KEGG   Oscillatoria nigro-viridis: Osc7112_1394
Entry
Osc7112_1394      CDS       T02375                                 
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)
Organism
oni  Oscillatoria nigro-viridis
SSDB
Motif
Pfam: EAL PAS_9 GGDEF PAS PAS_3 PAS_4 PAS_8 PAS_11 PAS_6 DUF5319
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFZ05925
UniProt: K9VF92
LinkDB
Position
complement(1628235..1631246)
AA seq 1003 aa
MGDRENQSISNLGEVGGVGDRHTASEALWLRDRALAATSCGIVIADANAPDCPIIYCNPA
FERMTGYCASEILGRNCRFLQGPDTDRTTVAKIREALRQGRAIQTPIKNYRKDGTPFWTK
LSLSPVRDDKANLTHFVGVQSDLSEPLCEVQQALQQANDQLQTILEAVPGTVSWISSDLR
YLGVNQHLAKLHGLAPSAFVGQDIGFLGASSDFNSFVVEFFAGDATEAVKELNIKVQTDG
GQSEGYYLIVAQKYDRGKAACLVGIDITERKRAEEALVLTRKAVESSSDAIGISDANGTH
IYQNQAFSQLFEWDTAEEFKLAGGISAVFADPAVAREVLDTIAQGYSWFGEITNRTKSGE
TLQVLLRADAIKDRKGKIVGLIYMNTDITDQKRTEQELRQSEKRFRSLIENARDIIVILD
EKGFCRYVSPSLERILGYPTGEVLGRSIFDLIHPDELLIVDQVFKGVMQMPKVSLGMAEY
RVQHKDGSWCVLEAVATNLLNEPSVRGIVVNCHDVTERKMAEEQLLHDALHDALTELPNR
ALLTDRLGQAFARAQRHPSEQFAVLFLDLDRFKVINDSQGHRTGDRLLVAVARRLLTCLR
PGDTVARLGGDEFVILLEEIKGVDEAIAQAKAILKTIERPLYLEGNKVLITASIGIALST
DKYQWPGDILRDADIAMYRAKALGKARYEVFTSAMHTRAVALMHLEHDLRESVEELNLKS
SIVDFACGTAAENSPMSEIDRRLERPKSPLTTLKLECPFTVYYQPIVCLKTGSVIGFEAL
VRWLHPERGLVSPMEFIAMAEETGLIMPLGLWVLNESCRQIIKWQSLNLPVGNSRLTVAV
NLSGRQFSEPESIEQIKQVLQETGVDARCLKLEITESVVMEDGEAAAAMLSQLRELGIDL
CIDDFGTGYSSLSYLHKFPINILKVDRSFVSRIGETGENLEIVRAIVMLARSLGMEVVAE
GVETAAQLAQMRAIGCEYGQGYFFSKPLDSEAATALLQRSPKW
NT seq 3012 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggagatcgggagaaccagtcaatttctaatttaggtgaagtggggggtgtcggcgat
cgccatactgcgtcagaagcgctgtggctgcgcgatcgagccttggcagctactagctgc
ggcattgtcattgctgacgccaatgcaccagattgtcccataatttattgcaatccggcc
tttgaacggatgacaggttactgcgccagcgaaattttggggcgtaattgcagatttttg
caaggcccggataccgatcgaactactgtagctaagatccgcgaggccttgcgccaaggt
agagcaatccagacaccaatcaaaaattaccgcaaagacggcactcctttttggacaaaa
ttatcgctatctcccgtgcgagacgacaaggctaatttgactcactttgtaggagttcag
tctgacttgtcggaacccctatgtgaagtgcagcaagcattgcagcaagctaacgaccaa
ctgcaaacgattttggaagcagttccgggaacagtatcttggattagctcggatttgcgc
tatttgggggttaaccagcacttagccaaacttcacggtttggcgccgtcggcttttgtc
ggtcaagatattggttttctgggtgctagctcggattttaactcttttgtggtggagttt
tttgccggggacgctacggaagcggttaaagaactcaacattaaggtacaaaccgacggg
ggacagtccgagggatactatttgattgtggctcaaaagtacgatcggggcaaagcagct
tgtctggtagggattgacattaccgagcgcaagcgggcagaagaagctctggtgctgact
cgcaaggcggtggaaagttcgagcgacgcgatcggcatcagcgatgcgaacggcactcac
atctatcaaaatcaagcgttttctcagctatttgaatgggacacggcagaggaatttaaa
ctggccggaggtatatcggcagtttttgctgaccccgcagtcgccagggaggtactcgac
acgatcgcccaaggttattcttggtttggtgaaattaccaaccgcactaaaagcggtgaa
actttgcaagtgttgctgcgggccgatgctattaaagaccgcaaagggaaaattgtcggt
ctgatttacatgaataccgatattaccgaccaaaagcgcacggaacaagagctgcgacaa
agcgagaagcgctttcgatcgttgattgaaaatgctagagacattattgtgattctcgac
gagaaaggcttttgccgctatgtctctccttccctagagcggattttgggctacccgacg
ggggaagtgctcggccggtctatatttgacttgattcaccctgacgaattgctgatagtg
gatcaagtgttcaaaggtgtcatgcaaatgccgaaagttagcctgggaatggcggaatac
cgagtgcagcacaaggacggttcctggtgcgtgttggaagcggtggcgacgaatttgctc
aacgaaccttcggtgcggggaattgtggtcaactgtcacgacgtgactgagcgcaagatg
gctgaagaacaattgttgcacgatgctttgcacgatgcgctgacggagttgcccaaccgt
gctttgttgactgacaggttggggcaagcttttgcccgcgcccaacggcatccgagcgag
cagtttgcggtgctgtttctggatttggacaggtttaaggtgattaatgacagtcaggga
caccgcacgggcgatcggctgttggtggctgtggctcgccgtctcttgacttgtttgcgg
ccaggcgatacggtggctcgtctggggggagatgagtttgtgattttgcttgaggaaatt
aaaggtgttgatgaggcgatcgcccaagcaaaggcaattctcaaaaccatcgaacgaccg
ctttatttggaaggtaataaagttttaattactgctagcatcggcattgctttgagtacc
gacaaatatcagtggccgggagatattttgcgcgatgctgatattgcgatgtaccgggcc
aaagctctcggtaaagctcgctacgaagtttttaccagtgcgatgcacactcgggctgtg
gctttgatgcacttggaacacgatttgcgggagtcggttgaagaactaaatttgaaatct
tcgatcgtggatttcgcctgcgggacggcggcggaaaactcgccgatgagtgaaatcgat
cggagattggagcgtccgaagtcgccattgactactttaaaattggaatgtccttttact
gtttattatcagccgatcgtttgtttgaaaactggctctgttatcggatttgaggcgctg
gtgcgctggctgcacccggaacggggtttagtttccccgatggaatttattgcgatggct
gaggaaactgggttaattatgcctttgggtttgtgggttttgaacgaaagctgccgccaa
attattaagtggcagagtttgaatttacctgtgggaaattcgcggctgactgtagcagta
aatctttcggggcggcagttttcggaaccggagtcgatcgagcaaattaagcaagttttg
caggaaacgggtgttgacgctcgctgtttgaagttggagattaccgagagtgtggtgatg
gaagatggggaagcggcggcggcgatgctttcgcagttgagagagttggggatcgatctg
tgcattgatgattttggcactggttattcgtctctgagttatttgcacaagtttccgatt
aatattttgaaggtcgatcgctcttttgtcagtcgcatcggagaaacgggtgaaaatttg
gaaatcgtgcgggcgatcgtgatgctggcccgcagtttggggatggaggtagtggcagaa
ggggtcgaaaccgccgcccagttggctcaaatgcgggcgatcggctgcgagtacggtcag
gggtactttttctctaaacctctcgacagcgaggcagctacagccttattacagcgatcg
cccaaatggtga

DBGET integrated database retrieval system