Orbus sturtevantii: RHO12_04295
Help
Entry
RHO12_04295 CDS
T10535
Symbol
mscM
Name
(GenBank) miniconductance mechanosensitive channel MscM
KO
K22051
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
osv Orbus sturtevantii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
osv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
osv02000
]
RHO12_04295 (mscM)
Transporters [BR:
osv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RHO12_04295 (mscM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
SP24
Usg
DUF3377
DUF4446
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVD67004
LinkDB
All DBs
Position
complement(976770..979421)
Genome browser
AA seq
883 aa
AA seq
DB search
MRQLRNVISAIFLLFICGGFGAAYAEPSSIVIESNDDLRQIISQLSAQNSELRDSIASQK
AQVSLINDQQNTILSQVSHVQNTLATLDEQGEWLSFSTALGETLRQQLLRLPEKPKFQPL
DASIAESKVLQLSYSNQLDNLDDYPNLTDLTLDHSQLMQYKQLIREQSELLKTLISGCDT
IILELTKLKIANRQLINAIDDVDDAAHRYFFWVADVNPINLSYPVELAKDVAFVFFSIDS
LSQLYSATIEIINTPLTLLLLILSLVLVITHFKSKARYNHYLEKTSSRIGKVTQDNFSIT
MRVVIYSLIMALPIPILWGMIGYALQSDWDYPVAVALGYSINAAAPILWVFIISAQFASP
NGLFITHFGWPESRVRSAMKYYQLSVWVVIPLVMMVMSFEQYNNRQFAATIGRFCFILLC
FALVFMTNAIHRAGVPLYIDRKVSGDNLLNRILWIILLSAPWVAIIAACLGYLSTAQVLL
GRLEASVVIWLALLVIYFMIRRWMWIQKRRIEFERAKQRRLERLAQRSKSDDEANPNSSS
NNAADSIEEPVIDLDVISAQSLHLVRSIIALVALISMILLWSELHSAFAFMDNIRLWSSK
SVISGVETEQYITLSSLFIAILVMTITIQLVKNLPALLELGILQHLDLKPGTGYAISTIS
KYIILMIGCMIAFSLIGIDWSKIQWLIAALGVGLGFGLQEIFANFISGIIMLFEKPVRIG
DTVTIRDLTGNITKINTRATTIVDWDRKEIVMPNKAFVTEQLVNWSLSDAITRIVLTIPA
TIDADSDLVIDILKRVAKNCQYVLDDPEPQVYLVDIQEGIQLYEIRLFAAEMSYRMPLRS
EIQQMIIEEYRKHDLKLPFPPLQTNLEALGRKTGRRTYNVGTM
NT seq
2652 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagacagttgcgtaacgttattagtgctattttcctattgttcatttgcgggggattt
ggtgccgcctacgccgaaccatcatcaatcgtgattgaaagtaatgatgatctccgccaa
atcattagccaattatcagcgcaaaatagcgagttacgcgacagtattgccagtcaaaaa
gcgcaagtttcgctaataaatgatcagcaaaacactattttatcgcaagtgtcacatgta
caaaatacattagctacccttgatgaacagggggaatggctcagtttttcaactgccttg
ggggaaaccttacgtcaacagctactgcgcttgcctgaaaaacctaaattccagccgcta
gatgccagtattgctgaatctaaagtattacagttgagctatagtaatcagctcgataat
ttggatgattatcctaatttaactgatttgactttagatcacagccaattaatgcagtat
aaacagcttattcgtgagcaaagtgagctacttaaaacactgatatcaggctgtgatacc
attattttagagttaactaagctaaaaattgctaatcggcagttaatcaatgccattgat
gatgttgatgatgcggcgcaccgttacttcttttgggtcgccgatgtcaatccgatcaat
ttatcttatcctgttgaattagccaaagatgtcgcttttgtctttttctctatcgatagc
ttgtctcagttatacagtgccacgattgagattatcaatacaccattaaccttactgctc
ttgattttgtctctagtacttgttattactcactttaaaagtaaggcaaggtataatcac
tatttagaaaaaacctcgtcacgcatcggtaaagtgactcaagataacttttcgattacg
atgcgtgttgttatttactccttaattatggcattgccgatcccgattttatggggcatg
attggttacgctttacaaagtgattgggattatccggttgcggtggcattaggttatagt
attaatgccgctgcgcccattttatgggtatttattattagcgcgcagtttgcctcacct
aatggtctatttattactcattttggttggccagaaagccgagtacgttccgcaatgaaa
tattatcagttatcggtatgggtggttataccgctagtgatgatggtgatgagctttgaa
cagtataataatcgccaatttgccgccacaattggtcgtttttgttttattttactctgc
tttgcgttggtatttatgaccaatgccattcatcgcgcgggcgtaccgctgtacattgat
agaaaagtatcgggtgataatttattaaaccgtattttatggataattttgctcagtgcg
ccgtgggttgcgattattgcggcatgcttaggctatctatcaaccgcgcaagtactactc
ggccgattagaagcatccgtggttatttggttggcgctattggtgatctactttatgatc
cgtcgttggatgtggatccaaaaacgacgcattgaatttgaacgcgcgaagcagcgccga
ttggagcgattagctcagcgcagtaagagcgatgatgaggctaatccaaactcctcgtca
aataatgccgccgatagcattgaagagccagtaattgaccttgacgtaatcagtgcccaa
tccttgcatttggttcgttcaattattgcactcgtcgccttaatcagtatgatcttactc
tggtctgagcttcattctgccttcgcctttatggacaatattaggctctggagcagcaaa
tcagtaattagcggcgttgaaaccgaacaatacatcacgttaagctcgctatttattgct
attttagtcatgaccattaccattcagctggttaaaaatttaccggcattactcgagctc
ggtattttgcagcaccttgatttaaaaccgggtaccggttatgccatctcaacgatcagt
aaatatattattttaatgattggctgtatgattgctttttccctaatcggcattgattgg
tcaaaaattcagtggttaattgcggcattaggggttgggcttgggtttggtctgcaagaa
attttcgccaactttatttcaggtatcattatgttatttgaaaaaccagtacgcataggc
gatacggttacgattcgtgatttaactggcaacataactaaaatcaacactcgcgctaca
accattgtcgattgggatcgcaaagaaattgtcatgcctaacaaggcgtttgttaccgag
cagttagtcaactggtcattatctgacgcgataacacgcattgtattaacgatcccagcc
accattgatgcggatagtgatttagtgatagacattcttaaacgagtggctaaaaattgt
caatatgtactcgatgatcctgagccacaagtctaccttgttgatattcaagaagggatt
cagttatatgaaattcgtttattcgcggcggaaatgagttatcgcatgccactgcgtagc
gaaattcagcaaatgattatcgaagagtaccgtaaacatgaccttaaattacccttccca
ccgttacaaactaatttagaagcattagggcgcaaaacagggcgacgaacttataatgtg
ggtacgatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
