Oscillatoria nigro-viridis: Osc7112_5670
Help
Entry
Osc7112_5670 CDS
T02375
Name
(GenBank) pentapeptide repeat protein
Organism
oni
Oscillatoria nigro-viridis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pentapeptide
Pentapeptide_4
Pentapeptide_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ09884
UniProt:
K9VQQ4
LinkDB
All DBs
Position
6772325..6773764
Genome browser
AA seq
479 aa
AA seq
DB search
MEMNVGDFLHRLDLRGQALKGTNLGGAELRGANLRGTDLRETNLSGAMLRYADLIEADLS
GANLSGADLAESFLNLANLTRADLTGAVLREANLVGVEFTGANLKQASLIKANLVGANLH
EANLTRANLSGADLRGSQLSGAILDKAVYNNRTIFPEDIDPGAMGAFLLAPNASLPGLNL
AMVDLTEADLKGADLRRTNLYKAILFGAKLDRANLAGANLSAADLREASLSGTILEKAVY
SNKTLFSEGIDPALGGAYLIAPNVSLQGVNLTGADLNGSDLSGANLSASNLTSVNLKNVD
LSRASLKKAYLKGANLEGTDLRGADLSGAILHQVNLSSADLRGVDLTRADLSGANLRDAD
LRETDFTGATLLFANLSGADLRGVDLTKADLSGAKLNEADLRKADLMRVNLEGADLTEAD
LSDAHLFRVNLRGANLKGTNLKGASLKGVFLTDAYLSETDVTDIDLSPNFFELPLESEW
NT seq
1440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatgaacgttggtgactttctgcaccgactcgacctcaggggacaagcacttaaa
ggcaccaaccttggcggtgcggaactccggggagccaacctccgaggcacggatctccga
gaaaccaacctcagcggcgctatgctcaggtatgcagacctgattgaagccgacctcagc
ggtgcaaatctcagcggggcggatttagctgaatcatttctcaatttagctaacctcact
agagccgatttgactggtgctgtcctccgagaagctaatctcgtaggagtcgaattcacc
ggcgccaacctcaaacaagcaagtttgatcaaggctaatttagttggagccaatctccac
gaagccaacttaaccagagccaacctcagcggagccgatttgcgcggttctcagttgagc
ggtgccattttagacaaggccgtatacaacaaccggactatctttcccgaggatatcgat
ccgggtgcaatgggagcatttttgctagctcccaatgcttcgctccccggcttaaatctg
gctatggtagatttgaccgaagccgatttaaaaggagccgatttgcggcggacaaactta
tacaaagctattttatttggcgccaaactcgatcgggcaaacttagcaggagccaacctc
agcgcagcggacttgagggaagccagtttgagcggcacgattttggagaaagctgtttac
agcaacaagactttgttttcagaaggcattgaccccgctctggggggagcttatttaatt
gctcccaatgtatcgctgcaaggggtaaatttaaccggagccgacttaaacgggtcagat
ttaagcggagctaatttgagcgcttctaacttaacttcggtcaatctcaaaaatgtagac
ctcagcagagctagcttaaaaaaagcttacctcaaaggtgcaaacttggagggaactgat
ttaagaggagccgatttaagcggcgcaattttacaccaagtaaacttgagttctgctgac
cttcggggtgtagacttaacaagggctgacctcagcggcgctaatttaagggatgccgat
ttgagggagacagatttcaccggagctactttgctgttcgctaacttgagcggggccgac
ttgagaggtgtagacttgacaaaagctgacctcagcggcgctaagttaaacgaagccgat
ctccgaaaagcagatttgatgagagtaaatttggagggagcagatttaactgaggccgac
ttgagcgatgctcatttattccgagttaatctcagaggtgctaacctgaaaggtactaac
ctcaaaggcgcaagtttaaaaggggtatttttgactgacgcttatttgagcgaaacggat
gtgacagatatagatctgagtccgaatttttttgaattgccgctagaatcggaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
