Orientia tsutsugamushi Boryong: OTBS_1417
Help
Entry
OTBS_1417 CDS
T00531
Symbol
atrC1
Name
(GenBank) Cationic amino acid transporter-1
KO
K03294
basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
Organism
ots
Orientia tsutsugamushi Boryong
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ots00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
OTBS_1417 (atrC1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AA_permease_2
AA_permease
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAM80486
UniProt:
A5CEE6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1377193..1378611)
Genome browser
AA seq
472 aa
AA seq
DB search
MSIFRKKNFDLAKSTTSSNNLKKSFTAFDLILLGLGAIIGTGVFSLTGMVAAKYSGPAVT
ISYIIAGVVCILVALAYTELAVMIPASGSVYTYSYIALGEVFAWIMASVIILELTFGAAT
VAASWSAYTQGILEAGGIIIPKIYAATPFEGGIINLPAVLIVAFASFILYLGTSDSKRLN
IILVIVKLLSVGIFIIVAAPHFQAENWKNFMPFTVNSTLVGASILFFAFTGFSVLAAAAE
ECKNPTKDLTVGIIGSLIISTIVYVVIAGLLTGMATFDQLDNAQPLAYALKLNGSTIGSA
IVAIGAISGMTTVLMLNIYGQSRIFFAIARDGLLPKIFQKVHPTYDSPYVAILFFAVIVA
LIGGFFPYQTVAQLSSMGALIDYMVVSVIVMLLRIKMPNAVRAFKCPAVFVVAPISLVSC
IYLLFKQILDEDGNLLDTGKIIIAWMILVLVLYFIFYYAKQSCQALAYKSKQ
NT seq
1419 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtatattcagaaaaaaaaattttgacttagctaagtctacgacgagtagcaacaac
ttaaaaaaaagctttactgcttttgacttaatattgttagggcttggagctattattggt
actggagtattttcgttaactggtatggtagctgctaaatattctggacctgcagtaaca
atatcttatattatagctggagttgtttgtatattagtagctttagcatatactgaactt
gcagttatgattcctgcatctggtagcgtttatacttattcttatatagcgcttggggaa
gtatttgcttggataatggctagtgttataattttagaattaacatttggtgctgctact
gtagcagctagttggtcagcttatactcagggtatattagaagcaggtggaataattata
ccaaaaatatatgctgctactccatttgaaggtggcattataaatctaccagcagtacta
attgttgcttttgctagctttattttatatttaggaacaagtgatagcaaaaggttaaat
ataattttagttattgttaagcttttatcagttgggatttttataattgttgcagctcca
cattttcaagcagagaattggaaaaattttatgccttttacagttaatagtactttggtt
ggagcatctattttgttttttgcatttactggatttagtgtattagcagcagctgctgaa
gaatgtaaaaatcctacaaaggatttgacagtaggcatcataggctctctaataatctca
acaatagtttatgttgttattgctggattattaactggtatggccacatttgatcagctt
gataacgctcaaccgttagcttatgctttaaaacttaacggtagtactattggatcagca
attgttgcaattggagcaattagtggcatgactacagttttaatgctaaatatttatggg
caatcaagaatattctttgctattgctagagatggattattgccaaaaatttttcaaaaa
gtacatcctacatatgatagtccatacgttgctattttattttttgcggtaatagtagcc
ttaattggaggtttttttccttatcaaacagtagctcagctatcaagtatgggggcgctt
attgattatatggtagtatctgtaatagtaatgctgcttagaatcaaaatgcctaatgct
gttagagcatttaagtgccctgctgtatttgttgttgctccgatatcattagtatcttgt
atttatttgttgtttaagcaaattcttgatgaagatggtaatttacttgatactggaaaa
ataattattgcttggatgatattagtattggtattatattttatcttctactatgcaaaa
caatcttgtcaagcattagcttataagagcaagcaatga
DBGET
integrated database retrieval system