Pseudoalteromonas aliena: B0W48_09595
Help
Entry
B0W48_09595 CDS
T04815
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
paln
Pseudoalteromonas aliena
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
HTH_18
HTH_AraC
Y_Y_Y
HisKA
Beta-prop_LRRK2
HATPase_c_5
HATPase_c_2
K319L-like_PKD
HATPase_c_3
PSII_BNR
P3A
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQQ00019
UniProt:
A0A1Q2GY16
LinkDB
All DBs
Position
complement(2149015..2153013)
Genome browser
AA seq
1332 aa
AA seq
DB search
MKAIKTIIKYKVISFLLLFHISSLALPLYLDTYTNEQGLSQNSITCSTTDEKGFHWFSTQ
GGLNRFDGYEFKHYKFNPSQSSISGNWITDCLNLGNGQLWFATTSNGLNLLNTETGNFSV
FNQYSTPSITNERISAIISNSPETIWIGHDKGQLTRLNTNTNTTELFTYQDIDQLNVVFK
DMLFDDKKNLWLASNIGLIKFDSITNRFTHIPNSPKQLWQLKKASNGQLILGGKTGLSVF
DLNTLAFYNFEQLKNVWITDILFDDEKKLWVSTYGHGLYYQATDNLLSSEFHQLTHSPDL
KHGLANDHLLSLYQDPQGIIWIGTDGYGLHRYDKKQAQLGHQKHQSNNPASISNDFVRAI
LKDSNNLLWIGTRDGLNKQTNNGFKRYKVNENPTTGLTNNNIFSLYEDANKRIWVGTYGG
GLLLYDPVNDTFSAFTVQSHQLSSNRIYAIEGDENGNLWLGSNEGLTRFNPDTLQVTNFK
YSTDKNSISNNTVFSITYDSYNNIIWAGTRAGLNKLSLNDGIFTHYQSDLKKPNSLTHDM
VTSLHLQDKNTLWVGTFGGLNKLNIPTNNVIKITEFDGLLNDNIFAIKQDSNSYLWLSSN
QGLTRYAPQTQQMQHFLPANGAQHNSFILGAAFQADDGELFFGGINGFNQFDPLKLTLAT
QPPEPVITDLLIYNQSVATQQYIKAKTQAAKLISYTDRLFFKEEDGVIGFKFSALNSAEP
PSQYQYAYKLAGLDKQFLYANKNQRQVSYSQLPAGSYHFIVKVKDQYGQWSDDKTMVALT
VTPPWWKNNVAYVTYIIIVLFIIWLIITARYRAKIAEQENLKERELSNLKTQLLDNVSHE
LKTPLSLILAPLESLQKSHKDSDTQQKLAMIHRNSHKLLDQINQLLQLSQRPSSVIKYVT
PYAIKPLIIQLIEDFTPLFEQKDITFEFKDLTQQSIYLELEHEHITSIISNLLSNAQKYT
TNTGKVLLQLSAQNKTFVISVSDTGVGIDKEHLEAIFQRFTRINTNNQSGSGIGLALVKQ
LTEQYAGTINVTSKINKGSCFTVSLPTAQSQEASNLTVLTTSKNDNERSAKSNKILIIED
NDEMRDLLTSLFINSYECISALNGKQGLALCTNEMPDLVISDVMMPVMDGYQFIKALRSD
TAISHIPVLLLSAKADTNSKLKGLDLLADDYLSKPFEPQLLLSRVQGLLTIREVLNQHLK
QQLPALSQTIQLDPQMVQSKDYIFTQRVKAIVKEHYQDEAFSVEEFAAALYLSPRALQLK
MKALYNLTPSDYIRNIRLEFAEELLKNSNLAIGLVAQQVGFNSQSYFARCFKAKYAVSPK
QFREKRLKTSPV
NT seq
3999 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaagcaattaaaacaatcataaaatataaagtcatcagctttttattattatttcat
attagctcgcttgccctaccactgtacttagatacatatacaaatgagcaaggtttatcg
caaaattcaattacctgcagtaccactgatgaaaagggatttcattggttttcgacccaa
ggcggcttaaaccgattcgatggatatgaatttaaacactataaattcaacccttcacaa
tcgagtatttcggggaattggattacagactgcctgaatttaggaaacggccaactttgg
tttgcgacaacaagcaacggcctcaacttattaaatactgaaacaggaaattttagtgtt
tttaaccagtattcaaccccctctattacaaacgaacgcatttcagcaattatctctaat
tcccccgaaacaatttggattggtcacgataaggggcaacttactcggttaaatacaaac
acaaatactaccgaattatttacttatcaagacatcgaccaattaaatgttgtttttaaa
gatatgctttttgatgacaaaaaaaacctttggttagcaagtaatattgggcttattaaa
ttcgattcaataacaaatcggttcacacacatacctaatagcccaaaacaactctggcaa
ttaaaaaaagcatcaaacggccagttaattctaggaggcaaaactggtctaagtgttttt
gacttaaacacactcgcattttataactttgagcaactcaaaaatgtttggatcacagat
atactttttgatgatgaaaaaaaattatgggtaagcacttatggtcatggtctttattac
caagctactgataatttattaagtagcgagtttcatcaacttactcactctccagattta
aaacatggcttagctaacgaccacctattgtcactttaccaagaccctcaaggcattatt
tggattggtacagatggttatggattacaccgctatgataaaaagcaggctcaattaggc
catcaaaaacatcaaagcaataacccggcttcaatttcgaatgactttgtaagagcaata
ctcaaagacagcaacaacttactttggattggcacacgcgatggccttaacaagcaaact
aacaatggctttaaacgttataaagtgaatgaaaaccctacaacgggcttaactaacaac
aatatatttagtctttatgaagatgcaaataagcgtatatgggtaggcacgtacggcggt
ggtttactgctttatgaccctgtaaatgatactttttcggcttttacagtgcaaagccat
caactcagtagtaaccgtatttatgcaatcgagggcgatgaaaatggtaatttgtggctg
ggcagtaatgaaggattaacgcgttttaaccccgatacattgcaagttacaaactttaaa
tacagcacagataaaaatagtatctcaaataatactgtttttagtattacatatgacagc
tacaataatattatatgggctggaacccgtgcaggactcaataaactttctttaaatgat
ggaatatttactcattaccaaagcgatcttaaaaagcctaatagtttaacgcacgacatg
gttacatccttgcatttacaagataaaaacactttatgggtaggtacttttggcgggctc
aataaattaaatatcccaacaaacaacgttataaaaattacagagttcgatggcttactt
aatgataatatttttgcaattaaacaagatagcaacagttacttgtggctcagtagtaat
caagggttaacccgttacgctcctcaaacccaacaaatgcagcattttttacccgcaaat
ggagcgcagcataattcatttattttaggtgccgcttttcaagccgatgatggcgaatta
ttttttggtggtattaatggctttaatcaatttgatccgttaaaactaactctagcaacc
caacctccagaacccgttattacagacttacttatttataaccagtcagtcgcgacgcag
caatatataaaagccaagactcaagcggctaagcttataagctatacagacagactcttt
tttaaagaagaagatggtgttatcggttttaagttttctgctttaaacagtgcagagccc
ccttctcaataccaatatgcttacaagttagctggattagataagcagtttttatacgca
aacaaaaatcagaggcaagttagctattctcaacttcccgctggaagctatcactttatt
gtaaaagttaaagaccaatacggccaatggagtgatgataaaacgatggttgcgcttacg
gttactccaccttggtggaagaacaatgtcgcttatgtcacttacatcattatcgtatta
tttataatctggttaattataaccgcaaggtatagagctaaaatagcagaacaagaaaac
ttaaaagagagagagcttagtaacttaaaaactcaactattagataacgttagccatgag
cttaaaacaccattgagcttaatattagcgccacttgagagtttacaaaaaagccataaa
gattcagacactcaacaaaaactagcgatgattcatcgcaacagtcataaattattagat
caaataaatcaacttttgcaattaagccaacgccctagttcagtgataaaatacgtaacg
ccctatgctataaagccattgataatacagctaattgaagactttactcccttatttgaa
caaaaagatattacattcgaatttaaagatttaacgcagcaaagtatttaccttgagtta
gagcatgaacatataacttcaattattagtaacttattgagtaacgctcaaaagtacaca
acaaacacaggaaaagtgctacttcaattatcagctcaaaataaaacttttgtaatatct
gtatcagacacgggtgtcggtatagataaagaacaccttgaagcaatttttcaacgtttt
actcgtataaataccaacaatcaaagtggcagcggtattggcttagcgctagtaaaacag
ctcaccgagcaatacgcaggcaccataaatgtaacaagtaaaataaacaaaggaagttgc
ttcacggtttcattgcccacagctcaaagccaagaagcctctaacctcacagtgcttact
acatctaaaaacgacaatgaacgtagcgcaaaaagtaataaaattcttattattgaagat
aacgacgaaatgcgtgacttactgacttctctctttattaacagctatgaatgcataagt
gcactcaatggcaaacaaggcttagcattatgtacaaatgaaatgccagatttagtgata
agtgatgtaatgatgcccgttatggatggttatcagttcattaaagcactgcgcagcgac
acggctattagccacattccagttctattgctttcagcaaaggctgatactaacagtaaa
ctaaaaggcctggacttacttgcagatgattatttaagtaaacccttcgaaccacagctg
ttactaagccgcgttcaagggttattaacgattagagaagtgcttaatcaacatttaaaa
cagcagttaccggctttatcacaaacaattcaactcgacccacaaatggtacaaagtaaa
gactacatatttacccagcgtgtaaaagcaatagtaaaagagcattatcaagacgaggcg
tttagcgtagaagaatttgcagcagcgctttacctgagccctcgcgctttgcaattaaaa
atgaaagccttgtataacttaacacctagcgactacattcgaaacattcgtttagaattc
gcagaagaacttttgaaaaacagtaatcttgcaataggattagttgcgcaacaagtcggc
tttaattcacaaagttattttgctcgctgctttaaagcaaaatatgcagtgtcgcctaag
caatttcgtgaaaaaagattaaaaacttcgcctgtgtga
DBGET
integrated database retrieval system
