Pyxicephalus adspersus (African bullfrog): 140326541
Help
Entry
140326541 CDS
T11284
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
pads Pyxicephalus adspersus (African bullfrog)
Pathway
pads04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pads00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
140326541
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pads00536
]
140326541
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
pads00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
140326541
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
TB
EGF
FXa_inhibition
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_TEN
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140326541
NCBI-ProteinID:
XP_072261321
LinkDB
All DBs
Position
3:73114816..73211903
Genome browser
AA seq
2494 aa
AA seq
DB search
MGVVWLAKFMLGCTALWYVEQAQGQVELGDHQVDRFAGYEDRQALRVRRRGQDTLRGPNV
CGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCSNGQLSPTCGAGAVMN
CNVRCMNGGSCNEDSCSCQKGYTGTHCGQPICENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCE
RDYRTGPCFTQISNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPN
IRTGACQDVDECQAIPGLCHGGTCINTVGSYECKCPAGHKQSETSQKCEDIDECSTIPNV
CDGGECTNTAGSYVCVCPRGFTTSSDGSRCIDQRAGSCFSALIGGRCAGELPGQYTKGQC
CCDTGRCWAIGQTPEMCPVRGSDEYRRLCIESLPLGPSYPGTYPHGPGGIGPGGVGPGGI
GPGGIGPNGYGPIGVGPNGQGTIGLPSVGTEIGTATLNQTGDICKHFTNLCQNGRCIPTP
NSYRCECNMGYKQDSRLECIDVDECASSPCIHGDCVNTQGSYHCRCHEGFQSNPTKQACI
DIDECIMNGVMCRNGRCVNTEGSFQCICNAGFETTPDGKNCVDHDECATTNMCLNGMCIN
EDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCVDVDECQTPGICMNGRCINTEGSFRCECLGGLTIGIDG
RVCVDTHMRSTCYGGIKKGTCARPFPGAVTKSECCCANPDHGFGEPCQPCPAKNSAEFQA
LCSSGIGITADGRDINECALNSEICPNGICENLRGSYRCICNVGYESDASGKNCVDVDEC
AVNRLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPKGYVFKPESETCEDINECASNPCVNGVCRNNAGSFV
CECSFGSKLDPTGTICVDSMKGTCWLNIQDGRCEVNINGATLKSECCATLGAAWGSPCER
CEIDPACPRGYSRKKGVACEDVNECEVFPGVCPNGRCVNTAGSFKCECPEGLILDSSGRT
CVDIRAEQCYMKWDEDECTAPLPGKYRMDMCCCSVGAAWGFDCEECPKPGSDEYKNICPR
GPGFANRGDVLSGRPFYKDVNECKVFNSLCTHGTCRNSIGSFRCICDSGFALDAEERNCT
DIDECRISPDLCGHGTCVNTPGSFECECFDGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGTC
INTDGSYECICPPGHELNTEGNACVDINECSLSDNLCKNGRCVNMIGTYQCSCDSGFQST
PDRQGCMDIDECSIMNGGCDTQCTNSEGSYECSCSEGYALMPDMRSCADIDECEDNPDIC
DGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASLDMKTCVDVNECDLNPNICLHGECENTKGSFICHCEM
GYFVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDVHASCINVPGNFKCKCRPGWVGDGLKCVDLDECTT
EDHNCNANANCVNTPGSYRCACNEGFNGDGFTCSDVDECADNVNLCENGHCLNAPGGYRC
ECEMGFTPSEDSRACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCVCDDGYELDRSGGNCTDVN
ECADPVNCINGLCVNTPGSYLCNCPQDFELNPTGVGCVDTRVGNCYLETLTRGDASLACS
AEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCESCPLANSTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDEC
QELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPLGYYLNEETRICEDIDECSAHIGICGPGTCYNTLGN
YTCVCPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNYNDTCENELSTNMTKKMCCCSYNIGKAWNKP
CEPCPVPASPEYQVLCGNQAPGFIIDIRTGKPMDIDECSEIPAICTNGVCINQIGSFRCE
CPMGFSYNNILLICEDIDECSSGENLCQINADCINIPGSYRCECSSGYKLSPSGACVGRN
ECNEIPNVCSHGTCMDTTGSYICICHNGFKASADQTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVGS
YNCLCFPGFELTHNNDCMDIDECSSLVGQVCRNGQCINNIGSFQCLCHEGYEITPDGKNC
VDINECVSLPGTCAPGTCQNLEGSFRCICPPGYAVQNDNCIDINECDEEPNICLFGTCTN
TPGSFQCVCPPGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTQFDNGKCSVPKAFNTTKSKCCCSTMAGE
GWGDPCELCPQEGTVAFRELCPYGLGSIPNIGDTREDVNECAENPGICVNGVCINTDGSF
RCECPFGYNLDYTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCSNVVGGFECACDEGFEPGPMMTCEDI
NECTNPLLCAFRCINTFGSYECTCPSGYTLREDRRMCKDLDECAEGLHDCESRGMMCKNL
IGTFMCICPPGMQRRPDGEGCMDENECRTKPGICPNGRCVNTIGSYRCDCNEGFQVSDSG
TECIDTRQGSCFTEVLQTMCQLSSTNRNMVTKSECCCNGGRGWGNQCELCPLPGTAAFKK
MCPHGPGFTTDGRDIDECKVLPNLCKNGQCINTIGSFRCHCNLGYTTDITGTTCVDLDEC
SQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQEDGKT
NT seq
7485 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggtggtatggctagccaagttcatgctgggatgtacagcactatggtatgtggag
caagcccaaggccaggtggaacttggtgaccatcaggtggacaggtttgcaggctatgaa
gacagacaagccctaagagtaagaagaagaggacaagacacactaagagggccaaatgtt
tgtggatctcggttccattcctactgttgcccagggtggaaaacattaccaggaggaaac
cagtgcattgttccgatctgtcggaattcatgtggagatggattttgttcacggccaaac
atgtgtacatgttccaacggacaactgtctcccacttgtggggctggtgcagttatgaac
tgtaacgtgcgctgcatgaatggaggatcttgcaatgaggactcatgttcttgtcaaaaa
ggatacactgggactcattgtggacaaccaatctgtgaaaatggttgtcagaacggagga
cgttgcattggacccaacagatgtgcttgtgtttatggttttacaggacctcagtgtgaa
agagattaccggaccgggccttgtttcacacaaatcagcaaccagatgtgtcagggccag
ctcagtggaattgtgtgtacaaagacattgtgctgtgccaccattggccgtgcctggggt
catccatgtgaaatgtgtcctgctcaaccccacccatgccgcagagggtttattccaaat
atccgcactggagcctgccaagatgttgatgaatgtcaagctatacctggtctgtgccat
ggtggcacctgcattaacacggttggttcctatgagtgtaaatgtccagctggacacaaa
cagagcgagacctcccagaagtgtgaagatattgatgagtgcagtacaatacctaatgtg
tgtgatggtggggaatgcaccaatacagctggaagctatgtatgcgtgtgtcctagaggg
tttaccacaagctctgatggatctcgctgcattgatcagagggctggcagctgtttctct
gctttaattgggggccgatgtgctggggaacttcctggccagtacacaaaaggacaatgc
tgctgtgatactgggcgatgctgggccataggtcaaaccccagaaatgtgtccagtcagg
gggtctgatgaataccgaagactttgcattgaaagcctgcccttagggccttcataccca
ggaacttatcctcatgggcctggtggtattggacctggaggagttggccctggtggaatt
ggaccaggaggtattggacctaatggatacggtccgattggagttggaccaaatgggcaa
ggaactattggcttacctagtgtgggtacagagattggaaccgctacattgaatcagact
ggagatatctgtaagcacttcaccaacttgtgccaaaatggacgctgcatccctacacca
aatagttatcggtgtgaatgcaacatgggttacaaacaggacagccgactggaatgtata
gatgtagatgaatgtgccagcagtccatgtattcacggagactgtgtgaacactcaagga
tcataccactgcagatgccatgaggggttccaaagcaatcccaccaaacaagcatgcatt
gacattgatgaatgtataatgaacggagtgatgtgcagaaacgggcggtgtgtgaacaca
gagggcagcttccagtgtatctgtaacgctggctttgagactactcctgatggaaagaat
tgtgtagatcatgatgagtgtgcaaccacaaacatgtgcttgaatggcatgtgcattaat
gaagatggcagttttaagtgcatctgtaaacccggctttgtgctggcacccaatggacgc
tactgtgttgatgtggatgaatgccaaacaccaggaatctgtatgaatggacgctgcata
aacacagagggttctttccgttgtgagtgccttggtggtctgacaattggcattgatggc
cgagtatgtgtggatacccacatgcgaagtacctgctatggaggtattaaaaagggcacc
tgtgcccgcccattccctggcgctgtcactaaatcagaatgctgctgtgctaaccctgac
catggatttggagaaccctgccagccttgccctgccaaaaattctgctgaattccaggct
ctttgtagcagtgggattggaatcactgcagatggaagagatattaatgaatgtgccctg
aactctgaaatctgtcccaatggcatttgtgaaaatttgcgtggcagctatcgctgtata
tgtaatgtgggctatgaatctgatgccagtggaaagaactgcgtagatgttgatgaatgt
gctgtgaaccgcttgctttgcgacaatggcctgtgcaggaacactcctggcagctacaca
tgtacctgccctaaaggttacgtcttcaaacccgaatcagaaacctgtgaagatatcaat
gaatgtgcatccaacccctgtgttaatggggtctgcaggaacaatgctggctcctttgta
tgcgagtgttcattcggaagcaaacttgatcctactgggacaatttgtgtggacagcatg
aagggaacctgttggttaaacatccaagatggtcgatgtgaggtgaacatcaatggagcc
actcttaagtcagaatgctgtgcaaccttaggagctgcttggggcagcccttgtgagcgt
tgtgagattgaccctgcttgtccaagaggatattccaggaagaagggggttgcttgtgaa
gatgtgaatgagtgtgaagtcttccctggagtttgtcccaatgggcgatgtgtaaatact
gctggttcctttaaatgcgagtgtcctgaagggctgatcttggacagctcaggcagaacc
tgtgttgatatacgtgctgaacagtgctacatgaaatgggatgaggatgagtgtacagct
cctttacctggtaaatacaggatggatatgtgctgctgctctgttggtgctgcctggggt
tttgactgtgaagaatgccctaaacctggaagtgacgaatataagaacatctgtccaaga
ggacctggctttgctaacagaggagatgttctttctggccgtccattctacaaagatgtg
aatgagtgtaaggtcttcaacagcctttgtactcatggaacatgtcgtaacagcattgga
agcttcaggtgtatctgtgacagtggttttgctttggatgccgaagaaagaaactgtacc
gacatagatgaatgccgaatttctcctgatctttgtggacatggaacttgtgttaacaca
cctgggagctttgaatgcgaatgctttgatggttatgagagtggcttcatgatgatgaaa
aactgcatggacattgatgagtgtgaaagagacccactgttgtgcagaggaggaacatgt
attaacaccgatggcagctacgaatgtatatgtccacctggtcatgagctgaatacagaa
ggaaacgcctgtgtggatataaatgaatgttccttgagtgataacctgtgcaagaatgga
cgctgtgtgaacatgattggaacataccagtgttcttgtgattctggcttccagtcaaca
cctgaccgacagggttgtatggacattgacgaatgttccatcatgaacggaggatgtgac
acacaatgtaccaattcagagggtagttatgagtgcagctgtagtgagggatatgcactg
atgccagacatgagatcctgtgcagatattgatgaatgtgaggacaacccagacatttgt
gatggaggacagtgtaccaatatcccaggagagtatcgttgcttgtgctttgatggcttt
atggcttctctagacatgaagacatgtgtagatgttaatgagtgtgacctgaacccaaac
atctgcctgcacggagagtgtgaaaacactaaaggttctttcatctgtcactgtgagatg
ggttactttgtgaagaagggaaccacaggatgcacagatgtcgatgaatgtgaaataggt
gcacacaactgtgatgtgcatgcatcttgcatcaatgtacccggaaactttaaatgcaaa
tgtcgacccggttgggttggagatggccttaaatgtgttgatctggatgaatgtactaca
gaggaccacaactgtaacgcaaatgccaactgtgtaaacactcctggctcttacagatgt
gcctgcaatgaaggattcaatggagatggctttacttgctcagatgttgatgagtgtgca
gacaatgtaaacctgtgtgaaaatggccattgcctaaatgctcctggagggtaccgctgt
gagtgtgaaatgggattcactccttctgaggacagcagggcttgtcaagatattgatgag
tgcacattccagaatatttgtgtctttggaacatgccagaatctgccaggaatgttccgc
tgtgtctgtgatgatggctatgagcttgacagaagtggaggcaactgtactgatgtgaat
gaatgtgctgacccggtgaactgtatcaatggtctgtgtgtgaacactcccggaagttac
ttgtgcaactgcccacaggactttgaattaaatcccaccggagttggttgtgttgatact
cgtgttggaaactgctacttggaaacactgacaagaggagatgccagccttgcctgcagt
gctgagataggagttggtgttacacgagcatcttgctgttgctctctgggacgtgcctgg
ggcaacccttgtgaaagctgccctcttgccaactctactgaatataaaacactctgccct
ggaggagaaggatttagaccaaatcctataacagtcattttagaagatattgatgaatgc
caggaactcccaggcctgtgtcagggtggcaactgtgtgaacacttttggaagtttccag
tgtgaatgtccacttggctactacctgaatgaggaaacccgcatttgtgaagacattgat
gagtgctctgctcacattggaatctgtggacctggtacttgttataacacacttggaaac
tacacctgtgtttgcccaccagagtatatgcaagtcaatggaggaaacaactgcatggat
atgagaaagagtgtgtgttaccgtaactacaatgatacatgtgaaaatgaactgtccacc
aacatgacaaagaaaatgtgctgctgttcctacaacattggtaaagcctggaacaaacct
tgtgagccatgtcctgtgccagccagtcccgaataccaggttctttgtggaaaccaggca
cccggttttattattgatatccgaactggaaaacctatggatattgatgagtgcagtgaa
attccagcaatctgcaccaatggagtctgcatcaaccagattggaagcttccgctgtgaa
tgtcctatgggattcagctacaataacattcttctcatctgtgaagatattgatgagtgc
agcagtggagaaaacctgtgccagataaatgcagattgcattaacatcccaggctcatac
cgctgtgaatgttcaagtggatacaagctgtcacctagtggagcctgtgttggccgaaat
gaatgtaatgagatcccaaatgtatgcagccatggaacatgtatggacacaacaggaagc
tacatatgcatatgtcacaatggattcaaagcaagtgctgaccaaaccatgtgcatggat
attgatgagtgtgatcgccagccttgcggcaatggtacttgcaagaacaccgtgggctct
tataactgcctctgcttccccggctttgaactgactcacaacaatgactgcatggacata
gatgaatgctcttcccttgtgggacaagtatgccgaaatggacagtgcatcaacaatatt
ggctccttccagtgtctatgtcatgaaggctatgaaatcactccagatggaaaaaattgt
gttgatattaatgagtgtgttagcttacctggtacctgcgctccaggcacatgtcaaaat
ctggaaggatctttccgctgtatctgccctccaggttatgcagtacagaatgacaactgt
attgatattaatgaatgtgatgaagagcccaacatctgtctctttggaacctgtactaac
actcctggcagcttccagtgtgtttgtccaccaggatttgtcttgtctgataatgggcgt
cgttgctttgatactcgccagagtttctgcttcactcagtttgataatggaaaatgctca
gtgcctaaagcctttaacactacaaaatcaaagtgctgctgcagtacaatggctggcgag
ggctggggagatccttgtgagctctgtccacaggaaggaactgtggctttccgggaactc
tgtccatatggtttgggctccatccctaacatcggagataccagagaagatgtcaatgaa
tgtgctgaaaaccctggaatttgtgtcaatggagtctgtattaacacggatggctctttc
cgatgcgaatgtccatttggatacaatctagactacacaggtgttaactgtgttgatacg
gatgagtgctctattggaaacccatgtggaaatggaacatgttccaacgtggttggagga
ttcgaatgtgcttgtgatgaaggtttcgaaccagggccaatgatgacttgtgaagatatc
aatgaatgcacaaacccacttctgtgtgctttccgctgcataaacacttttggatcctat
gaatgcacatgtccatctggatataccttaagagaagaccgcagaatgtgcaaagatttg
gatgaatgtgcagaaggtctacatgactgtgaatcccgaggaatgatgtgcaagaacctg
attggtacattcatgtgtatctgtccaccaggcatgcagcgacgtccagatggagaaggt
tgcatggatgaaaatgaatgtcgtacaaagcctggaatctgccctaatggacgctgtgtg
aatactattggaagttacaggtgtgattgcaatgaaggcttccaggttagcgactctgga
acagaatgtattgacacacgccaaggctcatgtttcactgaagtgctacaaacaatgtgc
caactttcatctacaaatcgcaacatggtcaccaagtcagaatgctgttgtaatggagga
agaggctggggtaaccagtgtgaactctgtcctcttcctggaactgcagcatttaagaaa
atgtgtccacatggccctggcttcactacagatggcagagatattgatgagtgtaaagtg
cttcctaacctgtgcaaaaatggacaatgcataaatacaattgggtccttccgttgtcat
tgcaatttgggctacaccacagacattactggaacaacttgtgtcgatctggatgaatgc
tcccagtctcctaaaccttgcaactttatatgcaagaatactgagggcagctaccagtgt
tcttgtccaagaggctacatcttgcaagaagatggcaagacctga
DBGET
integrated database retrieval system
