Oceanisphaera profunda: CBP31_02675
Help
Entry
CBP31_02675 CDS
T04856
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
opf
Oceanisphaera profunda
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_4
Big_9
Cadherin_5
VWA_2
VWA
HYR
T2SSF_N
DUF5801
HemolysinCabind
vWA_Rv0959
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ART81669
UniProt:
A0A1Y0D2D2
LinkDB
All DBs
Position
complement(603724..608076)
Genome browser
AA seq
1450 aa
AA seq
DB search
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NT seq
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+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system