Pyxicephalus adspersus (African bullfrog): 140344196
Help
Entry
140344196 CDS
T11284
Symbol
NOTCH1
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1
KO
K02599
Notch 1
Organism
pads Pyxicephalus adspersus (African bullfrog)
Pathway
pads04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pads00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
140344196 (NOTCH1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
EGF_2
Ank
NOD
Notch
NODP
Ank_4
Ank_3
Ank_5
EGF_3
EGF_DL_JAG
cEGF
DUF4199
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140344196
NCBI-ProteinID:
XP_072287292
LinkDB
All DBs
Position
Z:48362544..48413272
Genome browser
AA seq
2532 aa
AA seq
DB search
MQPGRGMGHVVLLVLLLLSLTIHTQGLRCTQPGETCLNNGKCDSSGTECRCTSSFIGERC
QFPNPCSSSPCLNGGSCQAEVRGGISQFTCTCPLGYQDARCLTRKDNACLSSPCRNGGTC
ELVINEKNYRCRCPPGWTGDTCQQADACASNPCGNGGTCVPFDSQYVCKCLEGFHGETCK
QDVNECKQNPCKNGGTCINGFGSFSCLCKSRFTGNFCENPYVPCNPSPCQNGGTCRQIDD
TSYECTCLPGFAGQNCEENIDDCPGHNCKNGGTCVDGVNTYNCQCPPDWTGQYCTEDVDE
CQLMPNACQNGGTCHNTHGGFNCVCVNGWTGEDCSENIDDCANAACNNGATCHDRVASFY
CECPHGRTGLLCHLEDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACNHDVDECSL
GANPCEHAGKCINTQGSFQCNCLPGYAGPRCEIDVNECLSNPCQNDATCLDQIGGFQCIC
MPGYEGTYCEINTDECSSNPCLHNGKCIDKINEFHCECPTGFNGPQCQYDIDECASTPCK
NGAKCVDGPNAYTCKCAEGFTGVHCETDINDCHPDPCHYGTCIDGIATFTCQCRPGFTGR
LCDTDINECQSMPCQNGGECMDKINSYVCQCLRGTSGTNCEINLDDCASNPCDSGKCIDK
IDGYECACEPGYTGKMCNINIDECASNPCRHGGTCEDLVNGFKCTCPEGFQGPTCLSEVD
ECRSNPCIHGICRDGVNGYKCNCDSGWSGTNCDINNNECDSNPCMNLGTCKDMTSGYICS
CREGFTGVNCQTNINECASNPCLNQGTCIDGVAGYKCICPLPYTGETCEDVLAPCGNSPC
KNGGRCQESEDYESFSCICPVGWQGQTCEIDINECVKNPCRNGALCQNTNGSYKCNCKPG
YTGRNCETDINDCLPNPCHNGGSCTDEVNDFFCNCLPGFRGLKCDEDINECASNPCKNGA
NCTDCVNSYTCTCPSGFSGIHCEINTPDCTESSCFNGGTCIDGINSFTCLCPPGFTGSYC
QHDINECDSKPCMNGGTCQDSYGTYKCTCPQGYTGINCQNLVRWCDSSPCKNGGKCWQTN
NLYRCECNSGWTGLYCDVPNVSCEVAALQRNVDVNNLCRNSGSCRDTGNTHYCLCQPGYT
GSYCEEQVDECSPNPCQNGATCTDYLGGYSCECVAGYHGVNCSEEINECHSHPCQNGGTC
IDLINTYKCSCPRGTQGVHCEINIDDCNPFYEGPNQEPKCFNGGKCVDRVGGYHCNCLPG
FVGERCEGDVNECLSNPCDVRGTQNCVQLINDYRCECRQGFTGRRCESLLDGCKAKPCRN
GGTCAIASNTERGFICKCPAGFDGATCEYDTRMCGNLQCLNGGTCVSTLKSPKCLCAEGF
TGLECQHSVSSSCNPNSCYNGGTCKSLPQEPFYQCICPKNFNGLFCHILDYNFEGGPGQD
IIPPKINEKCESDLCAKQAGNKICNAQCNSNACGWDGGDCSLEFNDPWKNCSQALQCWKY
FNDDKCDSQCNNAGCLYDGFDCQKIEVQCNPLYDQYCKDHFQDGHCDQGCNNAECEWDGL
DCANNMPEKLADGTLVVVVLMTPEELKNNSFNFLRELSRILHTNVVFKKNENNDYMIFPY
YGNKEELKKHHIKRSVPEWSEGPSAILGSLKDSLISRRYRRELDQLEVKGSIVYLEIDNR
QCFQASSQCFNSATDVAAFLGALASLGNLDIPYKIEAVKSETAPPLPTSPLYPALVVGAV
ALLLILLVAGVIVNKKRRREHGHLWFPEGYTVKESNKTKKRREPLGEDSVGLKPLKNGAE
GSLMDDNQNEWGDEETLDNKRFRFDDSVLVPDLSDQTDHRQWTQQHLEAADLRPPSMAPT
PPQGEIDADCMDVNVRGPDGFTPLMIAACSGGGLETGNSEEDEDASGQMISDFIGQGANL
HSQTDRTGETALHLAARYARADAAKRLLESSADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQIL
IRNRATDLDARMYDGTTPLILAARLAVEGMVEELINSHADVNAIDELGKSALHWAAAVNN
VDAATVLLKNGANKDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDI
AQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHNGQLGAPTLSPPICSPNGYVGNMKPAVQGKKSRKP
GTKAPGCKDSKDMKARRKKSQEGKNGLLDSGSSGVLSPVDSLESPHGYLSDVSSPPLMTS
PFQQSPPMPLNPLTNMQDAHITLNHLNMATKQEMVAGSNRMGFDAMAPRLTHLSVSSPST
VVNSASMQYTVGGTPAMNGHCDWLTRLQNEMVVNQYNPMRGNLQQGSHQQAQALQHGLMT
SLHSGVPTTLTHMMTYAAMPNTRMTNQPQLIQAQQIQQIQQQNLQLQQQSLQQQQQHNNP
NSASGSHIGAPFCGSNIAQSEMQQMTGNGLHAIIPQDTQILTASLPTALAQSMTTTQFLT
PPSQHSYSSPMDNTPNHQLQVSDHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNMSDWSEGISSPPTNI
QSQHNHIPEAFK
NT seq
7599 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagccaggacgaggaatgggtcacgttgtgttattggtgcttttgctgctgtcattg
actatccacacacaaggtttaaggtgcacacagcctggtgaaacttgcttgaacaatgga
aagtgtgactccagtggaacagaatgcaggtgcaccagttcctttattggagagcgatgc
caattccccaatccatgctccagtagtccttgcctgaatggagggagctgccaggctgaa
gtccgaggtggcatttcccagttcacctgcacttgccctctaggataccaagatgcacgc
tgccttacccgcaaggacaatgcatgcctcagcagcccttgtcgcaatggtggaacctgc
gagctggtcataaatgagaagaattataggtgcagatgccctccaggttggacaggagac
acttgccaacaggctgacgcatgtgcttcaaacccttgtggcaacggtggaacttgtgtc
ccattcgactcacagtacgtgtgcaaatgcctggaaggttttcatggagagacttgcaag
caggacgtcaatgaatgcaaacagaatccatgcaaaaatggtggaacctgtattaatggc
tttggatctttctcttgtctgtgcaagagtcgttttactggcaatttctgtgagaaccca
tatgtgccatgcaacccatcaccatgccaaaacgggggcacctgccgccaaatcgacgac
acttcctatgaatgtacttgcttgcctggatttgcaggtcagaactgtgaggaaaacatt
gacgattgccctggacacaactgcaagaacggagggacctgtgtggatggtgtaaacacc
tataactgtcagtgtccccctgactggactggccagtactgcacagaagatgtggatgaa
tgtcagttgatgccaaatgcttgccagaatggtggtacatgccacaacactcatggggga
tttaattgtgtctgtgtcaacggctggactggagaggattgtagtgaaaacattgatgat
tgtgccaatgctgcttgcaacaatggagctacctgtcatgatagagttgcatctttctac
tgcgaatgtccacatggacgcacaggtcttctctgtcaccttgaggatgcttgtatcagt
aacccatgcaatgagggctccaactgtgataccaaccctgtcaatggcaaagctatctgc
acttgcccatctggctacaccggtcctgcctgcaatcacgatgtggatgagtgctcactt
ggtgccaatccatgtgaacatgcaggaaagtgtatcaacactcaaggttctttccagtgc
aactgtctcccaggctatgctggaccacggtgtgaaattgacgtaaatgaatgtctttca
aacccttgccaaaatgatgccacatgccttgaccagattggtggattccagtgtatctgt
atgccaggctatgaaggcacatactgtgaaatcaatacagatgaatgctccagcaacccc
tgcttacacaatggcaaatgcatcgataaaataaacgagtttcactgtgaatgccctaca
ggcttcaacgggcctcagtgtcagtacgatatagacgaatgtgccagtacaccatgcaag
aacggtgccaagtgtgtagatgggccaaatgcttacacttgcaaatgtgctgaaggtttt
acaggggtgcactgtgagactgacataaacgactgccacccggacccttgccattatggt
acctgcattgatggtattgccactttcacctgccagtgtagacctgggtttaccggaaga
ctatgtgacactgacattaacgaatgccaaagcatgccttgtcagaacggaggagaatgt
atggacaagattaacagctatgtgtgccaatgcctaagggggacctcaggtacaaattgt
gagatcaatttggacgactgtgccagtaacccatgcgactctggcaaatgcattgataag
attgatggctatgagtgtgcctgcgaaccaggttacacaggaaaaatgtgtaacatcaac
attgatgaatgtgccagtaacccctgtcgtcatggagggacttgtgaagaccttgtcaat
ggcttcaagtgcacttgtccagaaggcttccagggacctacgtgtttgtctgaagtggat
gagtgccgcagcaacccttgtatccatggaatatgccgcgatggggttaatgggtacaag
tgtaattgtgactcaggctggagcggcaccaactgtgacattaataacaatgaatgtgac
tccaatccctgtatgaaccttggcacctgcaaggacatgaccagtggctatatctgttcc
tgtagagaagggttcactggagttaactgtcagaccaacattaacgaatgtgcatcgaac
ccttgtctgaatcaaggtacttgcattgatggggttgccggatacaagtgtatttgccca
ctcccctatacaggtgagacatgtgaagatgttctggcaccatgtggtaacagcccatgt
aagaatggaggcagatgtcaagagtctgaagactatgaaagcttctcttgtatttgccct
gtgggatggcaagggcaaacctgtgagatcgacataaatgaatgtgtgaaaaacccatgc
cgaaatggtgctttgtgccagaacacaaacggaagctacaaatgcaactgtaaacccggt
tacactggcaggaactgtgagactgatatcaacgattgtctgccaaatccttgccacaat
ggagggtcctgcactgatgaggttaatgatttcttttgcaactgtttgccgggcttcaga
ggtctaaaatgtgatgaggatattaatgagtgcgcaagcaacccctgtaaaaatggtgcc
aactgcactgactgtgtcaacagttatacctgtacttgtccatctggtttcagcggcatc
cactgtgaaattaatacacctgactgcacagaaagctcctgcttcaatggtggaacttgc
attgatggtattaactcattcacctgcctctgtccacctggctttactggaagctactgc
caacacgacatcaatgagtgtgactccaagccctgcatgaatggtgggacttgccaggac
agctatggcacctacaagtgcacttgccctcaggggtacactgggataaattgtcagaat
ctggttcgttggtgtgattcctcgccttgcaaaaatggaggaaaatgctggcagacaaat
aacctttatcgatgtgaatgtaacagtggctggactggattgtattgtgatgtgcccaat
gtctcatgtgaggttgctgccctacagagaaatgtggatgtcaacaatctgtgccgcaat
tctgggtcatgtagggacactggaaatactcactactgcttgtgccagcctggttataca
ggaagttactgtgaggagcaggtggacgaatgttctcccaatccatgccagaatggagct
acatgtacagactacctaggaggctactcttgtgagtgcgtagctggatatcatggtgtt
aactgctcagaggagatcaatgaatgtcactctcacccttgccagaatggaggaacttgt
attgaccttatcaacacttacaaatgctcctgtcccagaggaactcagggtgttcattgt
gaaattaacatagatgactgcaatccattttatgaaggacccaaccaagaacccaaatgt
tttaatggtggcaagtgcgttgaccgggtaggcgggtaccactgtaactgtctgccggga
tttgttggagagcgctgtgaaggagacgtgaacgagtgcctgtctaatccttgtgatgtc
cgtggaacacagaactgcgtacagctcattaacgattaccgatgtgaatgcagacaggga
ttcacagggagacgctgtgagtcgctacttgatggatgcaaagcaaaaccatgcagaaat
ggaggaacctgcgctatagccagcaatacagagcgtggtttcatctgcaagtgtcctgcg
ggatttgatggcgctacctgtgaatatgacactcggatgtgtggtaacctgcagtgtcta
aatggtggcacctgtgtatctacactaaagagccccaaatgcttgtgtgccgaagggttc
actggtttggagtgccaacattcagtcagcagttcttgcaatcccaattcttgctataac
ggtggcacatgcaagtcacttccccaggagccgttttatcagtgtatttgtcccaagaat
tttaacggtctcttctgccacattttggactacaactttgaaggtggtcctggccaggac
atcatcccaccgaaaatcaacgaaaagtgtgagagcgacttgtgtgccaaacaagctgga
aacaagatctgcaatgctcagtgcaatagtaatgcttgtggttgggatggaggagattgc
tcgctcgaattcaatgacccatggaagaactgctcacaggcactccagtgctggaagtac
ttcaatgacgacaaatgtgactcacagtgcaacaatgcaggttgcctctatgatggtttt
gactgccagaaaattgaagtccagtgcaatcctctttatgaccagtactgcaaagaccat
ttccaggatgggcactgtgatcaaggttgcaacaatgcagagtgtgaatgggatggcctg
gactgtgccaacaacatgcctgaaaaactggcagatggcaccttggtggtggtggtccta
atgactccagaggagctgaagaacaattcctttaatttcctcagagagctgagccggata
cttcacaccaatgttgtcttcaagaagaatgaaaacaatgactatatgattttcccatac
tatggaaacaaggaggagcttaagaaacatcacattaaacgatcggtgccagaatggtcg
gaaggccccagtgccatattaggcagtttgaaggattccctgatttcaagacggtatcgg
agagaactggaccagctggaagtaaaagggtcaattgtatacttagaaatagataaccgg
caatgtttccaggcatcttcccaatgctttaacagtgcaacagatgtagcagcttttctc
ggggcccttgcctctcttgggaacctagacatcccgtataagattgaagctgtaaaaagt
gaaacggcacctccactacccacctctccactgtatcctgctttggttgttggagccgtc
gccctcctgctgatcttgcttgtggccggggtcattgtgaacaagaagagacggagagag
catggacacctctggttcccagagggatacaccgtgaaggagtcaaacaagacaaagaaa
cgaagggagccccttggggaagattctgtgggtttaaagcctttaaagaatggtgcagag
ggttcattgatggatgataatcagaatgagtggggtgatgaagaaacactagataacaag
agattcagattcgatgattctgtgttggttcctgaccttagcgatcagactgatcacaga
caatggacccaacaacatctggaagctgctgatctccgacctccatccatggcacccaca
ccaccgcagggagaaattgatgccgactgtatggatgtcaatgtacgcggaccagatggt
ttcactccactcatgatcgctgcgtgcagtggaggaggcttggaaactggcaacagtgag
gaggatgaagatgcgtctggccaaatgatctcagacttcattggtcagggtgccaaccta
catagccaaactgaccgcactggagagacagcacttcacctggccgcccgatatgcccgt
gctgatgccgccaaacgattgttggaatccagtgcagatgccaatgtgcaggataacatg
gggcgaactccacttcatgccgctgtagccgcagatgcccaaggtgtattccagattctt
atccggaacagagcaacagatcttgatgcccgtatgtatgatggcacaaccccactgatc
ttggcagctcgcttggcagtggaaggaatggttgaagaacttatcaactcccatgctgat
gtgaatgcaatcgatgagttgggaaaatctgctttgcactgggctgctgcagtaaataat
gtggatgctgcaacagtcctgctgaagaatggtgccaataaggacatgcaaaacaataag
gaggagactcctttgttcctggcagcaagagaaggaagctatgaaactgctaaggtgctt
ttggatcactttgcgaacagagacatcactgaccacatggataggctcccccgtgacatt
gcacaggaacgtatgcatcatgacattgtccggttgttggatgaatacaacttagttagg
agtcctcagttacacaacggtcagctgggtgctccaaccttatcccctcccatctgctcc
ccaaatggctatgttgggaatatgaaaccagcagtacaagggaaaaagtctcgaaagcct
ggtaccaaggcccctggttgtaaagattctaaagatatgaaggccaggagaaaaaaatcc
caggaaggaaaaaatggactcctggattcaggaagttctggtgtgttatctccagttgac
tctttggagtcacctcatgggtatttgtcagatgtctcttctcctcctctcatgacctct
ccatttcagcaatctccaccaatgcctcttaaccccctcactaacatgcaagatgctcat
attaccctgaaccacctaaatatggctaccaagcaagaaatggttgctggttccaacaga
atgggctttgatgctatggcaccacgccttacgcatctctctgtgtccagtcccagcact
gttgtaaacagtgcttcaatgcagtatacagtgggtggtacacctgccatgaatgggcat
tgtgactggctgacgaggcttcagaatgaaatggtagtaaaccaatacaatcctatgagg
ggtaaccttcaacaaggtagccaccagcaagcgcaggctctacaacatggcctgatgacg
tctctgcacagtggtgtaccgactactctaacacatatgatgacctacgcagccatgcct
aacacacggatgactaaccaacctcaacttattcaagctcaacagattcaacaaattcag
caacagaatttacagctgcagcaacaaagtctgcaacaacagcagcaacacaacaatcca
aactctgcatctggcagccatataggtgcaccgttttgtggaagtaatatagcccaatca
gaaatgcagcagatgacaggtaatggtctacatgctataatcccccaggacacccaaatc
cttactgcctccctgccaacagctctcgctcagtctatgacaaccactcagttcctgacg
ccaccatctcaacacagttactcctctccaatggacaacactccaaaccaccaattacaa
gtgtccgatcacccattcctgacgccatctcctgagtcacctgaccagtggtcaagttcc
tccccgcattccaatatgtctgactggtcagaaggtatatcaagtccacctacaaacata
caatcccagcataatcatattccagaagcttttaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
