Orientia tsutsugamushi Ikeda: OTT_1346
Help
Entry
OTT_1346 CDS
T00705
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
ott
Orientia tsutsugamushi Ikeda
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ott00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ott03400
]
OTT_1346
Enzymes [BR:
ott01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
OTT_1346
DNA repair and recombination proteins [BR:
ott03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
OTT_1346
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PDDEXK_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAG40804
UniProt:
B3CTV7
LinkDB
All DBs
Position
1369897..1372737
Genome browser
AA seq
946 aa
AA seq
DB search
MSIYYVKPNDDFLFLLANFLLKNYTSSLDKVKVILPYSQQCQELKKIIMLTARKEAMLLP
DVLTLKQFITSFIAASNYSLSICCQLSSYEQEAALSKIIQQHNQQPIRLGDALKLSGKLL
QLFQQLESQQINLTQLKDFVDQIDSSEYWQNTYKFLSFAYIEWSKLYSNSSCDSKSDIFS
QLQDLLKSNLSSNIVILAGLLPTSKLELVIFKGVLSCKLGHVILPPIYLEELCYSVKNSS
DTLYDFQYFVKSCNISLDDITYLAKAIALPTKNKPIQLSEFLGLPKLNLVSDADATKFNS
NIPIDIEYVKVNSQYDEAKLVAAMIHNYLIKANTQHNKILVVTTTPSFTTLLTMHLSKYQ
INYANLTNVDIKQLLEINFILVLADLVSSNFSISKFINLIKTSLLTSSSSNKFENLILKN
KFQQSELKQILLDLTISKDDSELQKWATFILSALDDLWIYYNSNTILCDQLIIGLLQAAE
NLTEGKIWQFQFSKRISDVLKEVIHIAKQFGNIDIRDFSNVLTELVTMIKFNYEHDYNAN
VVITGADSAILLSADYIIIPEFNNDHWPGNSIQNPWLNQAIYSKLGLIERNAHYDRKQYI
LYTILQKAHVSLINSQFTASSKTTDSQFILKLQLLAFKNPLIRIRVNDLKLQYNQNYTSN
VVDNKSTTFQILPGILLSSADIVKTISATDIEMLIRNPYGFYAKNILRLKPVILNDDQLT
QAKFGDFIHKVIHRYTICYKDMEESKLINYFIDIGKQLIDCYNCSSFAKMIWLTKLHQLA
EEFVRFDMERKNEGFKIFSEQSGQISLNINNNALNIIAIADRIEYSQNGECYIIDFKTGT
VPNKKEVQQGIATQLIIESIILYRGGFKNLPAMMPNKIIYIKITSTKPLLEFTEITVDQE
MLDKHELGLVELLQYYIKDGGVFFPSPVDKLAPKYNNYKHLARYLI
NT seq
2841 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtatatactatgttaagccaaatgatgatttcctatttttactagctaatttttta
ttaaaaaattacacatcatcacttgataaggttaaggttatattaccttatagtcaacaa
tgtcaggaactcaaaaaaataataatgcttacagctcgaaaagaagctatgttattacca
gatgtattaacattaaaacaatttattacttcttttattgctgctagtaactactcgtta
tctatttgttgccagttaagttcttatgaacaagaagctgcactttctaaaattattcaa
caacataatcaacaaccgattcgtttaggtgatgctcttaagttaagtgggaaattatta
cagctttttcaacaattagaaagtcaacaaatcaatctaactcaattaaaagattttgtt
gatcaaattgatagttcagaatactggcaaaatacatataagttcttaagctttgcatat
attgagtggagtaaattatatagtaacagcagttgtgatagtaaaagcgatattttttca
cagctacaagatttattaaaatctaacctcagttcaaatatagttatcttagcagggtta
ttaccaactagtaagctagagctagtaatttttaagggagtactttcttgtaagcttggc
catgtgattttaccgccaatttatttagaagaattatgctatagtgtaaaaaattctagt
gatactttatatgattttcagtattttgttaaatcatgcaatatttcactagatgatata
acatatctagctaaagcaatagcattaccaacaaaaaataaacctatacaattatcagag
tttttaggtttaccaaagttaaacttagtatctgatgctgatgctactaagtttaacagt
aatattcctattgatattgaatatgttaaggttaacagtcaatatgatgaagcaaagttg
gttgcagctatgattcataactatttaatcaaagctaatactcaacataataaaatttta
gttgttactactactccaagctttactactttgctaactatgcacttaagcaagtatcag
ataaactatgctaatcttacaaatgttgatattaagcaattattagaaataaattttata
ctagtattagcagatttagtatctagcaattttagcattagtaaatttattaatttaatt
aaaacttcattacttactagtagtagcagtaataaatttgaaaacctaattttaaaaaat
aaatttcaacaatcagaacttaaacagattttacttgatttaaccattagtaaagatgat
agcgaattgcaaaaatgggctacttttattcttagcgctttagatgatttatggatatat
tataatagcaatactattttgtgtgatcaactgattataggtttattgcaagcagctgaa
aatttgacagaaggaaaaatttggcaatttcaatttagtaaaagaatatctgatgttcta
aaagaagttattcatattgctaagcagtttgggaatattgatattagagattttagcaat
gttcttacagaattggttactatgattaaatttaattatgaacatgattataatgctaat
gttgttattacaggcgcagatagcgctatattattaagtgcagattatattattatacca
gaatttaataatgatcattggcctggtaactcaattcaaaatccatggcttaaccaagct
atatatagtaagttaggattaattgaacgtaatgctcattatgatagaaaacaatatata
ttatatactatattacagaaagctcatgttagtttgatcaattctcaatttactgcatca
agtaagactacagattctcaatttatcttaaaattacaacttcttgcttttaaaaatcct
ttaattcgcattagagtaaatgacttaaagcttcaatataatcaaaattatacttctaat
gttgtagataataaatctacaacattccaaatattgcctggcattttactgtctagtgct
gatatagtcaaaacgatatctgcaacagatattgaaatgctaattagaaatccttatgga
ttttacgctaaaaatatattaagactaaaaccagtaatactaaatgatgatcaattaaca
caagcaaaatttggcgactttattcataaggtaattcataggtatactatttgctacaaa
gatatggaggaaagtaaattaataaactattttattgatataggtaaacaattaatagat
tgttacaactgtagttcatttgctaaaatgatatggctaactaagctgcatcaattagct
gaggaatttgtgagatttgatatggagaggaaaaatgaaggatttaagattttttcagaa
cagtcaggacaaatttcactaaatattaataataatgcgctaaatattatagctatagca
gatagaatagaatattcacaaaatggtgaatgctacattatcgattttaaaactggtaca
gttcctaataaaaaagaagtacagcagggaatagcaactcaattaattattgaaagtatt
atactatatcgaggtgggtttaaaaacttacctgcaatgatgcctaataaaataatttat
attaaaattacttctactaagccattacttgagtttacagaaataacagtagatcaagaa
atgttagataaacatgagttaggcttagtagagttactgcaatattacattaaagacgga
ggagtattttttccttctcctgttgataagttagctccaaaatataataattataagcat
ttagcacgttatttaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
