Orbus wheelerorum: RHO14_05445
Help
Entry
RHO14_05445 CDS
T10511
Symbol
mscM
Name
(GenBank) miniconductance mechanosensitive channel MscM
KO
K22051
miniconductance mechanosensitive channel
Organism
owh Orbus wheelerorum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
owh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
owh02000
]
RHO14_05445 (mscM)
Transporters [BR:
owh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
RHO14_05445 (mscM)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MscS_TM
MS_channel_2nd
MS_channel_3rd
MS_channel_1st
SP24
DUF4446
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVD72245
LinkDB
All DBs
Position
1169297..1171960
Genome browser
AA seq
887 aa
AA seq
DB search
MQLRNFLRVVLLFLGSVFLISLLLVKANADELPITIENNHDLSQIISQLSAQNSELRDSI
TSQKAQVSLINDQQTTILSQVSHVQNTLTTLDEQGEWLSFSTALGETLRQQLLRLPEKPK
FQPLDASIAESKVLQLSYNNQLDNLKDYPNLTDLSLDHSQLMHYKQLIREQNELLKTLIS
GCDTIILELTKLKIANRQLISAIDDVDDAAHRYFFWVADVNPVNLAYPVELAKDMAVVFF
SIDSLSQLYSAMTEMVETPLTLLLLIFSLVLVITHFKSKTKYHRYLENTTSRIGKVTQDS
FSITVRVVVYSLIMALPIPILWGIIGYALQGDWDYPVAVALGYGINAAAPILWVFMISAQ
FAAPNGLFITHFGWPENRVRSAMKYYQLSVWVVIPLVMLLMSFDQYNNRQFAATIGRFCF
ILLCFALVFMTNSIHRARVPLYIDKRSSGDNLLSRILWVILLSAPWVAIAAACLGYLSTA
QVLLGRLEASVIIWLGLLVIYFMIRRWMWIQKRRIEFERAKQRRLERLAQRSKAEDEASQ
NASSNNVADNIEEPVIDLDVISAQSLHLVRSIIAMVALISMILLWSELHSAFAFMDNIKL
WGTKTVISGVEIEQYITLSSVFIAILVMTITIQLVKNLPALLELGILQHLDLRPGTGYAI
STISKYIILIIGCMIAFSLIGIDWSKIQWLIAALGVGLGFGLQEIFANFISGIIMLFEKP
VRIGDTVTIRELTGTITKINTRATTIVDWDRKEIVMPNKAFVTEQLVNWSLSDAITRIVL
TIPATIDADSELVMDILKRVAKNCQYVLDDPEPQVYLVDIQEGIQLYEIRLFASEMSYRM
PLRSEIQQMIIEEYRQHGLKLPFPPLQTNLEALGRKTGRRTYSVGTM
NT seq
2664 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagttgcgtaactttcttcgtgtcgtattattgtttttaggatcagtatttttaata
tcgctattgttagttaaggctaatgctgatgaattgccaattacgattgaaaataatcat
gatttaagccaaattatcagtcaattatcggcacaaaatagtgaattacgtgacagcatt
accagccaaaaagcacaagtttcactgatcaatgatcaacaaacaaccatcttgtcgcaa
gtgtcgcatgtgcaaaataccttaacaaccttagatgaacaaggtgaatggttaagtttt
tcaactgcacttggcgaaaccttacgccagcagttattaaggttacctgaaaagccaaaa
tttcaacctctagatgcaagtattgctgaatcgaaagtactccagttaagctataacaat
caactcgataatttaaaagattatcctaatttaactgacctatcactagatcatagccag
ttaatgcattataaacagctgattcgtgagcaaaatgaactccttaaaactttgatatcg
ggctgtgatactatcattttggagttaacaaaattaaaaattgccaataggcaactaatt
agcgccattgacgatgttgatgatgcggcgcatcgttatttcttttgggttgctgatgtc
aatccggtcaatttagcttatccagttgaacttgccaaagatatggctgttgtgtttttc
tctatcgacagcttatcacagctatatagcgcgatgaccgagatggttgaaacgccatta
acgctactgcttttgattttttctttggtactcgttattactcactttaaaagcaaaacg
aagtaccatcgatatttagaaaacaccacctcgcgaattggtaaagtaacgcaagatagt
ttttcaataaccgtacgcgttgtcgtttactccttaattatggcattaccgatccctatt
ttgtggggcattattggttatgcgttacaaggcgattgggattatccagttgctgtggcg
ctgggctatggtattaatgccgctgctccgattttatgggtatttatgataagtgcccag
tttgccgcgcccaatggtttatttattacccattttggttggcctgaaaatcgcgttcgc
tctgcgatgaaatattatcaattatcggtgtgggttgtgatccctttagttatgctactt
atgagctttgatcagtataacaatcgtcagtttgcggcaacgattgggcgattttgtttt
atattgctctgtttcgctttagtatttatgactaactctattcatcgggctagggtgcct
ttatatatcgataaaaggtcttctggtgataatttattaagccgaattttatgggtaatt
ttacttagtgctccttgggttgcaattgcagctgcgtgtttaggctatttatcaacagcg
caagtgttacttggcaggctagaggcatcagtcattatttggcttgggcttcttgtgatc
tattttatgatccgcaggtggatgtggatccaaaaaagacgaatagaatttgaacgtgca
aagcagcgcagattagagcgcttagctcagcgcagcaaagctgaagatgaggcaagtcaa
aatgcatcatcaaataatgtcgctgataatatagaagagcccgtcattgaccttgatgtc
attagtgcacaatcgttacatttagttcgttcaattattgcaatggttgctttaattagc
atgattttgctttggtctgaactacattccgcctttgcttttatggataatattaagcta
tggggcactaaaactgtgattagtggcgttgaaatcgaacaatatattacactcagctca
gtatttattgccattttagtcatgactattaccattcaattagttaaaaatttacccgca
ctattagaacttggcattttgcaacacctagatttaaggcctggcactggctatgccatc
tcaactatcagtaaatacattattttgattattggttgtatgattgccttctcattaatt
gggattgattggtcgaaaattcaatggttgattgcggcattaggggttgggcttggattt
gggctacaagaaatttttgctaactttatttcaggcatcatcatgttatttgaaaaacca
gtacgtattggcgatacagtaacgattcgtgaattaacgggtacgataaccaaaatcaat
actcgagcgacgacaattgtcgattgggatcgtaaagaaattgttatgccgaacaaagcg
tttgtgaccgagcagctagttaactggtcattatcagatgcaatcactcgaattgtatta
acgatcccggcaacgattgatgctgatagtgaattagtgatggatattcttaagcgcgtt
gctaaaaattgtcaatatgtgttagatgatccagagccgcaagtatacttggttgatatt
caagaaggaattcagttatatgaaattcgtctgtttgcttctgaaatgagttaccgtatg
ccgctacgtagcgaaattcagcaaatgatcattgaagaataccgccagcatggactcaaa
ttaccatttccaccgttgcaaactaatttagaagctttagggcgtaaaacaggtcgacga
acttatagtgtcggcacgatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system