Planktothrix agardhii: NIES204_42370
Help
Entry
NIES204_42370 CDS
T05658
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
pagh
Planktothrix agardhii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pagh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pagh02000
]
NIES204_42370
Transporters [BR:
pagh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
NIES204_42370
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Bactofilin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBD56902
LinkDB
All DBs
Position
4677123..4683305
Genome browser
AA seq
2060 aa
AA seq
DB search
MTNTPNPNSESILPRRRRLKRILLWGGMGCGVTLLAVGTTASWLIRYRLAPIISNVLEGI
LQRPVDVGPLERFTLNSIRFGHSSIPPTATDTDRGEATAVEVNFSLLSLFKPKVKLDITI
VNPNIYIEQNSSGNWIDTQLKLDPNPPITLVFRTIGIENAQINLMPYQLLKAKEKPIVIA
VDQIKANLTEDQQSIQANLRGKFAETGTFAIKGDALLETGKINAQIQANSLNLSNLAWFV
ETPGISIKQGKLNTNLNVKLNNYKPSDVRGTLNLDQVKIAVDSLPEPVNLSQAKLRFSGT
KLIIDQLNTTMADLALGLTGSVLTNSNLDLAKTQVDLLANLQPVQVSTLLKTVETIQNQP
VTLPFPVTGELKANLNLKGNLNSPKISGNIGTTQKTLLDRVYFDTIQTDFNILTKLDPNF
KILADPIIEIQNLLIQPSLGGSVTGKGEVKLAGMTALLAPPIKPQPTVDQKTLLKLPPNP
QISQQKTELNPIVKLDFNVNNIPVDAIAKSYGFIPSFPIGNLSANGQISGDLDNLKANSQ
FSLPSTIYPIFGEAQISGNTAKAQIKIAEGNLNIIAQQTNNQIWNAEVIANQLSLTPLVD
LGLLFSTIPNTTKQQIQSIDLTDGQLNLAAKLSANLQDFSLNSLKADSQIQLNFQNSTIK
AIAQLQNGLLQTDFSSDNLSLPRLINIGLPFANLTDAITSQIQSLDISQGTLQIDGSLSG
KIENFSPNNFIGNAKTVINLGKLGGIITANSQLNQGQFQGQFNAQEIQLNPWINLGLPLA
NLPPNLQNQIQTLDFRNSRLNGEGNLTGNLTNFNLNSLIATGLAQVNLGNFGGIINAEGQ
LANNQLTGQVITDQIPLQPLINFGLPLANLQPSLVAEINALNFQGGFLQGLAKFNGNLTN
FSPNNLIAFLDSKVNLGRDGGIVLATGETRQGQWKTTIKGDQIALGRFSQLVESQIPNSL
RQNGLLQQAENMPLLRGLLTTEITGEGNIASFNPNTIQALGQLRLTELPIIKQPFEAIAS
WNGREINIKKAETQGFSTDGLIGVEFQGNGIPQLSNLNLNVRADNFDLQSPLVQSFLTAL
PLEIRTGDSPLVAGIVDFNGKLTGTPSALNLNGNLRLNNFAVRDVTFESILAGTVNIIPN
QKVNIALAGERDKIELALDNQYLPTSFLVKRNDSQLVGNSQGNNLEINLDDFPLQTLSLS
PLAELNIGQLKGIASGKLTVSNLASFDINKIGVIGNIAIQNLILGHIETDLFLGNFSYQN
GIAKLTDAELSKGITQIIINGQANISDILASLSTPQTQNLSTVSNQFEGTIKIPQGSLQD
ILTALKIFNLADLGRGLTPPNYGIATDVKPVPVGLPPTATLFEQLQRLEEIRRILQESLA
EIAAEPLPPLRDLDGKFTGEIAFKGSIQWGINATATIKGQDWNYGRYTADQFLLEANFVD
NVVRVEPIQLLAESALYDFRGQLNLANQQISGQFRGKNIRLEEIEKIVDLPNVDLTGQLN
VRASIGGTLDNPQSSGELTLLEATVNNEPIQEAQSSFSYNNARLRFGGSLLVTETDPINF
RGTLPFQFPFAKVTSESDVVDVRVDIKDQGLAVINLLNPELNWQEGKGLVQLRISGSLQQ
PETGGIKLNLKPEGLFKIQDAVLIARSLEQSIVGLSGTAVFIGDRIQVKDIQGDLQGDKG
TGRIRLSGVLPVSRPLDENDPDLQTPLQLDLEKLTLNLPELYKGNADGAILLTGTLLKPK
LGGEVILSQGKVTLPSEQTATLPTDTTNTTQPPVDVSLNGLKLTLGDNIQVMTPPILNAP
LINFNAKGTIELNGSLASLDDIRPQGTIDLTGGQVNLYTSQLRLDRGYPQRAIFVPSEGL
NPILDVRLFTRVPETLRFVSPPSAFPAEQTEALSPSRLGSVRTIRITAIVRGPASEINDI
IKLQSSPSRSQNELVALLGGSVIQGIQDDSTLVLANIASTGLFGKLQQNVINATGLTEFR
IYPSRIAERGSKGTASALGVGIEVGLDVTDNAYVSLSRVLAADQPFQFNINYRLNDNILL
RGVTNFRNESEIRFEYETRF
NT seq
6183 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaatacaccgaatcccaattctgaatcaattttaccccgccgacgacggttaaag
cggattttgctttggggcggtatgggctgtggagtcaccctgttagccgtggggacgacc
gctagttggttgattagatatcggttagcccccataattagcaatgtcttagaagggata
ctacaacggccagttgatgttggccccctggaacgatttaccctaaatagtattcgtttt
ggtcattcgtccatcccccccacagccacggataccgataggggggaagcgacggcggta
gaggttaatttctctcttttatccttgtttaaacccaaggttaaacttgatattaccata
gttaatcctaatatttatattgaacaaaattcatcgggaaactggattgatactcaactt
aagttagatccaaatcctccaattacattggtttttagaacgattgggattgaaaatgct
caaattaatttaatgccctatcagcttttgaaagccaaagaaaagccgattgtgattgcg
gtggatcaaatcaaagctaatttaaccgaagatcagcagagcattcaagcgaatttaagg
ggtaaatttgcagaaacaggtacttttgccatcaagggagatgctttattagaaacagga
aaaattaatgctcaaattcaagctaatagtttgaatttaagcaatttagcttggtttgta
gaaactcctgggatttcgattaaacagggaaaacttaatacaaatttaaacgttaaatta
aataattataaaccatcagatgttcggggaacgctgaatttagatcaagttaaaattgct
gttgatagtcttcctgaacctgttaatctgagtcaagctaaattacgattttcgggaact
aaattgatcattgatcagttgaatactactatggcagatttggctctaggattaacggga
tcggttttaactaattctaacttagacttagctaaaactcaagttgatttattagcaaat
ttacaaccagttcaagtttccaccctgttaaaaaccgtagaaactattcagaaccaacct
gttacccttccctttccggtgacgggagaattgaaagctaatcttaacttaaaaggaaat
ttaaacagtcctaaaatttcaggaaatatcggcacaactcaaaaaaccttattagatcgc
gtttattttgatacaattcaaacggattttaatatattaactaaacttgatccaaatttt
aagattttagctgatccaattattgagattcaaaacctattaattcaaccttcccttggg
gggtcagtaaccggaaaaggggaagttaaattagcaggaatgaccgcgttattagcaccc
ccaataaaacctcagcctacggttgatcaaaaaactttactaaaattacccccaaatcct
cagatttcacaacaaaaaaccgaacttaatccgattgttaagttagattttaatgttaat
aatattcctgtggatgcgatcgctaaatcctacggatttatccccagttttccgattgga
aacctatcagcaaatggtcaaatttctggagatttagacaacttaaaagctaatagtcaa
ttctccttaccttcaacaatttatccgatttttggggaagctcaaatttcaggaaatacg
gcgaaagcacagattaaaattgctgagggaaatctgaatattattgctcaacaaactaat
aatcaaatttggaatgctgaagtcatagctaatcaactttccttaactcctttagttgat
ttgggtctattattttccacaattcctaatacaactaaacaacaaattcaatctattgat
ttaaccgatggtcagttaaatttagccgccaaattatcagcaaatttgcaagatttttcc
ctgaatagtttaaaagcggatagtcaaattcaacttaattttcagaatagtacaattaag
gcgatcgcccaactccaaaacggactactacaaacggatttttctagcgataatttatcc
ttacctcgattaattaatattggattaccctttgccaacttaactgatgctatcacctcc
caaattcagagtttagatatcagtcaaggaactttacaaattgatggatctctatcaggt
aaaatagagaattttagcccaaataactttatcggaaatgccaaaacagtcattaattta
ggtaaattaggaggaataattaccgccaatagtcaacttaatcaaggacaatttcaagga
caattcaatgctcaagaaatccagttaaatccttggattaatttaggtttacccctcgct
aatttacccccaaacctccagaatcaaattcaaaccttagactttcgtaatagtcgttta
aacggagaaggaaatcttaccggaaatttaactaattttaatcttaatagtctgattgct
acgggattagcacaggttaatttagggaattttggtggaattattaatgcagaaggacaa
ttagcaaataatcaattaacaggtcaagtaatcaccgatcaaattcctctacaaccctta
attaatttcggattacccttagcaaatttacaacctagtttagtagctgaaattaacgcc
ttaaattttcaaggaggattcctacaagggttagcaaaatttaatgggaatctgactaat
ttttcccctaataacttaatagctttcctcgatagtaaggtaaatttaggtcgagacggc
ggtatagttttagcaaccggagaaactcgacaaggacaatggaaaacaaccattaaagga
gatcaaattgctttaggtcgattctctcaattagttgaatctcaaataccaaatagttta
cgtcaaaatggactattacagcaagctgaaaatatgcctttattgcgaggattattaact
actgaaatcaccggagaaggaaatattgcctcctttaatcccaacactatacaggcatta
ggtcaattaagactaacagaattaccgattattaaacaaccttttgaagccattgcaagc
tggaatggtcgagaaattaatattaaaaaagctgaaacccagggattttcaactgatggc
ttaattggagttgaatttcaaggaaatggtattccccaattatctaatttaaacctaaat
gttcgggctgataattttgatttacaatctccattagtgcaaagtttcttaactgcttta
cccttagaaattagaaccggagatagtcctttagtggctggaattgttgattttaatggt
aaattaacggggactccttcggctttaaacctaaacggaaatttaagattaaataacttt
gcagttcgggatgtcacctttgaatccattctagcaggaactgtgaatattattccaaat
caaaaggttaatattgccttagcgggagaaagggataaaatagaattagctttggataat
caatatttaccgacttcctttttagtaaaacggaatgatagtcaattagtcggaaactct
caagggaataatttagagattaatttagacgactttcctctacaaacattaagtttatct
cccttagctgaactaaatattggacaattaaaaggtatagcatcgggaaaattaaccgtc
tctaatttagccagttttgatattaataaaataggggtaatcggaaatattgcgatccag
aacctaattttaggtcatattgaaaccgatttatttttgggaaattttagttatcaaaat
ggtattgctaagttaaccgatgctgaattgagcaaaggcataactcagattataattaat
ggtcaagccaatatttctgatattttagccagtctttccacacctcaaacccagaattta
tccactgtatcgaatcaatttgaaggaacaattaaaatcccccaagggagtttacaggat
attttaaccgccctaaaaatctttaatttagcagatttaggcagaggattaacccctcca
aactatggaatagccaccgatgtaaagcctgttcccgtcggtttaccccccacagctacg
ttatttgaacaattacaacgcctagaagaaattagacgaatattacaagaatccctagca
gaaatcgcggcggaacccttacctcctttacgagatttagacggaaaatttaccggagaa
attgcatttaaaggttcaattcaatggggaattaatgcgacagcaaccatcaaaggtcaa
gattggaattatggcagatataccgccgatcagtttttattagaagcgaattttgtagat
aatgtggtgcgggttgaacccattcaattgcttgctgaatcagcattatatgattttcgc
ggacagttaaatttagccaatcaacaaatatcaggtcagtttcggggtaaaaatatccgc
ttagaagaaattgaaaaaattgtcgatttgccaaatgtggatttaaccggacaattgaat
gttcgggcgagtattgggggaactttagataatccccaatcatcgggggaattaacctta
ttagaagcaacggttaataatgaaccaattcaagaagctcaaagcagttttagttataat
aatgctcgactaagatttggcggaagtttgttagttaccgaaaccgatccaattaatttt
agagggactttaccttttcaattcccctttgcaaaagtaacttctgaaagtgatgtagtt
gatgttagagttgatattaaagatcaaggattagcagtgatcaatttactgaatcctgaa
ttaaattggcaggaaggaaaaggattagttcaattaagaatcagtggtagtttacaacaa
ccggaaactggaggaattaagctcaacctgaaaccagaaggattatttaaaattcaagat
gcagttttaattgctcgcagtttagaacaatcaattgtgggattaagtggaactgctgta
tttatcggcgatcggattcaagttaaagatattcaaggagatttacaaggagataaagga
accggacgtatccgattaagtggggttttacccgtgtctcgtcccttagatgaaaatgac
ccagatctgcaaactcctctacaattagacctggaaaaactaacacttaatttacccgaa
ctctataaaggaaatgctgatggtgctatccttcttacaggaacattattgaaaccaaaa
ttaggaggagaagtcatattaagtcagggaaaagttaccttaccttcggaacaaaccgct
accttacccacagatactacgaatacaactcaacctcctgttgatgtcagtctgaacgga
ttaaaactaactttaggcgacaatattcaagtcatgactcccccgattttaaatgcacct
ttaattaattttaatgcgaaaggaacgattgaattaaatggaagtttagccagtcttgat
gatattcgtcctcaaggaacgattgacttaaccggaggacaagttaatctttataccagt
caattaaggttagatcgaggctatccccaacgggcaatatttgttccttcggagggatta
aatccaattttagatgtgcgtttattcacccgtgttcctgaaactttaaggtttgtttct
cctccttcggcttttccggcggaacaaaccgaagccctaagtccttctcgattgggaagt
gttagaacgatccgaattaccgcaattgttcgcggcccagcttcggaaattaatgatatt
attaagttacaaagttctccgtcccgttctcaaaatgaattggttgctttattaggtgga
agtgtgattcaaggcattcaagatgatagtacattagtattagcaaatattgccagtacc
ggattatttggtaaactccaacagaatgtgattaacgccacgggattaacggaatttagg
atttatccctcacgaatagccgaacgtggttccaagggcacagcttccgctttaggagtg
ggaattgaagtgggtttagatgtgactgataatgcttatgtttctttaagtcgggtctta
gctgcggatcaaccgtttcaatttaatattaattatcgtctaaatgataatatattgttg
cggggagttacgaattttaggaatgaaagtgaaattcggtttgagtatgaaacgaggttt
taa
DBGET
integrated database retrieval system