Oncorhynchus nerka (sockeye salmon): 115106821
Help
Entry
115106821 CDS
T07952
Name
(RefSeq) fibroin heavy chain-like isoform X1
Organism
one
Oncorhynchus nerka (sockeye salmon)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
115106821
NCBI-ProteinID:
XP_029485799
LinkDB
All DBs
Position
LG23:complement(27613994..27676125)
Genome browser
AA seq
2306 aa
AA seq
DB search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NT seq
6921 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgggtgggacggtggcgttgttcctgtatggattcctgctcctgtctctgtggaaa
ccttcactgcaaggaggtgtgtacatacctgctggtgtaggtgaaggagctggggctgga
ttaggagctggagcaggaggcagagctggatttggtccaggtggagctggcaccggtttt
gggcctggtggtgtaggcactggatatgggccaggtggcggagccggagttggatcagga
ggtgtaggtggagctggcgctggtccaggaggtgcaggctttggccctggagccggtgga
ggttacaccaagccagggaagacgggagctggctatggtggtcaggttgtaggccaaggc
caaggccaaggaggactggggactggaggtctgggggaaggaagagttagaccagaagga
gctggggccggaccaggaggttatggacatggcggtggtttaggagctggaggccttgga
gcaggagctggcaatggaggttggggtcctggaggacagggggctggactaggagctgga
ggtctgggaggaggaggtcttagaccaggagccagaccaggaggttatggaccaggtggt
tatgggcctggtgctgatcttagtctgggcggagctgtagctggaggtcttggtggtggt
tacggacttggcgggggtctaggtgccggaggccttggagcaggagctggaggaaagcca
gagaaggcaggagctggctacggtggtagagatccaggaggacagggggctggactaggt
gttggaggttttggaccaggtggctatggaccaggtggagctggagctggtgctggacca
ggtggctatgggcttggtgttggtcttggtcctgggggagctggtcctggagtttttggt
ggtggttatggacccgatggaacaggagctggctatgtaggtcgcagtcctgggggacag
ggggctggattaggagctggaggctatggaccaggtggagctggaccaggaggatatggg
cctggttctggtgttggccagggtggagctggtggttttggtggtggtcttggagctggc
ggacaaggagacgcccttggagctgggtttggaggcctcggagctgggggactgggatcc
agaggtacaggtcagggggctggaggacttggagcaggccaaggtcttggagccggccaa
ggagatggatacagacctggaggaggctacggtggtgctgctggtggtctgtaccctgga
gctggaggggcgggggcaggccagaaacctcccaaaacaggagcaggaagcacactagga
ggagatggatatgggcctggtggtgctggtggatatgggcctggtggcgcaggtggacat
tggcctggtggcgtaggtggacatgggcctggtggcgtaggtggacatgggcctggtggc
gcaggaactgggcctggtggcacaggaactgggcctggtggcgcaggaacgggacctagt
ggcacaggtggatatggtcctggtggcgcaggaactgggcctagtggcacaggtggagtt
ggccttggtggttttgggcctggtggcgcagcagtaccagctggagcaccagtacttcca
cagactggagtccctgggggtggagctagagagaagagcggttggaaggccaacaaacaa
gtgccaggtgttggagtacctggactttatcaaggtggaatagtgcctagtcaaggtttc
ggagggcgtggggttctaccaggtgttgccactggatccggacttgctccccagacaggg
gcaggtgtgctgggccagggtggagttggagctggcactggagctggaggtggccgaggc
agtttaaatggagtgttccgtggatatcccctcatatcacctaaatctggaggggctgga
ggcaaatcagctaattcccaggccaagcttgctgctaaatatgctggagctggaggtgta
cttcgtcaagggggcatgtcgggagcaggaggagtacctagcggtgtacctggagcaggt
ggggtccctggttatggagttggagctggaggtgtacttcgtcaagggggcatgtcggga
gcaggaggagtacctagcggtgtacctggagctggtggtgtacctggttacggaggtgga
gcaggaggcatacctggattcggaggcgtacctggttacgggggcggagccgggccagga
ggcgtacctggggcagggggcatccctggctcaggtgggtatggatacccagggggttac
ccaggtggagggcggtacccagggactggcctaggtgtaggaggtgcctaccccggagga
gctggatctaaggcagccaaatatggtcagggtggagcaggcactggagctggtggtggg
ctcagccagggagtgcctgcatctgggattggaaccggaagactgcctggtggggctgga
ggggaaccaggaggcggttacaggcctggcggtagcttcggtcctggaggtggagttgga
ccagggggggccagttatggaccaggtggggccggctatggaccaggtggagctggacct
ggtggctatggaccaggtagtgctggaagttatggaacaggtggaggggttggaccaggt
ggtgccggggaaggacatggtggagctggctatggaccaggtggaggagttggtggagtg
cctggtggtggacacagacccggaggtggtttacctggtagtggtgctggttacggacct
ggtgctggtgttggaggatatgatgcaaatgccaaagctcgtaaatatggtttgctaagt
ggtgtccttgggaccccaggaggaggacaggcagccagcctgggaggagtaccaggaggg
ggagcagggactggagtaggccagggtggagtgcctggatctgggcttggtggtggtgga
ggtgtccctggtggttatggtcctggagctggatttggacctggccgtggaaccggtggt
ggttatggaccaggagtgggtgctgggactggacttggccagggagcagggcctggagct
gggcttggtgctggtggagtgcctggtggtggatacacacccggaggtggtttacctggt
agtggtgctggttacggacctggtgctggtgttggaggatatcctgctggggctaagtct
ctgaaatacggtccaggaggaggtggaggagctccgggtggaggccttggtgggcgattc
ggtgccccgggaggaggtctgccaggaggaggctacggaccaggggccggaggcgcctta
ggagcaggagaagcaggagcaggaggaagagtgcctgggggtggatacgggaccggagct
gggcctggtgcagggtatggagcaggaacagggcctggagctgggtacggtcagggagca
ggaggagtccctggaggaggctatgaagctagggcaagagcaggaggactacctggggcc
ggatatggacctggaagaggatatggagccggatcaaaagctgctaaatatggacaagtt
gctggtggggccggtggggccctcggaggaggagctggacaaggattcggaggggtacca
ggtggctatggaccaggtggcttcggagccggaccaggtggctatggagccggaccaggt
ggctttggagccggaccaggtggctttggagccggaccaggtggctttggagccggacca
ggtggctttggagccgggggcggagcaggatcaggaggggtgccaggtgggcttccagga
gggtacagcggttctccctgggggaaaaggggctatggtactggatctggatttaaggca
gacaaatacggaccaggtggggcaggaggggcccttggtgctggggcagctggaggtgca
ggggctgggacaggggctgggaccggagctgggacaggtgctggaggaggtgcaggacct
acacctggccctggcacaagagcaggaggagatggcactgtgacaggagcaggaggagac
aggacaggcgcaggaggagcaggcacaggaggtgagcctggtggtgccggtggggttcta
gaaggatctggaagttctggtggcccaggagatggcaccggcgtcacagctggtgctgtt
ggaggaggggtgggagacacaggaatccctagcattggaggaaaaccagatcaatcggga
ctcggggggacagcaatcccaggtggaattgcagtgccagaaactggggctggagttgtt
caacccagtgctggggctggagttgatggggtaggagttccctctggaggttcggaaaca
ggcatcggtattggtgccggcggaaaaccctctaaagaaagacaagcaggtgctgctaac
ggtgatatcactggagggggcactctacctggagctaaacctctgaaggctccaagagga
gatacacctggtgaaggagagggagatgcaggaggaggagcaagaggtgttggtggaggt
cctgatggtgcaggaggagcaggcagtggatctggcggagtaggaagagatggtgatggt
agaggaggaggaccaggaggagcaggcagtggatctggcggtgtaggaagagatggtgat
ggtaaaggaggaggaccaggaggagcaggggggaaagacggtggtgcagttagagtggga
ggaagtcctaacggtacagggggagctggaggttcaggaggtggaggagcaggagtagaa
cctggaggagttggaggaggtgcaggaccaggcagtagtgacaaaccacccaaaggttat
ggagcaggtggggctggcagtctgggtgcaggaggtgctggaggagcagctctggtccct
gggactggtggtgctggtgatgtaggagctggaacccccaaaccaggaaaaagctacgga
gctggtggagtcctgccaggtggaggtctacgttacccaactggggctagagaaggactg
ggctcagggaagccgggcaaaggatatggtgctggccaatttggagcaggaggacgacgt
cctggaggatatggtgccggaccaggcggatacggagccagtcctggaggatatggcact
ggacccggtggttatggggccagacctggtggttatggtgctggtccaggtggttatggg
gctggagctggtcctggtggctatggtgctgggccaggtggatatggtgctgggcaaggt
ggctatggtgctgggccaggtggctacgggacaggggctgggcctggaggatatggatcc
aaaccatacaagactggaggtgctggagccggtggtgttggtggaggtctgggtggagct
ggcagcctgggtgccataggagccggaccaggaggagtgggcggaggtcaaggaggcggt
ctaggtggaggtcaaggtggagctggaccaggtggatatataccaggtggagttggtagc
agataccccacaggtgctggaacaggctatgggagagctgttggagctggagatgggctt
ggtggttatggtggcggaacagttggttatggaccaggaggaaccggggccggactaggt
ggggctggggccgggcaaggtggatatggtgccggacataaaggttatggaccaggtgga
gcagggccgggaggagctggggtcagaccaggtggagcagaggccagacctggtggctat
ggtgcagggcctggaggttatggggctgaacctggtggctatggaccaggtggagcaggg
ccgggaggagctggggtcagaccaggtggagccagaccaggtggagcagaggcaggacct
ggtgtctatggtgctgggcctggaggttatgggcctggggctggtcttggtcctggcgga
gctggtcctggaggttatggggctggacctggtggctatggaccaggtggagctggatct
cataaatatggtatgctaagtggttcccttggagggggacaagcagctggccagggaaga
gtgccaggagggggagcaaggactgggctaggtcagggaggagtgcctggagggggagca
ggtaccgggctaggccatggaggagtgcctggatctgggcttggtggcggtagtagtccg
ggtgctgggtatgtacctggcattggaacccatggaggttatggaccaggaggtggtgct
gggaccggacttggtcagggaagagccggggccggaccaggtggctatggaccacttgga
gctggggctggacagggaactggagctggagggtatgacgcaaatgcaaaagctcgtaaa
tatggtatgctaagtggtaccattggaggaggacaagcagctggccagggaagtgtgcca
ggagggggagcagggactggagtaggccagggtggagtgcctggatctgggcttggtggt
ggtggaggtgtccccggtggttatggtcctggagctggatttggacctggtggtggaact
gttggtggttatggaccaggagggggtgctgggaccggacttggccagggaggagttggg
gccgtaccagatggctatgggactgggcctggtggttacggaccaggtggagccggacag
ggtgcagtgaagccaaacaaatcaggttatggctcctcctcctcgggtggagctctcttt
ggaccaggtggtggagcaggtggggtacctggtgctggggctaccgggcgaagaggagga
gtaccaggttattatggctcccagggtggagctggctatcaaccaggaggctacggagta
ggagaagcgggacagtcagggcagaaatcaaaggcacagaaggcagccaaatacacagcc
atgcaaggcttcctgggagcacgcagctacagaggggtcgccgactgccagggtatatac
tgcggacggaggaggaagtga
DBGET
integrated database retrieval system
