Zophobihabitans entericus: IPMB12_07555
Help
Entry
IPMB12_07555 CDS
T06493
Symbol
mscM
Name
(GenBank) miniconductance mechanosensitive channel MscM
KO
K22051
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
orb
Zophobihabitans entericus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
orb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
orb02000
]
IPMB12_07555 (mscM)
Transporters [BR:
orb02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
IPMB12_07555 (mscM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
DUF3981
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIQ21552
UniProt:
A0A6G9ICK0
LinkDB
All DBs
Position
1654778..1657441
Genome browser
AA seq
887 aa
AA seq
DB search
MNVENSRYRKVKRYFVKALLSSILLFSTGLALAEEITPPEEPKFDFELVLQDLADQNSEL
KQQRALQEEQLSYIINEQNNISTQINHVQNTLNTLDEQGEWLSFSTALGETLRQQLLRLP
EKPKSQPLDEDIAEIRVKQLNYNDQLVTLDENVEIIEPMANSKQLASYRRLVREQRDLLK
ALQLNSDAQILELTKLKIANKQLIDAIDNVFEAAHRYFFWVADVNPVSTSYPVSLARDIG
YVFFSADTFSQLLGATGEILTSVGTFILLLLAIVFVVIHFRFQARYLQFLEQNSTRVGKV
TQDHYMLTIRVVCYSLLMALPIPVLWGVLGYCLKSAWDYPVAVALGHGVNAAAPVLWVFM
ISAYFAEPKGLFITHFGWPSERVQSAMKYYRLSVWVVIPLVMLVIAFGNYHNGQFAATLG
RFCFILLCFALIFMTTALHKAGVPLYIDKKGNGNNLFSRILWIILLSAPWLAILAACLGY
LSTSQVLLGRLEASVVIWFGLLVIYFMIRRWMLIQKRKIEFERAKQRRLERLAQRNKSFV
EDDSSNNDSVDEPVVDLDVISSQSLQLVRSILVMIALICMIVLWSELHSAFAFMENITLW
HSKAATAGGTELDQNITLASVFIAILVMTITVQLVKNLPALLELGILQHLDLTPGTGYAI
STLTKYIILMIGCIIAFSFIGIDWSKIQWLIAALGVGLGFGLQEIFANFVSGLIILFEKP
IRIGDTVTIRDLTGNITKINTRATTIVDWDRKEIVMPNKAFVTEQLINWSLSDSITRIVL
TVPATIDADSNLIIEILKEAAIDCSYVLNDPEPQVFLVDIQEGIQLFELRVFAAEMGHRM
PLRSEIHQLILSEYRKRDLELPFPPLQTNLEAIGRKSGRRTYNVGTL
NT seq
2664 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtagaaaatagtaggtacagaaaggtaaaacgctattttgttaaagccctgctg
agcagtatattactattttctaccggactcgcgctggccgaggaaattacgccgccagaa
gagcctaaatttgattttgaactggttctgcaagatttagctgatcaaaatagtgagctg
aaacaacaaagagcactacaggaagagcagctaagctatattattaatgaacaaaataat
atttcgactcagataaatcatgtccaaaacaccctaaatacgcttgatgagcaaggtgaa
tggctaagtttttcaaccgctctgggtgaaacattacgtcaacaactcctacgtttacca
gaaaagccaaaatctcagccacttgatgaagatatcgctgagattcgggttaaacagctt
aattacaatgatcagttagtcactctggatgaaaatgttgaaatcattgagccgatggct
aacagtaagcagttggcgtcataccgtcgtctggtgcgtgagcaaagggatttactaaaa
gcattacaacttaatagtgatgcacagattctggagctgactaaattaaaaattgctaac
aagcagttgattgatgcgattgataatgtgtttgaagcggcgcaccgatatttcttctgg
gttgctgacgtcaatccggtatcaaccagttatccggtaagtctggcacgtgatattggt
tatgtctttttctctgctgatactttctctcaattacttggtgccacaggggaaatctta
acttctgtcggtacctttattttgcttctgctggcaattgtttttgtggttattcatttc
cgctttcaagccagatatttacagtttttagaacaaaatagcacccgggttggcaaggtg
acacaggatcactatatgctaacgattcgtgttgtctgttattcgctactgatggcttta
ccaatcccagtactttggggtgtgcttggttattgtttaaaaagtgcctgggattatccg
gtagccgtggcgttggggcatggtgtgaatgcggcagcaccagtactttgggtctttatg
atcagcgcttattttgctgagccaaaaggcttgtttattactcattttggctggccaagt
gaacgtgttcagtcagcgatgaagtattaccgtttatctgtctgggtcgtgattccgctg
gtgatgctggtgattgcatttggtaattatcataatggtcagtttgccgcgacgcttggt
cgattctgttttattctgctctgttttgctcttatttttatgacaacagcactgcataaa
gcgggtgtgccgttatatatagataaaaagggtaatggtaacaatctgttcagccgaatt
ttgtggatcattttgttatctgctccgtggctggcaattctggctgcctgtttaggttac
ctgtcaacgtcacaagtattactcgggcgtcttgaagcatctgtcgttatctggtttggt
ctgcttgtcatttactttatgattcgtcgctggatgttaattcaaaaacgtaagattgaa
tttgaacgggctaagcagcgacgtctggaacgacttgctcagcgtaataagagctttgtt
gaagacgacagtagtaacaatgatagtgttgatgagccggtggtcgatttagatgtgatc
agttcccagtctttacaactggtacgctcgattttggttatgatagcgttaatttgtatg
atcgtactctggtcagagctgcactctgcttttgcctttatggaaaatattactctgtgg
cattcaaaagctgcgaccgctggtggtaccgaactggatcaaaatatcacgctggcttct
gtctttatcgctattttagtgatgacaataacggtacagttagttaaaaatctgccagca
ttacttgaactgggaattttgcagcatctggatttaacgccaggtaccggttatgccatc
tcaacgctgactaaatatattattctgatgatcggctgtattattgccttctcgttcatt
ggtatcgactggtccaagattcagtggcttattgccgctcttggtgttggccttggtttt
ggtttacaagagatctttgctaactttgtgtcaggtctgatcattctgtttgaaaaacca
attcgtattggtgatacagttacgattcgtgatttgactggtaatatcactaaaataaat
acccgtgcgaccacgattgttgactgggacagaaaagagattgtgatgccaaataaggca
tttgtgacagagcagctgattaactggtcattatcagactctattacccgtattgtttta
acagttccggcgacgattgatgcagatagtaatttaattattgagatcttaaaagaggcg
gctattgattgcagctatgtgcttaatgatcctgaaccacaagtcttcttagtggatatt
caggaagggattcagttatttgaactgcgtgtatttgctgcagaaatggggcatcgtatg
ccgctgagaagtgagatccatcagctgattttaagtgaataccgtaaacgtgatctggaa
ttaccattcccgccactgcaaactaatcttgaagcgattggtcgtaagagtggacgccga
acctacaatgttgggacactatag
DBGET
integrated database retrieval system