Candidatus Odinarchaeum yellowstonii: OdinLCB4_003870
Help
Entry
OdinLCB4_003870 CDS
T09928
Name
(GenBank) glycosyltransferase family 39 protein
Organism
oyw
Candidatus Odinarchaeum yellowstonii
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
STT3
PMT_2
STT3-PglB_core
AglB_core-like
DUF4232
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WEU39632
UniProt:
A0AAF0D0W0
LinkDB
All DBs
Position
710692..714390
Genome browser
AA seq
1232 aa
AA seq
DB search
MDWSISSFSGKLRELMTFRREKFKLKNLILYFSIITIFLLALFIRLTPAAYEVILKEFDP
YFQFRQTQFIVENGFAAWFNWHDPLSWYPWGRDIASNSYPGLPFAAAAVYLFLTGIGLPI
SLLEMCWAWPAFMGAFTTVAIYFLGREIGSKKVGLLAAFFLAVIPAYFQRTIAGFFDNET
LGILLMVLTTYFYIRAIKRESMFSGLLAGLALAYLTLTWGANIYFFYLIPLSNLILLILR
KYKSFYLIPYALVIGIPMLVGSQIPLIGGVNILFNNIGVVSIGVLSILVLYELLNRFRKT
DLYLRIKPHILPMIGGVIGVIVIVLVAVNFIAQINVLSPIIGVFTNLSARFISIINPLAR
SEVYLVASVGEHAVSSWGVFYYYLFIPVFLFPVGVYFILKRVEPYDIILLTALITSLYFA
ASMIRIILILAPFICLFASYGLVTVMKPFSYIISKEAVAVSTRKMRVAKTVSREYSVVAF
GLVFILLAANLWHGMEMSKQFASPEMIGLGAYYDWQESFQWMRNNIGTGKVVLSWWDYGY
WITAVANQTSLMDNGTFNQTQIAKLGLALVSNDVEALKILREYGVEYVLVHFGYFIPSLS
GDEGKWIWMVRIASDNFPELISESQYYNATSGKPTSKFFDSLIYKLLFYKEPGTYELAYY
VSNTMDKLGYPKYQAYPTSQIWKFIGADTSYPIYRVAYLSSHNLVKLYQVDYTILDTWLK
IVNTSVYTFLGKTTALVTVKNNGSTPVTLDTSPSSIFINGTKLSVIGGSASIAEGSALMN
PGDTCVVKIDVNSPSTIGSQFNTTVSSVEFYGYRKSSEINVVRSAGSFNISIINATAYSN
ETIFLTVQNTGSEYLTVSKIYVNGSSNGISFTGDLTIAPNQFETYAITLNRVAYPSLNLN
VSDIVNLSITTWEGVSASLTGVTVQAPPGYNFTLTNVNAFSNETVLFTVYNNGSYPLDLS
HIILSVNLGDFTFYKSSVTALNGSLTVNPGVAVRYKLSWAPSLLDLNQSDTVNITVYTYQ
GLDYSALNVTVIEPSGYDYILNGQVYDNETAYLTIYNNGSYPVTLSTVTVNDTLVTSITP
VNGSMTVNPGAATLYRILWDPFIFNVSSGDYVTLKTVTYEDINRTVSMLVESSNYSMIID
SSLTSVYSNNTLFITLNNTSPSLPISNFTILVENQTSGELQYLTWTGVLNSSESVNLSFQ
LAQLPALNPGEPVRILVKCVEGASDQITVIVL
NT seq
3699 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattggagcatttcaagcttcagtggaaaacttagagagttaatgacatttagaaga
gagaaatttaaactaaagaatctaatactctatttctcgattatcaccatatttttactg
gcgttattcatacgtttaacacctgcagcgtatgaagtaattttaaaggagtttgatcct
tatttccaatttcgtcaaactcaattcatagttgaaaacgggtttgccgcttggtttaac
tggcatgaccccctatcatggtatccttggggtagggatatcgcatctaattcttatcca
ggtttacctttcgcagccgccgcggtttatctctttctgacaggtatcggtttgccgatc
agtctattagaaatgtgctgggcttggcctgcttttatgggagctttcaccactgttgca
atttattttctagggagggaaatcggctctaagaaggtgggcctcctagccgccttcttt
ctcgccgttatacccgcttactttcaaagaacgatcgccggcttcttcgataatgaaacc
ctcggcatacttttaatggtgttaacaacctacttttatattagagctattaaacgggaa
tcaatgttttcaggtttactagcaggtttagctttggcatacttgactttaacatggggg
gctaacatctacttcttttatctaatccctctttctaatttaattcttttaattcttaga
aaatataagtcgttttacttaataccttacgctttagtgattggaatacctatgctagta
ggatctcagattcctttaatcggtggagtcaacatattattcaataatatcggggttgtt
tcaataggtgtactcagcatcctagtactatacgagttgttaaacagatttagaaaaacc
gacctttacctgagaattaaacctcacattctccctatgataggtggggttataggagtc
atagttatagttttagtggctgtcaattttatagctcaaatcaatgtcttatcccctata
ataggtgtattcacgaatttatcagccagatttatatctataattaatccattagccaga
tcagaggtttatttagtcgcctcagtaggggagcacgccgtctcctcttggggtgtattc
tactactatcttttcatacctgtattcttattcccggtgggggtttactttattcttaaa
cgtgtagaaccgtatgatattattcttttaacagctttaattacttccctatacttcgca
gcttctatgattcgtataatccttattttagctccattcatatgtttattcgcctcatac
gggcttgtaactgtgatgaaacccttctcatatattatcagcaaggaggctgtagcggtc
tcaactagaaagatgcgtgtggctaaaactgtttcacgcgaatacagtgttgtagccttc
gggttagtgtttattcttttagcagcgaatttatggcatggaatggaaatgtctaaacaa
ttcgcctctcctgaaatgattggtttaggcgcctactatgattggcaggaatcttttcaa
tggatgaggaataacattggaacaggtaaagttgtactttcatggtgggattacggttac
tggataaccgccgtggctaatcaaactagtttaatggataacgggacgtttaatcaaacg
caaatagctaagctaggtttagctttagtttcaaatgatgtggaagctcttaaaatacta
agagaatacggcgtagagtatgttctagttcacttcggctattttatcccttcattaagc
ggggatgaaggtaaatggatttggatggttagaatagcttcagataacttcccagagctt
ataagtgaaagccagtactataacgctacatcaggtaaacctacatctaagttcttcgac
agcctcatatacaaactattattctataaagagcctgggacatatgagttagcatattat
gtaagtaataccatggataaattaggatatcctaagtatcaagcttatccaaccagtcag
atttggaagtttattggagctgatacaagttatcctatttacagagtagcctacctctcc
tcccacaacttggttaaactctatcaagtggattatacgattctagatacttggcttaaa
atagttaacacttcagtatacacttttttaggtaaaaccacagctctcgtaaccgttaaa
aacaacggctcaactcctgtgacattagacacctcaccgtcctctatttttattaacgga
actaaactctcagtaatcggcggttcagcatccatagctgagggttccgcgttaatgaat
cctggggatacctgcgttgttaaaatagatgttaactcgccttccacgattggctcacaa
tttaatactactgtaagctctgttgaattctacggctaccgtaaatcctctgaaatcaac
gttgttagatcagccggctccttcaacatatctattataaacgctaccgcttatagtaat
gaaacaatatttttaactgttcaaaacacgggaagcgaatacttaactgtttcgaagatt
tacgttaacggttcttctaacggaattagcttcacaggcgatttaaccatcgctcctaac
cagtttgaaacctatgctattacacttaaccgggtcgcctatccatctctcaatctcaac
gtatctgacatcgttaacctgagtataactacatgggagggtgtttccgctagtttaaca
ggtgttactgtacaggcgccacccggctataatttcactttaactaatgttaacgctttc
agtaatgaaactgttttattcaccgtctacaataacgggtcatatccgttagacttatcc
catataatattgagcgtaaacctcggagacttcacattctataaatctagcgtaactgct
ttaaacggtagtttaaccgttaaccccggggttgctgtaagatataaactctcatgggcg
ccttcacttttagatttaaatcaaagtgacactgttaatataacagtttacacttatcag
ggtctagattactccgctcttaatgtaactgttatagagccaagcggctacgattatatt
ttgaatggtcaagtatacgataatgaaacagcatatcttacaatatataacaacggctct
tatcctgtaactttgagcacagttaccgttaatgatactcttgtaactagtataacgccg
gttaacggttctatgactgttaaccccggagcagctacgttatacagaattttatgggat
ccgtttatatttaatgtgagttcaggcgactatgtaactttgaaaacagttacatacgaa
gatattaatagaactgttagcatgcttgtagagtcctctaattactctatgattatagac
tcttctctaacttcagtgtactctaataacactctcttcataacattgaataatacgagc
ccctctctcccaattagtaatttcactatcctagttgaaaaccaaacttcaggtgaatta
cagtatttgacatggactggcgtgttgaattcaagtgaatctgttaatttaagttttcag
ctcgcacagctacctgctttaaacccgggtgaacctgttagaattctagttaaatgcgtt
gaaggtgctagcgatcagataactgtgatagttttatga
DBGET
integrated database retrieval system
