Orbus sturtevantii: RHO12_02480
Help
Entry
RHO12_02480 CDS
T10535
Name
(GenBank) hemagglutinin repeat-containing protein
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
osv Orbus sturtevantii
Brite
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
osv00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
RHO12_02480
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVD66647
LinkDB
All DBs
Position
complement(588806..593653)
Genome browser
AA seq
1615 aa
AA seq
DB search
MVEHLTNTVDSIHKIVTTGTRYYQYDYYAKKGRHYNRRDSYAYNPLDEISAIDLGLSTIK
ENTSVSSTTLNPSERTEVDPNLSISTIKPNTALPNSSLYKINKDPQSNYLIETDSRFTNK
QEWLSSDYMLKQIKNDPNNTQKRLGDGYYEQQLIKDQIIALTGQRYLGDYSSDMEQYKNL
MNAGAEFANTYGVRIGVALTDEQMKLLTSDMVWMVSKTVTVDGQDIEVLVPQVYIVNRPQ
VTSAGALVSAKNVVISSDADIRSSGAIAAKDQLAISANTIHNQGSLSGASVALNAVDSIL
SNGSISADSKLSLTAGNDVNLITTTRTAERETKQGHDIKTVIDRTSSVSVKNGDMVIKAG
HDINTAGALLINQDKDGSITLDAGNNINLGSVNTRDKQEYIASRTNYVKSDVDHVVGSEI
YSQGNINLKAGSDINVTASTVNADNALGLAANNININSQSSNRKVDAHLVVVSKSTFSKT
TNIYDLNVDNTVQTGSSLSGKTIDLNAKKDITVTGSQVVGSNDINLSAGNNVVINSGEES
YYQKENTTTKTSGLMSSGGIGFTYGKEKESTTTTDTQQGYQSSTVGSTEGNVTIKAGQDL
TVKGSDIIAKKEINLTGNNVTLEENDAKITYKEEYEYEKSGLTLAMTGTAADVYEAGKAV
EQAKKKDNDKLLALQSIKAGLTAIQAIEDSQLKNDKGESQASIGVSVSVGTQKTERIENR
EEHSVMGSGVSAGDNITITATGNEQNKGGDITVKGSEVKAGQDISLEAGHDVNLIGAVNT
QHSDKDEKSYGGSFGLGLTFGSKETGLKFSGNANFSRERENADGSAWSEGVVDAGKNLTV
KTGNDTNLIGGQLKGDSVKLDVGNNLNIESLQDTDNYDYDKLSTSISGSYTYGSNNVDVN
VSISKTEMESNWASVTDQSGVFAGKGGFDVTVGNNTDLKGAVIASTADDKSKNKLDTGTI
SFENIENKADFNVDHVSISVGVSKGDEYQATGGMPSVYHNDGKASSTTKSAVEEGSLVVR
NQDEQQQNVDELSRNTDNANNPLGQIFDKQKEQDRMDTLDLVKDIAAQAKDVVNKYDRIQ
AQNEVDKNKDELAKAEAKKVYDKLSKEDKEKISLDDFYKSDKDGFYYSAVDTQLKNNQEK
GKTNGGMGSSVSKGIDAATAIISGLVTGDITGGLAGASAPYLAEQIKKQTGHYDSKEDKW
KMDDPNANLIAHAILGAAVAAAQGNSALAGGIGAASGEAAAEYIRKTLYDDRDPRDLTQA
EKENISALAQLASGLAVAAGSGSIADAGTAVAGSKNAVENNYLNASEDKVKTDLERQLPY
LSAEDKEKAQAAINELNKKSEELNLALKDACQNLSSEQCGTLRKDLKLAGESYDGKLDKN
DPYYHYLQSQYKDQYDGYKEINSLEFDLALKDVEAYREWKAQQLTENYGFSIETSRNLVF
WERVSNTAMAAAAAIVGPKVVEEATGTKPPVNSIGKGTSTTANKPNNIGGEIAGEVGKGT
IAPQGYNVDPNKFDYFFGRVTTGNAHNVQRSAQNLKDLNTLGIKTEQQLVSIFNKAAGEG
TIVSQKSNNFGTTITKSMNVSDKGAIQVSFFYPNGNLNATPKVTTLIPKLSGGIK
NT seq
4848 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgagcatctaactaatactgttgattcaatacacaaaatagtgactaccggtacg
cgttattatcaatatgactattatgctaaaaaagggcggcattataaccgccgtgattcc
tatgcttataacccacttgatgaaatatctgcaattgatttaggcctatcaacgattaaa
gaaaatacatcagtgtcgagcactacgcttaatccgagtgaacgcactgaggttgatcct
aacttaagtatcagcaccataaaacccaataccgcgttaccgaacagtagcttatacaaa
ataaacaaagatccgcaaagcaattacttaattgaaactgactcacgttttaccaataaa
caagagtggcttagctcggactatatgcttaagcagattaaaaacgatcccaataacacc
caaaaacgcctaggtgatggttattatgaacaacaattaatcaaagatcagattattgcc
ttaaccgggcaacgctatttaggtgattacagcagtgacatggagcagtataaaaacctc
atgaatgctggggctgaatttgccaatacttatggcgtgcgaattggggtggccttaacg
gatgaacagatgaagctgctcacctcagacatggtctggatggtgagtaaaaccgtgacc
gtcgatgggcaagatatcgaagtattagtgccgcaagtctacattgttaatcgccctcaa
gtcaccagtgccggtgcactcgtgtcggctaaaaatgtagtaataagcagtgatgccgat
attcgttcatcaggggcgattgcggcgaaagatcaactggctatctcggcgaatacaata
cataaccaaggcagcctatcaggtgcaagcgttgcattaaatgctgtcgactctatttta
tcaaatggcagcatctcagctgactcaaaactcagcttaacagcgggtaatgatgttaat
ttgattaccacaacgcgcacggctgagcgtgaaaccaagcaaggtcatgatattaaaacc
gtcattgatcgcacttcaagcgtcagcgttaaaaacggtgatatggtgattaaggccggt
catgatattaataccgccggcgcgttacttattaatcaagataaagatggcagtatcaca
cttgatgcgggtaataatattaaccttggcagcgttaatacacgtgataaacaggagtat
attgccagtcgtaccaactacgtcaaatcggatgtcgaccatgtggtgggcagtgaaatt
tatagccaaggcaatattaaccttaaagcgggcagcgatatcaatgttaccgcctcaacc
gttaatgccgataatgcgctaggcttagcggcaaataatattaatattaattcgcagtca
tccaatcgaaaagtggatgcccatttagtggtggttagcaaaagtaccttctctaaaacg
acaaatatctatgatttaaatgttgataatactgtgcaaacaggcagctcattaagtggt
aaaaccattgatttaaatgcgaaaaaagatattactgtgaccggtagtcaagtggttggc
agcaatgatattaatttgagtgctggcaacaatgtggtgattaatagtggtgaagagtct
tactatcaaaaagagaacaccaccactaaaacctcagggttaatgagtagcggcggcatt
ggctttacctatggtaaagaaaaagagtcgaccaccaccaccgacacccagcaaggctac
caaagtagcacggtgggcagtacggaaggtaatgtgacgattaaagccggtcaagacctg
acagttaaaggcagcgatattattgccaaaaaagagattaacttaaccggtaacaacgtc
acgctagaagagaatgatgctaaaattacctataaagaagagtatgagtacgaaaaatca
ggcttaacgcttgccatgaccggtacggctgcggatgtgtatgaagcaggtaaagcggtt
gaacaagcgaaaaagaaagataatgataaattacttgcactgcaatcgattaaagccggc
ttaaccgctattcaagcaatagaagattcacaacttaaaaatgacaaaggagagagtcaa
gcctcaattggcgtgagtgtgtcggttggcacgcaaaaaaccgaacgcattgaaaatcga
gaagagcatagcgtgatgggcagcggcgtatcagccggtgataatatcactatcacagcg
actggtaatgagcaaaacaagggtggtgatatcaccgttaaaggcagtgaagttaaagcg
ggtcaagatatcagccttgaggcagggcatgacgttaaccttattggcgcagtcaatacc
cagcatagcgataaagatgaaaaaagctatggcggcagtttcggtcttgggctcaccttc
ggttcaaaggaaaccgggctaaaatttagtggtaatgccaactttagccgtgagcgtgaa
aatgccgatggtagcgcctggagcgaaggcgtcgttgatgctggtaaaaacctgacggtt
aaaaccggcaatgataccaacttaatcggcgggcagctaaaaggtgatagtgttaaactg
gatgtgggcaataacctaaatattgagtctctgcaagacactgacaactacgattatgac
aaattatcaacctcaataagcggtagttatacttacggcagtaataatgttgatgttaat
gtctcaataagcaaaacagaaatggaaagtaactgggcgagtgtcactgaccagtccggt
gtttttgccggtaaaggtggctttgatgtgacagttggcaataatactgaccttaaaggg
gcggtaattgcctcaaccgccgatgataaatcgaaaaacaaactcgatacgggcaccatt
agttttgaaaatatcgaaaacaaagcggattttaatgttgaccatgtgtcaatcagtgtt
ggtgttagtaagggtgatgagtatcaagcaactggagggatgccatcggtttaccataat
gacggcaaagcctctagtaccaccaaatcagcggtggaagaaggcagcttagtggtacgt
aatcaagatgagcagcagcaaaacgttgatgaattaagccgtaacactgacaatgctaac
aacccactggggcaaatctttgataaacaaaaagagcaagaccgtatggacacccttgac
cttgtcaaagatattgccgcccaggcgaaagatgtggtcaataaatatgaccgcatacag
gcgcaaaacgaggttgataagaataaagatgagctagctaaagcggaagcgaaaaaagta
tacgataaattatctaaggaagataaggaaaaaatttcgttagatgatttttataaaagt
gataaagacggcttttactatagtgcggttgatactcaactcaaaaacaaccaagaaaaa
ggcaaaactaatggcggaatgggtagcagcgttagcaaagggattgatgcggcaaccgcc
attattagtggccttgttacaggcgatattactggtgggcttgcgggagccagtgcgcct
tatttagcagagcagattaaaaagcaaacaggtcattatgattcaaaagaagacaaatgg
aaaatggatgaccctaatgctaacctaatcgcccatgcaatactcggtgccgcggttgcc
gcagcacaaggtaattcagcattagccggcgggattggtgccgcttcgggcgaagctgca
gctgaatatattcgtaaaacactgtatgatgatcgagatcctagagacttaacccaagct
gaaaaagaaaatatcagcgccttagctcaattagccagcggcctagctgttgcagcagga
agtggaagcattgccgatgcgggtaccgcagttgcaggcagtaaaaatgcagttgagaat
aactatttaaatgcatcagaggataaagttaagactgaccttgagcgacaacttccttat
ttgtcagcggaagacaaggaaaaagcgcaggcggctattaacgaactgaataaaaaaagc
gaagaactaaatcttgcattgaaggatgcttgccaaaatctaagttcagaacaatgcggg
acattaagaaaagatctcaagttggcaggtgagtcttatgatggtaagttagataaaaat
gacccttattatcattatttgcaaagtcagtataaagatcagtatgatggttataaagag
ataaattcattagagtttgatttagctttaaaagatgtagaggcttatcgagaatggaaa
gctcagcaattgactgaaaattatgggtttagcatagaaacatctcgaaatttagttttt
tgggaaagagtgagcaatacggcaatggccgcagccgctgccattgtaggacctaaagta
gtagaagaagcaacaggaaccaaaccaccagttaatagcattggaaaaggaacctcgaca
acggctaataagccgaataatataggcggggaaattgctggcgaggttggaaagggtaca
atagccccacaaggctataatgttgatcctaataaatttgactatttctttggtagggta
acgactggaaacgctcataatgttcagcgttccgcgcaaaacttaaaagatttaaataca
cttgggataaaaacagaacaacaattagtttctatatttaataaggcagccggtgaagga
actattgtttcacagaaatcaaataattttgggacaacaataactaagtcaatgaatgtt
tcagataaaggagctattcaagtgagtttcttctaccctaatggtaacttaaatgcaaca
ccaaaagttacaaccttaattccaaaattatcggggggtattaagtga
DBGET
integrated database retrieval system