Orbus wheelerorum: RHO14_01105
Help
Entry
RHO14_01105 CDS
T10511
Name
(GenBank) MacB family efflux pump subunit
KO
K05685
macrolide transport system ATP-binding/permease protein [EC:7.6.2.-]
Organism
owh Orbus wheelerorum
Pathway
owh02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
owh00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
RHO14_01105
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
owh02000
]
RHO14_01105
Transporters [BR:
owh02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
Other subfamilies
Macrolide exporter
RHO14_01105
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MacB_PCD
ABC_tran
FtsX
AAA_21
SMC_N
AAA_29
RsgA_GTPase
nSTAND3
nSTAND1
MMR_HSR1
AAA_22
AAA_23
AAA_25
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVD71415
LinkDB
All DBs
Position
242740..244683
Genome browser
AA seq
647 aa
AA seq
DB search
MDIIKISQINKLFGNKDNQVYALKSIDLTIEKGDFVAIIGQSGSGKSTLMNILGCLDTPS
SGSYQINGVETSQMNNNQLAELRSKTFGFIFQRYNLLGNLSALENVALPAIYNGTNITER
RARAQSLLGDLGLGEKLDNKPNELSGGQQQRVSIARALMNGGEIILADEPTGALDSKSGE
NVMEIIMDLHRKGHTIILVTHDKNIANYASRVIEIKDGIIIADHRQNEDICQSLTPTKTT
TRNVFSHYKYMLCESFKMSIQAILSHKMRSLLTMLGIIIGIASVVTVVALGQGSTKTIME
NINSMGTNTIDILPGKNFGDMRSNKIKTLTVGDANYLTQQNYIDSTTPNSSTSGTITFAN
ESVSAQLNGVGEQYFDVKGIKIESGRIFSPQDVKDNASVVVIDQNVKNKLFSNGENPIGK
MIIFNKKPLKIIGVAQKLTTVGMSSDTLTLWTPYTTVMNKVTGGKYISSITVKVADNVSS
QQAEENIIQVLTQRHGSKDFFTINSDSIKKTIESTTSTMTILVSGIALISLIVGGIGVMN
IMLVSVTERTKEIGLRMAIGAKQADIMQQFLIEAVLICMIGGVLGLIFSGLIGLVLGIFL
ADVVTLSFSTNIMVLSIVFSMLIGVVFGFMPAKNAAKLNPIEALTRE
NT seq
1944 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatattattaagatcagtcaaattaacaaactttttggtaataaagacaaccaagtc
tatgcgctaaaaagtattgatttgactattgaaaagggtgattttgtcgcgatcatcggt
cagtcaggttcaggtaaatcgacattaatgaatatactcggttgtcttgatacgccttca
tcgggttcttatcagatcaatggtgttgagacaagccaaatgaataataaccagctagcc
gagctgcgctctaaaacgtttggttttatttttcaacgctacaatttattaggaaattta
agtgctttagaaaatgttgcgctacccgctatttataatggcactaatattactgagcgc
agagcgagagcccaatcattattaggcgatttaggattaggtgaaaaattagataataag
ccaaatgagctttcaggtggtcaacagcaaagagttagtattgcgcgagctttaatgaat
ggtggcgagatcattttagctgatgaaccaaccggtgcacttgattctaaaagcggtgaa
aacgtgatggaaatcatcatggatttacaccgtaaaggtcacacgattattttagtgaca
cacgataaaaatatcgctaattatgcaagccgagttattgaaattaaagatggaataatt
attgccgatcaccgtcaaaatgaagatatttgccaatctttaactccaacaaaaaccact
actcgcaatgtgttttcgcactataaatatatgctatgtgaatcgtttaaaatgtctatt
caagcgattttatcacataaaatgcgctcacttttaacaatgttaggtattattattggt
attgcttctgttgtgaccgttgttgcactcgggcaaggctcaacaaaaacgattatggaa
aatattaattcgatgggaacaaatacgattgatattttacccggtaagaattttggtgat
atgcgctctaataagataaaaacactaaccgttggtgatgcaaactatttaacacaacaa
aactatattgatagtaccactccaaatagctcgactagtggcacaattacatttgctaat
gaatctgttagcgcacagcttaatggcgttggtgaacagtattttgatgttaaaggtatt
aaaattgaatcaggacgcatttttagtccacaagatgttaaagataatgcctctgtcgtg
gttattgatcaaaatgtaaaaaataagctattttctaatggtgaaaatccaatagggaaa
atgattatttttaataaaaaaccgttaaaaattattggcgttgcacaaaaactcacaact
gtaggcatgtcctccgataccttaacgttatggacgccttatacaactgtgatgaataaa
gtaacgggtgggaaatatatcagttcgattacggtaaaagttgctgacaacgtgagttca
cagcaagctgaagagaatattattcaagtattaactcagcgccatggtagtaaagatttt
tttacaattaactctgatagcatcaaaaaaacgatagaaagtacaacaagtacgatgaca
atattagtatcaggtattgcattaatttcattaattgttggtggtattggggtaatgaat
attatgctggtatccgttactgagcgaactaaagaaattggattgcgtatggcaattggc
gccaagcaagctgatatcatgcagcaatttttaatagaagctgtgttaatttgtatgatt
ggcggtgtattgggattgatattctctggtttaattgggcttgtgctagggattttttta
gcggatgtggttacgctctctttctcgaccaatattatggtgttatccattgtattctcg
atgctaattggggtagttttcggttttatgcctgcaaaaaatgccgctaaacttaatcca
attgaagcattaacaagggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system