Paludihabitans sp. MB14-C6: RBG61_09040
Help
Entry
RBG61_09040 CDS
T09321
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
palm
Paludihabitans sp. MB14-C6
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
palm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
palm02000
]
RBG61_09040
Transporters [BR:
palm02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
RBG61_09040
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
DUF3278
CSN7_HB_subdom
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMJ22145
LinkDB
All DBs
Position
1882374..1883786
Genome browser
AA seq
470 aa
AA seq
DB search
MKKITNDLGNDSIGKLLLRLAIPAIAAQLINALYNIVDRIYIGNIDEVGKVALTGVGVTF
PIIMIISAFSALIGMGGAPKVAIKLGEGNKEEAEHILGNCFITLMGVSIILTAVFLIWGR
DMLMLFGASENTIEYALSYLNIYVLGTIFVQLSMGLNSFISTQGFAKTAMLTVLIGAILN
IVLDPIFIFAFNMGVKGAAIATVISQAVSAIWVVKFLLSSESEIRIRKKYFRLNKAVMLP
VLALGLSPFIMQSTESLVNIALNSSLQRFGGDDAVGAMTIIGSVIQFCIMPLAGLASSAQ
PIIGFNFGARKVDRVKKTFRYLLISAIVFSILMWGCVMVVPQMFVRLFASDAALMDITVW
AMRIFMSGVFMLGIQFACQQTFVALGQAKVSLLLALLRKIILLIPLIYILPFFFTDKVLA
VLLSEPIADVIAATVTGLVFIIKFKKILKARELEDIDKERIEVEVIETNV
NT seq
1413 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaataacgaacgatttgggaaatgattcaattggtaaattgcttcttcgcctt
gcaatcccggcaattgcggcacaactaataaatgcattatacaatattgtagaccgcatt
tacattggaaatattgatgaagttggaaaagtagctttaactggtgtaggagtaacgttt
ccgataatcatgattatttcggcttttagcgcattaattggaatgggtggtgcaccaaag
gttgcaattaagcttggcgaaggaaacaaagaggaagcagaacatattttaggtaattgt
tttattactttaatgggagtttccattatattaactgcggtattcttaatttggggccga
gatatgctgatgctatttggagctagtgaaaacacaatagaatatgcattaagctatttg
aatatttacgttttgggtacaatttttgttcaattatcaatgggattaaacagttttatt
tccactcaaggatttgctaaaacagctatgctgactgttttgattggtgcaattttaaat
attgtattagacccaatttttatttttgcatttaatatgggtgtaaagggtgctgcaatt
gcaaccgttatttctcaagcagtttctgctatatgggtggttaaattcttattatctagt
gaatcagaaattcgcatacgtaaaaaatatttccgccttaataaagctgttatgttacct
gtgctagcacttggcttatcaccgtttattatgcaaagcacagaaagtttagtaaatatt
gcattaaactcttctttgcaacgatttggtggagatgatgcagtaggtgctatgacgatt
atcggtagtgtcattcaattttgtattatgcctttagctggattagcttcaagtgcacaa
ccgattattggatttaactttggcgctagaaaagttgatcgtgttaagaaaacatttaga
tatttgttaatttcagcaatcgtattttcaatattaatgtggggctgtgtaatggtggtt
cctcaaatgtttgttcgtttgtttgctagtgatgctgcactaatggatataacagtttgg
gcaatgcgaatttttatgagtggtgttttcatgcttggtattcaatttgcatgtcaacaa
acttttgttgcattaggtcaagcaaaggtatcacttttattagcactattacgaaaaata
attttgctaataccacttatttatattttaccattcttctttactgataaagtgcttgcg
gtattattatcagagccaattgcagatgttatagcagcaacagtaacgggattagtgttt
atcattaaatttaaaaagatactaaaagcaagagaattggaagacatagataaagaaaga
atagaagtagaagtaatagaaacaaatgtataa
DBGET
integrated database retrieval system
