Pyxicephalus adspersus (African bullfrog): 140323030
Help
Entry
140323030 CDS
T11284
Symbol
NOTCH3
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 3
KO
K20995
Notch 3
Organism
pads Pyxicephalus adspersus (African bullfrog)
Pathway
pads04330
Notch signaling pathway
pads04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pads00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
140323030 (NOTCH3)
04371 Apelin signaling pathway
140323030 (NOTCH3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
EGF_3
Ank
Notch
NODP
Ank_4
NOD
Ank_3
Ank_5
EGF_2
cEGF
EGF_DL_JAG
Ank_KRIT1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140323030
NCBI-ProteinID:
XP_072255861
LinkDB
All DBs
Position
2:17715409..17781765
Genome browser
AA seq
2408 aa
AA seq
DB search
MGRPGMYGLVWVAAVLLSLGGGIYGFQCLDTYRPCQNGARCTMYSNGEAACLCPTGWIGD
YCQFKDPCVPTPCVNGGACQNSIRGGTVQYECSCPKGFRGQDCSLIDACASNPCENGARC
TNWNGRYNCTCPPGYQGRSCRLDIDECRTSGLCQNGGQCINTQGSFRCRCPSSFTGQFCE
ANYVPCAPSQCQNGGTWRPTGDLSYQCVCLPGFEGLNCEINVDDCPDHKCMNGATCVDGV
NTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHTCVCVNGWTGESCSENI
DDCATAVCFNGATCHDRVASFYCECPMGKTGLLCHLEDACVSNPCHKDAMCDTNPVNGRA
ICTCPPGFTGGACDQDVDECSIGANPCEHFGRCVNTQGSFQCQCGRGYTGPRCETDVNEC
LSTPCQNDATCLDRIGEFTCICMAGFTGTFCELNINECDSSPCVNGGLCKDMVNGFTCSC
PAGFTGSMCQIDIDECASTPCKNGAKCVDRPNGYECRCAEGFEGTLCERNINECSPDPCH
HGKCQDGIASFTCTCDPGYTGYRCENQINECHSNPCLHGGKCIDLVNKYLCFCQQGTSGV
NCEYNYDDCASNPCDYGECKDGINKYECVCKPGFTGPLCNIEVSPCASNPCRSGGTCQVT
QNGFRCVCPEGGGPRDSLCNPTQLCSPACVHGVCRKANEIYTCECHQGWSGRSCDRRSSD
VCTGSTCQNGGSCSDHLGRPVCRCREGFRGNFCESNINECAPAPCLNGGTCVDGIAGYSC
LCTLPYTGQTCETLLAPCSSEPCHNGGVCTPSADYESYTCKCLSGWEGESCDIDVNECNR
SPCQNGGQCANLPGGYNCVCKPGYTGHNCETDINDCSPNPCLNGGSCKDLVNSYSCSCLP
GFTGSRCVNEINECLSNPCRNGATCLDYVNSYVCACAPGYTGPICETNIQDCTESSCFNG
GTCVDGVDSYSCICRSGFTGSHCQHEVDECASRPCQNGAVCVDRVESYRCICPNGYTGTQ
CQTLLDLCRRSPCHNGGRCTQIGPSIRCECPPGWTGSYCDIPRVSCDVAASRKGVRLDQL
CHASGTCMNTGNSHKCFCKGGYTGSYCETPINQCDPDPCLNGGSCHSYLGGYVCECQVGF
EGTNCEVNIDECQSHPCQNGGSCIDLIGRYICSCPPGTLGVLCEINEDDCSTLTSSGQPK
CLNNGTCVDKVGGYRCNCPPGYTGERCEGDINECLSGPCVTHNTRDCIQMANDYQCICKN
GYTGRRCQSVVNTCESRPCQNGGVCRVTVNTPLGYTCRCPTGFAGPSCERPLNSCRNFDC
PAGFSCVLSSHGPRCCPQGVCRTINGTRIQPPLSPPACSPSPCQNGAQCVSSDKFPYFTC
NCPPGYVGPRCDLKLPTEEVPARECGPSRCLNKIGDGHCDRECNSPECHWDGGDCALSVG
DPWKKCPSQKCPLLFNNSRCDPECASADCLYDNFDCQEKTERSCNPVYEQYCMDHYGDGR
CDQGCNSEECGWDGLDCAGSRDGEQLAEGVLVIVVLLPPEQLLKESKAFLLRLSAILRTS
LRFRVDKDGQYMIKPYRRSQAAERRVRRELDSDIIGSEVFLEIDNRLCKKQVDKEPSECF
PDAENAADYLAALSAVERLHFPYPIKSVSSDKIDEPLPSLHLLPLVGVAGLLVLIVLVLG
VLVSRRKRAHSTLWFPEGFILKKDRDRREPVGQDALGLKNIAKAERLMEDPSEDWTEADC
PETKRLKTEELSPCRQDPVDPRPWTQHHLAAADIRLPPATALTPPQGDYETDGMDVNVRG
PDGFTPLMLASFLGGGLEPEAQEDEEEGEASAISDLICQGASLGAQTDRTGETALHLAAR
YARADAAKRLLDAGADPNAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRSTDLDARMSDGST
ALILAARLAVEGMVEELIACHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNIEAAMALLKNGANKDMQ
DSKEETPLFLAAREGSYEAAKVLLDHYANREITDHMDRLPRDIAQERLHHDIVQLLEEHN
AVRGTQGTMGGHTMSPLLCPPNGFMGNIKQTPQGKKSRRASSKAGGASLSRGEAKEAKNR
NKKLSLDCPNGNNGLLESSVTLSPVDSLDSPRAYSANPGSPAMAAPGTFHLSSLSVPSTP
LVNGLMEGPFAVSLARLNEIGEVQGNMMALQGRVPLQRAPSCVVNGLNIGMLNTSNIPFT
WQNQVPASHPSRNIIPGAPAGSVPNLHQLHAQQVMMLQNQMAMQSPVKVSMDPQCQMGPV
APNTAHLRQQSMPHVAERSSQAVTPTEGNYFKQQSIPNDGNIQTSPAMAGPQQTFVPPQE
ETPKHYLHIPTEHPYLTPSPESPEQWSSPSPHSVSEWSDTTPSPVVVGGTHSQTSHLPEQ
ANNMQVFA
NT seq
7227 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggcggccggggatgtacggactcgtctgggtcgctgcagtgctgctgagtcttggt
ggaggaatctacggttttcagtgtttggatacctacagaccatgtcagaatggagcaaga
tgtacaatgtattcaaatggagaagctgcttgtctatgtcccactggatggattggagac
tattgtcagtttaaagatccttgtgtgccaacgccttgtgttaatggaggagcctgccaa
aactccatccgaggaggaactgtccagtatgagtgtagctgtcccaaaggatttagaggt
caagattgctctctcattgacgcctgtgcctctaacccatgtgagaatggtgcccggtgt
accaattggaatggtcgctacaactgtacctgcccaccaggataccagggacgcagttgt
cggctagatattgatgaatgtcgaacttctggactttgccaaaatggcggacagtgcatt
aacacccaaggttcattccgctgccgttgcccgagtagtttcaccggccagttttgtgag
gccaactatgtgccatgtgctccttcccaatgtcagaatggaggcacctggcgccctaca
ggagacctctcctatcaatgtgtctgcctgccaggttttgaaggactaaactgtgagata
aacgtggatgactgcccggaccataaatgtatgaacggtgccacatgtgtggatggagtg
aacacttacaattgtcagtgtccccctgagtggacaggtcagttctgtacagaagacgta
gatgagtgccagctgcagcccaatgcctgccacaatggcggaacctgctttaacactctg
ggcgggcacacatgcgtctgtgtcaatggctggaccggagagagctgcagcgagaacatt
gatgactgtgccaccgccgtgtgctttaatggcgccacctgccatgaccgggtagcctca
ttttactgcgaatgccccatgggcaagactggtctgctatgtcatttggaggatgcctgt
gttagcaatccgtgccacaaggatgccatgtgtgatactaacccagtgaacgggcgagca
atctgcacatgtccaccaggttttacaggaggagcttgtgaccaggatgtggatgaatgc
tcgataggcgccaacccctgtgagcactttggtcgttgtgtgaacactcaaggttctttc
cagtgccaatgtggtcggggttacactggtcctcgatgtgaaacggatgtcaatgaatgc
ttatccaccccctgccagaatgatgccacctgcctggaccgtataggggaattcacctgt
atctgtatggcaggcttcactggtacattctgtgaattgaacatcaatgaatgtgacagc
agtccgtgtgtaaatggaggactttgtaaggatatggtgaacggatttacctgcagctgt
cctgctggttttaccggctcgatgtgccagattgacattgatgagtgtgccagcactccc
tgtaagaacggagccaagtgtgtggatagacccaacggttacgagtgtcgttgtgcggag
ggatttgagggtactctttgcgagcgtaacataaacgaatgttcccctgacccatgccac
catgggaagtgccaggatggcattgccagcttcacctgcacatgtgaccccggatatact
ggctaccgctgtgagaaccagataaacgaatgccacagtaacccgtgtcttcatggagga
aaatgcattgacctggtcaacaaatacctctgcttctgtcagcagggaacctcaggtgtg
aactgtgagtacaactatgatgattgtgccagcaacccttgtgactatggagaatgtaaa
gatggaatcaacaaatacgaatgtgtctgcaaaccaggatttacaggtcccctctgtaac
atagaggtctctccgtgtgcatctaacccctgccgttctggaggaacctgtcaagttaca
cagaatggattccgctgtgtttgtcctgaaggtggtggtcctcgcgactccctatgtaac
ccaacccagctatgctctcctgcctgtgtccatggtgtgtgccgcaaagccaatgaaata
tatacatgtgaatgtcaccagggctggtctggcaggtcgtgtgaccgacgaagcagtgat
gtttgtactggcagcacttgtcagaatggaggaagttgcagtgaccatcttggacgacca
gtctgtcgctgtcgggagggcttccgaggtaacttttgtgagagtaacattaatgaatgc
gccccagctccttgcctgaatggagggacctgtgttgatggcattgcaggatacagttgt
ctatgtacactgccatatacaggccagacatgtgagaccctacttgccccctgcagctct
gaaccttgtcataatggtggtgtctgcacaccatctgcagactatgaaagctacacctgc
aaatgtctttctggctgggaaggtgagtcctgtgacatcgatgtgaatgagtgcaacaga
agcccttgccaaaatggtggacagtgtgccaaccttccaggaggatacaactgtgtctgt
aaaccaggatacacaggccacaactgtgagaccgatattaatgattgttcaccaaatcca
tgtcttaatggtggctcatgcaaagatctggtgaattcctactcctgctcatgtctacct
ggcttcaccggatcaagatgtgtgaatgaaatcaatgaatgtctcagtaatccatgccgc
aatggagccacctgcttggattatgttaacagctatgtgtgcgcttgtgctccaggatac
accgggcctatctgcgaaaccaacatacaggactgtactgagagctcctgctttaatggc
ggcacatgcgttgatggtgtagactcctactcctgcatctgtcgctctggattcaccggt
tctcattgccagcatgaagttgatgagtgcgcttctcgcccctgccagaatggagccgtg
tgtgtggacagggtggagtcctatcgctgtatctgtcccaatgggtacacagggacacag
tgccagactttgctggacctttgccgtcgttccccctgccataatggaggtcgttgcact
cagataggtccatctatccggtgcgagtgccctcctggctggacaggaagttattgcgat
atcccacgtgtatcttgtgacgtagcagcaagcaggaaaggtgttcgtctggatcagctc
tgccatgcttcaggaacctgtatgaacactggcaactctcacaagtgtttctgcaaaggc
ggctacactggtagctactgcgagactcccatcaaccagtgtgaccctgatccttgtctt
aatggaggctcctgccacagctacttgggtggttatgtgtgcgagtgccaagttggattt
gagggaaccaactgtgaagttaacatagatgagtgccaatctcatccttgtcagaacgga
ggttcttgtattgaccttattggacgttacatctgttcctgtcctccagggaccctggga
gtgctgtgtgagattaatgaagacgactgctccacactcaccagttctggccagcccaaa
tgtttaaacaatggaacttgtgtggataaagttgggggttaccgctgcaactgccctcca
ggttataccggcgagaggtgtgagggtgacatcaatgagtgcctgtctggaccatgcgtg
acacacaacacccgagactgcatccagatggctaatgattatcagtgcatatgcaaaaat
ggctacacaggtcggcgctgccagagtgtggttaatacatgcgagtctaggccatgccaa
aatggaggtgtctgccgtgtgactgtaaacaccccacttggttacacctgccgttgtcct
acaggttttgctggaccatcctgtgagcgccctttaaattcctgccgaaattttgattgt
ccagcaggcttctcctgtgtcctttcatctcatggtcctcgttgttgccctcaaggtgtc
tgccgtactataaacggcaccagaatccagccacctctcagtcctccagcctgctcccct
tcaccctgccaaaatggagctcagtgtgtctcttctgacaagtttccctacttcacctgc
aactgcccaccaggctatgttggaccacgatgtgatttgaagctcccaactgaggaagta
ccagcccgggaatgtggtccatcacggtgcctcaacaagatcggagatggtcactgtgac
cgggaatgcaattctccagaatgtcactgggatggcggagattgtgctctgtctgtgggt
gacccatggaaaaaatgtccctcacaaaaatgccctctcctgttcaacaactccagatgc
gatccagagtgcgcctcggctgactgtctgtatgacaactttgattgccaggagaagacc
gagcgtagctgcaaccctgtctatgaacaatactgcatggaccactatggtgatggccgg
tgtgaccagggatgtaattcagaggaatgtggttgggatggtcttgactgtgctggaagc
cgggatggagagcaattggcagagggagtgctggtcattgtggttctgctccctcctgaa
cagctcctgaaggaaagcaaagcattcctgctcaggcttagtgccattctacgcacttct
ctgcgcttccgtgtggacaaagatggccagtacatgattaaaccatacaggagaagccag
gcagccgaacgaagggtgaggagagagctggacagtgacatcatagggtctgaagtgttc
ttggaaattgacaatcggctgtgtaaaaaacaggttgacaaagagccatccgaatgcttc
ccagatgcagaaaatgctgcagattacctggctgctctgagcgctgtggaaaggctgcat
tttccctatccaatcaagtctgtgagcagtgataagattgacgagcctctcccgtcattg
catcttcttccactggtcggagtagctggactgttggtcttgattgtgttagtgttgggt
gtcctggtatctcgcaggaagcgagctcacagcaccttatggttcccagaaggatttata
ttgaaaaaggacagagacagacgtgagcctgtgggacaggatgctcttggacttaagaat
atcgctaaagcagaacgtctcatggaagatccatctgaagactggactgaggcagactgt
cctgagaccaaaagacttaagactgaggagctttccccctgtcgccaggatcctgtagat
ccacgtccctggacacagcaccacttagctgctgcagatattagacttcctccggctaca
gcactgactccaccacagggtgattatgagactgatggcatggatgttaacgtgagaggc
ccagatggattcactccattgatgctggcatccttcttgggaggtgggctggagccagag
gctcaggaagatgaggaagaaggggaggcctcagcaatttctgaccttatctgccaagga
gcatctcttggggcacagacagatcgaaccggtgagacggctctacatcttgcagcacga
tatgccagagcagacgctgccaagagacttttggatgctggcgctgatcccaacgctcag
gataatactgggcgtaccccactacatgctgctgtagctgccgacgcacaaggtgttttc
cagatcttgataaggaaccgctctacagacctagatgctcgaatgagtgatggctctact
gcattgattttggctgcccgtttggcagtggaaggaatggtggaggagcttatcgcctgc
catgctgatgtcaatgctgtggatgaacttggcaagtcagctttgcattgggcagcagct
gttaacaacattgaagctgccatggcactgctaaagaatggagccaacaaagacatgcag
gatagcaaggaggaaaccccattgttcctagcagctcgggaaggaagttatgaagcggca
aaagttctccttgatcactacgctaatcgtgaaattactgaccatatggaccgccttcct
cgtgacatagctcaggagaggctacaccatgatattgttcaacttctagaggaacacaat
gcagtacggggtactcaagggacaatgggaggtcacactatgtcaccactgctctgtcct
cctaacggttttatgggcaacataaagcagacaccacaaggcaagaaaagccgcagagca
agctccaaagccggtggagcaagcctgagccggggagaagcaaaggaagcgaaaaacaga
aacaagaagctgtctcttgactgcccaaatggcaacaatggtcttctggagagctcagtc
accctctcacctgttgactccctcgactctccacgtgcttacagtgccaatcctggctcc
ccagcaatggctgcccctggcacatttcaccttagttccttgtctgtgccatctacccct
cttgtgaatggcctgatggaagggccttttgctgtgtctttggctcgtctaaacgaaatt
ggagaagtccaaggtaacatgatggctcttcaaggcagagtgccacttcagcgagcacca
agctgtgtggtaaatggattaaacatcggtatgctgaacacaagcaacattccattcaca
tggcagaaccaagttcccgcttcacatccttctcgcaacatcattccaggagctcctgca
ggttcagtgcctaacttacatcagctgcatgcccaacaagtcatgatgcttcaaaaccag
atggcaatgcagagcccagtaaaggtctccatggatccgcagtgccagatgggcccagtg
gctccaaacactgctcacttgagacaacagagcatgccacatgtagccgagaggtcatct
caggccgtcaccccaacagaaggaaactactttaaacaacagagcatacccaacgacggc
aacatccagacatcaccagctatggccggtcctcaacaaaccttcgtacctcctcaagag
gaaaccccaaaacactatcttcacatccccactgagcacccttacctgaccccctctcca
gaatctccagagcagtggtccagcccatcacctcactcagtgtcagagtggtctgacacc
acccctagcccagtcgtagttggtggtacccacagccagacatcccacttacctgagcaa
gccaacaacatgcaggtgtttgcttga
DBGET
integrated database retrieval system
