Oligella ureolytica: I6G29_10365
Help
Entry
I6G29_10365 CDS
T07321
Name
(GenBank) VCBS domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
oue
Oligella ureolytica
Pathway
oue02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
oue00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
I6G29_10365
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
HemolysinCabind
VWA_2
DUF3117
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QPT39544
LinkDB
All DBs
Position
2114245..2118537
Genome browser
AA seq
1430 aa
AA seq
DB search
MGCEHGRCDRRYGGWEEIIRVAVGTVTEDGTVSNGFMADYTVTLSGPIDHPNKTIEDALD
LAFGFVVHDGTADSAPQTLTVSVEDDSPVAEDDTATIAEDVTEVTGNVADNDAYGADGPG
NVTAFNDDLTYGHLELNADGSYTYTLDNTNPAVQALNEDETLVDEYEYTITDADGDSHTA
TLTITITGANDVPVVSTNSVLNAAVSEEGLDDGIADGDGTPDTTDEATVTVTDGIKFTDV
DNAADAFTIKFTAPTGSFTSGGKAITWDVSTDGVIVGTADGREIIRVAVGTVTEDGTVSN
GFMADYTVTLSGPIDHPNKTIEDALDLAFGFVVHDGTADSAPQTLTVSVEDDSPVAEDDT
ATIAEDVTEVTGNVADNDAYGADGPGNVTAFNDDLTYGHLELNADGSYTYTLDNTNPAVQ
ALNEDETLVDEYEYTITDADGDSHTATLTITITGANDVPVVSTNSVLNAAVSEEGLDDGI
ADGDGTPDTTDEATVTVTDGIKFTDVDNAADAFTIKFTAPTGSFTSGGKAITWDVSTDGV
IVGTADGREIIRVAVGTVTEDGTVSNGFMADYTVTLSGPIDHPNKTIEDALDLAFGFVVH
DGTADSAPQTLTVSVEDDSPMAEDDTATIAEDVTEVTGNVADNDAYGADGPGGVTAHTGD
LTYGHLVLNADGSYTYTLDNTNPAVQALNAGDSLTDTYEYTITDADGDSHTATLTITITG
ANDAPVVSTNSVLNAAVSEEGLDDGIADGDGTPDTTDEATVTVTDGIKFTDVDNAADAFT
IKFTAPTGSFTSGGKAITWDVSTDGVIVGTADGREIIRVAVGTVTEDGTVSNGFMADYTV
TLSGPIDHPNKTIEDALDLAFGFVVHDGTADSAPQTLTVSVEDDSPFVSTVFETVGVSNT
FYANVMISLDVSGSMAWNSGVPGKSRLEAAVEAINVMLDTYQAQVDAATEGEVRVNLSTF
ESRASQVSPGWVTIADAKNLLSGLTANGGTNYRAALNELLDNFDGSEYPTKPPLTGLNVN
NLSYFMSDGEPNRVREVNAALKTQWENFLKDHQIKSYALGFGEAVNAKQYLDPIAYDGTT
GVDDNNMAIIVTDMNQLGSILAGTVPQAEKVDSSVIKRSLIDVDVVTGFGADGGYVSEVY
VGDKTFTSTKEGVISGPSGGGWTHENGILTVQLDGGGELVVEMTGKNPNGNVTYTPPKSV
SNHDPVVFGFQVTDNDGDSMSNTMVIDTSGLPIANATIQGDVTIDTLDGTNGNDIIDGGA
GDDILNGNGGDDYLYGGLGNDILNGGAGDDHLYGGQGNDTLNGGDGDDYLVGGAGNDTLT
GGAGADQFVFIAPLMPDGSNVDTVMDFSFTQGDKLVLSSLVFTGLVKDGTVNLVNGTEAT
DAVPTVLYDSSTGALSYDADGSGSGVAVHFATLHEDNRPTELISTDFIII
NT seq
4293 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgggatgtgagcacggacggtgtgatcgtcggtacggcggatgggaggaaatcattcgc
gtagcggtaggcacggtgacggaagatggtacggtgtctaatggctttatggcggattac
acggtgacactcagcggtccgattgatcatccgaataagacgatagaagatgccttggat
ctggcctttggctttgtggtccatgatggcacggcggacagtgcgccacaaacgctgacg
gtgagcgtggaagatgacagcccggtggctgaagacgatacggcgacgattgctgaggac
gtcaccgaggtgacgggcaacgtggcggataacgatgcgtacggagccgatggcccaggt
aatgtgacggcatttaatgatgacttaacctacggtcacttagagttgaatgccgatggt
agctacacctacaccttggacaacacgaatccggcggtgcaagcgctgaatgaagacgag
actctagtcgatgagtatgagtacacgatcacggatgcggacggtgatagccacaccgcg
accttgacgatcacgatcacgggtgcgaatgacgtgccagtggtgagtacaaatagtgtc
ttaaatgccgcagtgtcggaagaaggattggatgatggtattgccgatggggatggtact
ccggacactactgatgaagcaacggtgacggtgacggacggtattaaattcacggacgtg
gataatgcggcggatgcctttacgattaagttcacggcaccgacgggtagctttacctcg
ggtggtaaggcgattacgtgggatgtgagcacggacggtgtgatcgtcggtacggcggat
gggagggaaatcattcgcgtagcggtaggcacggtgacggaagatggtacggtgtctaat
ggctttatggcggattacacggtgacactcagcggtccgattgatcatccgaataagacg
atagaagatgccttggatctggcctttggctttgtggtccatgatggcacggcggacagt
gcgccacaaacgctgacggtgagtgtggaagatgacagcccggtggctgaagacgatacg
gcgacgattgctgaggacgtcaccgaggtgacgggcaacgtggcggataacgatgcgtac
ggagccgatggcccaggtaatgtgacggcatttaatgatgacttaacctacggtcactta
gagttgaatgccgatggtagctacacctacaccttggacaacacgaatccggcggtgcaa
gcgctgaatgaagacgagactctagtcgatgagtatgagtacacgatcacggatgcggac
ggtgatagccacaccgcgaccttgacgatcacgatcacgggtgcgaatgacgtgccagtg
gtgagtacaaatagtgtcttaaatgccgcagtgtcggaagaaggattggatgatggtatt
gccgatggggatggtactccggacactactgatgaagcaacggtgacggtgacggacggt
attaaattcacggacgtggataatgcggcggatgcctttacgattaagttcacggcaccg
acgggtagctttacctcgggtggtaaggcgattacgtgggatgtgagcacggacggtgtg
atcgtcggtacggcggatgggagggaaatcattcgcgtagcggtaggcacggtgacggaa
gatggtacggtgtctaatggctttatggcggattacacggtgacactcagcggtccgatt
gatcatccgaataagacgatagaagatgccttggatctggcctttggctttgtggtccat
gatggcacggcggacagtgcgccacaaacgctgacggtgagcgtggaagatgacagtccg
atggctgaagacgatacggcaacgattgctgaggacgtcaccgaggtgacgggcaacgta
gcggataacgatgcgtacggagccgatggcccaggtggtgtgacggctcacacgggtgat
ttgacgtacggtcacttagtgttgaatgccgatggtagctacacctacaccttggacaac
acgaatccggcggtgcaagcgctcaatgcaggcgatagcttaacggatacgtatgagtac
acgatcacggacgcagacggtgatagccacaccgcgaccttgacgatcacgatcacgggt
gcgaatgacgcgccagtggtgagtacaaatagtgtcttaaatgccgcagtgtcggaagaa
ggattggatgatggtattgccgatggggatggtactccggacactactgatgaagcaacg
gtgacggtgacggacggtattaaattcacggacgtggataatgcggcggatgcctttacg
attaagttcacggcaccgacgggtagctttacctcgggtggtaaggcgattacgtgggat
gtgagcacggacggtgtgatcgtcggtacggcggatgggagggaaatcattcgcgtagcg
gtaggcacggtgacggaagatggtacggtgtctaatggctttatggcggattacacggtg
acactcagcggtccgattgatcatccgaataagacgatagaagatgccttggatctggcc
tttggctttgtggtccatgatggcacggcggacagtgcgccacaaacgctgacggtgagc
gtggaagatgacagtccatttgtttccacggtgttcgagactgtgggggtatctaatacc
ttttatgccaacgtgatgatcagtctagatgtctcgggcagtatggcatggaattctggc
gttccagggaagtcacgtctggaagcagcagtcgaagccattaacgtcatgcttgacaca
taccaagcgcaggtggatgcggcaaccgagggcgaagttagggtgaacctaagcacattc
gaatctagggcgtctcaggtttcgccagggtgggttactattgctgatgccaagaacctg
ctgagtgggcttacggcaaatggtggcaccaactatagggcggctttgaatgagttatta
gacaattttgatggaagcgagtatccaaccaaacctccgctgacaggattgaatgtcaat
aatctttcgtatttcatgagcgatggagagccgaatcgggttagagaagtaaacgcggca
ctaaaaacacaatgggaaaacttcctgaaagaccatcaaattaagtcttacgcactaggt
tttggcgaggcagttaatgctaagcagtatttagacccaattgcctatgatggtacaact
ggtgttgacgataataacatggccattatagttacggacatgaatcagcttggttctatt
ttggcaggcaccgtaccacaagcagagaaagtggacagtagtgtcatcaagcgctctttg
attgatgttgatgtggtaactggctttggcgctgacggtggttatgtttctgaggtgtat
gttggagacaagaccttcacaagtacgaaggagggtgtgatcagtggccctagtggcggt
ggctggacccatgagaatgggatactgacagttcaacttgatggaggtggcgaactggtg
gtagaaatgaccggtaagaaccccaatggtaatgtgacctacacgccaccaaagagtgtg
tccaatcacgatccggtggtgttcggtttccaagtcacggacaatgatggcgactccatg
agcaacacgatggtaattgatacctctgggttacctattgccaatgcaacaatccaaggc
gatgtgacgatcgacacgttggatggtaccaacggcaatgacatcatcgatggtggtgct
ggtgacgacatcttgaacggtaacggtggagatgactacctgtatggtggcctaggtaac
gacatcctaaacggtggtgctggcgatgaccatctatacggtggtcagggcaacgatacg
cttaatggcggtgacggtgacgactacctagttggtggtgctggtaacgacaccttgacg
ggtggcgcgggtgcagaccagtttgtctttattgcgccgttaatgcctgatggcagtaac
gtggatactgtgatggacttcagttttacgcaaggtgacaagctggtgttgagctcattg
gtcttcacggggctggttaaggacggtacggtgaacctagtcaatggtactgaagcgacc
gacgccgtgccaactgtgttgtacgacagttcgacaggcgcattatcctacgacgctgat
ggctcaggtagcggtgtggcggtgcactttgcaacgctacacgaggataatagaccaacg
gagttgatatcgaccgacttcatcatcatctaa
DBGET
integrated database retrieval system