Paludihabitans sp. MB14-C6: RBG61_06035
Help
Entry
RBG61_06035 CDS
T09321
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
palm
Paludihabitans sp. MB14-C6
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
palm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
palm02000
]
RBG61_06035
Transporters [BR:
palm02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
RBG61_06035
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMJ24223
LinkDB
All DBs
Position
1255278..1256687
Genome browser
AA seq
469 aa
AA seq
DB search
MKPFTKFKSQNEETRLSHFLTNQLGSKHFTYKQILSMLVPLILDQFFIFFIGTLTTFMIS
ASGEDSVAAVTLVGPITFLIVALFSSVSAGGTVIVAQYKGKGDEKQMRRAAGQVVLTTFL
VATIGSLILILFAEPIINTLFHSADPTVKLKAKNYMIGICLSNPAFSIFNGIFNVLRGVG
DTKTCLRLTIVINVIHLFASYLFINICKLDILGTAISLNLARFIGCAIALYLILRPNDIL
TLKLKDMFQFRWSIQKAIIKIGIPFSLEQVFFNLGRMLTQVYMIQLGQSAIAADAIASSG
SNLFYSAGFAVATLAITVVGQCIGAGDIKQAKKYGKKLIGLGTVCMLISVAVLYPFMPLI
IKLSNPSATIIPMIHQAMLIGVIAIPFFWSSSYVMPSVLRAGGDAGFTSIVSLVIMWIAR
VALGYILAITLGLGLNGMWISMGVEWAARAIIFQIRFKGDKWHKKNLIA
NT seq
1410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaccttttacgaaatttaaaagtcaaaatgaagaaacacgtctttctcattttcta
accaatcaattagggagcaagcattttacatataaacaaatactttcaatgcttgtccct
ttaatattagatcagttttttatcttttttattggtacccttactacgtttatgattagt
gcttccggcgaagactctgtagctgcggtaacacttgtaggtccaattacttttttaatt
gtggcgttgttttcttctgttagtgcaggaggcacagttatagttgcccaatataaagga
aaaggcgacgaaaagcaaatgcgcagagccgcaggtcaagttgtattaaccacttttctt
gttgcaaccattggaagcttgattttaattttgtttgctgaaccaatcatcaataccctg
tttcatagtgccgaccccactgttaaattaaaagcaaaaaactatatgataggaatttgc
ttatccaatcctgcattttctattttcaatggtatatttaacgttttacgtggtgtgggt
gacacaaaaacctgcttacgtttaacaatcgtcataaacgtcatccacttatttgcaagc
tatttgtttatcaacatttgcaaactcgatattcttggaacggcaatctctttgaatctt
gctcgctttattggatgtgctattgctttatatttgatattacgacctaacgacatctta
actttaaaattaaaagatatgtttcagttccgttggtcaatacaaaaagcaattattaaa
attggtattccgttttcgttggaacaagttttctttaacttaggaagaatgttaacccaa
gtttatatgattcaattaggtcaatctgcaattgctgctgatgcaattgcttcatctggt
tctaacttattttatagtgcaggatttgctgttgcaacattagcaatcactgttgtcggc
caatgtattggtgcgggagatatcaagcaagccaaaaaatacggcaaaaagctaattgga
cttggaacagtttgtatgctaatcagcgtagcagttttatatccgtttatgccgttgatt
ataaagctatccaacccatctgctaccatcatcccaatgattcaccaagctatgttaatc
ggtgtcattgcaattccatttttctggtcatcatcttatgttatgccaagcgttctacgt
gcaggcggtgacgcaggatttacttctatcgtttcattggttattatgtggattgctcgt
gttgctttaggttatattcttgctattacattaggcttaggtttaaatggaatgtggatt
agcatgggtgttgaatgggcagctcgtgcaattatattccaaattcgatttaaaggcgat
aaatggcataagaagaatttaatcgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
