Oscillatoria nigro-viridis: Osc7112_1394
Help
Entry
Osc7112_1394 CDS
T02375
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)
Organism
oni
Oscillatoria nigro-viridis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
PAS_9
GGDEF
PAS
PAS_3
PAS_4
PAS_8
PAS_11
PAS_6
DUF5319
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ05925
UniProt:
K9VF92
LinkDB
All DBs
Position
complement(1628235..1631246)
Genome browser
AA seq
1003 aa
AA seq
DB search
MGDRENQSISNLGEVGGVGDRHTASEALWLRDRALAATSCGIVIADANAPDCPIIYCNPA
FERMTGYCASEILGRNCRFLQGPDTDRTTVAKIREALRQGRAIQTPIKNYRKDGTPFWTK
LSLSPVRDDKANLTHFVGVQSDLSEPLCEVQQALQQANDQLQTILEAVPGTVSWISSDLR
YLGVNQHLAKLHGLAPSAFVGQDIGFLGASSDFNSFVVEFFAGDATEAVKELNIKVQTDG
GQSEGYYLIVAQKYDRGKAACLVGIDITERKRAEEALVLTRKAVESSSDAIGISDANGTH
IYQNQAFSQLFEWDTAEEFKLAGGISAVFADPAVAREVLDTIAQGYSWFGEITNRTKSGE
TLQVLLRADAIKDRKGKIVGLIYMNTDITDQKRTEQELRQSEKRFRSLIENARDIIVILD
EKGFCRYVSPSLERILGYPTGEVLGRSIFDLIHPDELLIVDQVFKGVMQMPKVSLGMAEY
RVQHKDGSWCVLEAVATNLLNEPSVRGIVVNCHDVTERKMAEEQLLHDALHDALTELPNR
ALLTDRLGQAFARAQRHPSEQFAVLFLDLDRFKVINDSQGHRTGDRLLVAVARRLLTCLR
PGDTVARLGGDEFVILLEEIKGVDEAIAQAKAILKTIERPLYLEGNKVLITASIGIALST
DKYQWPGDILRDADIAMYRAKALGKARYEVFTSAMHTRAVALMHLEHDLRESVEELNLKS
SIVDFACGTAAENSPMSEIDRRLERPKSPLTTLKLECPFTVYYQPIVCLKTGSVIGFEAL
VRWLHPERGLVSPMEFIAMAEETGLIMPLGLWVLNESCRQIIKWQSLNLPVGNSRLTVAV
NLSGRQFSEPESIEQIKQVLQETGVDARCLKLEITESVVMEDGEAAAAMLSQLRELGIDL
CIDDFGTGYSSLSYLHKFPINILKVDRSFVSRIGETGENLEIVRAIVMLARSLGMEVVAE
GVETAAQLAQMRAIGCEYGQGYFFSKPLDSEAATALLQRSPKW
NT seq
3012 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagatcgggagaaccagtcaatttctaatttaggtgaagtggggggtgtcggcgat
cgccatactgcgtcagaagcgctgtggctgcgcgatcgagccttggcagctactagctgc
ggcattgtcattgctgacgccaatgcaccagattgtcccataatttattgcaatccggcc
tttgaacggatgacaggttactgcgccagcgaaattttggggcgtaattgcagatttttg
caaggcccggataccgatcgaactactgtagctaagatccgcgaggccttgcgccaaggt
agagcaatccagacaccaatcaaaaattaccgcaaagacggcactcctttttggacaaaa
ttatcgctatctcccgtgcgagacgacaaggctaatttgactcactttgtaggagttcag
tctgacttgtcggaacccctatgtgaagtgcagcaagcattgcagcaagctaacgaccaa
ctgcaaacgattttggaagcagttccgggaacagtatcttggattagctcggatttgcgc
tatttgggggttaaccagcacttagccaaacttcacggtttggcgccgtcggcttttgtc
ggtcaagatattggttttctgggtgctagctcggattttaactcttttgtggtggagttt
tttgccggggacgctacggaagcggttaaagaactcaacattaaggtacaaaccgacggg
ggacagtccgagggatactatttgattgtggctcaaaagtacgatcggggcaaagcagct
tgtctggtagggattgacattaccgagcgcaagcgggcagaagaagctctggtgctgact
cgcaaggcggtggaaagttcgagcgacgcgatcggcatcagcgatgcgaacggcactcac
atctatcaaaatcaagcgttttctcagctatttgaatgggacacggcagaggaatttaaa
ctggccggaggtatatcggcagtttttgctgaccccgcagtcgccagggaggtactcgac
acgatcgcccaaggttattcttggtttggtgaaattaccaaccgcactaaaagcggtgaa
actttgcaagtgttgctgcgggccgatgctattaaagaccgcaaagggaaaattgtcggt
ctgatttacatgaataccgatattaccgaccaaaagcgcacggaacaagagctgcgacaa
agcgagaagcgctttcgatcgttgattgaaaatgctagagacattattgtgattctcgac
gagaaaggcttttgccgctatgtctctccttccctagagcggattttgggctacccgacg
ggggaagtgctcggccggtctatatttgacttgattcaccctgacgaattgctgatagtg
gatcaagtgttcaaaggtgtcatgcaaatgccgaaagttagcctgggaatggcggaatac
cgagtgcagcacaaggacggttcctggtgcgtgttggaagcggtggcgacgaatttgctc
aacgaaccttcggtgcggggaattgtggtcaactgtcacgacgtgactgagcgcaagatg
gctgaagaacaattgttgcacgatgctttgcacgatgcgctgacggagttgcccaaccgt
gctttgttgactgacaggttggggcaagcttttgcccgcgcccaacggcatccgagcgag
cagtttgcggtgctgtttctggatttggacaggtttaaggtgattaatgacagtcaggga
caccgcacgggcgatcggctgttggtggctgtggctcgccgtctcttgacttgtttgcgg
ccaggcgatacggtggctcgtctggggggagatgagtttgtgattttgcttgaggaaatt
aaaggtgttgatgaggcgatcgcccaagcaaaggcaattctcaaaaccatcgaacgaccg
ctttatttggaaggtaataaagttttaattactgctagcatcggcattgctttgagtacc
gacaaatatcagtggccgggagatattttgcgcgatgctgatattgcgatgtaccgggcc
aaagctctcggtaaagctcgctacgaagtttttaccagtgcgatgcacactcgggctgtg
gctttgatgcacttggaacacgatttgcgggagtcggttgaagaactaaatttgaaatct
tcgatcgtggatttcgcctgcgggacggcggcggaaaactcgccgatgagtgaaatcgat
cggagattggagcgtccgaagtcgccattgactactttaaaattggaatgtccttttact
gtttattatcagccgatcgtttgtttgaaaactggctctgttatcggatttgaggcgctg
gtgcgctggctgcacccggaacggggtttagtttccccgatggaatttattgcgatggct
gaggaaactgggttaattatgcctttgggtttgtgggttttgaacgaaagctgccgccaa
attattaagtggcagagtttgaatttacctgtgggaaattcgcggctgactgtagcagta
aatctttcggggcggcagttttcggaaccggagtcgatcgagcaaattaagcaagttttg
caggaaacgggtgttgacgctcgctgtttgaagttggagattaccgagagtgtggtgatg
gaagatggggaagcggcggcggcgatgctttcgcagttgagagagttggggatcgatctg
tgcattgatgattttggcactggttattcgtctctgagttatttgcacaagtttccgatt
aatattttgaaggtcgatcgctcttttgtcagtcgcatcggagaaacgggtgaaaatttg
gaaatcgtgcgggcgatcgtgatgctggcccgcagtttggggatggaggtagtggcagaa
ggggtcgaaaccgccgcccagttggctcaaatgcgggcgatcggctgcgagtacggtcag
gggtactttttctctaaacctctcgacagcgaggcagctacagccttattacagcgatcg
cccaaatggtga
DBGET
integrated database retrieval system