Oenococcus sicerae: DLJ48_01810
Help
Entry
DLJ48_01810 CDS
T05833
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
osi
Oenococcus sicerae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
Collagen_bind
SdrD_B
bMG3
CarboxypepD_reg
Big_8
Gram_pos_anchor
Cupredoxin_1
DUF2606
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QAS69346
LinkDB
All DBs
Position
complement(347677..352998)
Genome browser
AA seq
1773 aa
AA seq
DB search
MNKMFQRLYAILMALVISFQYVGIGAQAVSATTSDSSDNSIHLTSLLPVSGSTNEFTLKV
HVTATTDSDYKIALDSPLAFKTAAEQQSKDTDLVSYLLNDDNVEIKAKAGTDNDVSISLN
LDSSKIAETSQIKLTYETQSVSADIASQTAASSSSSSAASSSAATVKKAATVRSAAVTDP
HDISQYLPASDNGTIIDSADFKFTDSKGNSVDPTKVDQNTNITLDYNWSIPNKLSGHTLA
SGDYFTFKLPAGVQYKAGQGDLGTYGTYTIAADGTVTFTFNDNVNTNDTISGTFGYTSQI
TSTTTTGEQTITIPTKTEPSTTTIVVNPNGGNTIAKTGTLTGANSSNNNPTGITWDVTIN
TIGAELDNATVIDPMPSSTDGTVPTTLKTTTIYPLTVNLNGNVTSTGPALVAGTDYTVDG
SGKITFIGKYAKTYSAFKIEYTSDIDSSKLPDDGGQVSFKNTATLSNNGTNYPASATVDA
NYGKLIAKSYDGQDNNGSQKYNWHIDYNYGEKSLAANTSIVDTLSTGQAFSGTPTLVYED
GTTVDASLYAITYNSDKSQMTVTFPNGLTKGVKISYQSQLTDPNDTNTVISNSASSNGQT
SDPGNQTVGQQGLTKSLGDVDYNSKTLTWNFDINMARQDMSNWSMTDTAPNGLTVIPTSF
VLKDKDTGVTYKEGTDYTVTIDSVGSGFTIEFSGSLKSHAKDWYTLSYQTTFDTNNLPSS
GKWTNNATTTWTDQSGKTHHNDGSADFTPNDDFKNDGSKSGAYNAVNKHITWTVVGNYNQ
RTLTSASIVDPIIGNQTYVADSAKLYEATINKDGSYNLGTQVTTTSINYDSGTKTITANL
PEGSTKTYVLTFDTDLSGTLIGVNPSSPETSTPYTNTATYTNNSKSSDLTASISIPKAGE
YVKKSGTQDPTNSAYATYHIWVNRSQSTLSNVVVDDVPDGKQIIDESSIVVYSTKVAQDG
TVTEDTTKPLQLNQDYTVKLTTDPTTGQQELLITFNGQITTAYSIRYRSLINSSSTNDTL
SNSVTITGDNTKSISQTTTTNTQVVNNSGSASGKNTNLVITKTDSASKKPLAGASFSLYS
DNNGVKGQLLRSATTDANGQLTWNNLKSGNYILVETAAPDSYIIPTDLANGKEISVNYSD
ADSNNNVQLPESNTQGNITLTKTDSDTQAVLPGATFSLYGSAGNLIKAGLTTDANGQIKY
SGLDAGSYYFVETSAPTGYTFDSSKHYTVTLNSDNISGTVNVADAEKTGSVILYKVDSDT
NQALSGATFTLYKANGTGVASNLTTDAAGQIKVGDLKPGNYYFVETSAPAGYTFDSTAKY
TFAITIGDQSQSVIVNAGNAEKRGSVVLTKTDADAFDPTVVAGAVFDLYKAGQSTASVTG
LTTDNNGQIKVSGLQPGNYYFVETKAPTGYVLDAAHHNFTVAFDQVTAIGVSVADAEKTG
SVLLTKTDSDTNKVLANAAFSLYKKDGTLLKSNLTTNANGQISYDGLKPGDYYFVETSAP
AGYTFDSTKQYAFTIVLGDQTTPVTVSSQNAEKTHSVLLTKTDSSDAAKTLSGATFSLYK
KDGSLVKDKLTTDAKGQLSYDGLKPGDYYFLETSAPAGYNFDSTKQYAFTIDISDSTDPV
VVSAQNAEKTGSVVLTKTDAKTNKTLAGAVFDLYKANGTKIQSGLTTNAKGQIVVANLKP
GDYYFVETKAPAGYTLNAGKHYAFTITIGDQTAAASVSVKDTKKPTQTAWTTVHKELPHT
GEQVFYFSAITATMLAISAAAAALALKRKREQK
NT seq
5322 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaatgtttcaaagactgtatgccattttgatggcacttgtcatttcttttcaa
tatgtcgggatcggtgcgcaagctgtttccgctacgacaagtgattcatctgacaacagt
atccatttaacaagccttttgcctgttagcggcagcacgaatgaatttacgttaaaagtt
catgtgactgccacgactgacagcgattacaaaattgctttggacagtccgctggccttt
aagaccgcggctgaacagcaaagcaaagacacagatctcgtgagctatctgctcaacgac
gataatgtcgaaattaaagcaaaggctggcacagacaatgatgtctcgatctcattgaat
ctggacagctctaaaattgctgaaacgagtcaaattaaattaacatatgaaacacaatct
gtttcagctgatattgcctcacaaactgcagcaagcagttcatcgagctcggcagcaagt
tcttctgcagcgacggttaaaaaagcagcaactgttaggtctgctgcggtaactgatcct
cacgatatctcgcaatacttgcctgcgtctgataatggcacgattatcgattctgctgat
ttcaaatttacagattcgaaaggcaattcagttgatccaacaaaggtggatcaaaatacg
aatatcacgttggattataactggtcgattccgaataagttatcgggccatacattagca
tccggtgattatttcactttcaagctacccgctggtgttcaatataaagcaggccaaggc
gatttaggcacttatggaacctacacgatcgcagctgatggtactgtgacttttactttt
aacgataacgttaataccaatgacacgatttctggcacatttggttatacgtctcaaata
acgagcacaaccaccactggtgaacaaacaattacgattccaacgaaaaccgaaccaagt
accacaacgatcgttgtgaatccaaatggtggaaatactattgcaaaaacaggtaccttg
actggtgccaatagttctaacaacaacccgactggtattacttgggatgtcacgatcaac
acgatcggtgctgaacttgataatgcgacagtgatcgatcctatgccaagcagcacggat
ggtacggtaccaacaactttgaaaacgaccacgatttatcctttaacggtcaacttgaac
ggcaatgttacctcgactggcccagctttggttgcaggcacggattacacagttgatggc
agtggcaagataacttttatcggcaaatacgccaaaacttattcagccttcaagattgaa
tatacaagtgatattgatagtagcaaactccctgatgatggtggccaggttagctttaaa
aataccgcaacattgtctaacaatggcacgaattatcctgctagtgcgaccgtggatgcc
aattatggcaagctgatcgcaaaaagttacgatggccaagataacaacggtagccaaaag
tataactggcacatcgattataactatggtgaaaaaagcttagcagctaacaccagcatc
gtggacacactttctactggacaagccttctcaggcacgccgactttagtctatgaagat
ggcacgactgttgatgcatctctttatgccattacttataattccgataaatcacagatg
actgtcactttcccaaatggtttgacgaagggtgttaagatttcttaccaatcacagttg
acagatcctaatgacaccaacacggtcattagcaattctgccagcagtaatggccagact
tctgatccgggtaatcaaactgttggtcagcaaggattgacaaagagtcttggtgatgtt
gattacaatagcaaaaccctgacttggaattttgatatcaacatggctcgccaggacatg
tcaaattggtctatgaccgatacagcaccaaatggtttaacagttattccaacttctttc
gttttgaaggacaaggataccggtgttacttataaagagggtacagactacacagtcacg
attgatagtgttggcagtggttttacgattgaattctcaggtagcctaaagagtcatgct
aaagattggtacactttgtcctatcagacgacttttgatacgaataacttgccatctagt
ggcaaatggaccaataacgcaaccactacttggactgaccaaagtggcaaaacacaccat
aatgatggcagcgctgatttcacgcctaatgatgattttaaaaatgacggtagtaagtca
ggtgcttataatgccgtgaataagcacattacttggacagttgttggaaattataatcag
cgcacattaactagcgcttcgattgttgatccaataatcggcaatcagacttatgttgct
gatagcgctaagttatacgaagcaacgatcaataaagatggttcatataatttaggaact
caagtaactaccactagtatcaattatgattctggcaccaagacgattacagccaatttg
ccagagggcagtactaagacttatgtattaacttttgatacagacttgtcaggtacgctg
atcggtgttaatccttcatcaccagaaacatcaaccccgtatacgaatacagctacttac
acaaacaattctaaatccagcgatttgactgctagtatttctattcctaaggctggtgaa
tatgtgaaaaaatccggtacacaggatcccactaattcagcttatgcaacctaccatatt
tgggttaaccgtagccaatccactttgtcgaacgttgttgtcgatgatgtacctgatggt
aaacaaatcattgatgaaagctcgatcgtagtttattcgaccaaggttgctcaagatggt
accgttactgaagatactactaaacctttacagctaaatcaggattatacagttaagttg
accacggatccgaccaccggccaacaagaattactgatcactttcaatggtcagatcacg
acagcttattcgattcgatatcgttcgttaattaattcttcatcaactaatgacacactt
tcaaattcagtcacgattactggcgataatacgaaatcaatctcgcagacgactacgact
aatacgcaagttgttaataatagcggttctgcaagtggtaaaaatacgaatcttgtcatc
acgaagactgatagcgctagtaaaaagccactagctggtgcatccttcagtctctattct
gataataatggtgtcaaaggtcagctgcttcgcagtgcgacgaccgatgctaatggccag
ctaacttggaataatttgaagtccggcaactatatcttggttgagaccgctgcaccagac
agctatattattccgaccgatctagctaacggtaaagaaatttctgttaattacagtgac
gctgattcaaataataatgttcagcttcccgaatctaatacgcagggcaacatcactctg
accaagaccgatagcgatactcaagctgttttgcctggtgcgaccttcagtttgtatggt
tctgcgggcaatctgatcaaggcaggattgacgactgacgctaatggtcagatcaaatat
tctggtttggatgccggcagttactattttgttgaaacatctgccccgaccggttacact
tttgattcatcaaagcactacactgtcactctgaattcagacaatatcagcggcacggtc
aacgtggctgatgctgaaaagacgggttcagtgatcctttacaaagtagattctgatacg
aaccaagccctgtctggcgcgacctttaccctctataaagccaatggtacgggtgttgct
tctaatctgacgactgatgccgctggacagatcaaagtaggcgatttgaaacctggcaat
tactatttcgtcgaaacatccgctcctgctggctatacttttgacagcacggccaagtac
acttttgcgatcacaatcggtgatcagtcacaatcagtcattgtcaatgcaggcaacgcc
gaaaagcgtggatctgttgtgctgacaaagaccgatgctgatgcatttgatccaacagtt
gtcgctggcgctgtctttgatctttataaagcaggtcagtcaacagcttctgtcacgggc
ctcacgactgacaacaacggacagatcaaagttagcggtttgcagcccggcaattattac
tttgtcgagactaaagcgccgaccggttatgtcctggacgcggctcaccataatttcaca
gttgcttttgatcaagtgacggcgatcggtgttagcgttgctgatgccgaaaagacgggt
tcggttcttctgacgaagacggattctgatacgaataaagttttggcaaacgcagccttc
tcgctctacaaaaaagatggcacgctgctgaaaagcaatttgacgacaaatgcgaatggc
cagatctcttatgatggcctaaagcctggtgattactattttgttgagacatctgcacct
gccggctatactttcgacagtacgaaacagtatgcattcacgatcgtattaggtgaccaa
accacgccggtcacggtcagttcacaaaatgctgaaaaaacacactcagttcttctgact
aagactgacagcagtgatgctgctaagactttgtctggcgctactttctccctatacaaa
aaagatggcagcttagttaaagacaagctcaccactgatgccaaaggccagctttcttat
gatggtctaaagcctggtgattactacttccttgaaacatctgcccctgctggttataac
tttgatagcactaagcagtatgcctttacgatcgatatcagtgattcaactgatccggtc
gttgtctcggcccaaaatgctgagaagactggttcggtcgtcctgacaaagaccgatgct
aagacgaacaagactttggctggcgctgtctttgacctttacaaggctaatggcaccaag
atccagtctggtctgacgacgaatgcaaaaggtcagatcgtggtcgctaatttgaagcct
ggtgattactacttcgtcgagaccaaagcgcctgccggctacacattgaatgctggcaaa
cattatgcctttacgatcacgatcggtgatcagacggctgccgcttcagtctcagttaaa
gacactaagaagccgactcagactgcttggacgacggttcacaaagaattgccgcacaca
ggcgagcaggtcttctacttctctgcgatcactgccacgatgcttgctatctccgccgcc
gctgccgcactagctttaaagcgcaagcgcgagcaaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system