPRIIQHRGVQLQTEMRYLNYLGLGTVAFDWLQHDNLYSKNRTD
TSKSGYSDNSYRWLFHWKNDELINYNWRFFVDATRVSDNQYITDLGSKYASETDGYLTQH
YQIGYTNEYWDIGLNYKYFQALRNDIKDDLYRAVPQLNINYYNNDIDNLSIKSFSQISHF
VSSGSNNPKAWRFHFEPTLDYTLMSSWASVTTEAGFMATHYNQDIPNVGQNAHLKENVNR
FLPKFGIDGKMIFERNVNLFEGYTQTLEPRVKYLYIPYRDQSQINNYDSSLLQSDYIGLF
RDQPYSGLDRIASSNKVATGLTTRFYDENKIEKFNLSIGQIYYFSKSRTGINGTGFSESD
GTGSITWATDVFWRINENVITRSGIQYDEHLGEISLASAVVEYRQADNKLIQLSYRYANK
NYINSISLSNNTTPYQQSISQIGIMGSWPLTDTVSAVGSVYYDIDNKQSTDSYVGLHYED
CCWGVSVQYGRKITDWDSSQKVSQYENKLSVNFELRGLTKNNNAVAKMLDFGLIPYKTAF
EEDYGTN
NT seq
2364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaattaacaccatcttttattgctgcagcagtcactctgtctatttatagtcag
agcagttttgcagacacagagcaaaaagctacatcaacaaatcaatgtttagttgatgtc
cctaaatacaatcgtcctcttgtcgatggtgatattaattccttaccgattgaagtttca
tccgatagtttccaagtcaacttacctaatcaagcaatttacagtggtaatgtatcggca
acacaaggcaaccgtctcgtaaactcagatcagatcacgcttgatcaaactaaaaataga
aatatgttactacggggtaatattttttatgaagatccgatgattgaaatgaaaggtgat
caagcggaaatggatttagatacaaacgagatccaaattcaaaatagccaatatcattta
gtcggtcgtcttggtagaggtagtgctgataatgttcaatttacaaataatcgttatatc
gttttagataatggtagttttacctcatgcccagttaataatagcagttggaatattgaa
ggttctaaaattatctatgataaccaagaacagctacttgaagtatgggatgcaaaattt
agattaggtaaagtgcctgtactctatttaccctatttacaattaccaactggtgataag
cgtcgttcagggctattaatgccagagtttgcttatgatagtattggtggctttgatatc
tctcagcctatttactggaatatagcaccaaattatgatgtaacctttacaccaagaatt
attcaacatcgtggcgtacagttacaaactgaaatgcgttatttaaactatcttggttta
ggtacagtagcatttgactggctacaacatgataatctttatagtaaaaatcgtaccgat
accagtaaaagcggttatagtgataatagctaccgttggttattccactggaaaaatgat
gagctaattaactataactggcgattttttgtagatgcaacgcgagttagtgataaccag
tatattactgatttgggttctaagtatgcgtcagagactgatggatatctaacacaacat
tatcaaattggttataccaatgaatactgggatattggtttaaattataaatactttcaa
gcattacgtaatgatattaaagatgatctttatcgagcggtaccgcaactgaatatcaat
tactataataatgacattgataatttgagtattaagagctttagccagatttctcatttt
gttagcagtggtagtaataatcctaaagcttggcgttttcactttgaaccaacactcgat
tataccttaatgtcatcatgggcttcagttacgacagaagctggtttcatggcaacccat
tataatcaagatattccaaatgtgggtcaaaacgctcatcttaaagaaaatgttaatcgt
tttcttccgaaatttggtattgacggtaagatgatttttgaacggaatgtaaatttattc
gaaggttatacccaaacattagagccgcgagtgaagtacttatatattccataccgtgat
cagtcacaaattaataattatgactcatcattactacaatctgattacattggtttattc
cgtgatcaaccttatagtggacttgatcgcattgcatcttcaaataaagtcgcaacaggc
cttacaacccgtttttatgatgaaaataaaattgaaaaatttaatttatctatcgggcaa
atctattatttcagcaaatcaagaactggcattaacggcacaggcttctctgagagtgat
ggaacaggtagtatcacttgggcaactgatgtattttggcgaattaatgaaaatgttatt
acacgcagtggtatacaatatgatgaacaccttggtgaaatatcactagcaagtgccgtg
gtcgagtatcgtcaagcagataataagctaattcagctctcttatcgttacgcgaataaa
aactatattaacagtatttcactatcaaataacaccacaccttatcagcaaagtatttca
caaattggtataatgggctcttggccgttaactgatacagtgagtgctgtcggttctgtg
tattatgatattgataacaagcaatcaaccgatagctatgttggcttacattatgaagat
tgttgctggggcgtatctgttcaatatggaagaaaaattactgactgggatagttcacag
aaagtcagccagtatgagaataaattgtctgtcaactttgaattacgcggtctgactaag
aataataatgccgttgccaaaatgctagattttgggttgatcccatataaaacagcattt
gaagaagattacggaactaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
