Zophobihabitans entericus: IPMB12_05120
Help
Entry
IPMB12_05120 CDS
T06493
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
Organism
orb
Zophobihabitans entericus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
AraC_binding
Cupin_2
HutD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIQ21111
UniProt:
A0A6G9IA62
LinkDB
All DBs
Position
1133548..1135911
Genome browser
AA seq
787 aa
AA seq
DB search
MSAKSLSEYNLTANQKTLFHHNGYNGVTLLYVIKGQVDVTSEELCVTLYTGDLLLINNNT
EYEIQSEQENIVITLEVSNFYFSRYYKNYFYHKYILLPQNYADFKRKYVENIQLLLAKMM
VAYIKSSEEAALEINRQLSEILLILVSFFKEKNISTYKNNSAYSSRIEKTIQFLDSHYNQ
DVSLQKMAEREHVSFAYLSRLFKKEVGIGFMQYLTKLKFQHAVHDLINTSKPVYRIIEDH
GFSNTKQFINLFKKVYNNTPNQFRNEYKKKPDRAIFIKKHVEIEEMKVKEANINEVVSIL
SDIINNSGSREYTLEQYSHTEEQVISLSGKVKSEGFTTLEHIVTIGELNELLKEDVRQQI
VMLKQASHINYVDTYHLISGNTILPEFATDEPIPTYSPYNNSDIALSFLKQHNIHLFVRL
YHANIREDPYAYIEKSTKFFKHCISLYGFDYVKKWQFVYYIEDKQAVSHRDLETCYFLVR
DSIKAYLPDAKVGFYYPASEEIQFKTDPFFTSDIAKSMDFFGYTASFSEHIDLDKISNKP
FGNEITYIQEKTKHIKQGLKFHGINIPLVLMKWNSLTGNTRHTNGSFFRAALIFHTLLDL
AHHINSVGISLNTEIQQETQVGHIDVSGIAAFYLFNTKRPLFYVLQFMDKLKGKIIAQGD
GYLVTKTYFGYQVVLTNLSVFNPYLSVQEHLTQSFKKRKIMTFHGIESGQYQIRKYIFDQ
QHGALYKQYERFQTKYGRDYEVFDYLNRNTMPDFTVYDESINNEQWTVLSELDINAIHFY
ELKKAME
NT seq
2364 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcggcaaaaagcttgtctgaatataacctgacggccaatcaaaaaacgctatttcac
cataatggctataatggagtgactctgctctatgtgattaaagggcaggtggatgttacc
agtgaagaactctgtgtcacactctataccggtgatttgctgctgattaacaataatact
gaatatgagattcaaagtgagcaggaaaatattgtgattactctggaagtctcaaatttc
tacttttcccgttattacaaaaattacttctatcataaatatattttactgccacaaaac
tatgctgattttaaacgcaagtacgttgaaaatattcagttattactagccaaaatgatg
gtggcctatattaaaagtagtgaagaagcggcacttgaaatcaatcgccaattatcagaa
attctgttaattctggtctccttttttaaagaaaagaatatttcgacctataaaaataac
agtgcttatagttccagaatagaaaagaccattcagtttttagatagtcactataatcag
gatgtgtctctgcagaaaatggctgaacgggaacatgtttcttttgcttatctttcccgt
ctgtttaaaaaagaagtgggtattggttttatgcagtacctgactaaacttaaatttcag
cacgcggtacatgatttaattaatacctctaaaccggtttatcgcattattgaagatcac
ggtttttctaatactaagcaatttattaacctgtttaaaaaagtgtataacaacacgcct
aatcagtttcgtaatgaatataagaagaaacccgatcgcgctatctttattaaaaagcac
gttgaaatagaagaaatgaaagtcaaagaggcaaatattaatgaagtggtgtctattctc
agtgatattatcaataattcaggaagccgtgaatacacattagaacaatattcacataca
gaagaacaggtgattagcttatcaggcaaggtcaagtcagaaggatttaccacactggag
catatagtcactattggtgagcttaatgagttattaaaggaagatgtcagacagcagatt
gtgatgctcaaacaagcatcacatattaattatgtggatacttatcatttgatttcgggc
aataccattttgccggaatttgcgaccgatgaacccattccgacttattctccttataat
aacagcgatatcgccttgtcgtttttgaaacaacacaatattcatctgtttgtgcggctt
tatcatgccaatattcgtgaagatccttatgcgtatatcgaaaaatccaccaagttcttt
aaacactgtattagtttgtatggatttgattatgtcaaaaaatggcagtttgtttattat
attgaagataaacaagcggtgtcacatcgtgacctggaaacatgttatttcttagtccgt
gattccattaaagcctatttaccagatgctaaagtgggtttttattatcctgcttcagaa
gagattcaatttaaaactgatccattttttacctctgatatagcaaaatccatggatttt
tttggttacacggcaagttttagtgaacatattgacttagataagatttctaataaacct
tttggcaatgagatcacctatattcaggaaaagaccaaacatatcaaacaggggctgaag
tttcatgggattaatattcctttagtcttgatgaaatggaactccctgaccggtaatacc
cgtcatactaatggtagtttcttccgggcggcattaatttttcatactctattagattta
gcacatcatattaatagtgtcggaatctcacttaatactgaaattcagcaggaaactcag
gtagggcatatcgatgtaagtggtattgctgcattctatctgtttaatactaagcgccca
ttgttctatgtactgcaatttatggataaattaaaaggtaaaattattgcccagggtgat
ggctatctggtcacaaaaacctattttggctatcaggtagtgctgaccaatctttctgtt
tttaatccctatttatccgtacaggaacatcttactcaaagctttaaaaaacgtaaaatt
atgacattccatggtattgaatcaggtcaatatcagattcgaaaatatatctttgatcag
caacatggtgcgctctataaacagtatgaacgctttcagaccaaatacggccgggattat
gaagtatttgattatctgaatcgtaataccatgccggatttcactgtttatgatgagtct
atcaataatgaacagtggacagttctgagtgagctggacattaacgccattcatttctat
gaactgaaaaaagcgatggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system