Pasteurella aerogenes: NCTC13378_01821
Help
Entry
NCTC13378_01821 CDS
T05989
Symbol
lptD
Name
(GenBank) LPS-assembly protein LptD
KO
K04744
LPS-assembly protein
Organism
paet
Pasteurella aerogenes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
paet00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
paet02000
]
NCTC13378_01821 (lptD)
Transporters [BR:
paet02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NCTC13378_01821 (lptD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LptD
LptD_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEG72408
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(1904568..1906943)
Genome browser
AA seq
791 aa
AA seq
DB search
MKKYSYTLLSLSILTALYSLPSRAASEPTGALRVSGLQQQCLVGVPQVTGEVISGDPNEL
PVYIEADRAELNQPTNAIYEGNVDIKQGNRHLVTEYAKVEQEGEGENIQRYAYAQGGFDY
KDNQINVLGSDAKIHLNTKDSDIKDADYQFVGRQGRGTAQEAELRETYRELRNATFTSCL
PTDDAWLIEANEIRQHIQEEYLEMWHARFKILGVPVFYTPYLQLPIGDRRRSGLLIPDAG
TSSRDGYWYSQPIYWNIAPNFDATITPKYMSHRGWQLNGEFRYLTNLGTGKIAGEYLNRD
RYDEYLDKNSSRYLFYWTHSSAFLKNWRLNINYTHVSDKRYFTDFDSDYGSSTDGYADQT
MRIAYYQPNYNFAISAKQFQVFDENVSIGPYRALPQIDFNYYKNGLANGLLDFKLFSQAV
HFDNDSSEMPTAWRFHLEPSFNMPLSNRYGSLNVETKLYATHYIQKDGKDQVEEMDKSVS
RVLPQLKVDLQTLLASKKTLIDGYMQTIEPHIQYLYRPYKDQSKIGSANNSSYLGFGYDS
ALLQQDYFSLFRARRYSGLDRISSANQVTLGGTTRFYDANSNERFNFSIGQIYYLQDSRI
DENRNNSTQGSSSSWALESNWKITDKLQWRGSYLYDTSLNQTSLANTTLEYNPSGMNLIQ
LNYRYASQEYIDQNLTRSINRYDQDIKQLGVTAAMEVTDNWAIVARYYQDLALKKPVEQY
LGVQYNSCCWAIGVGARRYVTSRIDQEADEVLYDHGVSFTFELRGLGNDHKSGIERMLKR
GKLPYIQAFSL
NT seq
2376 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatattcttatacattactttcgttgtcaattttgaccgcactttacagcttg
ccgagccgggcagcgagtgaaccgactggtgccttgcgggtcagcggtttgcagcaacaa
tgtttggttggtgtgccgcaagttaccggagaggtaatttccggtgatccgaatgagttg
ccggtgtatattgaagccgatcgggcggagttaaatcagccgacaaatgcgatttatgaa
ggcaatgtggatattaaacaaggtaatcgtcatcttgtaaccgaatatgccaaagtggag
caagagggcgaaggggaaaatattcagcgttatgcttatgcacaaggtggatttgattat
aaagataatcaaatcaatgtattaggttcagatgcgaaaattcacctcaatacgaaagac
agtgatattaaggatgccgattatcaatttgttggtcgtcaagggcgtgggacagcgcaa
gaggcggagttgcgcgaaacctatcgtgagttacgtaatgcgacctttacctcttgttta
ccaacggatgatgcttggttgattgaggcgaatgagatccgtcaacatattcaagaagaa
tatttagaaatgtggcatgcgcgttttaaaattttgggtgtgccagtattttatactccg
tatttgcaattgccgattggtgatcgtcgtcgttcgggtttgttaattccagatgcggga
acctcttcgcgcgacggttattggtattcacagccgatttattggaatatcgcgccgaat
tttgatgcgactattacgccgaaatatatgtctcatcgcggttggcaattaaacggtgaa
tttcgttatttaactaatttaggaacgggaaaaatcgccggtgaatatttaaatcgcgat
cgttatgatgaatatttggataagaacagctcgcgctatttattctattggacacacagt
tccgctttcttaaaaaattggcgtttgaacattaattatacgcatgtgagcgataagcgt
tatttcaccgattttgattccgattacggtagcagtacggacggttatgcagatcaaact
atgcgtattgcctattatcagccgaattacaatttcgccatttccgctaaacagttccaa
gtatttgatgaaaatgtttcgataggaccttatcgcgcgttaccgcagattgattttaat
tactataaaaatgggttagccaatggcttgcttgattttaaactgttctcacaagcggta
cattttgataatgacagttccgagatgccgactgcgtggcgttttcaccttgagccgagt
ttcaatatgccattgtctaaccgttatggtagtttaaatgtggaaacaaaattgtatgcg
acgcactatatccaaaaagatggtaaagatcaggtcgaggaaatggataaatccgtgtcg
cgcgtgttgccgcagttaaaagtggatttacaaaccttacttgctagtaagaaaacgttg
attgatggttatatgcaaaccattgagccgcatattcaatatttgtatcgtccgtataag
gatcaaagcaaaattggtagtgccaataattctagctatcttggttttggttatgattcc
gcattgttgcaacaagattatttttcgttgttccgcgcgcgtcgttatagcggtttggat
agaatttcttccgcaaaccaagtcactttggggggaacgacacgtttctatgatgccaat
tctaatgaacgttttaatttctcgattgggcaaatttattatcttcaagactcaagaatt
gatgaaaaccgtaataacagcacccaaggttcatcttcttcttgggcgttggagtccaat
tggaaaattacggataaattacaatggcgcggtagttatttgtatgataccagtttaaat
caaacttcattggcaaatactacgttggaatacaatccaagtgggatgaatttaattcag
ttaaattatcgctatgccagccaagaatatatcgatcagaatttaacccgtagcattaat
cgttacgatcaggatattaagcaattaggcgtaaccgcggcgatggaagtgactgataat
tgggcgattgtggcacgttattatcaagatttagccttgaaaaaaccggttgagcagtat
ttaggagtgcaatataactcttgttgttgggcgattggggttggtgcgcgacgttatgtg
actagtcgtatcgatcaagaggcggatgaagtgttatatgatcacggtgtcagttttacc
tttgaattacgcggtttaggcaatgatcataaaagcggtattgagcgtatgttaaaacgc
ggtaaattaccgtatattcaagcctttagtctataa
DBGET
integrated database retrieval system