Pasteurella aerogenes: NCTC13378_00895
Help
Entry
NCTC13378_00895 CDS
T05989
Symbol
hsf2_2
Name
(GenBank) autotransporter adhesin
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
paet
Pasteurella aerogenes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
paet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
paet02000
]
NCTC13378_00895 (hsf2_2)
Transporters [BR:
paet02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NCTC13378_00895 (hsf2_2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_head
YadA_anchor
YadA_stalk
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEG70600
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(944119..952401)
Genome browser
AA seq
2760 aa
AA seq
DB search
MNKIFKVIWNHATQSWVATSELSRAKGKSKTKSVALAVVAAGMGLCAAESAFAATAIGVV
GNSLVVNTGGGWQYANTSNIPATPIASAIGINAIAMGINVTANGANAIAFGNNASAIGID
NTAIGINASATGGSSAKSTAIGANTNVTAPQGTAIGANASVIAGNGIAIGTNATAIRNEA
GSERAVTVIGNDALIRNVESAGQNRGATAIGSNALAGLLTDAGAANGTAVSTSNGDYKTS
SGDLTAARLMYRAGITDATGVTVRKLESNEATAIGFDSRAIGDQSIAIGAQVVSGHSSVA
IGSNDMNAVISDTTRNTYKDIVGTDLAENNLPMPGTTTRWYETTYAKDGSVAIGAKAHSN
ALFGTALGTSAFVQAGAELGTAIGTGARVGAQSIPSGDAMTSTANFTTKGGVAIAAGAVA
ERDFTTAVGTGANALNTRATALGYKALANGTNATAVGANAQATATDALAYGANAKSFASD
GVAIGTNSTVTATGNSSVAFGTDTSVSGKKTVALGSNIKNVSTDGSVVLGDASTGVLTNT
DGTIKVDPQTDLPGASHGVGTVANATVTGGNGAKITYSGFSGQPKDAGKYVSIGAVGAER
QLKNVAAGNIDANSTDGINGSQLYALAITLGDQVFQSTYFHTNNVTNKDTGNAITNLGNV
TDSAGAMGDYSVTAGVNTTAKVGAGAAIGYQAATTGDSVAIGKDAKAYGITSGSNAVGIS
PTAYGSVAIGNSSVAADGAVAIGTNAKVDSQSAFAAEGAIAIGKDALVDATSGSASASIA
IGRKAFAEANAPKVNGNAVTITIPNGTGISDGVATSVGDHARAAQGGSAFGQGSDARAYA
TAVGLAAYAEGVMSTAVGYKVHSQGRESTAIGNDITANGFASVAIGNATIAHENSTIAIG
NNATAGTAATDDDMTEAIAIGYTSNASGKRGVALGAYAGASHNHAAALGPYAKALANSSI
ASGVLATVTGESSIAIGRESVVSGANSTTLGQLNNVSGVESIAIGKSSQVTGNQSIAVGV
GHVIAANNSGTFGDPNYILAGADRSYAVGNNNTVTTADTFVFGSNVNRLADGSNNTVGTV
ENSVYLGNGTEATEGVGSVGADGKGTLFTLNTDQVVGTAATTAGDTGTVSNATVGGVTYG
TFAGATANGVVSVGAAGAERRIQNVAVGEISSTSTDAINGSQLYAVYDKAAKPVTFTANT
NLDTANTSANYRANNGLERQLGDTLSVKGAETAIALTRNTDNAVTGNYSAKNIQTIVDDQ
GVQIQMAENPEFESMNITDGTNSTVITPTTITVGDKAGNADKPVTITSGDNGGIISNLTT
TLPDVVTMNTTDGDGNPVNYTTNIVRPTIPASILTNAATLGDVLNAGWNLQENGGARDFV
KPYDTVNFANGTGTTVNITSDGNVSTVKVDVNTSELVGNITHNDNGTVSVGDNDGDKLAN
ITTVTNAINNASFNVTIGSDNTAITDQEGKAPAKVKPGSELVLQSGKNLVAKQNGTTITF
ATAEDVSFNSTTIGGKAASAPDATGGKAPITIGTVGDKNVIGGLDTTIEAPTTVATTTKP
TGDVLNHAATIGDVLNAGWNLQENGQARDVVTPYDTVNFTNGTGTVVNISTTDNVSTVKV
DVNTSELVGNITNNDNGTVSVGDNDGDKLANITTVTNAINNASFNVTIGSDNTAITDQEG
KAPAKVKPGSELVLQSGKNLVAKQNGTTITFATAEDVSFNSTTIGGKAASAPDATDDKAP
ITIGTVGDKNVIGGLDTTIEAPTTVATTAKPTGDVLNHAATIGDILNAGWNLQENGQARD
VVTPYDTVNFTNGTGTVVNISTADNVSTVKVDVNTAELVGNITHNDNGTVSAGDNDGDKL
ANVSTVVDAINNSGWNVTSSAVGSGVVFGSNSELINPGEIVTFQAGDNMVLTQANNTFTY
SVNPNPVFNSTMIGGEATYTDADGNALTKNENGTYSNADGSLYTGPVTTTVNNPISIGTD
ANGTNTISNLTTTLPDVVTMNTTDEDGNPVNYTTNIVRPTIPASSLTNAATLGDVLNAGW
NLQENDGARDFVKPYDTVNFANGTGTTVNITSDGNVSTVKVDVDTAALTGDVNSNATTGV
AEVPADQGDKLVNQTTVVNAINGSGWKTNSTTATGGANETVVNPGETVNFEAGKNMTVTQ
NITQVDGKDVITYTYATANNVTFDSVTIGGNNATNTAPITISTTPEGNNVISNLTTTLDD
PTGKTEGKAPENVTTTNAATLGDVLNAGWNLQENGTAKDLVSPYDTVNFVNGTGTVVNIT
SDGNVSKVRVDMNVSALTGDITNNANGTAGAGDNGNKLVNVTTVTDAINNAGWTAAVNQT
GIGKATDNGGDKLVNPGDTVTMIAGDNMVITKEGLNYTIATKKDVSFDNVAAEKGLTIGS
GNTSVNMTPTTSNVANGDISPAVNMNGATLTNMSSNLPNTTSVGDNPTTNAPLTAQQAAD
MANTSGSNAATLNDVLNVGWNLQENGQDKDFVKPYDTVNFTDGDNTKVVISTDGNTNGIK
INVVTGSTTVDEAGRAQTADTNAVATVGDIVNSINNINWNVDSGKVSGSVKSDSSYEVTE
ASKVKAGDTIRYNAGNNIEISGSGKNVNIATSMTPTFTSVQLGNNSGPVISSDKQGNVKV
ATADGKPTKITNVAPGEDANDAVNMSQLKGAVGNIYNSINKVDRTLRAGIAGSNAAATLP
QVYIPGKSMVAASGGTFKGENAFAIGYSRASDNGKLILKVQGNANSQGDIGAGVGIGYQW
NT seq
8283 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagatttttaaggttatctggaaccatgcaactcaaagctgggtggcaacctcc
gaattatctcgtgctaaagggaaatcaaaaacgaaatctgttgcgctagcggttgtcgca
gccgggatgggattgtgcgcggcggagagtgcatttgcggcaactgcgattggtgttgtg
ggtaatagtttagttgtaaatactggtggtggttggcagtatgcaaacacttcaaatatc
ccagcgacgccgattgcttcagcaataggtattaatgcgattgctatggggattaatgtc
acagcaaatggagcaaacgccatcgcgtttggtaataatgcttcagcgataggtatagat
aatacagcaattggcattaatgcttctgcgacaggtggaagttctgctaagagtacagcc
attggtgcgaatactaatgttacagccccccaaggtactgcgattggtgccaatgcctct
gttattgctggcaatggtattgcaattggtacaaatgctactgcgatccgtaatgaagct
ggttcggagcgtgcagttacagttatcggtaatgatgctttaattcgtaatgtagaaagt
gctggtcaaaatcgaggtgctactgcaattggtagtaatgcattagctggtttattaacg
gatgctggtgcagcaaatggaactgcagtgagtacgagtaacggtgattataaaacatca
tcaggagatttgaccgcggcacgtttaatgtatcgtgctgggattacggatgcaacaggt
gtaacagtacgaaaattggaatccaatgaagctacggcgattggttttgactcacgcgcg
attggtgatcaatcaattgctattggggcgcaggtggtatcaggtcattcctccgttgct
attggtagcaatgatatgaatgctgtaattagtgatacgactagaaatacgtataaagat
attgtcgggacagatttagctgaaaataatttgccgatgccgggtaccactacgagatgg
tatgaaacaacttatgctaaagatggttctgtcgctattggtgcaaaagcgcattcaaat
gcattatttggtactgcgctagggacttcggcgtttgtacaagccggtgcagaacttggt
actgcaatcggtacaggagcgcgtgtcggagcgcaatctattccatcaggcgatgctatg
acctctactgctaattttacgactaaaggcggtgtagcaattgcagccggtgcagtagcg
gaaagagactttacaacagcagtagggactggtgcgaatgcattgaatacaagagcaaca
gcattaggttataaagcccttgcaaatgggactaacgcaacagctgtgggggcaaatgca
caagcaacagcgacggatgcgttggcttatggagcaaatgcaaaatcttttgccagtgat
ggagtagctattggtacgaattctacggtaactgcaacgggtaattcttctgtagcattt
ggtacggatacttctgtatcaggcaagaaaactgttgcattagggtcaaatattaaaaat
gtttctactgatggttcagtggtgcttggggatgcgtcaacaggcgtattgaccaatact
gatggtacaattaaggtagatcctcaaacagatttacctggtgcatctcatggagtggga
acagttgctaacgcgacggtaactggtggtaatggcgctaagatcacttattcaggtttt
tctggtcaaccaaaagatgcgggtaaatatgtttctattggcgccgtgggagctgaacga
caattaaaaaatgttgcagcaggtaatatcgatgcaaactctaccgatggcattaatggc
tctcaactttatgcgttagctataacattaggcgatcaggtattccaatcgacttatttt
catacaaataatgtgactaacaaagatactggtaatgcgataactaaccttggtaatgtt
acagattctgcaggcgcgatgggcgattattcggtcacagcaggtgtgaatacaacagct
aaagtaggggcaggtgctgctattggttatcaagctgcaactacaggtgattcagtagca
attggtaaagatgctaaagcctatggtatcacaagcggttctaatgcagttggtatatca
cctactgcttatggttctgttgctattggtaatagttcggttgcggctgatggtgctgtt
gcaattggtacaaacgcaaaagtggatagtcagagtgcctttgccgccgagggagcgatt
gcaatcggtaaagatgcattggtcgatgcaacttcaggttctgcaagtgcgtctatcgcg
attggtcgcaaggcttttgcagaagcaaatgcgccaaaagtcaacggtaatgctgttact
attacaatccctaatggcacaggaattagcgatggtgtggctacatctgtgggcgaccac
gctcgcgctgctcaaggtggttcggcattcggtcaaggttctgatgctcgtgcgtatgca
acagcagtaggtttggctgcttatgcggaaggggtaatgtctactgctgtgggttataaa
gtacattctcaagggcgagaatcaacagctatagggaatgatattacagcaaatggtttt
gcttctgtggcgattggtaatgcgactattgcacatgagaactcaacaattgcaattggt
aataatgcaacagcgggtactgcagctacagatgatgatatgactgaggcaattgcaatt
ggttatacttcaaatgcaagtggtaaacgaggtgtggcattaggtgcttacgctggtgct
agccataatcacgctgctgctttaggtccttatgctaaagccttggcaaacagttcgatt
gcttccggtgtattagcaacagtaacaggtgagagttcaattgcaattggtcgtgaaagt
gttgtttctggtgctaattcaacaactcttgggcaacttaataatgtatccggtgttgaa
tctattgcgattggtaagagttcgcaagtaaccggcaatcaatctattgctgtaggtgtt
ggtcatgttatagctgcaaacaactcaggtacatttggtgacccgaactatatcttagcc
ggtgctgatcgctcttatgctgttggtaataataataccgtgacaactgcagatactttc
gtattcggtagtaatgttaaccgtttggctgatggcagcaacaacactgtcggtacagtg
gagaactctgtttacttaggtaatggcactgaagcgactgaaggtgttggttcagtaggt
gctgatggtaaaggaacattatttactttaaatacagatcaagttgttggtacagcggca
acaacagcaggtgacacaggtactgtttctaatgcaacggtaggtggcgtgacttatggt
acgtttgctggagcaacagccaatggcgttgtatcagtaggggcggcaggtgcagaacgt
cgtattcaaaatgtggcggtaggtgaaatttcttcaacttctaccgatgctatcaatggc
tcgcagttatacgcggtttacgataaagcagcgaaaccggttacctttactgcaaatacc
aacttagatactgcaaatacaagcgcaaattatagggcgaataatggtctagagcgccaa
ttaggcgatacgctaagcgttaaaggtgcagaaactgcgattgctttaacacgtaataca
gataatgcagtaacgggcaattatagtgcaaaaaacattcaaactatcgttgatgatcaa
ggtgttcaaattcaaatggcagaaaatccggaatttgagtcaatgaatatcactgatggt
accaatagcacagtgattaccccgacaaccatcactgtaggagataaagcaggtaacgct
gataaaccggtaaccattacaagcggtgataatggtggcataattagtaatttgacgacc
accttgccggatgttgttactatgaatacaactgatggggatggcaatccggttaattac
accacgaatattgttcgtccaacgattccagcatccatcttaacgaatgcggcaactcta
ggagatgtattaaatgccggctggaacttgcaagaaaatggtggcgctcgtgattttgtg
aaaccgtatgacaccgttaatttcgctaatggcacaggtacgacggttaacattacttct
gatggtaatgtcagcacagtaaaagtggatgttaacacctccgaattggtggggaatatt
acccataatgataatggtaccgtcagtgtgggtgataatgatggcgataaattagccaat
attaccactgtaaccaatgcaattaataacgcctcatttaatgtaacgatcggttcagat
aacactgccattacagatcaagagggcaaagcgccggcgaaagttaaaccgggtagtgag
ctggtgttgcaatcaggcaaaaacttagtcgcgaaacaaaatggtacaacgattactttt
gcgaccgcggaagatgttagctttaatagtacgactattggtggtaaagcagcatctgcg
ccggatgcgacaggcggtaaagcgccaatcacgattggtacagtgggtgataagaatgtt
atcggcgggttagatactacgattgaggcgccaacaaccgtagcgacaactacaaaaccg
accggtgatgtattaaaccacgcggcaaccattggcgatgtattaaatgccggctggaac
ttgcaagaaaatggtcaagcacgagatgtggtgacgccatatgatacggtgaatttcacg
aatggaactggaacagtcgttaatatcagtaccactgataatgtcagcacggtaaaagta
gatgttaatacctccgaattggtggggaatatcacgaataatgataatggtaccgtcagt
gtgggtgataatgatggtgataaattagccaatattaccactgtaaccaatgcaattaat
aacgcctcatttaatgtaacgatcggttcagataacactgccattacagatcaagagggc
aaagcgccggcgaaagttaaaccgggtagtgagctggtgttgcaatcaggcaaaaactta
gtcgcgaaacaaaatggtacaacgattacttttgcgaccgcggaagatgttagctttaat
agtacgactattggtggtaaagcagcatctgcgccggatgcgacagatgataaagcgcca
atcacgattggtacagtgggtgataagaatgttatcggcgggttagatactacgattgag
gcgccaacaaccgtagcgacaaccgcaaaaccgactggtgatgtattaaaccacgcggca
accattggtgatatattaaatgccggttggaatttacaagaaaatggtcaagcgcgagat
gtggtgacgccatacgatacggtgaatttcacgaatggaactggaacagtcgttaatatc
agcaccgccgataatgtcagcacagtaaaagtagatgttaataccgccgaattggtgggg
aatattacccataatgataatggtaccgtaagtgcgggtgataatgatggcgataaatta
gctaatgtttccactgtagtagatgcaattaataactccggttggaatgtaacttcaagt
gcggtcggttctggcgtagtttttggttcgaatagcgagttaattaatccgggcgaaatc
gtgactttccaagccggtgataatatggtgttaacgcaagcgaataatacctttacatat
tcagtcaatccaaacccagtgtttaatagcacgatgatcggtggagaggcgacttatacg
gatgcagatggtaatgcattaaccaaaaatgaaaatggaacctatagcaatgcagatggt
tcactatataccggaccggttacgacgacggtaaataatccgattagtattggcactgac
gctaatggcactaataccattagtaatttgacgaccaccttgccggatgttgttactatg
aatacaactgatgaggatggcaatccggttaattacaccacgaatattgttcgtccaacg
attccagcatccagcttaacgaatgcggcaactctaggagatgtattaaatgccggctgg
aacttgcaagaaaatgatggcgctcgtgattttgtgaaaccgtatgacaccgttaatttc
gctaatggcacaggtacgacggttaacattacttctgatggtaatgtcagcacagtaaaa
gtggatgtagatactgctgcgttaactggggatgtgaacagcaatgcaacaaccggtgtt
gctgaagtgccagcagatcaaggcgataaattagttaaccaaacaacagtggtaaatgcg
attaatggctctggttggaaaactaattcaacgactgcgactggtggcgcaaatgaaacc
gtagttaatccgggagaaaccgttaactttgaagccggtaagaatatgacggtgacacaa
aatattacgcaagtggatggcaaagatgtcattacttatacctatgccactgcaaataat
gtgacattcgacagtgtaacgattggtggtaacaatgcgacaaatacagcgccaattacc
atcagtacaacaccggaaggtaacaatgtcatcagtaacttaacgacgactcttgacgat
ccaacaggtaaaactgaaggtaaggcgccggaaaatgtgactaccactaatgcagcgact
ttaggggatgtattaaatgctggttggaacttgcaagaaaatggtactgcaaaagacttg
gttagcccgtatgatacggtaaattttgttaacggtacggggaccgtagtgaatattact
tccgacggtaacgtgagcaaagtgcgagtcgatatgaatgtttctgcgttaacaggtgat
attacgaataatgccaatggtactgctggtgcaggtgataatggcaataaattagtaaat
gttaccacggtaaccgacgccattaataatgctggttggactgcagctgttaatcaaacc
ggtataggtaaagcaacggataacggtggtgataaattagtcaatccgggtgatacggtc
acgatgattgccggtgataatatggtgatcactaaagagggattgaattacaccattgcc
accaaaaaagacgttagttttgataatgtggcagcggagaaaggtttgacgattggttct
ggtaatacctcggtgaatatgacgccgaccacctcaaatgtggcaaatggtgatatttct
ccagcggtgaatatgaacggtgcaaccttgaccaacatgagttctaacttgccgaatact
accagcgtgggtgataacccaacaactaacgcgccattaactgcacaacaagcagcagat
atggcaaatacgtcaggtagtaatgcggcaaccttgaatgatgtgttaaacgtcggttgg
aatctacaggaaaacggtcaggataaggatttcgttaaaccttatgatacagtgaacttc
actgatggcgataataccaaagtcgtgatctcaacagacggtaatacgaatggcattaaa
attaatgtcgtgaccggttcaaccacggttgatgaagcgggcagagcgcaaaccgcagat
actaatgcagtagcaactgtgggtgatattgttaatagtatcaataatatcaactggaat
gtcgattcaggtaaggtgagcggttcggtgaaaagtgacagttcttatgaggtaacggaa
gcgtctaaagtgaaagcgggcgacaccattcgctacaatgccggtaacaatattgaaatt
agcggttcaggtaaaaatgtgaatatcgcaacttcaatgacgccgacatttaccagcgtt
caattgggtaataattccggaccagtcattagttcggataaacaaggcaatgtgaaagtg
gcgactgcggatggtaaaccgacgaagatcacaaatgttgcaccgggtgaagatgcgaat
gatgcagtgaatatgagccaattaaaaggcgcagtaggcaatatttataatagcatcaat
aaagtggatagaactttacgtgcgggtattgccggttcaaatgcggcggcaacattgcca
caagtttatattccgggtaaatccatggtcgcggcttcaggcggtacgtttaaaggcgaa
aatgcgtttgcaattggttattcgagagcctctgacaacggtaaacttatcttgaaagtt
caaggtaatgccaatagccaaggtgatattggcgccggcgtaggtattggttaccaatgg
taa
DBGET
integrated database retrieval system