Oceanisphaera profunda: CBP31_12885
Help
Entry
CBP31_12885 CDS
T04856
Name
(GenBank) heme lyase NrfEFG subunit NrfE
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
opf
Oceanisphaera profunda
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
opf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
opf02000
]
CBP31_12885
Transporters [BR:
opf02000
]
Other transporters
Others
CBP31_12885
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
SPC25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ART84056
UniProt:
A0A1Y0DA28
LinkDB
All DBs
Position
2909078..2911063
Genome browser
AA seq
661 aa
AA seq
DB search
MIPELGQFSMILALAASLILSIYPLIGASRGNASMMLLARPLAYAMFGFLLFSFGCLTWA
FIDHDFSVIYVASNSNSLLPLEYRISAVWGAHEGSLLLWVLILAGWAAAVARFSRTLPLD
AVARVLSVMGMIAVGFLLFVIVTSNPFARTLPFFPIDGRDLNPMLQDPGLIFHPPMLYMG
YVGLSVAFAFAIASLMTGKLDAAWARWSRPWTMAAWIFLTAGIALGSWWAYYELGWGGWW
FWDPVENASFMPWLAATALIHSLVVTEKRATFKAWTVLLAIMAFSLSLLGTFLVRSGVLV
SVHAFASDPTRGLFILIFFMLVVGSSLLLYAIKGAQVKSHGKHELASRESMLLGNNIMLM
AGLFVVLVGTILPLIHKEIGLGSISIGAPFFNGIYAWLIIPFALLMGAAPLFRWRRQSMK
EINGKLVLALVAAAAIGVALPWYFAEEFKVWAAIGLSLGAFIVITSVQETWVRATHRHSF
GTGIRKLGNSHWAMFLGHLGMAVTIIGISCTQLYSIEKDVRMATGDSVTFSGYTFTFEGT
KHADGANYQGFKGVIAVSKDGKVLPPLKPEKRLYLVQRMPMTEAAISAGITRDLYAALGE
ELDDGSWAVRLYYKPFIRWIWFGTLFMVIGGIIAIVDKRYRIGGKTFASKTITGKKEQEA
L
NT seq
1986 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
attattcccgaattagggcaatttagtatgatactcgcgctggccgcgagtttaatccta
agtatttatccgctaattggcgcctctcgtggtaacgccagcatgatgttgctagcgcgc
cccttggcttatgccatgtttggctttttgctgttttcatttggctgcttaacttgggcc
tttatcgaccacgactttagcgttatttatgtggcctctaactccaacagcttactcccc
ctggaatatcgtatttctgcggtgtggggtgcccacgaaggctccttactgctgtgggta
ctgatcctcgcgggttgggcggcagccgtggcgcgttttagtcgcaccttgccgctggat
gccgtggcgcgggtgttaagcgtaatgggcatgatagctgttggcttcttgctgtttgtg
attgtcacctctaatccctttgcgcgtaccttgccgtttttcccgatcgatggtcgtgac
ttaaaccccatgctgcaagaccctggactaatcttccatccgcctatgttgtatatgggt
tatgtgggcttgtcggtggcgtttgccttcgccattgcctcattgatgaccggtaaattg
gatgcggcttgggcccgttggtcacgcccgtggaccatggcagcttggatatttctcact
gcaggtatcgcactgggctcatggtgggcgtattacgagctaggctggggcggctggtgg
ttctgggatccggtagaaaacgcttcctttatgccatggttggcggccaccgccttgatc
cactcactggtggttactgaaaagcgcgccacctttaaagcgtggaccgtattgctggcc
attatggcgttctcactgagcttactcggtactttcttggtgcgctcaggcgtcttggta
tcggtacacgcctttgcctcagatcctacgcgtggtttgtttatcttaatcttctttatg
ttggtggtgggcagctccttgttgctgtacgccattaaaggcgctcaagttaaaagccac
ggtaagcatgaattagccagtcgcgaaagtatgttgctgggtaacaacatcatgctgatg
gccggtctatttgtggtgctggtgggcactatcttgcctttgatccacaaagaaataggc
cttggtagtatctccattggtgcacctttctttaacggcatttatgcttggctgattatt
ccctttgccctgttaatgggtgccgcaccgctgtttcgctggcgccgccagagcatgaaa
gagatcaatggcaaattagtgttggcattggtggcggccgccgccattggtgtggcactg
ccttggtactttgctgaagagtttaaagtgtgggcggctatcggcttgagcttgggcgcc
tttattgtgatcaccagtgtgcaagaaacttgggtgcgcgccacccacaggcacagcttt
ggcaccggtattcgcaaactcggcaacagccactgggccatgttcctcggccacttaggc
atggcggtgaccattattggcatcagctgtactcagctgtatagcattgaaaaagacgtg
cgcatggccactggcgatagcgtgactttctctggttataccttcacctttgaaggcacc
aaacacgcagacggcgctaactatcaaggctttaagggggtgattgcggtcagcaaagac
ggcaaagtgctgccaccgcttaagcctgaaaaacgcctgtatttagtgcagcgcatgccg
atgactgaagcagccattagcgccggtattacccgtgacttgtatgcggcattgggtgaa
gagttagacgatggctcttgggcagtgcgtctgtattacaaaccctttattcgttggatt
tggttcggtactttgtttatggtcatcggtggcatcattgccattgtggacaaacgctat
cgcattggcggtaaaacttttgccagtaaaactattaccggtaaaaaagagcaggaggcg
ctatga
DBGET
integrated database retrieval system
