Pseudoalteromonas agarivorans: PAGA_a1393
Help
Entry
PAGA_a1393 CDS
T06137
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
paga
Pseudoalteromonas agarivorans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
paga00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
paga02000
]
PAGA_a1393
Transporters [BR:
paga02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PAGA_a1393
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
IG_AIR9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATC81808
UniProt:
A0ACA8DVF3
LinkDB
All DBs
Position
I:1317655..1320393
Genome browser
AA seq
912 aa
AA seq
DB search
MMKLKHFALCAVAAAIIGCDTDSNNNNNTLGSIALSGTALTGETLSTSVNDADGISGEVS
YYWYADGQVISGANDATFTLTDEQIGFAITAQALYTDDSGVNESHLSEPTDEVSAIPFAA
TVEINGDAIIGNELSANVADENGFDPALVAYTWFADDVEIADETLATYTITESQLGKVIT
VNAAFEDNRGFAESATSTATAPVERANSEGSVAIVGTPTVGNTLTAEITDEDGASGTITY
QWFADEVAISGATQSTYVVDESLLGQFITVEVTYTDDHGFTEDNLSEATIAVSAEAVDEA
GSITISGATPYLVTSELTAEISDNNGVDEQNVTYTWLADGVAIADTNNKTFTPTNQAGAI
ISVTASYTDNDGFSSTITGAADTVVYTQVISDADALLGAINAGLGDGDVLGLNTGVYADL
DAIMLTSAATLKAVEGQSPVISGELCIHVASGVDGAGIEGLTFKNIDTKSGGFCETEEDA
VIYSEGDNFTFTQNTIDGEAETLNNSTYHWLMLKGDAAMVERNTFANRDKAENGSVIKMS
SSSTNHVIQYNLFTGTSSNPNFGNSSLHLINAGSTTGTGSADDANFTIQYNRVENFVTGR
RLMRVQTSGATIKGNTILNPNGGISLEDGGFNTVSDNIIIRTTDIASSSDRPAGVLVTPL
GHTVSNNYIAGIRSGNKEAGGIVFTANPFSQADGGVPNGGNQAVLDGAGDFTLNVTNNTV
LNSQQPFVFSTEIGSKAPVGDCDELTAENAPVLYGLTKNAFEINFNGNLNANGVGDQTDE
DTIESSALVYGFFYPNELSSDHSFEYDCDLINHTESLFSNSFGFSDSYESGDASDLWVDI
RNLNGNGEYDTDGAIDQNPEANGKEIPEFVTATSTLLETDSNGAQALAGARNLYYIQSTD
VGAGSTWVAQDE
NT seq
2739 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaattaaaacattttgcattatgtgctgttgcagctgccattataggttgtgac
acggattcaaataataataacaacacattgggctctattgctctatcaggcacagcgtta
acgggcgaaacattgtcgaccagcgtgaatgatgccgatggtatttctggcgaagtaagc
tactactggtacgccgacggacaagttataagtggcgctaatgacgcaacttttacatta
acagatgagcaaattggttttgcaattacagcacaagcactttatacagatgacagcggt
gttaatgagtcacatttaagtgagcccaccgatgaagtgtcagctattccttttgcggcc
acggtagaaattaacggtgatgcaattataggtaatgaactaagtgctaatgtagcggat
gaaaatggttttgatccggcgcttgtagcatatacatggtttgcagatgatgttgaaatt
gccgatgaaaccttagcaacctacactattaccgaatcgcaactaggtaaagttataact
gtaaatgcagcatttgaagataacagaggctttgcagagtcagctacatcaactgccaca
gcgccagtagagcgtgcaaattcagaagggtcggtggctattgttggcacacctacggtg
ggtaatacacttacagccgaaataacagatgaagatggcgcaagcggcacaattacttac
caatggtttgctgatgaggttgcaattagtggtgccacgcaaagcacttacgttgtagat
gagtcattattagggcaatttattaccgtggaggttacctacacggacgatcacggtttt
actgaagacaacctttctgaggcaaccattgctgtttctgcagaggctgtagatgaagcg
ggtagtatcaccatctcaggggctacgccatatttagtgactagcgaattaaccgctgaa
attagcgataacaacggggtagatgagcaaaacgttacctacacttggcttgctgatggc
gtagcaattgccgacaccaacaacaaaacatttacgccaactaatcaagctggcgcgatt
atatcggtcactgcgagctataccgataacgatggcttttcaagcacaattactggtgcc
gccgatacagtagtgtacacgcaagtgataagcgatgcggatgcgctattaggtgctatt
aatgcagggcttggtgatggcgatgtgcttggtttaaataccggtgtatatgccgatctt
gatgccattatgctaaccagcgcagcaacacttaaagctgttgaaggacaaagcccagta
attagtggcgagctttgtattcatgtagccagtggggttgatggcgcgggtattgaaggc
cttacatttaaaaatattgatactaaatcgggtggcttttgtgaaaccgaagaagatgcc
gttatttattctgagggtgacaacttcacatttacacaaaatactatcgatggggaagca
gagacgttaaataactctacctaccattggttaatgcttaaaggcgacgccgcaatggtt
gagcgtaatacctttgccaaccgcgataaagcagaaaatggttcggtgataaaaatgtct
tcatcgagcactaaccacgttattcaatataaccttttcacaggtaccagcagcaaccca
aattttggtaactctagcctgcacttaattaacgcagggagtacaacaggtacaggctct
gctgatgatgcaaactttactattcaatataaccgagtagaaaactttgttacaggccga
cgtttaatgcgcgtacaaacctctggcgcgacgattaaaggcaataccattttaaatcct
aatggcggtatttcgcttgaagatggtggatttaatacggtatcagacaacattattatt
cgtaccactgatattgcaagttcaagcgatcgtcctgccggcgtgctagttacgccttta
ggccacactgtaagcaataactacatcgctggtattcgttctggtaataaagaagccggt
ggtattgtatttaccgctaacccattttcacaagctgatggcggggtgccaaatggaggt
aaccaagctgtgcttgatggcgcaggcgactttacccttaatgtgactaataatacggta
cttaactcacagcaaccatttgtatttagtacagaaataggttcaaaggcacctgttgga
gattgtgatgagcttaccgcagaaaatgcacctgtactgtatggtttaactaaaaatgcg
tttgaaattaacttcaacggtaatttaaatgctaatggggtgggcgatcaaactgatgaa
gacaccattgaaagcagcgcgcttgtttatggtttcttttaccctaacgagctgtcgagc
gatcactcttttgaatacgactgtgacctaattaaccatactgaatcactgttctctaac
agctttggctttagtgacagttatgagtcgggcgatgcgagcgacctatgggttgatatt
agaaacttaaatggcaatggtgaatacgacaccgatggcgctattgaccaaaacccagaa
gcaaatggtaaagaaatcccagagtttgtcactgctacaagtacgctgcttgagactgac
tcaaatggagcacaagccttagcaggtgcaagaaacttatactacatccaaagcactgat
gtaggtgcaggctctacgtgggtggcacaagatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system