Oscillatoria nigro-viridis: Osc7112_4198
Help
Entry
Osc7112_4198 CDS
T02375
Name
(GenBank) nitrogen assimilation regulatory protein
Organism
oni
Oscillatoria nigro-viridis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma54_activat
cNMP_binding
Fer4_5
Sigma54_activ_2
Fer4
Fer4_10
Fer4_2
Fer4_6
Fer4_16
Fer4_21
MIP-T3_C
Fer4_7
Fer4_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ08521
UniProt:
K9VKP7
LinkDB
All DBs
Position
complement(4970744..4973302)
Genome browser
AA seq
852 aa
AA seq
DB search
MSTETLVNWLESSTELGILSREILQAIAGEMEMSTYPPGFRVVIEDTPITHLYILERGQA
DRYRRKQPGLMWGSSLLPGAIVNLSALQRSQPADSRIITRTECQFWVISADRWRNLLERY
PRITEAYAQRLAAKLEQLEAEIAYERERQNALRSYLVPRAKRGVIGNSRYAVKLRQQVRA
ASSDGRSVLISGEPGLEKDNLAALIHFGSHRRNEPIIQIKSALLQANGAELFGRLGGKPG
LLEWLGEGTLILNDVQELPAQLCPQIQQLLTDGTYTLVVKEGQIPPPPRSSNARIILISE
MVLPQLDKLAQHKIKVPSLRVRKADLEAQVNYYLNIFSRQKKLVRPQVTPEAIRRLQAYD
FPGNLQELQGMVDRALVQAQGSQVLTEEVFWAQAAKQQKFRLNLLKIYPKFRQFLRSDWY
PDRVNYWFTTWVFAVVVITLFVAPQDRQHNFALNIFWAWWWPLILLLFPIIGRLWCAFCP
FMIYGEIVQKLSLKIFPRTLNKWPRQQAEKWGGWFLFGLFTLIFLWEELWNLENTAYLSS
CLLLLITAGAVIFSLIFERRFWCRYLCPIGGMNGLFAKLSIIELRAQQGTCGAECSTYQC
YKGGPGLGEGLTTNGCPIYSHPAQLTDNKDCVLCMTCLKACPHRSVELNLRPPGIELWTT
HVPHSYEIALLFLLLGGIYLHRLPEINSLLGLGINLEEFLPHLGLSIAVLIIPPMIPLIA
YAIIQAIYRLGQAETVPFTTYKPLSFVSLAYGYLPLVWGGSLAHYWRLGLQEGGRVIPVT
FATFGQIRDDLPSFIGDPAVISFLQGLTLIVSLLVTILVTQKIAKRSIKSLIPQHLASLC
LMVSLWYAIVGT
NT seq
2559 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaccgaaacattagttaactggctcgaatcgagcaccgaattaggcatattatcc
cgcgagattttacaggcgatcgccggtgaaatggaaatgtcaacttatccccctggattt
cgagtggtaatcgaagatacaccaatcactcatctctatatcctagaacgaggacaagcc
gatcgctatcgccgcaaacaaccgggattaatgtgggggagtagtttgttgccgggggcg
atcgtcaatttatctgccctccagcgatcgcaacctgccgacagtcgaattataactcgg
acagagtgtcaattttgggtaattagtgccgatcgctggcgcaatttgctagaaagatat
ccacgcattaccgaagcctacgctcaacgcttggcagcgaaattagaacagttagaagca
gaaattgcctacgaacgcgagcgtcaaaatgccctccgcagctatctagtaccccgggca
aaacggggagtcattgggaacagccgttatgcggtaaaattgcgccaacaagttcgggct
gcatcgagtgacgggcgatcggtattaatctctggcgaacctggtttagaaaaagataat
ttagctgctttaattcatttcggttcccatcgccgcaacgagccaattattcagatcaaa
agtgccttgcttcaggctaatggagcggaattattcgggcgtttgggcggcaagccgggg
ctgttggaatggttgggagaaggtacgttaattttaaatgacgtgcaagaattacccgct
caattatgcccccaaattcagcaattattaaccgatggaacctatacgctagttgtcaag
gaaggacaaataccaccaccgccgcgttctagcaacgcgcggataattttaatctcagaa
atggtcttgccccagctagataagctggcgcaacacaagattaaagtaccgtcattgcgg
gtgcgaaaagcagatttagaggcacaagttaactattatctcaacatcttttcccgccaa
aagaaattagtcagaccccaagtcacaccggaagcaattcgccgcttgcaagcctacgat
tttcccgggaatttacaggaattgcagggaatggtcgatcgcgctttagttcaagcacag
gggagtcaggtattaacggaagaagtattctgggcgcaggctgcgaagcaacaaaaattt
cggcttaatttattgaagatatatcccaaatttcggcaatttttacgcagcgattggtat
cccgatcgcgtgaattattggtttaccacttgggtatttgccgtagttgtaattaccctg
tttgtcgctccccaagatcgacagcataattttgccctaaatatcttttgggcgtggtgg
tggccgttaattttattattattccccatcatcgggcgattgtggtgtgctttttgcccg
tttatgatttatggggaaatcgtccaaaaactatcgctgaaaattttcccgcgcactctc
aataaatggccgcgccaacaagcagaaaaatggggcggctggtttctcttcggactattt
actctgatatttctgtgggaagagttgtggaatttagaaaataccgcctatttatccagt
tgtttgttattgctaattacggctggcgcggtaattttttccctcatcttcgagcggcga
ttttggtgtcgttatttatgcccgatcgggggaatgaatggattatttgctaaactctca
attatcgaacttcgcgcccaacaaggaacctgcggggcggaatgcagcacctaccaatgt
tacaaaggcggccccggcttgggggaaggattaactactaatggctgtccgatttattcc
catcccgcccaattaaccgataataaagattgcgtgttgtgcatgacttgcttgaaagct
tgtccgcatagatcggtagaattaaatctgcgccctcccggcatcgaattatggactacc
cacgttccccacagttatgaaatcgcgctgttatttctattgttgggcggtatctatctg
catcgcttgccggagataaatagtttgttggggctgggcatcaatttagaggaattttta
cctcatttaggactgtcgatcgcagtgttaattatcccgccgatgattcccctaattgcc
tacgcaattatacaggcaatttatcgattgggacaagcagaaaccgtgccatttacaacc
tacaaacccctctcatttgtctctctcgcctacggttatttacccttagtctggggcggt
agtttggctcactattggcgattgggtttgcaggaaggcgggcgagtgattcctgtaact
tttgccactttcggacaaattagagacgatttacccagttttatcggcgatccagcggtg
attagtttcttgcaaggtttaactttgattgtatcattattagtcacaatattggtgact
caaaaaattgccaagcggtcgattaaatctttgattccacagcatttagcgagtttgtgc
ctgatggtgagtttgtggtatgcgatcgtaggaacctga
DBGET
integrated database retrieval system