Paenibacillus sp. FSL R5-0345: R50345_25880
Help
Entry
R50345_25880 CDS
T03333
Name
(GenBank) alpha amylase
Organism
paef
Paenibacillus sp. FSL R5-0345
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM_25
Alpha-amylase
fn3
RGI_lyase
CBM_20
AMPK1_CBM
X25_BaPul_like
CBM53
A_amylase_dom_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIQ37748
LinkDB
All DBs
Position
complement(5716610..5719669)
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MKRRLWYVPVLITSILLSTVINLFVLTPQKAEAASIGTINENDTIYQIMVDRFNDGDTSN
NATGAAIRYGENSEEDFRYMKGGDWQGIIDKLSYIKNMGYTAIWISPVAEPQMTNRENNG
TGKNTAYHGYNVKNPNAANPYFGTKEKLKELVDSAHALGIKVVIDVVPNHVGDYMLGTQA
YYDIPSLQPVAPFNNPAWYHHNGDINWSLADGRYDQWAQDYLENHDLGGLDDIDFDVPAA
KQAIFDSIKGWFDYTGADGARVDAAKLMKPTDIGELQNYLGVNTFGENFDGNAEFVSRWV
GNNKEWGMLDFPMFFSVLNSFAYGQSFESNIKSTLAQDSYYNGNANHMVTFIDNHDRNRF
LTEAGGSVDKLQNALTFIFTVRGTPVVFQGTEQNKGNGNSQIMTGGIADTWNRWSMVKRD
ASGNVIENYFNENASTYKHVAKLNEIRKNNPALRTGTQREMWAAQNLYAFSRRIDTGTNQ
GQEAISVFSNQSNGSQTVTIPLRAESSLTVGTVLYNQLNTADTVTVQSGGVTGKQITVTV
GANSAKIYAKQQQPSETVPPTTPTNVTATVQNASSALISWTASTDNVGVTGYEVYRNGVK
VGTTATTSYTDNGLSASTTYNYTVKAFDAAGNLSLLSAIASITTPAGNSVTIYYKQGYTS
PYIHYRPVGGTWTTSPGVAIPVSDVAGYNKITINIGSASQLEACFNNGSGTWDSNGGSNY
LFGTGTWTYTPTGSITSGGPVTPTPTPTPTVTPTPTPTVTPTPTPTVTPTPTPTPTVTPT
PTPTPTVTPTPTVTPTVTPTPTVTPTPTPTVTPTPTATPTGNTATIYYKNTAYSSSYIHY
KLDGATVWTTAPGEQLQASSFPGYKSITIQLGTAAGLTAAFNNGSGTWDNNGSSNYHFAA
GTWSLVNGSISAGEPQADSVTFRVNVPSSTPASGPVYLTGTFNSWNAADPAYQLTKGSDG
VYSITLSLPAGTAVQYKFTRGAWTNVEVNSNGSDISNRALTPAGGAQTVNLTVQRWKDL
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacgtaggttatggtatgtacccgttctaattacatctattcttctttctaccgtg
attaacttgtttgtcttaacaccgcaaaaggctgaagcggccagcatcggcacaattaat
gagaatgacacgatttatcagattatggttgaccgatttaatgatggagacacttccaac
aatgctactggtgcggcaattcgctatggagaaaactctgaggaagatttccgttatatg
aaaggcggagactggcaggggattatcgacaagctatcatatattaaaaatatgggttat
accgcgatttggatttccccagtggctgagccacagatgactaatcgggaaaacaacggt
accggtaaaaatacagcctatcacggatacaacgttaagaaccctaacgctgccaatccg
tacttcggtactaaggagaagctgaaggagcttgtggattccgcacatgcgcttggcatc
aaagtagtaattgacgttgtgccaaaccacgtaggcgattatatgcttggtacccaagcc
tattatgatatcccatcattgcagccagtggctccgttcaataatccagcatggtaccac
cataatggagatattaactggtctctagcggatgggagatatgatcagtgggcacaggat
tacttagagaatcatgatttgggcgggttagatgacattgatttcgatgttcctgcggct
aagcaggcgatattcgattcaatcaaaggctggtttgattatacgggcgctgacggtgcg
cgtgtggatgctgccaagctgatgaagccaacagatattggtgaactacaaaattatctg
ggcgttaatacctttggcgagaatttcgacggaaatgctgaatttgtttcacgttgggtt
ggaaacaacaaggaatggggcatgctcgatttcccaatgttcttctccgtgcttaacagc
tttgcttatggacagtcttttgagtccaatatcaaaagcaccttggcacaggattcctac
tacaacgggaatgccaatcacatggtaacctttatcgacaatcatgaccgcaatcgtttt
ctaacggaagctggtggaagcgttgataagctgcagaatgctttaacctttatttttaca
gttcgtggaacaccggttgtcttccaaggaacagagcagaacaaaggcaatggcaacagt
cagattatgacgggtggtattgctgatacttggaaccgctggtctatggtgaaacgggat
gcaagcggaaacgtgattgagaactattttaatgaaaatgccagcacctacaagcacgta
gccaaacttaatgagattcgtaaaaataatccagcactacgtacaggtacacaacgtgaa
atgtgggctgcacagaacttatatgccttctcacgccgcatcgacactggaacgaatcaa
ggccaagaagcaatctccgtattcagtaatcaatcaaacggttcgcaaacagtaactatt
ccattgcgcgctgagagctcattaaccgtaggtacagttttatataaccaattgaatact
gcagatacagtgactgtacaatcaggcggagtaactggaaagcaaattactgtaactgta
ggtgccaattcagccaaaatctatgcgaaacaacaacaaccatcagaaacggttcctcca
actactccaaccaacgtaaccgcaacggttcagaatgcatctagcgctttgatcagctgg
acagcttctaccgataatgtgggcgtaactggatatgaagtttatcgtaacggtgtcaag
gtaggcacaacggcaactacttcctatacggataatggtttatccgctagcactacctat
aactacacggtaaaagcatttgatgccgcaggcaatctatctcttcttagtgcgattgcg
tctattacaacaccggcagggaacagtgtcacgatttactataagcaaggttatacctcg
ccttatattcattatcgcccagtaggaggtacatggacgacatctccgggtgtggctata
cctgtatctgatgtagccggatacaacaaaataacgattaatatcggctccgccagccag
cttgaagcatgctttaacaacggcagtggcacatgggacagtaacgggggcagcaactat
ctattcggtacaggaacatggacttatacgccgactggaagtatcacgtcgggtggacca
gtaacaccaacaccaacaccaacaccaacggtaacaccgacaccaacaccaacggtaaca
ccgacaccaacaccaacggtaacaccaacaccgacaccaacaccaacggtaacaccaaca
ccgacaccaacaccaacggtaacaccaacaccaacagtgacaccaacggtaacaccaaca
ccaacagtgacaccaacgccgacaccgacagtcactccaacgccaacggcaacaccgact
ggtaacaccgcaacgatctattataagaatacggcatatagcagctcgtacattcattac
aagctagatggagcgacagtctggacgacggcacctggtgaacagcttcaagcttcttct
ttcccaggatacaagtcgatcacaattcagctaggcactgcagcgggactgaccgcagcc
tttaataatggcagtggtacatgggataacaatggcagcagtaattatcattttgctgct
ggaacctggagtctggtgaacggaagtatcagcgcaggggaacctcaagcagacagtgtg
acgttccgtgtaaatgttccatcgtctactccggcgagcggacctgtgtacctcaccggt
accttcaacagctggaatgcggcggatccagcttatcaactgaccaaaggtagtgatggg
gtatactccatcacgctgagcttgccagcaggaacagcggtgcaatataagtttacgcgg
ggcgcttggactaatgtggaggtaaactcgaacggctcggacatttccaatcgagcgctt
actcctgcaggcggcgcacaaacagtgaatctaaccgtgcagcgttggaaagatctataa
DBGET
integrated database retrieval system