Oscillatoria nigro-viridis: Osc7112_1266
Help
Entry
Osc7112_1266 CDS
T02375
Name
(GenBank) transcriptional attenuator, LytR family
KO
K01005
polyisoprenyl-teichoic acid--peptidoglycan teichoic acid transferase [EC:2.7.8.-]
Organism
oni
Oscillatoria nigro-viridis
Pathway
oni00552
Teichoic acid biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
oni00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00552 Teichoic acid biosynthesis
Osc7112_1266
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LytR_cpsA_psr
LytR_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ05809
UniProt:
K9VE83
LinkDB
All DBs
Position
1482635..1483984
Genome browser
AA seq
449 aa
AA seq
DB search
MKNLSIFKRDFVTPVDQTSRKKPKFFLYIVGLFFLVFTAAISATLGAITALLAPVEPPII
NRVLEATGFDYLSSNRSGYRLSRSVNILILGIDGVPEAAANSPKIFNGRSDTILLFHLDP
RDKSISLLSVPRDTQVEVPGISFSKISEANARGGAALATRLVSSMLNNTTIERYVRVSSN
AFRELVDLLGGVEVFVPRAMSYTDTAQKLKINLGKGWQTLNGEQAEQFARFRNDGLGDIG
RIQRQQSLIQAIRDRLASPSVLVRLPQIVRLMQKYVDTNLNYEEILTLANFGLQLDRDNF
KMVMLPGRSSSETGDLRSYWMVDALGRDRIMTQYFNQSVPDFAQGRFRNPTESVLPKNLK
IAVQNASSKPTAAKTVSEFLTKKGFFNVSVVQDSPQKQRQSQIIVQQGDLEAANLLQKEL
GGGKLEASSTGEINSDLTLRVGEDWVKRF
NT seq
1350 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaacttgtcaatttttaaaagagactttgttacaccagtcgatcaaacatctcga
aaaaagcctaaattcttcctgtatatagtggggctatttttcctagttttcacagccgca
atctcggccacattgggggcaattactgcccttttagctcccgtggaaccgccaattatc
aatagagtattagaggcgacgggctttgactatctatcctccaaccgctcaggataccgc
ctgtcgcggtcagttaatatcttgatcttgggaattgacggcgtgccggaagctgccgcc
aattcccctaagatatttaacggtcgcagcgataccatactcttatttcacctcgatcct
agagataaatctattagtttgctttcagttccgcgagatactcaagtcgaagttcccgga
attagcttcagcaaaattagcgaagccaatgctagaggaggagccgctttggcaacgcga
ttggttagcagtatgctgaacaatacgacaattgaaagatacgtgcgagtcagcagcaat
gcgtttcgggaattagtcgatttgttgggcggagttgaggtatttgtacctcgcgcgatg
tcctatacagataccgctcaaaagttaaaaataaacttaggcaagggatggcaaactctc
aacggagaacaagcagaacaatttgctcgatttcgcaacgacggtttaggagatatcggc
cgcattcagcggcagcaatctttaattcaagctattcgagaccgcctcgcaagtccatca
gtattggtgcgcttgccacaaattgttcgattgatgcaaaaatatgtggatacaaaccta
aattatgaggaaatattgacgctggcaaatttcggtttgcaattggatcgagataatttt
aaaatggtaatgttgcctggacgttctagttcagaaacaggggatttgaggagttattgg
atggtagatgcgctcgggcgcgatcgcattatgacacaatatttcaaccagagcgtgccg
gattttgcacaaggacgatttcgcaatccaaccgagtctgttttgcccaaaaacctcaaa
atagccgtccaaaacgcttctagcaaaccgacagcagccaaaaccgttagtgaatttctc
acaaaaaaaggcttttttaatgtatctgtagtgcaggattcgccccagaagcagcgtcaa
agtcaaattattgttcagcaaggcgatttagaggcagcaaatctactgcaaaaagaatta
ggtggcggtaaacttgaagcatcttctaccggtgaaattaattctgacttgacacttcgc
gtcggcgaagattgggtaaagcgattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
