KEGG   Planktothrix agardhii: NIES204_42370
Entry
NIES204_42370     CDS       T05658                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K09800  translocation and assembly module TamB
Organism
pagh  Planktothrix agardhii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pagh00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pagh02000]
    NIES204_42370
Transporters [BR:pagh02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   NIES204_42370
SSDB
Motif
Pfam: TamB Bactofilin
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBD56902
LinkDB
Position
4677123..4683305
AA seq 2060 aa
MTNTPNPNSESILPRRRRLKRILLWGGMGCGVTLLAVGTTASWLIRYRLAPIISNVLEGI
LQRPVDVGPLERFTLNSIRFGHSSIPPTATDTDRGEATAVEVNFSLLSLFKPKVKLDITI
VNPNIYIEQNSSGNWIDTQLKLDPNPPITLVFRTIGIENAQINLMPYQLLKAKEKPIVIA
VDQIKANLTEDQQSIQANLRGKFAETGTFAIKGDALLETGKINAQIQANSLNLSNLAWFV
ETPGISIKQGKLNTNLNVKLNNYKPSDVRGTLNLDQVKIAVDSLPEPVNLSQAKLRFSGT
KLIIDQLNTTMADLALGLTGSVLTNSNLDLAKTQVDLLANLQPVQVSTLLKTVETIQNQP
VTLPFPVTGELKANLNLKGNLNSPKISGNIGTTQKTLLDRVYFDTIQTDFNILTKLDPNF
KILADPIIEIQNLLIQPSLGGSVTGKGEVKLAGMTALLAPPIKPQPTVDQKTLLKLPPNP
QISQQKTELNPIVKLDFNVNNIPVDAIAKSYGFIPSFPIGNLSANGQISGDLDNLKANSQ
FSLPSTIYPIFGEAQISGNTAKAQIKIAEGNLNIIAQQTNNQIWNAEVIANQLSLTPLVD
LGLLFSTIPNTTKQQIQSIDLTDGQLNLAAKLSANLQDFSLNSLKADSQIQLNFQNSTIK
AIAQLQNGLLQTDFSSDNLSLPRLINIGLPFANLTDAITSQIQSLDISQGTLQIDGSLSG
KIENFSPNNFIGNAKTVINLGKLGGIITANSQLNQGQFQGQFNAQEIQLNPWINLGLPLA
NLPPNLQNQIQTLDFRNSRLNGEGNLTGNLTNFNLNSLIATGLAQVNLGNFGGIINAEGQ
LANNQLTGQVITDQIPLQPLINFGLPLANLQPSLVAEINALNFQGGFLQGLAKFNGNLTN
FSPNNLIAFLDSKVNLGRDGGIVLATGETRQGQWKTTIKGDQIALGRFSQLVESQIPNSL
RQNGLLQQAENMPLLRGLLTTEITGEGNIASFNPNTIQALGQLRLTELPIIKQPFEAIAS
WNGREINIKKAETQGFSTDGLIGVEFQGNGIPQLSNLNLNVRADNFDLQSPLVQSFLTAL
PLEIRTGDSPLVAGIVDFNGKLTGTPSALNLNGNLRLNNFAVRDVTFESILAGTVNIIPN
QKVNIALAGERDKIELALDNQYLPTSFLVKRNDSQLVGNSQGNNLEINLDDFPLQTLSLS
PLAELNIGQLKGIASGKLTVSNLASFDINKIGVIGNIAIQNLILGHIETDLFLGNFSYQN
GIAKLTDAELSKGITQIIINGQANISDILASLSTPQTQNLSTVSNQFEGTIKIPQGSLQD
ILTALKIFNLADLGRGLTPPNYGIATDVKPVPVGLPPTATLFEQLQRLEEIRRILQESLA
EIAAEPLPPLRDLDGKFTGEIAFKGSIQWGINATATIKGQDWNYGRYTADQFLLEANFVD
NVVRVEPIQLLAESALYDFRGQLNLANQQISGQFRGKNIRLEEIEKIVDLPNVDLTGQLN
VRASIGGTLDNPQSSGELTLLEATVNNEPIQEAQSSFSYNNARLRFGGSLLVTETDPINF
RGTLPFQFPFAKVTSESDVVDVRVDIKDQGLAVINLLNPELNWQEGKGLVQLRISGSLQQ
PETGGIKLNLKPEGLFKIQDAVLIARSLEQSIVGLSGTAVFIGDRIQVKDIQGDLQGDKG
TGRIRLSGVLPVSRPLDENDPDLQTPLQLDLEKLTLNLPELYKGNADGAILLTGTLLKPK
LGGEVILSQGKVTLPSEQTATLPTDTTNTTQPPVDVSLNGLKLTLGDNIQVMTPPILNAP
LINFNAKGTIELNGSLASLDDIRPQGTIDLTGGQVNLYTSQLRLDRGYPQRAIFVPSEGL
NPILDVRLFTRVPETLRFVSPPSAFPAEQTEALSPSRLGSVRTIRITAIVRGPASEINDI
IKLQSSPSRSQNELVALLGGSVIQGIQDDSTLVLANIASTGLFGKLQQNVINATGLTEFR
IYPSRIAERGSKGTASALGVGIEVGLDVTDNAYVSLSRVLAADQPFQFNINYRLNDNILL
RGVTNFRNESEIRFEYETRF
NT seq 6183 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgactaatacaccgaatcccaattctgaatcaattttaccccgccgacgacggttaaag
cggattttgctttggggcggtatgggctgtggagtcaccctgttagccgtggggacgacc
gctagttggttgattagatatcggttagcccccataattagcaatgtcttagaagggata
ctacaacggccagttgatgttggccccctggaacgatttaccctaaatagtattcgtttt
ggtcattcgtccatcccccccacagccacggataccgataggggggaagcgacggcggta
gaggttaatttctctcttttatccttgtttaaacccaaggttaaacttgatattaccata
gttaatcctaatatttatattgaacaaaattcatcgggaaactggattgatactcaactt
aagttagatccaaatcctccaattacattggtttttagaacgattgggattgaaaatgct
caaattaatttaatgccctatcagcttttgaaagccaaagaaaagccgattgtgattgcg
gtggatcaaatcaaagctaatttaaccgaagatcagcagagcattcaagcgaatttaagg
ggtaaatttgcagaaacaggtacttttgccatcaagggagatgctttattagaaacagga
aaaattaatgctcaaattcaagctaatagtttgaatttaagcaatttagcttggtttgta
gaaactcctgggatttcgattaaacagggaaaacttaatacaaatttaaacgttaaatta
aataattataaaccatcagatgttcggggaacgctgaatttagatcaagttaaaattgct
gttgatagtcttcctgaacctgttaatctgagtcaagctaaattacgattttcgggaact
aaattgatcattgatcagttgaatactactatggcagatttggctctaggattaacggga
tcggttttaactaattctaacttagacttagctaaaactcaagttgatttattagcaaat
ttacaaccagttcaagtttccaccctgttaaaaaccgtagaaactattcagaaccaacct
gttacccttccctttccggtgacgggagaattgaaagctaatcttaacttaaaaggaaat
ttaaacagtcctaaaatttcaggaaatatcggcacaactcaaaaaaccttattagatcgc
gtttattttgatacaattcaaacggattttaatatattaactaaacttgatccaaatttt
aagattttagctgatccaattattgagattcaaaacctattaattcaaccttcccttggg
gggtcagtaaccggaaaaggggaagttaaattagcaggaatgaccgcgttattagcaccc
ccaataaaacctcagcctacggttgatcaaaaaactttactaaaattacccccaaatcct
cagatttcacaacaaaaaaccgaacttaatccgattgttaagttagattttaatgttaat
aatattcctgtggatgcgatcgctaaatcctacggatttatccccagttttccgattgga
aacctatcagcaaatggtcaaatttctggagatttagacaacttaaaagctaatagtcaa
ttctccttaccttcaacaatttatccgatttttggggaagctcaaatttcaggaaatacg
gcgaaagcacagattaaaattgctgagggaaatctgaatattattgctcaacaaactaat
aatcaaatttggaatgctgaagtcatagctaatcaactttccttaactcctttagttgat
ttgggtctattattttccacaattcctaatacaactaaacaacaaattcaatctattgat
ttaaccgatggtcagttaaatttagccgccaaattatcagcaaatttgcaagatttttcc
ctgaatagtttaaaagcggatagtcaaattcaacttaattttcagaatagtacaattaag
gcgatcgcccaactccaaaacggactactacaaacggatttttctagcgataatttatcc
ttacctcgattaattaatattggattaccctttgccaacttaactgatgctatcacctcc
caaattcagagtttagatatcagtcaaggaactttacaaattgatggatctctatcaggt
aaaatagagaattttagcccaaataactttatcggaaatgccaaaacagtcattaattta
ggtaaattaggaggaataattaccgccaatagtcaacttaatcaaggacaatttcaagga
caattcaatgctcaagaaatccagttaaatccttggattaatttaggtttacccctcgct
aatttacccccaaacctccagaatcaaattcaaaccttagactttcgtaatagtcgttta
aacggagaaggaaatcttaccggaaatttaactaattttaatcttaatagtctgattgct
acgggattagcacaggttaatttagggaattttggtggaattattaatgcagaaggacaa
ttagcaaataatcaattaacaggtcaagtaatcaccgatcaaattcctctacaaccctta
attaatttcggattacccttagcaaatttacaacctagtttagtagctgaaattaacgcc
ttaaattttcaaggaggattcctacaagggttagcaaaatttaatgggaatctgactaat
ttttcccctaataacttaatagctttcctcgatagtaaggtaaatttaggtcgagacggc
ggtatagttttagcaaccggagaaactcgacaaggacaatggaaaacaaccattaaagga
gatcaaattgctttaggtcgattctctcaattagttgaatctcaaataccaaatagttta
cgtcaaaatggactattacagcaagctgaaaatatgcctttattgcgaggattattaact
actgaaatcaccggagaaggaaatattgcctcctttaatcccaacactatacaggcatta
ggtcaattaagactaacagaattaccgattattaaacaaccttttgaagccattgcaagc
tggaatggtcgagaaattaatattaaaaaagctgaaacccagggattttcaactgatggc
ttaattggagttgaatttcaaggaaatggtattccccaattatctaatttaaacctaaat
gttcgggctgataattttgatttacaatctccattagtgcaaagtttcttaactgcttta
cccttagaaattagaaccggagatagtcctttagtggctggaattgttgattttaatggt
aaattaacggggactccttcggctttaaacctaaacggaaatttaagattaaataacttt
gcagttcgggatgtcacctttgaatccattctagcaggaactgtgaatattattccaaat
caaaaggttaatattgccttagcgggagaaagggataaaatagaattagctttggataat
caatatttaccgacttcctttttagtaaaacggaatgatagtcaattagtcggaaactct
caagggaataatttagagattaatttagacgactttcctctacaaacattaagtttatct
cccttagctgaactaaatattggacaattaaaaggtatagcatcgggaaaattaaccgtc
tctaatttagccagttttgatattaataaaataggggtaatcggaaatattgcgatccag
aacctaattttaggtcatattgaaaccgatttatttttgggaaattttagttatcaaaat
ggtattgctaagttaaccgatgctgaattgagcaaaggcataactcagattataattaat
ggtcaagccaatatttctgatattttagccagtctttccacacctcaaacccagaattta
tccactgtatcgaatcaatttgaaggaacaattaaaatcccccaagggagtttacaggat
attttaaccgccctaaaaatctttaatttagcagatttaggcagaggattaacccctcca
aactatggaatagccaccgatgtaaagcctgttcccgtcggtttaccccccacagctacg
ttatttgaacaattacaacgcctagaagaaattagacgaatattacaagaatccctagca
gaaatcgcggcggaacccttacctcctttacgagatttagacggaaaatttaccggagaa
attgcatttaaaggttcaattcaatggggaattaatgcgacagcaaccatcaaaggtcaa
gattggaattatggcagatataccgccgatcagtttttattagaagcgaattttgtagat
aatgtggtgcgggttgaacccattcaattgcttgctgaatcagcattatatgattttcgc
ggacagttaaatttagccaatcaacaaatatcaggtcagtttcggggtaaaaatatccgc
ttagaagaaattgaaaaaattgtcgatttgccaaatgtggatttaaccggacaattgaat
gttcgggcgagtattgggggaactttagataatccccaatcatcgggggaattaacctta
ttagaagcaacggttaataatgaaccaattcaagaagctcaaagcagttttagttataat
aatgctcgactaagatttggcggaagtttgttagttaccgaaaccgatccaattaatttt
agagggactttaccttttcaattcccctttgcaaaagtaacttctgaaagtgatgtagtt
gatgttagagttgatattaaagatcaaggattagcagtgatcaatttactgaatcctgaa
ttaaattggcaggaaggaaaaggattagttcaattaagaatcagtggtagtttacaacaa
ccggaaactggaggaattaagctcaacctgaaaccagaaggattatttaaaattcaagat
gcagttttaattgctcgcagtttagaacaatcaattgtgggattaagtggaactgctgta
tttatcggcgatcggattcaagttaaagatattcaaggagatttacaaggagataaagga
accggacgtatccgattaagtggggttttacccgtgtctcgtcccttagatgaaaatgac
ccagatctgcaaactcctctacaattagacctggaaaaactaacacttaatttacccgaa
ctctataaaggaaatgctgatggtgctatccttcttacaggaacattattgaaaccaaaa
ttaggaggagaagtcatattaagtcagggaaaagttaccttaccttcggaacaaaccgct
accttacccacagatactacgaatacaactcaacctcctgttgatgtcagtctgaacgga
ttaaaactaactttaggcgacaatattcaagtcatgactcccccgattttaaatgcacct
ttaattaattttaatgcgaaaggaacgattgaattaaatggaagtttagccagtcttgat
gatattcgtcctcaaggaacgattgacttaaccggaggacaagttaatctttataccagt
caattaaggttagatcgaggctatccccaacgggcaatatttgttccttcggagggatta
aatccaattttagatgtgcgtttattcacccgtgttcctgaaactttaaggtttgtttct
cctccttcggcttttccggcggaacaaaccgaagccctaagtccttctcgattgggaagt
gttagaacgatccgaattaccgcaattgttcgcggcccagcttcggaaattaatgatatt
attaagttacaaagttctccgtcccgttctcaaaatgaattggttgctttattaggtgga
agtgtgattcaaggcattcaagatgatagtacattagtattagcaaatattgccagtacc
ggattatttggtaaactccaacagaatgtgattaacgccacgggattaacggaatttagg
atttatccctcacgaatagccgaacgtggttccaagggcacagcttccgctttaggagtg
ggaattgaagtgggtttagatgtgactgataatgcttatgtttctttaagtcgggtctta
gctgcggatcaaccgtttcaatttaatattaattatcgtctaaatgataatatattgttg
cggggagttacgaattttaggaatgaaagtgaaattcggtttgagtatgaaacgaggttt
taa

DBGET integrated database retrieval system