Paenisporosarcina cavernae: D3873_02175
Help
Entry
D3873_02175 CDS
T05647
Name
(GenBank) AAA family ATPase
Organism
paek
Paenisporosarcina cavernae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NB-ARC
NatA_aux_su
nSTAND1
Iml2-TPR_39
TPR_2
TPR_19
nSTAND3
HrpB1_HrpK
TPR_11
CSD
AAA_22
AAA_19
Ribosomal_L20
nSTAND_NTPase5
TPR_1
AAA_16
ANAPC3
RsgA_N
DUF5788
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYC28734
UniProt:
A0A385YQC4
LinkDB
All DBs
Position
404206..406815
Genome browser
AA seq
869 aa
AA seq
DB search
MNNLNINTRILMFSVCTSLEFDLRKFILESNLVKNIPEPIKNKAKERNKKLKTEEINTNN
LAFLTELDMGDLVDIISNNIYEFKLNIEKKKLLVDYFTKIIPIRNRVMHTRPLEIGDRSI
LNEVIETVDEKLFWINWNETIKTREKIRTSPHEIINQSYKKVIDYTSNVYHNLPIPEFDD
TGYIGRKNEMKNIINLLKDKKNQIITIVGNGGIGKTATAVKALYDLIDLEDNPFEAILWV
SLKTRTLSNGEFQNINKAIIDMKGMFSNLEKLVIKEENLDKQNIINFMKEFNTLLVVDNL
ETISTPEIMGFLKDIPENSKVLITSRHGIGELENRIQLEGLDINDALTYFRILSKHYGLK
LHTRSDNDLKRLIGEFLYSSPLSIKWFISSIYTGLSESSILANKEDLIVFCMSNVVNKLN
DNERKILQLLLVEGKKLSYGEIDYFLQYQEGELVKYINNLVSTSMIQLINGEYELNQMAK
DYLSLSHPPKNDFINKVFKQRSKLNTMMQEIKIKNEVDPFNPKSIYKNLESSNKKIASFY
LIEALDFSSKRQWEMSFEKIKKAASIAPDYFEVYKIKAFIAAESGDWYEAINSYRTAIET
CHSNFEKATVLYLFSVFYVVRMVNYDNAKDLILKANELYPENKTLLMEKARVLTYLGEFN
EAQEILESIVIDESFTQKALNLYTTRIADLYRRMASNYDNRDNLKKYALYKLAIERIETL
SEIDPITYQTLLKVLVDLSFIHRNPDALSLLHETLIKHFDNLVGVKSANMNKLVRSIENF
KHEIPSDLYDLVRKLSKNYQQEAKTINNPNIGLVVRVINNFGFVQNAIGSYYFNFNQCLY
NPVSVGDRVSFKLTQNVKGPVAIKLNLID
NT seq
2610 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaatttaaatattaatacaagaatcttaatgttttctgtatgcacatcattagaa
ttcgatctgagaaaatttatcttagaaagtaatttggttaaaaatataccggaacctatt
aaaaacaaagcaaaagaacgaaacaaaaaacttaagaccgaagagataaatacaaataat
ttagctttcctaactgagttagacatgggagatttagtggacataatatccaacaatatc
tatgaatttaagttaaacattgaaaagaagaaattgttagtagattatttcaccaaaata
attcccataagaaatagagtcatgcataccagacctttagaaataggagatagatctatc
ttaaacgaagtaatagaaactgtggacgaaaaactattctggattaattggaatgaaact
attaaaacaagagagaaaattagaacaagtccacatgaaataataaaccagtcatataaa
aaagtgattgattatactagtaatgtttatcacaatctccctataccagaatttgatgat
actggctatataggtagaaagaatgaaatgaaaaatattatcaatttattaaaagataaa
aagaatcaaatcattacaatagtcggaaacggcggaattggaaaaacggcaactgcagta
aaagcattgtatgatttaatagatttggaagataacccttttgaagcaatattatgggtg
agtcttaaaacaagaaccctttctaacggtgaatttcaaaatattaataaggcaattatc
gatatgaaaggaatgttttctaatttagagaaattagtaattaaagaagaaaatctagat
aaacaaaatattataaattttatgaaagaattcaatacacttttggtagtagacaacctt
gaaaccattagtactcctgaaattatgggatttctaaaagacattcctgaaaattccaaa
gtgttaataacatctcgacatggaataggagaactcgaaaatagaatccaactagaagga
ttagatataaatgatgcactgacttatttcagaattttatcaaaacattatggattaaaa
ttacacaccaggtcagacaatgatttaaaaagacttataggggaattcctttattcaagt
ccgttgtctataaagtggtttatatctagtatatataccggcctaagtgaatcttccata
ttggcaaataaagaagatttgatagtgttctgtatgtcaaatgtagttaacaaactgaat
gataatgaaagaaaaattcttcaattgcttctagtggaagggaaaaaattaagttatgga
gaaattgattatttcttgcaatatcaggaaggagaacttgtaaaatatattaataatttg
gtttcaacaagtatgatacaacttattaatggagaatatgaactaaatcaaatggcaaaa
gattatctttctttaagccatccacctaaaaatgattttattaacaaggtatttaaacaa
agatcaaagctaaatactatgatgcaagagataaaaataaaaaatgaagtagatccattt
aatcctaaatccatttataaaaatttagaaagtagtaataaaaaaattgcttctttttat
ttaattgaagcactcgattttagttccaaaagacaatgggaaatgtccttcgaaaaaata
aaaaaagccgcaagtattgcacctgattattttgaggtttataaaattaaagcatttata
gctgcagaaagcggagactggtatgaagccataaatagttatcgaactgcaatagagact
tgccatagtaattttgaaaaagctactgttttgtatttattcagcgtcttttatgttgtt
cgtatggtaaactacgacaacgcgaaagacttaattcttaaagctaacgaattatatcca
gagaataaaacattgttaatggaaaaagcaagagttctaacatatttaggagaatttaac
gaagcacaggagatacttgaatctatagttattgatgagagtttcacacaaaaagcatta
aatctttatacaacaagaatagctgatttataccgtagaatggcgagcaactacgataat
agagacaatttgaaaaaatatgctttgtacaaactagcaatcgagagaattgaaacacta
agcgaaattgaccctataacatatcaaactctactaaaagtattagttgatttatcattt
atacaccgaaatcctgatgccctaagtttgttacatgagactttaattaaacattttgat
aatttagttggagttaaaagtgcaaatatgaacaaattagttaggagtattgagaacttt
aaacatgaaattccttcggatctttatgatttagtgagaaaattatcgaaaaattatcaa
caggaagcaaaaacaatcaataatcctaatattggtctagttgtaagggtaattaacaat
tttggattcgtgcaaaatgccattggttcatattattttaattttaatcaatgcctatat
aatcccgttagtgttggtgatcgtgtaagttttaaacttactcaaaacgtgaaaggaccc
gtggcaataaaattaaatttaattgactag
DBGET
integrated database retrieval system
