KEGG   Oscillatoria nigro-viridis: Osc7112_5010
Entry
Osc7112_5010      CDS       T02375                                 
Name
(GenBank) DNA/RNA non-specific endonuclease
Organism
oni  Oscillatoria nigro-viridis
SSDB
Motif
Pfam: Endonuclease_NS Lactonase Endonuclea_NS_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFZ09276
UniProt: K9VMV1
LinkDB
Position
complement(5984170..5989323)
AA seq 1717 aa
MFLTGSNVLADNFGDPKGSQFSDLVVKFYVGGKTYEGTILTNLSRELADNQFEVAVRVPD
TVPLGDSRIVLGRKQNEKVSQNPAEPATEILYNSNSYRIENDTEYVFGAQWTADRIAVLN
GSDAESVVATTNSSDLQIGNIAVGTDDRLDRARDLTVTSDGSRVYVPLEASGRVALVDPI
TRQQVDTKADVAGLNPIDLPSGASPRSIVLDSRDQYAYIADGKAGGNSIYVLDINPFSSK
YHQVTQTITVGTAPSGLRQMAISSDGKKLFVTAPNGLNSQIYVVNIDPKDRPSDPSQNPQ
KWNQLIGTVTADEGVEGLASTVDPLKMTFTNSGKDSKGFGVLDISNSDPVSFAATTRYAS
LGLGSDFDYFDVNEGVSVTVLPDASYAFVVGRNNDPKFFGQELPSVDGDPRAGSNIGIIK
DPLTNPQLVAATRPIPDGLTTDLVLSGDSKYLYASYPNLSGANGKVYVFDTEEFVKTVTN
PGQFQIDAKGRGVGLPLFDSTTARNATVADLSTVPIDNINPAVSVAADFQILIDANNQYT
YGVPPGSKRAPVAATNSRGLAATPLDWLDLTGPGGDTEDLTPTFEWEFDELPNQNVEEVN
LFLSVFDEGEGLLPWDEVVDLPDPNGNEFLFNQGLSKPEQLDLLTKPWNTSFYHSQENDF
NPNRILTATWQRDDDGIGKWTLDGGQTFIEGTNTSFTLPDNLTLTAGQEYNWAVEAWNKN
GSRNIEFGDFWTPILTEPDDGNDVFPSVTVLTHGFKPPFSAPFFDNPGIPSEFYQLGNSI
ANAGAEDNGLMMRYDLATGYWVPVTKYGAVAPDFPAGENPEDDVDYLTKLESYIAPYLDN
NQPLVLLNDWSNNNESAAPDSGFSEAVADTFFASLVQLDQLFIDENSTAKQGAIFNSPLH
FVGFSRGTVVNSEIIQRLGTHFPEAGGKENSDIRDLQMTTLDPHDFDQPGLNVVTDNFGD
FREPKVQVWENVTFADNYYQTVPNLLSGTVSPAGRDIPNLPSTEDGKTAPGLQFPREGWR
SENPDPDAPLLGEPDLSVFLGTNSNNPDYNDSRAGFTKETDPTVGIAGRGAVHGRVLSWY
GGTSDLFPTNFPFDEDLDVNPIFRRRGDGYREPLFDKDFSFSEIANSSARVTPWYTPEHS
FEHGVDGAPWEGIGTGWFYSVLGGGKEFRPQTNVERIPVDFDNTYDARMRGDFAVPTLFN
GNFDAVFNPQGGNRTIFSDAIPGWSFHNGETSASVTTNNLVDVNQLSATDAPALDAELDR
IGVDRTQANYALKLQSGKSITHNRFVVPESGTLRFNLHVPELTTNGKVKVSIKGNAPSDE
YQLLETVDGGTIDLRAADGRVNPGSSEIAYPVGYPDTDTYRIGYGDRGFETFHVDIPEEL
RGEVATLKFELTDGTVYLDDVFFQSISTKLGNPTFARPSETTHRENYLIEKPQYTLSYND
ATKGPNWVSWQLNKSWLGNTTRPSETVPPGYPPAGFPDGTYPASPVDYPWLGDNDLPSSW
VRTEGPDYRLNQRGMQKGHMTASADRNRTTKDIYSTFLTSNMLPQHRNNNQGAWQKFERN
IRTSLENPSVARDYYIVAGGYGYDPNNAIGNKVSVGPDGRTVLDPNGTWTVNPKEILIPD
FTWKIVVPLVAGQSIDDITANTEVVAIMVPNRASLVTPRDFPLPGETNRQITNWNNWQDW
RVSIDYLESLTGYNFLSNLPETIQEKIEERDNGLLPS
NT seq 5154 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgtttctgaccggaagcaacgttttagcagacaactttggcgaccccaaaggtagccaa
ttcagcgatttagtggtaaaattttatgtgggcggcaaaacttacgaaggcacaatatta
accaacctcagtcgcgaattagcagacaatcaatttgaagtagccgtcagagttcccgac
accgtacccttgggcgattcccggatcgtcctgggccggaaacagaacgaaaaagtcagt
caaaatccggcagaaccagcaacagaaattctctacaacagcaattcctaccggattgaa
aacgatacagaatatgtttttggggcccagtggacagcggatagaatcgccgtactcaac
ggttccgacgccgaatctgtcgtagccacaactaacagcagcgacttgcaaattggtaac
attgctgtaggtacggacgatcgactagatagagccagagatttgactgtaaccagcgac
ggttctcgcgtgtacgtacctctagaagcttccggtagagtcgctttggtcgatccgata
acccgacagcaggtagatactaaagcggatgtagctggcttaaacccgatcgatttgcct
agcggtgcatcgcctcgttctattgtacttgattcccgcgaccaatacgcttacattgct
gacggcaaagctggcggcaattccatctacgttctcgatatcaacccgttctcatccaag
tatcaccaagttacccaaactatcacagttggtacagcacctagcggtttgcggcagatg
gcaattagcagcgacggaaagaagctatttgttaccgcaccgaacggtttgaacagccag
atttacgttgtaaatattgaccccaaagaccgacccagcgacccaagtcagaaccctcaa
aagtggaatcaattaatcggaactgtaacagccgatgaaggcgtagaaggattagcttct
acggtcgatccgctgaaaatgacctttacaaacagcgggaaagatagcaaaggatttggg
gtactggatattagcaatagcgaccctgtaagttttgctgctacgactcgctatgcaagt
ttagggttgggttccgactttgattacttcgatgtgaatgagggagtttcggtaacagtt
ttaccggatgctagctatgcgtttgttgtgggtcgcaataacgatccgaaatttttcggt
caggaattgcccagcgtagatggagacccgcgggccgggagcaatatcggcattatcaaa
gacccgctgacaaatccgcaattagtagcagcaactcgaccaattcccgacggattgact
actgatttagtgctttctggtgatagcaagtacctctatgcttcctatcccaatttgagc
ggtgcgaacggcaaggtgtatgtttttgacactgaagaattcgtgaaaacagtgacaaac
cccggtcaatttcaaattgatgctaaaggtcggggtgtcgggctgcctttgttcgacagc
actaccgcacgaaatgctacggttgctgacctttccacagtacccatcgataatattaac
ccagcggttagtgttgctgctgacttccagattctgattgatgcaaacaaccagtatact
tacggcgtgccgcctggtagcaagcgagctcccgttgctgcgactaactctcgcggtttg
gcggcgacaccgctggattggttggatttaactggcccgggcggggatacagaagacttg
actcctacttttgaatgggaatttgacgaattgcccaatcaaaatgtagaagaagttaac
ctcttcctcagcgtattcgatgaaggtgaaggactgctgccgtgggatgaagttgtcgat
ttaccagacccgaatggcaacgaatttcttttcaatcaaggattgagcaaaccagaacag
ttggatttactgacaaaaccttggaatacttctttttaccacagccaagagaacgacttc
aaccccaaccgaattctgacggcaacttggcaaagagatgatgacggtattggcaagtgg
actttggatggcggtcaaacatttattgaaggtacaaataccagcttcacgctacctgac
aacctcactttgacagcgggtcaggagtacaactgggccgttgaagcttggaataaaaat
ggcagccggaacatagagtttggcgatttttggacgccaatattgaccgagcccgatgat
ggtaatgatgtcttccccagcgtaactgtgctgactcatggcttcaagcctccctttagt
gctcccttttttgataaccctggaattccttcagagttttaccaactcggcaatagtatt
gccaatgcaggtgctgaggataacggtttgatgatgaggtacgacctcgctactggttat
tgggttcctgttaccaaatatggagcggttgcgccagatttcccagcaggtgagaatcca
gaagacgacgtcgactatctcaccaagttggagagttacatagctccataccttgacaac
aatcaaccgttagtgctgctcaatgactggtcgaataataatgaatcggcagctcctgat
tcaggttttagcgaagcagtggcagatactttctttgcttccctcgtgcagttagaccaa
ctgttcattgatgaaaatagcacggcaaaacaaggagcaattttcaactcaccgctgcat
tttgttggtttcagtcggggaacagttgttaacagcgaaattattcagcgtttgggtact
cattttcctgaagcgggtggcaaagaaaactctgatattcgcgaccttcagatgacaact
ttagacccccacgatttcgaccaaccggggctaaatgtggtgacagataatttcggcgat
ttccgcgaaccgaaggttcaggtttgggagaatgtcacttttgcggataattactatcag
acagtaccgaatttattaagcggtacggtttcgcctgcgggccgggatattcccaatctt
ccatctacagaagatggaaaaacagctcccggacttcagtttccgcgagaaggttggagg
tcagaaaatcccgatccagatgctccgctgttaggagaaccggatttgtcggttttcctg
ggaaccaatagcaataacccagattataatgacagccgtgctgggtttaccaaggaaaca
gatcctactgttggtattgccggcaggggagccgtacacggacgtgttttgagttggtat
ggaggaacatctgacttgtttccaactaacttccccttcgatgaagacttagatgttaat
cctattttccgccggcgcggtgatgggtatcgcgaacctttgttcgataaggacttttca
tttagcgagattgcgaacagttctgctcgggttacaccttggtatacgccggaacacagt
tttgaacatggtgttgatggtgctccttgggagggaattggtacggggtggttttattcg
gttttgggcggcgggaaggagtttcgtccccaaacgaatgtagagcgcatcccggttgat
tttgacaatacttatgatgccagaatgcggggagattttgcggttcctactttgtttaac
ggcaatttcgatgctgttttcaatccgcagggtggtaatcggactattttttctgatgcg
attcctggttggtcttttcataatggtgaaacgtcagcgagtgtaactacaaacaatctc
gttgatgtgaatcagctatctgcaacggatgctccggctttggatgcggaactcgatagg
ataggagtcgatcggactcaagcaaattatgctctgaagctacaatcaggtaaaagtatt
actcacaaccgttttgtggtgcctgagtctggaactttgcggttcaatcttcacgtacct
gaacttaccaccaatggaaaagtcaaagtttctatcaaaggcaatgcacctagcgatgaa
taccaactgttagaaactgttgatggtggtacgatcgatctcagagcagcagatggtcgc
gtcaatccaggttcttctgaaatagcttaccccgtaggctatcccgacaccgatacttac
aggattggttatggagacagaggatttgaaacattccacgtagatataccagaagaattg
cgaggcgaggtagcgactctcaagtttgaattaactgacggcactgtttatctggatgat
gttttcttccaaagcatttctaccaaacttgggaatcccacctttgcccggccttctgaa
actactcaccgtgaaaactacctaatcgagaagccacagtacacgctttcatacaacgat
gctaccaaaggccccaattgggtgagttggcaacttaacaaaagttggttaggtaataca
acaagaccatcagagactgtcccacctggctatcctcccgcaggttttccagatggaact
tatccggccagcccagtagactatccctggcttggagataacgatctgcctagtagctgg
gtgcgtacagaggggcctgattatcggttgaaccagcgtgggatgcaaaaaggacacatg
actgcttctgccgatcgaaaccgcaccactaaggatatttactctacattcctcacctca
aatatgctgcctcagcatcgtaataataatcaaggtgcatggcaaaaatttgaacgcaat
attcgtacctcccttgaaaatcccagtgtagcgagagattattacattgttgctggcgga
tatgggtacgatccaaataacgcgattggaaataaagtttcagtaggcccagatggtcgc
acggtactcgatcctaatggaacttggacagtgaatcccaaagaaattttgattcctgat
tttacttggaaaattgtagtacctctggttgcaggtcagagtattgacgacattacagct
aacacggaagtggttgctatcatggtgcctaatcgagcatctctggttactccgagagac
ttccccctgccaggagaaaccaaccgccaaatcacgaattggaataactggcaagattgg
cgcgtgagtattgattatttagaaagcttaacaggatataacttcctgtccaacttacct
gagactattcaagagaaaatagaagagagagataacggattactgcctagttag

DBGET integrated database retrieval system