Orientia tsutsugamushi Boryong: OTBS_0102
Help
Entry
OTBS_0102 CDS
T00531
Symbol
rhp8
Name
(GenBank) ompA-like, putative autotransporter
Organism
ots
Orientia tsutsugamushi Boryong
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
TFIIA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAM79168
UniProt:
A5CC17
LinkDB
All DBs
Position
complement(99505..103890)
Genome browser
AA seq
1461 aa
AA seq
DB search
MKNSRKISLIFFTTLFTISNITIIQTADNDPSASSSSSGGFTGSGASQSNNTTESSNDNQ
GDTGSGATSNPSNPSNPSNPIEGASGTTPATGASDATGVTETTGGSATGSEVTDGKKSKK
SPFKKLKGFGSTLSLSGHTKSEEPSEGATGGKESSTSTLKRLRKQLGSTMSLSSTTPGEP
KAPIVLSDSTNKQVEVKQNKGSGVQKVVVKQPEVGFEKMDGKGNSIEISVEENAKVTIKG
EDCYRIKLANLNLTDSELIVNNTLYSNSELKTTSPITSSMSMPNLSDTDVSSSSTSSRRS
SSIIHSAGQSPFDLSFFSSTAHGGKTESTDRASFTGIGSFVVQSPTILSSDLNICGNINV
TKPFQLLTVPPVMLKTLTVERSKLVPQKSGVLNLQSDLTANIEVKGATVVASGSSTKISF
NKFGTPNNPIPVKVDGVLKLQAELQSSGLKTVDMYASITPKKQSASEVHFLNSASSTSLT
TYHVHGFIGTPDFVTGKILVDGETVLNVTGNLYTQKLKLNSSNKVSRGDSDTHGCIVLNG
EMYSRSVEPSVSNYGKLIIHGNPSTKYDPDHYKSIFYGDIGTGRSKIHRIEFAEHSNNPN
GIRPYTNWFISYDKSMNKSSIFCSDIIFSHPEDTINVLGNTVIEGNIGTKGHSGGKIIVR
NNGTLTHNGGDIGNTKISNPNSLQALCLCENASFVSMPGSNSIPYTCNIKEITADQNSYI
ELNSNADWNANIIPTGPGAKLTMSQGSYSGNIGTKDKPMLNVTLLPKSKRQSLIEVDGSV
HTKQFSISDKSSARGEMALLGDYTVTAQTSDGSGNINVGNASINLGINTLALFGDNIIIL
GHKSNKGSSTNPKKFDKKPVTVFSIGYTTNSDGTVKTQGKLKLSKHYDPSNKIVLNVVHQ
GDSRDLSKHGPQTIIQPVDIADTGNLDVSGLIYVCDGKCKWQPVPGSDGQLAFAGLVDKK
KKDKGDDGASSSSGSSSIAPSARVSPEVSDGEEGGKDEDIQASAASHLHSKDSAHSKQSQ
DKDHTEDPENPEDTTEAAIEELARRLDDPILSRRAAEQPQPDPAEQAQPVVAQPLAAGAG
MQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQHISSGVQPQQHLSSPYSDDQEQSSEQAVALQPILQR
TASDAPLKGGVNITVAAISSIVESRASNNKSVSDIVSSGSNINKQSWNIWADGFFSNVNQ
QDHKHIQGYKTDISGISIGADKHLKNNAIIGAAISYAKFDTKHTDSRIEKINSNVYLLSL
YGQYSFQSTTFIRGMINVAKFSDDSKNSSLTLWQGHSYHGSLTAGHYFYPLKNNKKLSLV
PTVGIRHSYFNTSGNKSVDNSSNKTIGDRSHKALEGIIGISLEQLVVNNANNNLNVLSTV
YGYVHHNLYDCQDGAQLPNINSTFNPDVITSREQCLHKTFYQLGVKLAIKRNIMDIGIAC
DVYLAEKYISHTGIIYAKASF
NT seq
4386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaactcaagaaagatatcactaattttttttacaactttatttactattagtaat
attacaattatacaaacagctgataatgatccatcagcttcatcaagtagcagcggaggt
tttactggtagtggggcatcgcagagcaataacacaactgaaagtagtaatgataatcag
ggagacacaggtagcggcgcaacaagtaatccaagtaatccaagtaatccaagtaatcca
attgaaggagctagtggcactactcctgcaactggtgccagcgatgcaactggtgtcact
gaaacgactggagggagtgcaactggcagcgaagtaactgatggcaaaaaatctaaaaaa
tcaccttttaaaaaactaaaaggttttggtagcactttatcattaagtggtcacactaag
tcagaagaacctagtgaaggtgcaactggaggaaaagaatctagcacatcaactcttaaa
agactaagaaaacaacttggtagtaccatgtcattaagcagtactactcctggagagcct
aaagctcctattgtactaagtgatagtactaataagcaggtagaggttaagcaaaacaaa
ggatctggagtacagaaagttgtagttaagcagcctgaagtaggatttgaaaaaatggat
ggtaaaggtaacagtattgagattagtgttgaagaaaatgctaaagtaactataaaaggt
gaggattgctataggattaaattggcaaatttaaacctcacagattctgagttaatagta
aataatacactgtattcaaatagtgaacttaaaactacttcacctattacatcaagtatg
tcaatgcctaatctttctgatacagatgtaagcagtagctctacttcaagcagaagaagc
tcatcaatcattcatagtgcaggacagtctccatttgatctttccttttttagctctaca
gctcatggcggaaaaactgaatccacagatagagcaagttttactggtattggatctttt
gttgtgcaatcacctacaatattatctagtgatttaaatatttgtggaaatattaatgtt
actaaaccatttcaattacttactgtccctccagtgatgctgaaaacgcttactgttgaa
cgatccaaacttgtacctcagaagtcaggagttttaaatctgcaatcagatcttacagct
aatatagaagttaaaggtgctacggttgttgctagtggtagtagtactaaaatttctttt
aataaatttggtacaccgaataaccctattcctgtgaaagtagatggtgtattaaaatta
caagccgagctgcaatctagtggtttaaaaacagtggatatgtatgctagcataacgcct
aaaaaacaatcagcatcagaagtacattttttaaattctgctagtagtactagcctaaca
acgtatcatgttcatggctttattggaacacctgattttgtcacaggaaaaatattggtt
gatggtgaaacagtgctaaatgttactggaaatttatatacacaaaaactaaagctaaat
tcttcaaataaagtttctcgtggtgatagcgatacgcatggatgtatagtattgaatggt
gaaatgtatagcagatcagtagagccatctgtatctaactatggaaaattaattatacat
ggtaaccctagtactaagtatgatccagatcattataaaagtatattttatggagatatt
ggaactggtcgaagtaagatacatagaatcgaatttgcagaacattcaaataatccaaac
ggaatacgtccttatactaactggttcataagttatgataaaagtatgaataaatctagt
attttttgtagtgatattatttttagtcatccagaagatacgattaatgtccttggcaat
acagttatcgaaggtaacataggaacaaaaggtcatagtggtgggaaaattatagtacgt
aataatggtacactaactcacaatggtggtgatattggaaatactaaaattagtaatcct
aattcacttcaagcactttgtctttgtgaaaatgcatcttttgtttctatgcctggtagt
aatagtataccttatacttgtaatataaaagaaataactgcagaccaaaacagttatatt
gaattgaatagtaacgctgattggaatgcaaatataattcctacaggccctggtgcaaaa
cttacaatgagtcaaggaagctatagtggtaatattggaactaaggacaagccaatgtta
aatgttacattgctaccaaagtctaaaagacaatctttaatagaagtagatggatcagta
catacgaagcaattttcgattagcgacaagtcatctgctagaggtgagatggcgttactt
ggagattatactgttacagctcaaactagcgatggatctggtaacatcaatgtaggtaat
gcaagtattaaccttggcatcaatacactagctctatttggtgataatattatcatattg
ggacataagtcaaacaaaggatctagtactaatcctaaaaaatttgataagaagcctgtt
actgtatttagtataggatatactactaactcagatgggactgttaaaactcaaggtaag
ttaaaattgagtaaacattacgatccaagtaacaaaatcgtactaaatgtcgttcatcaa
ggagattcaagggatttaagtaaacatgggcctcaaactataatacaacctgtagatatt
gctgacactggaaatttagatgtaagtggcttaatatatgtatgcgatggcaaatgcaag
tggcagccagtacctggttctgacggacaattagcatttgctggattggtagataagaag
aaaaaagataaaggagatgatggcgcttcaagtagtagtggtagtagtagtatagcacca
tctgctagagttagcccagaagtaagcgatggtgaagaaggtggcaaagacgaagatata
caagcgtctgctgcttctcatttacatagtaaggatagtgctcatagcaaacagtcgcag
gataaagatcatactgaagatcctgaaaatcctgaagatactactgaagctgctattgaa
gaacttgctcggcgacttgacgatcctatactgtcacgacgtgctgctgaacaaccacag
cctgatcctgctgagcaggcgcaacctgttgttgcacaaccacttgcggctggtgctggt
atgcaacgacagcaacaacagcaacaacagcaacaacagcaacaacagcaacaacagcaa
caacagcaacaacatattagcagcggtgtgcaaccacaacaacatctttcatcaccttat
agtgatgaccaagagcaaagtagtgagcaagcggttgctctacaaccaatattgcaaaga
actgcttctgatgcacctttgaaaggtggagtaaatattacagttgcagctatatcttct
atagttgaatctagagcatcaaacaacaaatctgtgtcagatatagtatcatctggatct
aatatcaataaacaatcatggaatatttgggctgatggctttttctcaaatgttaatcaa
caagaccataagcatattcaaggatataaaacagatattagcggtatttctattggagca
gataagcatttgaaaaataatgctattatcggtgcagctatttcatatgcaaagtttgat
actaaacatacagatagcagaatagaaaaaataaacagtaacgtttacttattatcttta
tatggtcaatattcgtttcaaagtactacatttattcgaggaatgataaatgttgctaag
ttcagtgatgatagtaaaaatagttctctaacattatggcaagggcatagttatcatggt
agcctcaccgcagggcattatttttatccattaaaaaataataagaagctaagtttagta
ccaactgttggtattagacattcgtactttaatacttctggcaataaatcagtagataat
tcatctaataaaactataggtgacagaagtcataaagcattagaaggaataattggtatc
tctttagagcagttagttgtaaataatgcaaataataatctcaatgtactttctacagtc
tatggatatgttcatcataacttatatgattgtcaagatggtgcacagctaccaaacatt
aactctacatttaatccagatgttataacttctcgtgaacagtgtttacataaaacattc
tatcaattaggtgttaaattagctattaagcgtaatataatggatataggtattgcttgc
gacgtttatttggctgaaaaatatattagccatactggaataatatatgcaaaggctagc
ttttag
DBGET
integrated database retrieval system
