Orbus wheelerorum: RHO14_08475
Help
Entry
RHO14_08475 CDS
T10511
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
owh Orbus wheelerorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WVD70389
LinkDB
All DBs
Position
complement(1883144..1887646)
Genome browser
AA seq
1500 aa
AA seq
DB search
MNKIYKIKKNGQGQSVVTSELAKNKSVSASILAVMVGSALLSVSSLALATPISKTATGSG
KTVTISENELNNNETETAIIGVGTDGANSSITITNSIISTSGTNTSAVVGKTTSSTPDTI
GKVTVTVDEGTYSTTNSNDANVIVGEISNYTGAGKDVSVTVTSSTVNAAGTGNANGIFAS
TSADSGKVSIESANSSYNIDTKGNAINGVSNSADNLSISSTSDTIVSTQGGGIYANAQST
GASSIDINSSSSMIVKGNGISSINNGSGSSTITSSSSSITANGIGISSINNGSGSSTITS
SSSTITADGVGISSINNGSGANVITVGGTLKSGESGIYATSKSGKININNTASMEILNDS
ANAIDVISAGGDVNISANDNSIKTNGNNANAFNVVTTGDKAAITVKASHMKYSSTGADTS
LVNILSKSASGDIDVRMTSIDANSVGNNANGIIVATDTGSSANNISITTSGGIINLDTPV
GSNTNTYGIYAVHESGSVNSGDINIFNTDTAITIGNLAEANDTQIKSHAIKAGILNSAST
GIINVTNTGKLVTYSGGSNGIDIVNNGSGTVTLSNSGEIITSGVNSHGISVSGDNNGVMI
EQTAGDIVTNGIDSSGINVTGVTSGDIDINTQAGSTITTNGDNSNGITVAGNSSLGNVNI
NNISDININGKASSGINYSSMPTTQGVTANIINSGNINLSNAANSVIASGIVAQTNANDS
LVITNTGNITQTSKTNSLSAIRVNVQENSSTTETNLIAKSSAKSVIINNSGAINAENSMG
IAAYLVNGDITINNTGNIATTYNNADFIAYTHGIQAISDTGNIVVNHDGGNIVLKSDPNN
TVSNAGIMALQNDSSVANTINVNVNNDAVVDASLGLKGIDVRTSGTADIYIASAAKVTGG
AHSGIAINAYSKDGTFTVTNDGTLNSSNDRAIFVQNGGTAAVNVTNASNMTGYIQTGTAT
DSTFATTNLTNTGAWDLRNTYQAAALNYGNYTKDTEGAAISSFGGGVIDNQGTISLVARN
SDLTLDTTGDYHSVGALSMADGASQAQLLNVSRFSNSGIIDLTANGSSKAGNVLVISGSD
TAGTNGDGTFVANGGSIKMNTVINQGDADSQSDMLVLDNVELGSAATKIFVTPVVGSTAV
ETINDGIKLIDVLGTQNNDAFVLGDVVVYGGYEYRLTTGSGQGFYLTYFDKVNNKMVDPN
VGTHLANQYIAATMFNQDIYDRRYSVREGNSAIWGRTNYSKAKSDTLNGRQHFKADTYIM
QIGADIVKSDDFVGGIYYGYGHSNVKNHSNQSGTKSDGTVDGYMMGIYASWVPDENKGPY
ADFWGHGALYNNALKGDAQVNKVKYDSYGYALSLEGGYGFVLSEDSDTGHSWILQPHNQI
IFNQVNSEAFTDSNGSEFGKSKASGITNRLGVRLYSNYTDNVDKFNPYVEANWLYNNVSE
KTKIDIESFDDTIGRNVGEIKVGLLGKLTKDTSIWGQVVHQFGTNSYSKNEVQFNISYEY
NT seq
4503 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaatttataagatcaagaaaaatggtcaagggcaatcagttgttacttctgaa
ttggcaaagaataaaagtgtgagcgcttccatattagctgtaatggttggctctgcttta
ttatctgtatcaagcctagctcttgcaaccccaatcagtaaaactgcaacgggctcagga
aagacagtaacaattagtgagaatgagctaaataacaatgaaactgagactgcaattatt
ggagtaggtactgatggtgcaaattcttcaataacaattacaaactccattatttcaaca
tcaggtactaatacgtcggcagttgttggtaaaacaacatcatcaacaccggatactatt
ggtaaagttaccgttacagtagatgaaggaacctattcgacaacaaacagtaatgatgcg
aatgttattgttggtgaaattagtaattatactggggcaggtaaagatgtgagtgttacg
gttacctcttcgacagttaatgcggcaggaacaggtaatgctaatggtatattcgcaagt
actagtgctgactcaggaaaggttagtattgagtcagcaaattcctcctataatatagac
actaaggggaatgcgattaatggtgttagtaattcggccgataatttatcgataagttca
acttcagatacgattgtgtcaacccaaggtggcgggatctatgctaatgctcaaagtact
ggcgcatcgagtattgatattaactcatcatcctctatgattgtaaaggggaatggtatt
agtagtatcaataacggttcaggttcgagcacgattacttcatcttcatctagtatcact
gcaaatggaattggaattagcagtatcaataacggctcaggttcgagtacgattacttca
tcgtcatctactattactgcagatggagtcggaattagtagtattaataatggttcgggc
gctaatgtaattacagtcggaggaacccttaaatcaggcgagagtggtatttatgctacg
tcaaagtctggaaagataaatattaataacacggcaagtatggaaattttaaatgattca
gccaatgctattgatgtaatatctgctggcggtgatgttaatatttctgctaatgataat
agcattaaaactaatggcaataatgctaatgctttcaatgttgtgacaactggcgacaaa
gctgcaatcacggtaaaagcatctcatatgaaatacagttcaaccggtgctgatacgtct
cttgtaaatattctatctaaatcggccagtggtgatatcgatgttagaatgactagtatt
gacgctaattcggttggaaataatgcaaatggaattatcgttgcaaccgatacaggtagt
tctgcaaataatatctctatcacaactagtggcgggataataaacttagatacaccggta
ggaagtaacaccaatacgtatggtatttatgctgtacatgagagtgggtcagttaacagc
ggtgatattaatatctttaatactgataccgcaattaccatcggaaatttagccgaggct
aatgatacgcaaatcaaatctcatgcgattaaagccggtattttaaatagtgcaagtacc
ggtattattaatgttaccaatactggtaaattagtgacatattctggcggctcaaatggg
atcgatattgttaataatggttctggaacagttactcttagtaatagcggtgaaataatt
acatcgggcgttaactcgcatggcattagtgtttcgggtgataataatggagtaatgata
gagcaaactgcgggagatattgtaaccaacggaatcgactcttcaggtattaatgttact
ggcgttacatcgggtgatattgatataaatactcaagctggctcaacgattacaaccaat
ggcgataattcaaatggtattaccgttgccggtaatagctcattgggcaatgtaaatatt
aataatatcagcgatattaatatcaatggcaaagcaagtagtggtatcaattattcaagc
atgccaactactcagggcgtgactgctaatattattaatagtggtaatattaatctatca
aatgcggctaattcagttatagcttcaggaatagttgcgcaaaccaatgctaatgattct
ttagttattaccaataccggtaatattacacaaacgagcaaaactaattcattaagtgca
attagagtaaatgttcaagaaaattcaagtactacagaaacaaatctgattgctaaatca
agtgcgaaaagcgttataatcaataatagtggcgctattaatgccgaaaatagtatggga
attgcagcctatttagttaatggcgatatcacaattaataatacaggtaatattgcaaca
acatataacaatgctgattttattgcttatactcatggtatacaagcaatctcagataca
ggaaatattgttgtaaaccatgatggtggaaatatcgtattaaaatccgatcctaacaat
actgtatctaatgcaggtataatggcattacaaaatgattctagcgtggcaaatacgatt
aatgtcaatgtcaataatgacgcggttgttgacgcttcgttaggattaaaaggtattgat
gttagaacgtcaggaacggctgatatttatattgcaagcgcagctaaggtaacgggcggt
gctcatagtggtatagcgattaatgcctattcaaaagacggtacatttaccgtgaccaat
gacggtacattaaattcaagtaatgaccgagctatctttgttcaaaatggcggcacagca
gcggtcaatgtgactaatgctagcaatatgacaggttatatccaaacgggtactgctact
gactcaacatttgcaacaactaacctaaccaatactggagcgtgggatttacgaaatact
taccaagcagccgcattaaattatggtaattatactaaagatacggaaggcgctgctatt
tcaagttttggcggtggtgtgattgataaccaaggtacaattagtttagttgccagaaat
agcgatttaacacttgataccacgggcgattatcattctgttggcgcattaagtatggct
gatggtgcaagccaagcacaactattaaatgtgagtcgttttagtaactcgggtattatt
gacctaaccgctaatggaagctctaaagcagggaatgtactagttattagtggtagtgat
acggcgggaaccaatggtgatggtacttttgttgctaatggtggctcaattaaaatgaat
actgttattaaccaaggtgatgcagatagccaaagtgatatgttagtactagataatgtt
gaactaggaagcgctgcaacgaaaatctttgttacaccggtcgttggtagtacagcagta
gaaacgattaacgatggtatcaaattaattgatgtattaggcacacaaaacaatgatgcc
tttgttttaggtgatgttgtggtttatggtggatatgaatatcgattaacgacaggaagt
ggtcaaggcttttatttaacttattttgataaagttaataataaaatggttgatccaaat
gttggtacacacttagctaaccaatatattgcagccacaatgtttaaccaagatatctat
gatagacgttatagtgttagggaaggcaatagcgcaatttgggggcgcaccaattattca
aaagcgaaaagcgatacacttaatggtagacaacactttaaagccgatacttacataatg
caaattggtgctgatattgttaaaagtgatgattttgttggtggtatttattatggttat
ggtcacagtaatgttaaaaaccattcaaatcaatcaggcaccaaatcagacggtacggtt
gatgggtatatgatggggatttatgcaagctgggtacctgatgagaataaaggaccatac
gctgatttttggggtcatggcgcgttgtataacaatgcattaaaaggtgatgctcaagta
aataaagttaaatacgatagttacggctatgcattatcattagaaggtggttacggcttt
gtactatctgaagatagtgatacaggtcatagctggattttacaaccacataaccaaatt
atctttaatcaagttaattctgaagcatttactgatagcaatggttctgaatttggaaaa
tcaaaagcatcagggatcaccaatcgactaggtgtacgtttatatagtaactatactgat
aacgtagataaatttaatccttatgttgaagctaactggctctacaataacgtatcggaa
aaaacgaagattgatattgaatcatttgacgatacaattggccgtaatgtcggtgagatt
aaagttggtttacttggtaagttaacgaaagatactagcatatggggtcaggttgttcat
caatttggtacaaatagttatagtaaaaatgaagttcaatttaatattagctatgagtat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
