Candidatus Portiera aleyrodidarum MED (Bemisia tabaci): O3E_01115
Help
Entry
O3E_01115 CDS
T03834
Name
(GenBank) antitermination protein NusA
KO
K02600
transcription termination/antitermination protein NusA
Organism
paly
Candidatus Portiera aleyrodidarum MED (Bemisia tabaci)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
paly00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
paly03021
]
O3E_01115
03009 Ribosome biogenesis [BR:
paly03009
]
O3E_01115
Transcription machinery [BR:
paly03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
Other transcription-related factors
RNA polymerase-associated proteins
O3E_01115
Ribosome biogenesis [BR:
paly03009
]
Prokaryotic type
rRNA transcription factors
O3E_01115
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NusA_N
KH_5
S1
KH_2
KH_NusA_C
RNA_pol_Rbc25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJF24124
UniProt:
A0AAU8RPG9
LinkDB
All DBs
Position
228691..229821
Genome browser
AA seq
376 aa
AA seq
DB search
MSKDILFVIDSILNEKGVARQLVFKTVEEALSSATIQRFEEKKVNIIVKMNRINGKYDTF
RRWKVVKDEKYTKSSIEIPYAAAKKINTKFEINKHIEYKIENIKFGRLAIKFAKHIIVQK
VRDSEQTEIIRIYSKKLGEIICGNIKKIIKEGIIIEFDDKNEGFLPRKQMIHGERFNINE
RIRALLLNIKPYSRKLKLILSRCCSKFIIELLKRESPEIIDELIEIKSVARDPGYKSKVA
VKTKDYNIDTVGSCVGIRGSRTKFIYNELRNEHIDIILWDKNATKFVINALYPLDVISLI
VDVNNHNMEIVVKDQSYYKAIGKGGQNIKLTSEITGWMLNVVTKNEVKKKNKKKVKNLSF
KLEIDEKIAALLVDFG
NT seq
1131 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaagatattttatttgttattgattctattttaaatgaaaaaggtgtagcacgg
caattagtttttaaaacagtcgaagaagctttatctagtgcaactattcaaagatttgaa
gaaaaaaaagtcaatatcatagtaaagatgaatcgcataaatggtaaatatgatactttt
cgtagatggaaagttgttaaagatgaaaaatatactaaatcatcaattgaaattccttat
gctgctgctaaaaaaataaatacaaagtttgaaattaataaacatattgaatataaaatt
gagaatattaaatttggtagattagctattaaatttgcgaaacatattattgttcaaaaa
gttcgtgattctgaacagactgagataatacgtatttatagtaaaaaattaggtgaaata
atatgtggtaatataaaaaaaattataaaagaaggtataataattgagtttgatgacaaa
aatgaagggtttttaccacgtaagcaaatgattcatggtgaacggtttaatattaatgag
cgtatacgtgctttattattaaatataaagccttatagtcgtaaattaaaattaatactt
tcaagatgttgttcaaaatttataattgaattattaaaacgagaaagtccagagataata
gatgaattaatagaaattaaaagtgttgcaagagatccaggttataaatctaaagttgca
gttaaaactaaagattataatattgacacagtaggttcttgtgtaggtattcgtggttca
agaacaaaatttatttataatgaattacgtaatgaacacatagatataatactttgggac
aaaaatgccacaaaatttgttattaatgctttgtatcctttagatgttatttctttaatt
gttgatgtaaataatcacaacatggaaattgttgttaaggatcaaagttattataaagct
atagggaaaggtggacaaaatattaaattaacttctgaaataacggggtggatgttgaat
gttgttactaaaaatgaagtaaagaaaaaaaataaaaagaaagtgaaaaatttaagtttt
aaacttgaaatagatgaaaaaatagcagctttattagtggattttggttaa
DBGET
integrated database retrieval system