Pasteurella aerogenes: NCTC13378_01158
Help
Entry
NCTC13378_01158 CDS
T05989
Symbol
hsf2_3
Name
(GenBank) autotransporter adhesin
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
paet
Pasteurella aerogenes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
paet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
paet02000
]
NCTC13378_01158 (hsf2_3)
Transporters [BR:
paet02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NCTC13378_01158 (hsf2_3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
YadA_anchor
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEG71107
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1240730..1247941)
Genome browser
AA seq
2403 aa
AA seq
DB search
MNKIFKVIWNASIQQVVVTSELTKSKGKTSSTDKRVKLSKVAAALAVASGMLTATHTIAA
TPIDQEAGVIEAWGGNVNDNTPSIDGSMSLGRKSYVDNSNSVAVGNNARIEALPENSVEL
QGNRISPGSNSVALGSNALVRGQQGTAIGNAAEAVMLSTATGQNAKATGYASVATGQDAK
SLQPWTTSTGVNSLANGKYANALGGQAKANSWGSTALGTKTVVTGDEGTALGYEADVTGR
DGTAAGSQSLAAEKATASGAQAKAEGTRATASGFQANASASSAVAIGDNSKAIANNTIAV
GVNASASGESAVAVGRNTTATQDGASSLGNEADATAKFATALGHESIANVEGAVALGSQS
KTSETVDTASKQISTFTYKFAGGDAYSTVSVGNDNIKRTITNVAAGRLESNSTDAINGSQ
LYTVAEQLGSEIENIYFHTNTGVAGQGAGDSATNKGRITDKAGATGNFGVTAGVGAKALN
ENTIAIGHNANSGLDKTVDGKILARGPGSIAIGANTLAESSGTIAIGKDAVARAVFMPQH
FTASESIAMGENATVVSLESIAIGGKSWAGTDKADRTTGVAADKDANTKINNVVVGHRAK
AISGDGTAIGHNASVTADHSIAIGKNANTTGSEAVSLGNGAQALASHTTVLGRLASAADT
ASSSIALGAYAQSQGVGSASVGTRSLSTGRSSTALGHGTTAFGENSTSLGRHAATISGST
TSVGHLSIAAGANGVALGANASAGISGGTSKIVNDLRNTLFSAEAGLRGAAGELASGKID
QAKYNEELAKRDAAKKALEDKVTEINTAATADSVAIGTNSVSSGERAIAMGTDAQALGEQ
SISIGTGNIVKANNAGAFGAPSYVSGDGSYSIGNNNTITTRDTFVLGSGINRADDLTSNL
SGTVANSVYLGKDSEATAGSGSVSVDGVGTLKALTSEQVEGVTSTAGATGVVTNAKVNNI
TYSNFAGEKAIGAVTVGASGTERRIQNVAAGEISSSSTDAINGSQLYMVANEIGKGFNVT
NNNGVTIGNIKPGDAVQFIDGINTKANVSTTNTGQVQVKFDAKDTSANVTVKPGSENYVS
VATGETTKVGDADVTNYQVGLTQTAIDQIKKEESVKAGSTLVTVTNTAKNSTGGTEFVVD
VKKGEFNTITNNGGLASISDTADGVATVSSVIKAVNEGYLTTKVGTTEVEKVGFGDDITF
VNGNGTVARADGTDITFDVNLTSADNSVIITNPTTAGGSVNVAVNTSTLVGGLENNANGT
VGVPNNEGSKLVNQTTVANAINNASFNVTIGSDKAAITDQEGKENATVKAGSDLVLQSGK
NLVAKQEGTTITFATADDVTFNNVTANNLTVGPVTINKDGIDAGDTQITNVKAGTNGTDA
VNLDQLNNQSTTLTTKGLNFAGNTGAEIHKDLGQTLNIEGTLVNEADASSKNVRVDSDGA
KLIVKIADNPVFNNITANEVKLGDVVINASTGINAGDTTITNVANGTAPTDAVNVSQLNA
SKENVKSTDKSVTITEGKTADGAKEFDLSVNTDGNTIVNGPNGLQVSVTPLTNKDDGSVN
VPTGNDATKLATAADIANAINKSGFTVKANTETTGELVNPGDTVDFIQGKNIEITRAGTA
FTVKTVDAPVFTSVQFGDNGPIIKADASNNINIAKADGSPTKITNVAAGTDNTDAVNVSQ
LNNTVAANRAVEKVVKDDAFADNLATVEVASGAVGDANQTYKVGVAKADVQKAAQEAINV
VGDNAAITVSKNTADGVDTYTVNYNGTEAAKTTPLSYKANGENPQTVNLSEGLDFTNGTT
TVATVGPNGEVTFDLNDAAKAQLAKEETVKAGSDLVTVTNTTKNSTGGTEFIVDVKKGVF
DGVTDNGALEIPTTDGVVTANDIAKVINKAFWTANVDGNTKVADVKFGDTVNFVDGQGTD
AAVKDGAITFNVKTDGNTIKLDNNGNLTVNTDNLPKTQLVDGKNTTVSGTGSDSDPYKVN
VQGDLADISSISNDGTTIKLGDNKVDVGGAKITNVAAGEADTDAVNVSQLKEAVAGVGKT
VVAAGNHTTVETKVEGNTTTYTVNAEKTTVSAGTSGNVVVTAGEKDASGTTNYTVELAKD
LKADTISVGGDENNGPVTIETKDGKNVISNLTTTLPDPTGKDNVTKPNVAEEDKRNAATI
GDVLNSGWNLQTNGKPADFVSTYDTVNFANGTGTTVVSETQNGVTTVKVNVDAVKANTVR
ETVVAADKNIVVTDTAVNKTGGKEFKVGLARDVNVNSITTNTVNVGPVTMSGSTAEDGTN
ELSVGTEKAPTRITNVAPGVKGTDAVNVNQLKAGLGNVYNNMNKMDKDLRGGIAGAMAAA
GLYHATLPGKSMVSAGVGNYRGQNAVAVGYSRLSDNGKLGVKLSINANTRGDTGAAASIG
YQW
NT seq
7212 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagatttttaaagttatttggaacgcatctattcagcaggtggttgtgacttct
gaattaactaaatcaaaggggaaaacgtcttctaccgataagcgtgtgaaattatctaaa
gtggctgctgcattggctgtagctagtggtatgctgactgctacacatactatagcagcc
acgccaattgatcaagaagctggtgtgattgaggcatggggtggtaatgttaatgataat
acaccgagtatagatggttctatgtcattgggtaggaagtcgtatgttgataattcaaat
agcgtagctgttggtaataatgctcgtatcgaagctttacctgaaaattcagtagagtta
caggggaatagaattagcccggggtcaaattcagtggcacttggttcaaatgcgctagta
cgtggtcaacagggtaccgctattggtaatgctgctgaagcagtgatgttatcgactgct
acaggtcaaaatgctaaagcaacaggttatgcttctgtagcgactggtcaagatgctaaa
tctttacaaccatggacaacatcaacaggtgttaattcattagcgaatgggaaatatgct
aatgctttaggtggtcaagcgaaagcgaatagttggggttcaactgctcttggtactaag
acagttgttactggcgatgaaggtactgcgcttggttatgaagctgatgttacaggtcgt
gacggtactgcagctggttcgcaatctttggcagctgaaaaagcaacagcatcaggagcg
caagccaaagccgaggggacaagagcaactgcatcaggcttccaggcaaatgctagtgca
agttcagcagtcgcaattggtgataattcaaaagcaatagccaataataccattgctgta
ggggtaaacgctagtgccagcggtgaatcagcagttgctgttgggcgtaatactacagca
acccaagatggagcatcatcacttggtaatgaagcggatgccactgctaaatttgcgact
gcattgggtcatgaatctatagcgaatgttgaaggcgctgtggcgttaggttcacaatct
aaaactagtgaaacagttgatactgctagtaaacaaatcagtacctttacttataaattc
gcaggtggtgatgcatattcaaccgtgagtgtggggaatgataatatcaagcgtaccatc
acgaatgtcgcagcaggtcgtcttgaaagcaactctactgatgccatcaatggttcacag
ctttatactgtcgctgagcagttgggttccgaaatcgaaaatatttatttccatactaat
actggggttgcaggtcagggcgctggtgattctgccacgaataaagggcgtattacggat
aaagcaggagctaccggtaactttggtgtgacagctggtgtgggggcgaaagctctcaat
gaaaataccattgctattggacataatgcaaattcgggtctggataaaactgttgatgga
aaaattttagctcgtggtcccggatcaattgcgattggtgcaaataccttagcagaatca
agtggcacgattgcgattggtaaagatgctgttgcaagagcggtgtttatgccacagcat
tttactgcatcagaatctatcgcgatgggtgaaaatgccacggtcgtttcgctagagtct
atcgctattgggggtaaatcatgggctgggacggataaggcggatagaaccactggtgtc
gctgcggataaagatgctaatacaaaaattaacaatgtggttgttggtcatcgtgcaaaa
gcgatctcaggcgatggtactgcaatcggtcataatgccagcgtaactgccgatcactcg
attgcaattggtaaaaatgcaaatactacaggttctgaagcagtttcacttggtaatggt
gctcaagcacttgctagtcatactaccgttttaggtcgtttggcttcagctgcggacact
gctagcagctcgatagcactaggtgcgtatgcacaatcacaaggtgttggttctgcatca
gtcggtactcgttcattatcaacaggtcgttcatcgacagcattgggtcatggtacaaca
gcatttggtgaaaattcaacttctctcggtcgtcatgcggcgacaatcagtggtagcact
acttcggtaggtcacttaagtattgctgctggtgcaaacggtgtagcgctaggtgcgaat
gctagtgcgggtatctctggtggtacaagtaagattgtaaatgatttgcgtaatacattg
tttagtgcagaagctggtttacgcggtgccgcaggtgagcttgctagtggcaaaattgat
caggcgaaatataatgaagagcttgcaaaaagagatgcagcgaagaaagcattagaggac
aaagttactgaaattaatactgctgcaacagctgatagcgttgctattggtacaaactct
gtatcatcaggtgaacgcgccattgcaatgggtactgatgcacaagccctgggcgaacaa
tcaatctctattggtactggtaatatcgtaaaagctaataatgcaggtgcattcggtgcc
ccatcttatgtgtctggtgatggttcatattcaataggtaacaacaataccattactacc
agagatacttttgttctgggtagtggtattaaccgtgctgatgatttaacctctaattta
agtggcactgtcgcaaattcagtttacttaggtaaagattcagaagcgactgctggtagc
ggttctgtcagcgttgatggtgtaggtacattaaaagcattaacttcagaacaagtagag
ggggtaacttcaacagcgggcgcaacaggtgttgtgactaatgctaaagttaacaatatt
acttatagcaattttgcaggtgagaaagctataggtgcggtgactgttggtgcttcagga
actgaacgtcgtatccaaaatgttgctgctggtgagatttcatcaagttctactgatgct
atcaatggttcacaactttatatggtagcgaatgagattggtaaaggttttaatgtcacc
aataataatggcgtgactatcggcaatatcaaaccgggtgatgcggttcagtttatcgat
ggtataaataccaaagctaatgttagtacgactaataccggtcaagttcaagtaaaattt
gatgctaaagatacttctgcaaatgtcactgtaaaacccggttcagaaaattatgtatcg
gttgctactggcgaaactacaaaagtaggtgatgctgatgtaactaactatcaagttggt
ttaactcaaacagcgatcgatcaaatcaagaaagaagagtctgttaaggctggctcaact
ttggtgactgttacaaatacagcgaagaactcaactggtggtactgagtttgtcgtcgat
gtgaaaaaaggtgagtttaataccattacaaacaatggtgggcttgcttcgatctcagat
accgctgatggcgtagcgactgtaagcagtgttatcaaggctgtgaatgagggttatctg
actacgaaagttggtacaacagaagttgagaaagtaggctttggtgatgatattaccttt
gtaaacggtaatggtactgttgcgcgtgcagatggtacagatatcacatttgatgtcaat
ttaacatcagctgacaattccgtcatcattactaacccaaccactgcgggtggctcggtg
aatgtggcggtgaatacttcaacattggttggcggtttagagaataacgccaatggtact
gttggcgttccaaataatgagggcagcaaactggttaatcaaaccactgttgctaatgcg
atcaataatgcctcattcaatgtcactatcggttctgataaagcagcaatcaccgaccaa
gagggtaaagaaaatgctacggtgaaagccggcagcgatttggtattacaatccggtaag
aatttagttgctaagcaagagggaacaaccattacctttgctactgcggatgatgtgaca
tttaacaatgtgacagcaaataacttaacggttggaccggttacaatcaataaagatggt
attgatgcgggtgatacgcaaatcactaacgtgaaagcgggtactaatggtactgatgca
gtgaacttggatcaattgaacaaccaaagtacaacgcttaccactaaaggcttgaacttt
gcgggtaatactggtgcagagatccataaagatcttggtcaaaccttgaatatcgaggga
acattagtaaatgaagctgatgcatccagtaaaaatgttcgtgttgactctgatggcgct
aagttaatcgtgaagattgcggataatccggtgttcaataatattactgcaaatgaagtg
aaattaggtgatgtggtaattaatgcgtcaacgggtattaatgccggtgatacaacgatt
accaatgtcgcaaatggtaccgcaccaactgatgcagtaaacgtgagccagttaaatgcc
tcaaaagaaaatgtgaaatcaacggacaaatccgtgaccattaccgagggtaaaactgcg
gatggcgcaaaagagtttgatttatctgtcaatactgatggcaacactatcgtaaatggt
ccaaatggtttacaagtatctgtaacaccgttgacaaataaagatgatggttcagtcaat
gttccgacaggcaatgatgcgactaaattggcaaccgcggcggatattgctaatgcaatt
aacaaatcaggctttacggttaaagcgaatacagaaacaacaggtgagcttgttaatccg
ggtgatacagttgattttatccaaggtaaaaacatcgagatcacacgtgcaggtactgca
ttcaccgtgaaaacagtagatgcaccggtatttacttcagtacagtttggtgacaatggt
ccgattatcaaagcggatgccagcaacaacattaatattgctaaagcagatggttcacca
acgaaaattacgaatgttgctgctggtacagacaatacggatgcagttaatgtaagtcaa
ttaaataatactgttgcggcaaatcgtgcagtggaaaaagtggtgaaagatgatgctttt
gcagataacttggcaactgttgaagtcgcttcgggtgcagtaggcgatgcaaaccaaact
tacaaagttggtgtagctaaggctgatgtacaaaaagctgctcaagaagccattaatgtt
gttggtgacaatgccgctattaccgttagtaaaaatactgcggatggtgttgatacttat
accgtaaattacaacggtactgaagctgcgaaaaccactccgttaagctataaagcaaat
ggtgaaaatccacaaacggtaaacttaagtgaaggtttagactttactaacggtacgaca
accgtggcgaccgttgggccaaatggcgaagtgacgtttgatctgaatgatgccgctaaa
gcacagcttgcgaaagaagaaaccgtgaaagcaggttctgatttagtgaccgtaactaac
acaacgaaaaatagcaccggcggtactgaatttatcgttgatgtgaaaaaaggtgtattt
gatggcgtaaccgataatggcgcgcttgaaattcctaccacagacggtgttgttactgca
aatgatattgccaaagtcatcaacaaggctttctggactgcaaatgttgacggtaataca
aaagtagctgatgtgaaattcggcgacaccgtgaatttcgttgacggtcaaggtactgac
gcggcggtgaaagatggcgcgattacgttcaatgtcaaaactgacggtaatacgatcaag
ttagataataacggtaacttaacggtgaacacggataacttgccgaaaactcaacttgtt
gatggtaaaaatacgacagtaagcggtaccggttctgattctgatccgtataaagtgaat
gttcaaggtgatttagctgacattagctctatcagcaacgacggtacaaccatcaaactt
ggcgataacaaagtagatgttggcggtgcgaagatcaccaacgtcgctgcaggagaagct
gatactgatgctgtaaacgtttctcaattaaaagaagcagttgcaggcgtaggtaaaaca
gttgttgccgcaggtaaccatacaacagttgagactaaagttgaaggtaataccacaact
tataccgttaatgcagagaaaaccacagtaagcgccggcacatccggtaacgtggtagtc
actgcgggtgaaaaagatgcttccggtaccactaactataccgttgaattagcgaaagat
cttaaagcagatacgatttctgtgggcggtgatgaaaataatggtccagttaccatagaa
acgaaagacggtaaaaatgtgatcagtaatttaactaccaccttgccggatccaacaggt
aaagacaatgtgacaaaaccgaatgtggcagaagaagataaacgtaatgcagcaacgatt
ggcgatgtgttgaattccggttggaacttacaaaccaatggtaaaccggcagacttcgtt
tctacttatgacacagttaacttcgcaaatggtacaggtacgaccgttgtttctgaaacg
caaaatggcgtaacgacagtgaaagtaaacgtcgatgcagttaaagccaatacggttcgt
gaaactgttgttgcagcggataaaaacattgtggtaacagatactgcggtgaacaaaacg
ggtggtaaagagttcaaagtaggtcttgcgagagatgtgaatgtgaattctattacgacg
aataccgttaatgttggtcctgtaacgatgagtggctcaaccgcggaagatggtactaac
gagttaagtgtcggtacagagaaagcaccaacacgtatcaccaatgtagcaccgggtgtg
aaaggtacggatgcagtcaacgtaaatcaattgaaagccggtttgggtaatgtttataac
aacatgaacaaaatggataaagatttacgcggtggtatcgccggcgccatggcagcggca
gggctttaccacgcaactcttccgggtaaatctatggtttctgctggtgtcggtaactat
cgtggtcaaaacgcagttgcagtgggttactcaagattatccgataatggtaaattaggt
gttaaactttctatcaatgcgaatactcgtggcgatacaggtgctgcagcaagtattgga
tatcaatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
