Candidatus Phytoplasma australiense: PA0541
Help
Entry
PA0541 CDS
T00752
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha subunit
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
pal
Candidatus Phytoplasma australiense
Pathway
pal03030
DNA replication
pal03430
Mismatch repair
pal03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pal00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
PA0541 (polC)
03430 Mismatch repair
PA0541 (polC)
03440 Homologous recombination
PA0541 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
pal03032
]
PA0541 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pal03400
]
PA0541 (polC)
Enzymes [BR:
pal01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
PA0541 (polC)
DNA replication proteins [BR:
pal03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
PA0541 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
pal03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
PA0541 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
PHP
DNA_pol3_finger
HHH_6
DEDDh_C
DNA_pol_A_exo1
HHH_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAM11875
UniProt:
B1VAA2
LinkDB
All DBs
Position
543097..547689
Genome browser
AA seq
1530 aa
AA seq
DB search
MMYNNAFQQFIKENGFDKNYFQNPQLEKVLVLESKNKLILHISFQKLLLVHDLETFLGQF
KIFLKEKEKEYLIKTILKEKQKDELTDKEKKELLDNYVKNEIEMEYRINFKNFDYLTSLF
PSYYRYIIPKAKIQKKYSDLDTFENDDFQIKCQNKKFIISVNPESFLTLNKKTKLLKEFF
YSFYRFENDFILEKDDKIKIKVGKDMTNTTNDKKNQNEEILKIRDIPKSPKELEEFGKNN
SQKTFIVEGLLAHTITESNFRKYNWKEFYFSCVIEENNGFSIEDRDAILIKAKVSKEKKA
EILNQNIQIHQKIQIEAEIKYSVWDDVHLLFDQNKINILGQSTLFPVRKDEFEGKKRIEF
HTHTKMSNLDAINSAKEYLKIAESWGHEAIAFTDHDGIYSYPEIYEYSKGKKIKPIYGLE
IDFIQERPIYITNQIEDNLTQDFNLKEATYVVFDLETTGFSSTKDKIIEIAGVKIKHGKK
IQEFQALINPQEKLSQTIINITNITDDMLEGKNTIDQVLPDFLNFIENCILVAHNATFDI
TFLKEKIKELGIAYKPQPVIDTMTLSQRFFSEFLKYFSLKRLATVFKVKMEEHHRALSDA
NTTAQVFIKMIDQLSDASKNDKNVLITNFFDLKDPIDPKYERSYHINILVANQKGYRNLF
ELLSAALTDGFYKKPRVLKSSLSKHREGLLVGSGCYDSNIFEIALNSNIEKLRKAISFYD
YIEIQPPQAYKHLISQLGDKGEKIIHSTLIKIIEETKKQNKIIIATGDVHYIHPWEKDYR
QIYIKAKQVGGGLHKLSKYGDCNLPNNHLLTTQEMLEAFNFLQNDYLSREIIIDNTHLLN
SKIEKIQPFTKELFSLKDDAFKDILNIPSIKKEIQSLVQKKVQKLYGPNPHPLIDKRLKQ
ELNSIIGDVNDATSNQDIAPIYYLSHLLVKKSLEDGYLVGSRGSIGSSLVATMLDITEVN
PLRPHYRCPNCCYTIIKTKPEEKEKYYSLEEQSYYDALGKVFSGYDLENKKCPKCQSPLE
KDGHDIPFETFLGFEGNKTPDIDLNFAGDYQIKAHNYIKNLIGEKHAFRAGTIQTIAKRN
AYGYVKGFVESANKNWRKQKISQITTKIEGVKRSTGQHPGGIVIVPPNRSIYEITPIQFP
ANDTNSEWKTTHFDYHSFENNLFKLDILGHDDPMMIKFLMDCVKKNPNKFAFKKAQEIPL
DDPEVYKLFSEDMKITSAQNETITIDSLGIPEFGTTFVKQMLKDIKKNHKKNINFADLVK
ISGLSHGTDVWLKNAKDVIGQTGDFEKYKNQNISFDDIIGCRDDIMLQLQDKGVDALKAF
EIMEFIRKGQPQNDPKTWQDYKNLMEGKVENWYIDSAEKIKYLFPKAHATAYVIMALRIA
WFKVYAPLIFYSGYFSKRAEQFDHQIMISNDPEIIQNKINNLKKNEIKAKEAVLINTLQI
AKEMLQRGFKFLSVDFNKSDIDVFKIENDNYLRMPLLCIDGLGMIAAKKIIKTREDKPFT
QEDFRTRSRVNKKIFEQIIKENLLESLPKE
NT seq
4593 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatgtataacaacgcatttcaacaatttataaaagaaaatggttttgataaaaattat
tttcaaaatcctcaattagaaaaagttttggttttagaatccaaaaataaattgatttta
catatcagctttcaaaaattacttttagttcatgatttagaaacttttttaggtcaattc
aaaatttttctcaaagaaaaagaaaaagaatatctgataaaaacaattctcaaagaaaaa
caaaaagatgaactaacagacaaagaaaaaaaagaactgttggataattatgtaaaaaac
gaaattgagatggaatatcgcataaatttcaaaaattttgattatttaacatcccttttt
cctagttattatcgttatattattcccaaagcaaaaatccaaaaaaaatattctgatttg
gatacatttgaaaacgatgattttcaaattaaatgccaaaataaaaaatttataatttct
gtcaatcctgaatcttttttaactttaaataaaaaaacaaaacttttaaaagagtttttt
tactctttttatcgctttgaaaatgattttatcttagaaaaagatgacaaaattaaaata
aaagttggcaaagatatgacaaatacaacaaatgacaaaaaaaaccaaaatgaagaaatt
ttaaaaatacgagatattcctaaatctccaaaagaactcgaagaatttggaaaaaacaat
tctcaaaaaacttttatcgttgaaggtcttttggctcataccatcacagaaagtaatttt
cgtaaatacaattggaaagaattttattttagttgtgttatagaagaaaacaatggcttt
tcaattgaagatagagacgctattttaatcaaagccaaagtttccaaagaaaaaaaagca
gaaattttaaatcaaaatatccaaatacaccaaaaaattcaaatagaagcagaaattaaa
tacagcgtttgggatgatgtccatttgcttttcgaccaaaacaaaatcaatattttaggc
caatctactttgtttccggttagaaaagatgaatttgaaggcaaaaaaagaatagaattt
cacacacacacaaaaatgtctaatttagatgctattaatagtgctaaagagtatttgaaa
atagcagaatcatggggtcatgaagcaattgcttttaccgatcatgatggcatttattct
tatcctgaaatatatgaatattccaaaggaaaaaaaatcaaaccaatttatggattagaa
attgattttattcaagaaagacctatttatattactaatcaaatagaagataatttaact
caagattttaatttaaaagaagccacttatgttgttttcgacttagaaacaactggtttt
tcaagcacaaaagataaaattattgaaatcgctggggtcaaaattaaacatggtaaaaaa
atacaagaattccaagccttaattaatccccaagaaaaactaagccaaactattattaac
atcacaaacattacagatgatatgttggaaggaaaaaatacaattgaccaagttttgcct
gattttttaaattttattgaaaattgcattttagttgctcataatgcaacttttgatata
acttttttaaaagaaaaaataaaagaattagggatagcatacaaaccacaaccagtaatt
gatacgatgacattatcacaacgttttttcagtgaatttttaaaatatttttctttaaaa
agattagctacagtttttaaagtaaaaatggaagaacatcaccgtgctttaagtgatgca
aacacaaccgctcaagtttttattaagatgattgatcaattatcagatgctagtaaaaat
gacaaaaacgtattaattacaaatttttttgatttaaaagatcccattgatcctaaatac
gaaagatcttatcatatcaatattttagtagccaatcaaaagggttatcgaaatcttttt
gaacttttaagcgctgcattaacagatggtttttataaaaaacctagagttttaaaatct
agtttatccaaacatagagaaggtcttttggttggtagtggttgttatgatagtaatatt
tttgaaatagccttgaattccaacattgaaaaattaagaaaagcaatttctttttatgat
tatattgaaattcagccccctcaagcttacaaacacttaatttctcagttaggtgataag
ggagaaaaaatcattcactctactttaataaaaattatcgaagaaacaaagaaacaaaat
aaaatcatcattgctaccggagatgtccattatatacatccttgggaaaaagattatcgt
caaatttacattaaagcaaaacaagtaggaggcgggttgcataaattatctaaatatggt
gattgcaatttaccaaacaaccatcttttaaccactcaagaaatgcttgaggcgtttaac
tttttgcaaaatgactatttatcgcgtgaaattataattgataacactcatttgcttaat
tcaaaaatcgaaaaaattcaacctttcactaaagaacttttttctttaaaagatgatgct
tttaaagatattttaaatataccaagcatcaaaaaagaaatccaaagtttagtgcaaaaa
aaagttcaaaaattatatgggccaaaccctcatcctttgattgataaaagattaaaacaa
gaattaaacagtatcattggtgatgttaatgatgctacaagtaatcaagatatcgctcct
atttattatttatctcatttattggttaaaaaatctttagaagatggttatttggtaggt
tctcgtggctccatcggttcatctttggtggctaccatgttagatattaccgaagttaat
cctttaagaccgcattatcgttgccctaattgttgttatactattataaaaacaaaacca
gaagaaaaagaaaaatattattctttagaagaacaaagttattatgatgctttaggaaaa
gttttttcaggctatgatttagaaaataaaaaatgccccaaatgtcaatctccccttgaa
aaagacggtcatgatattccgtttgaaacgtttttagggtttgaaggaaataaaactcct
gatattgatcttaattttgcaggcgattaccagattaaagctcataattacattaaaaat
ttaatcggcgaaaaacatgcttttagagctggaacaattcaaacaattgcgaaaagaaat
gcttatggttatgtaaagggttttgttgaaagtgctaacaaaaattggcgtaaacaaaaa
atatcccaaataacaaccaaaattgaaggagtcaaacgttcaactggacaacatccagga
ggaatcgttattgttccgccgaatcgaagcatttatgaaataacaccaattcaatttccg
gccaatgataccaattctgaatggaaaacaactcattttgattatcattcctttgaaaat
aatttatttaaattagatattttaggccatgatgatcctatgatgattaaatttttaatg
gattgtgttaaaaaaaatccaaataaattcgcttttaaaaaagctcaagaaattccttta
gatgatcctgaagtttataaattattttctgaagatatgaaaataacttctgctcaaaat
gaaacaattacaatcgattctttagggattccggaatttggaacaaccttcgttaaacaa
atgttaaaagatattaaaaaaaatcataaaaaaaatatcaattttgctgatttagttaaa
atttctgggctttctcatggaaccgatgtttggcttaaaaacgctaaagatgtcattggt
caaacgggtgattttgaaaaatataaaaaccaaaatatttcttttgatgacattattggt
tgtcgcgatgatattatgttgcaattgcaagataaaggtgttgatgctttaaaagctttt
gaaatcatggaattcatccgcaaaggtcaaccacaaaatgatccaaaaacttggcaagat
tataaaaatttgatggaaggaaaagttgaaaactggtatattgattcagctgaaaaaatc
aagtatttgttcccaaaggcccatgcaactgcttatgttattatggctttaagaattgct
tggtttaaagtttatgctcctttgattttttatagtggttatttttccaaaagagcagaa
caatttgatcatcaaattatgattagcaatgatccagaaattattcaaaacaaaatcaat
aatcttaaaaaaaatgaaatcaaagcaaaagaagcggttttgattaacactctccaaata
gccaaagaaatgttacaacgtggttttaaatttttaagcgttgatttcaataaatcagat
attgatgtttttaaaatagaaaacgataattatttgagaatgcctttgctttgcattgat
ggtttaggaatgattgctgctaaaaaaattataaaaactcgcgaagacaaaccttttact
caagaagattttcgcactcgttctagggttaacaaaaaaatatttgaacaaattataaaa
gaaaatcttttagaatccttacccaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system