Onthophagus taurus (bull-headed dung beetle): 111421767
Help
Entry
111421767 CDS
T07420
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein Msh2 isoform X1
KO
K08735
DNA mismatch repair protein MSH2
Organism
otu
Onthophagus taurus (bull-headed dung beetle)
Pathway
otu03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
otu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
111421767
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
otu03400
]
111421767
DNA repair and recombination proteins [BR:
otu03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
Mismatch and loop recognition factors
111421767
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MutS_V
MutS_III
MutS_IV
MutS_II
MutS_I
AAA_27
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111421767
NCBI-ProteinID:
XP_071051015
LinkDB
All DBs
Position
3:637630..653621
Genome browser
AA seq
917 aa
AA seq
DB search
MFSRKFYPNLTFFAFLSDPSQQQGFVRFYRNLPENISATVRFFNHSDYYTVHEDDAKLAS
ETIFGNKIIKYMGLEPKLSYLVLSRGNFEKFIKELLLVKQYRVEVYTKPSTQSRQNTWSL
EYKGSPGNLSQFEDILFDNSGNTVFNSTIMCIKNIKANNLGVACINTTESTFFLTEFIDN
EFHTQLDALIAQIGPKECIIPQGDSPELVSLKKILDRCNILVVRLKKNEFSGDEIDQDLN
RLLFFNEGQQRNYMALPSADLKHALGSLQAGIKYLNLTGDENNFNQYKISTADIHRYVRL
DTAALNALNLFPKPSTSARSKSDSIFDVLDNCSTAQGRRLLEQWIKQPLRDINIINERLE
VVEALVKNAEARSILSSGCLTRVPDVLVLAKKLSNKKATLQDCYKIYQVIESIPGMLSIL
KNVDNKFINGMLINPITDVYNDLEKYQAMIEQTLDFNLIDRGEFFIKPSYDEDLTELNEK
KLEVEEKIQKVFKKASNDLGLDMDKVLKLECNDQHGYYFRITLKEESALRNNKSYRIIDA
IKGGVRFTNDRLSDLNETYQNNNQLYEKQQKHVVDEILTVASGYADSIRNLNLLTAQVDV
LVSFATAATSAPITYTKPKLFPEGTGILKLFKARHPCLEKQDDCCYIPNDIDLKQDEKIL
SIITGPNMGGKSTFMRSIGTCVLLAHIGSLVPCESAEISLVDCILARVGAEDCELKGLST
FMLEMVETSGIVRSATKNSLVIIDELGRGTSTYDGCGIAWAIAEHLARDIQSFTLFATHY
HEITQLSETIPTVFNLHASAVVTKTTITPLYQIKEGSCDKSYGIHCARMAEFPVDVIQNA
IEHQKKLEFAEGMKYINDYEPILKRNVINEGDKLLKEVLDQIKSKAANLNDEELMNELKR
IKEEVMGKNLFIKGLLE
NT seq
2754 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttctctcggaaattctatcctaacctaactttttttgcgtttctttcagatccatcc
caacaacaaggttttgtaaggttttacagaaatttgccagagaacatctctgctacagta
agattttttaatcactccgattattacacggtccacgaggacgatgcaaaattagcctca
gaaacaattttcggcaataaaataattaaatacatgggtttagaaccgaaattgagttac
ttggttttaagcagaggaaatttcgaaaagttcatcaaagaattacttcttgttaaacaa
taccgagttgaagtttacacaaaaccctcaacgcaaagtcgccaaaacacttggtcgtta
gaatataaaggatccccaggaaatttaagccaattcgaagacattttatttgataattcc
ggaaataccgtttttaattcgaccataatgtgtatcaaaaacattaaggcaaataattta
ggtgtagcttgtataaatacaacggaatcaacatttttcttaaccgaatttatcgataac
gaattccacactcaactcgatgcgttaatcgcacaaattggcccgaaggagtgtataata
ccccaaggggattcacccgaattggtgtcgttaaaaaaaattcttgatcgttgcaacatt
ttggttgttcgattaaaaaagaatgaattttccggtgacgaaatcgatcaagatttaaat
agattactcttttttaatgaaggccaacaaagaaattatatggctttaccttcggctgat
ttaaaacatgctttaggtagtttacaagctgggattaaatacttaaatttaactggggat
gaaaataattttaatcaatataaaatttcaacagctgatattcatcgatatgttcgatta
gatactgcagctttaaatgctttaaatttatttccaaaaccatcaacatccgctcggagt
aaatccgacagcatatttgatgttttggataattgctcaacggctcaagggcgcagatta
ttagaacaatggattaaacaaccactaagagatattaatattattaatgaacgcttagaa
gttgttgaagctttagttaaaaatgctgaggctcgttcaatattatcttcgggctgttta
actcgagtacccgatgtcttagttttagcaaaaaaattatcgaataaaaaagccacttta
caagattgttacaaaatttaccaagttattgaaagtatccctgggatgttgagcatctta
aaaaacgttgataacaaattcataaacgggatgttaattaacccgattacggacgtttat
aacgatttagaaaaatatcaagcgatgatcgaacaaactttagatttcaatctaatagat
cgcggtgaatttttcataaaacccagttacgatgaagatttaacagaattaaatgaaaaa
aaattagaggtcgaagaaaaaatacaaaaagtcttcaaaaaggcttcaaacgatttaggt
ctagatatggataaagttttaaaactggaatgtaacgatcaacacggttattattttcgt
ataacattaaaagaagaatcggctcttcgcaacaataaaagttatcgaataatcgatgcg
attaaaggcggagttagatttacaaacgaccgtttatccgatttaaacgaaacctaccaa
aacaataatcaactttacgagaaacaacaaaaacacgtcgttgatgaaatattaaccgtc
gcttccggttatgcggattctataagaaatttgaatttattaacagcccaagttgacgtg
ttagtatcattcgcaacggctgctacttccgctccaataacatacacaaaaccaaaacta
tttccggaaggaacaggtattttaaagttgtttaaagcgagacatccttgtttagaaaaa
caagatgattgttgttatatcccgaatgatatcgatttaaaacaagatgaaaaaatttta
agcattattaccggacctaatatggggggaaaaagtacttttatgcgtagcattggtact
tgcgttttattagcacacatcggaagtttagttccttgtgaatccgctgaaatttctctg
gttgattgtattttagctagagttggagctgaagattgtgaattaaagggattaagtacg
tttatgttggaaatggttgaaacttctggaattgttaggagtgctacaaaaaactcttta
gtaatcattgatgaattaggaagaggaacttcgacttacgacggttgtggaattgcttgg
gcaatagcagagcatttagctcgtgatatacaatctttcacattattcgctacgcattat
cacgaaataacccaactttccgaaaccatccccaccgtttttaatttacacgcatccgct
gtcgtaacaaaaacaactataacaccgttgtatcaaatcaaagaggggtcatgcgataaa
agttatggtattcattgcgctagaatggcagaatttcctgttgatgttattcagaacgct
attgaacatcaaaaaaaactggaatttgcagaagggatgaaatacatcaacgattatgag
ccaattttaaaaagaaatgttattaatgaaggtgataagctacttaaagaagtgttagat
caaattaaatcgaaagcagctaatttaaacgatgaggagctgatgaatgaactaaaaaga
attaaagaagaagtgatggggaaaaatttgtttataaaaggattattagaataa
DBGET
integrated database retrieval system