Paenimyroides aestuarii: NPX36_11085
Help
Entry
NPX36_11085 CDS
T09513
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
paae
Paenimyroides aestuarii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
paae00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
paae02000
]
NPX36_11085
Transporters [BR:
paae02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NPX36_11085
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UUV20858
UniProt:
A0ABY5NQM6
LinkDB
All DBs
Position
complement(2282703..2284544)
Genome browser
AA seq
613 aa
AA seq
DB search
MSNRFFHSLAACFMGFVAFSQNTAPIELDELVIEKIKISAQSKSQNLVVLNDSLIENSIG
TFTDFLQKNTTIYFKESGYGMVSSPAFRGTTAQQTSVLWNGIRVNSALLGQSDFNATAFK
SYDNIVVKAGGGSVLYGSSAIGGTIHLNNQLQFNRKTENELQLHYGSFNTQSIHYKITTG
FDKFAVNAHFGYNKSDNDYEWIGKNRKNINGQFYNTNFGLEAAYKINRKNTLSFYSTTYN
DDRHFALLTPFQTKTKYQNNNYRNLLKWHFKTNTFLNTFYAAVLNESYTYFDQLPTNSKS
GGKANTLYFKNESFYNVLQHFKLSGFVEYQKTTGEGQNSSLPFSTQEIFAVSVLGNYEFT
ERFGMEAGAKNEMAKDYSNPFLFSAGFFYNSPFYQLKINTSKNYRIPTFNDLYWQPGGNL
NLKPETSLQLDVNQNFIFKNTRMNVSAYTISIKDMIRWIPTNSGFWEANNVDEVRVFGID
FFANYQKKWAYHVVELQANYGYTQSIDQTTKKQLTYTPLHKLNAQLIYKYRNFSVSPSFL
YVGKIYTTASNTAASALNSYGIIDVDFQQKFNLKNNPFYINLKIKNAANTVYTNMPERVM
PGRNIHLQLIKKF
NT seq
1842 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaatagattttttcattcattggcagcgtgttttatgggttttgtggctttttcg
caaaacactgctcctattgaattagatgaattggttattgaaaaaattaaaatttctgca
caatcaaaatcccaaaatcttgtcgttttaaacgattcgcttattgaaaacagcatcgga
acgtttactgattttctgcaaaaaaacactacaatttattttaaagaaagtggctatgga
atggtgagttcgcctgcttttagaggaactactgcccagcaaacaagtgttttgtggaac
ggaataagagttaattcggcgttattagggcaatctgattttaatgctaccgcttttaaa
agttacgacaacattgtggttaaagcaggtggtggaagcgttttgtatggaagcagcgct
attggcggaacgattcatttaaacaatcaattgcaatttaaccgtaaaactgaaaatgag
ttgcagttgcactacggtagttttaatactcaaagcattcattataaaataacaactggt
tttgataaatttgcagtcaatgctcattttggttacaataaaagcgataatgattacgaa
tggattggtaaaaatcgcaaaaacattaatggtcaattttacaataccaactttggattg
gaagcggcttataagatcaatcggaaaaacaccttgtctttttattccacaacttataat
gacgaccgccactttgcattgctcaccccatttcaaaccaaaacaaaatatcaaaacaac
aattaccgcaatttattgaagtggcattttaaaacgaatacctttttaaacactttttat
gcggctgtgttgaacgaatcatatacctattttgatcaattgcccaccaacagcaaatcg
ggcggaaaagcaaatacgctgtactttaaaaatgaaagtttctataatgttttgcaacat
tttaaactatcgggctttgttgaataccaaaaaacaacaggtgaaggacaaaattcgagc
ttgccattttctacacaagaaatttttgcagtgagtgttttggggaattatgaatttacg
gaacgctttggaatggaagcaggtgctaaaaacgaaatggcaaaagattacagcaatccg
tttttgttttctgcaggatttttttacaattcaccgttttatcagttaaaaataaataca
tctaaaaattatcgcatacccacatttaatgatttatattggcaaccgggtggaaacttg
aatttgaaacctgaaaccagcttgcaattggatgtcaatcaaaactttatcttcaaaaac
acacgaatgaatgtttcggcatatactatttctattaaagatatgattcgatggattcca
acaaacagtggtttttgggaagccaataatgtggacgaagtacgcgtttttggaatagat
ttttttgcaaactaccagaaaaaatgggcgtatcatgtggtggaattgcaagccaattat
ggatacacccaatctatcgatcaaactacaaaaaaacagttgacctatacaccattgcat
aaattgaatgcgcaattgatttataaatatcggaatttcagtgtgagtccgtcgttttta
tatgtaggaaaaatctatactactgcttcaaacaccgcagcatcggctttgaattcttat
ggaatcattgatgtagattttcagcaaaaattcaatctaaaaaacaacccgttttatatc
aatctaaaaataaaaaatgctgccaatacggtttacaccaatatgcccgaacgagtgatg
ccaggcagaaacattcatctacaattaataaaaaagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system