Oncorhynchus mykiss (rainbow trout): 110515887
Help
Entry
110515887 CDS
T07259
Name
(RefSeq) proteoglycan 4-like
KO
K24286
proteoglycan 4
Organism
omy
Oncorhynchus mykiss (rainbow trout)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
omy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00535 Proteoglycans [BR:
omy00535
]
110515887
Proteoglycans [BR:
omy00535
]
Extracellular matrix (ECM) proteoglycans
Others
110515887
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M10
Hemopexin
PG_binding_1
Metallopep
DUF4953
CT0912-like_C
Peptidase_M54
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110515887
NCBI-ProteinID:
XP_036816508
LinkDB
All DBs
Position
23:6398501..6414349
Genome browser
AA seq
1520 aa
AA seq
DB search
MISKQTRGLLSKQTRGMLSKQTRGMLSKQTRGMLSKQTGIQTRLFPVRCSRGVSSTSCFN
NMPYFQLFLSRYGFIRPVNWEELQFDQSTGISNDEDFPGEEDLSGIQEGDSSLSRAETDD
DDDDDDDDEDSPNPTESQAFISALRDFQMVSGLSVTGLFDDATKAAMNKPRCGVPDKETD
DATEEVHNSTSSALGINTATWLTKNTDTSEYSNQTFSGVLNASATDYTVDNNIFTDLSNG
TDGNYTEVDNSFSDIFNRTVSTHKGDISASSTTEYYDPVGDTLNYSAMNNTENNSNAHSH
TGNDPTSATDRPHQRPPPTTATDRPHQSPPPTTATDRPHQRQSPLPTTATDRPHQSPPPN
TATDRPHRSPPPTTATDRPHQRPPTTTANDRPHRSPPPTTATDRPHQRPPPTTATDRPHQ
SPPPTTATDRPYRSPPPTTATDRPHQSPPTTATDRPHRSPLTTTATDRPHQSPPPTTATD
RPHQRPPPTTANDRPHRSPPPTTATDRPDQSPPPTTATDRPDQSPPPTTATDRSHKSPPP
TTATDRPHQRQSPPPITATDRPHQSPPPTTATDRPHRSPLPTTATDRPHQSPPTTATDRP
HRSPLTTTATDRPHQSPPPTTATDRPHQRPPPTTANDRSHRSPPPTTATDRPDQSPPPTT
ATDRSHKSPPPTTATDRPHQRQSPPPITATDRPHQSPPPTTATDRPHQSQSPPLTIATDR
PHWSTPTTATDRPHQRQNPPPTTANDRPHWSRTPTTATDRPHQRQSPPPTTANDRLHRNP
PPTSATDRPHWSLTPTTATDRPHQRPSPPPTTANDRPHQNPPPTTANDRPHQSPPPTTAN
DRPHQSPPPTTATDRPHQSPPPTTATDRPHQSPPPTTATDRPHQSPPPTTATDRPHRSPL
PTTATDRPHQSAPTTATDRPHRSPLTTTATDRPHQSPPPTTATDRPHRSPLPTTATDRPH
QSPPPTTATDRPHQSPPPTTATDRPHRSPLPTTATDRPHQSAPTTATDRPHRSPLTTTAT
DRPHQSPPPTTATDRPHRSPLPTTATDRPHRSPPPTTATDRPHQSPPPTTATDRPHRSTL
TTTATDRPHQHQNRVASLLSKRRQKRHVGRRAWGNMAFSKMVLKWRLIGEGYSSQLTIQD
QRHIISLAFRMWSEVSPLEFIEDTSSPLADVDIKLGFGTGRHLGCNQKFDGTGREFAHAW
FLGDIHFDDDEHFTAPNTGSGISLLKVAVHEIGHVLGLPHIYRTGSIMQPSYLPQESGFE
INWMDRKSIQHLYGGCKGQFNTVFDWIRKERTQYGEVVIRFNTYFMRDGWYWLYENRTNR
TRYGDPVALQVGWHGIPPDGVDASVHVWNRNTDAVYFFKGTQYWRYDDDNDQVFTVDPEG
HLYPRLISEGFPGVPSPIDTAFYDRRDYHIYFFKGTYVYVFDVTANRVSPGFPRKITAVF
PAVVSGDHPGGSIDAAYFSYTHNAVFLFKDTQFWKVVGRSRDRWRRPALPRNGLLPHRKV
EEQWFDICNVHPSALKVARR
NT seq
4563 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatatctaaacagactagaggattgttatctaaacagactagaggaatgttatctaaa
cagactagaggaatgttatctaaacagactagaggaatgttatctaaacagactggtatc
cagactaggttatttcctgttagatgttctagaggtgttagttctaccagctgttttaac
aacatgccatatttccagctatttctctcaaggtacggcttcataagaccggtgaactgg
gaggagctccagtttgaccaatcaacaggcatttctaacgatgaagacttccccggggag
gaagacctatctgggatacaggagggagactcatcgttgtcacgtgcagagactgatgat
gatgatgatgatgatgatgatgacgaagactctccaaatcccactgaaagccaagccttc
atctcagctctcagagacttccagatggtgtccggcctgtctgtcacagggctgtttgac
gacgccaccaaggctgccatgaacaagccaaggtgtggggtcccagataaggagacggat
gatgctactgaggaagtacacaactccaccagctcagcacttggtatcaacaccgccacc
tggctaactaagaacacagacacctcagaatactctaaccaaacattcagtggtgtttta
aatgcctccgctactgattacacagtggacaataacatattcactgacctttctaatggc
actgatggaaactatacagaggttgacaattcattcagtgacatttttaatagaactgtt
agtacccacaaaggtgatatatctgccagtagcacaacagaatactacgacccagtcggt
gatactctcaattattctgctatgaacaacacagagaataacagcaatgcacacagtcac
acagggaacgacccaaccagtgctactgacagacctcatcagagacctcctcctaccact
gctactgacagacctcatcagagccctcctcctaccactgctactgacagacctcatcag
cgtcagagccctcttcctaccactgctactgacagacctcatcagagccctcctcctaac
actgctactgacagacctcatcggagccctcctcctaccactgctactgacagacctcat
cagaggcctcctactacaactgctaatgacagacctcatcggagccctcctcctactact
gctactgacaggcctcatcagaggcctcctcctactactgctactgacagacctcatcag
agccctcctcctaccactgctactgacagaccttatcggagccctcctcctaccactgct
actgacagacctcatcagagccctcctaccactgctactgacagacctcatcggagccct
cttactaccactgctactgacagaccacatcagagccctcctcctaccactgctactgac
agacctcatcagaggcctcctcctaccactgctaatgacagacctcatcggagccctcct
cctaccactgctactgacagacctgatcagagccctcctcctaccactgctactgacaga
cctgatcagagccctcctcctaccactgctactgacagatctcataagagccctcctcct
accactgctactgacagacctcatcagcgtcagagccctcctcctatcactgctactgat
agacctcatcagagccctcctcctaccactgctactgacagacctcatcggagccctctt
cctaccactgctactgacagacctcatcagagccctcctaccactgctactgacagacct
catcggagccctcttactaccactgctactgacagaccacatcagagccctcctcctacc
actgctactgacagacctcatcagaggcctcctcctaccactgctaatgacagatctcat
cggagccctcctcctaccactgctactgacagacctgatcagagccctcctcctaccact
gctactgacagatctcataagagccctcctcctaccactgctactgacagacctcatcag
cgtcagagccctcctcctatcactgctactgatagacctcatcagagccctcctcctacc
actgctactgacagacctcatcagagtcagagccctcctcttaccattgctactgacaga
cctcattggagcactcctaccactgctactgacagacctcatcagcgtcagaaccctcct
cctaccactgctaatgacagacctcattggagccgcactcctaccactgctactgacaga
cctcatcagcgtcagagccctcctcctaccactgctaatgacagacttcatcggaaccct
cctcctaccagtgctactgacagacctcattggagcctaactcctaccacagctactgac
agacctcatcagcgtccgagccctcctcctaccactgctaatgacagacctcatcagaac
cctcctcctaccactgctaatgacagacctcatcagagccctcctcctaccactgctaat
gacagacctcatcagagccctcctcctaccactgctactgacagacctcatcagagccct
cctcctaccactgctactgacagacctcatcagagccctcctcctaccactgctactgac
agacctcatcagagccctcctcctaccactgctactgacagacctcatcggagccctctt
cctaccactgctactgacagacctcatcagagcgctcctaccactgctactgacagacct
catcggagccctcttactaccactgctactgacagaccacatcagagccctcctcctacc
actgctactgacagacctcatcggagccctcttcctaccactgctactgacagacctcat
cagagccctcctcctaccactgctactgacagacctcatcagagccctcctcctaccact
gctactgacagacctcatcggagccctcttcctaccactgctactgacagacctcatcag
agcgctcctaccactgctactgacagacctcatcggagccctcttactaccactgctact
gacagaccacatcagagccctcctcctaccactgctactgacagacctcatcggagccct
cttcctaccactgctactgacagacctcatcggagccctcctcctaccactgccactgac
agacctcatcagagccctcctcctaccactgctactgacagacctcatcggagcactctt
actaccactgctactgacagacctcatcagcatcagaaccgcgtggcctcactgctgtcc
aagcggaggcagaagagacatgtggggagacgtgcatggggaaacatggcattctccaaa
atggtgctgaagtggaggctgataggagagggttatagcagtcagctgaccatacaggac
cagagacacatcattagcctggccttcaggatgtggagcgaggtgtctcccctggagttt
atagaggacacatcctctcccctggcggatgtagacatcaaactgggttttggaacaggg
agacacttgggatgcaaccagaagttcgatggtactggacgagagtttgctcacgcctgg
ttcctgggagacattcacttcgatgacgatgaacattttactgcacctaacactggcagt
gggatcagcctgctcaaagtggcagtgcatgagataggccacgtcctgggtctgcctcac
atctacaggactggttccattatgcaacccagttacctgccccaggaatcaggcttcgag
atcaactggatggacaggaagtccatacagcacctctatgggggctgtaagggtcagttc
aacacagtgtttgactggatcaggaaggagagaacccagtacggtgaggtggtgattcgt
ttcaacacctacttcatgagggacggctggtactggctctatgagaacaggaccaaccga
acccgctatggtgacccggtggctcttcaggtgggctggcacggcataccccccgacggg
gtagacgcaagtgttcacgtgtggaacaggaacactgatgctgtctacttctttaaaggc
acccagtactggaggtatgacgatgacaacgaccaggtgtttacagtggaccctgaggga
cacctctaccctagactcatctctgaggggttcccaggggtgcccagtcctatagacaca
gccttctatgacaggagggactaccacatctacttcttcaagggcacctatgtgtatgtg
ttcgacgtgacagccaaccgcgtgtccccaggcttccccaggaagatcacagctgtgttc
ccagcagtagtgtctggggatcacccgggcggtagcatagacgccgcctacttctcctac
acgcacaacgctgtcttcctgttcaaggatacacagttctggaaggtggtggggaggagc
agagaccgctggaggagaccggcgctgccacgcaacggcctgctgccacacaggaaggtg
gaggaacagtggtttgacatttgtaacgttcacccctcggccctgaaagtggcccgtcga
tga
DBGET
integrated database retrieval system