Populus alba (white poplar): 118027549
Help
Entry
118027549 CDS
T07314
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
palz
Populus alba (white poplar)
Pathway
palz03015
mRNA surveillance pathway
palz03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
palz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
118027549
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
118027549
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
palz03041
]
118027549
Spliceosome [BR:
palz03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
118027549
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118027549
NCBI-ProteinID:
XP_034886815
LinkDB
All DBs
Position
9:7269510..7274749
Genome browser
AA seq
447 aa
AA seq
DB search
MSGMYGQEGDSGPPSYGGGGGYGGGGPGAGAGGYGGYGGGSRGGYGARGGGGSVGGRGGG
YGGNSQSRGDGYQGGDRGGRGGGGGRGGGRGGSGRDGDWPCPDPSCGNLNFARRSECNKC
GTPSPSAGQNDRGGGGNRGGSGGGYGGSRGGRGGGSYDGNRSSNYNDGSRGGGNRGGSYG
ANQGRGDSGYNQAPPPSLPSYGGGGGGNYPPAPNSYSANANYGMEAVPPPTSYTGGPTSY
PPSYGGPASGYGGDATGEARSGGRGGQPGGRGGGSRYPGGSGYGAAPDDAPAKIKQCDDN
CDDTCDNSRIYISNLPPDVTIEELRELFAGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEKGN
NKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDMRGYKINVAMAEKSAPRQPAHDHGGGRGGYGGGD
RRRDNYRDGGNSGPDRHQHGGNRSRPY
NT seq
1344 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtatggtcaagaaggcgattctggtcctccatcttacggcggtggtggt
ggatacggtggaggcggccccggagctggcgcaggtggatatggaggctatggcggaggt
agccgcggtggatatggtgctagaggtggcggtgggagcgttggcggcagaggtggggga
tatggtggtaattcgcaaagtcgaggagatggataccaaggaggagatcgtggaggcaga
ggaggcggcggcggaagaggtggtggccgaggtggaagcggcagggacggtgactggcct
tgccctgatccaagctgtgggaatttgaactttgcaagaagatccgagtgtaataaatgc
ggtactccttctccttctgctggccaaaatgatcgtggtggtggtggtaatagaggagga
agtggtggaggatatggtggtagtcgaggggggagaggtggtggtagttatgacggtaat
agaagtagcaattataatgatggaagcagaggaggtggcaatagaggtggatcttatggt
gctaatcaaggaagaggtgatagtggatataatcaggcgccaccaccatctcttccttct
tatggtggtggtggtggaggtaattatccacctgctcctaactcgtacagtgcaaatgct
aattatggaatggaagcagttcctccaccaacaagctatactggtggacccacatcgtac
cctccgtcttatggtggccctgctagtggttatggtggtgatgctacaggtgaggcgagg
agtggcggacgaggtggtcaacctggtggtcgtggtggtggttcacgatatcctggaggt
agtggttatggggctgctcctgatgatgccccggctaaaattaagcagtgtgatgataat
tgtgatgatacttgcgacaactcaagaatatacatatctaatttgccacctgatgtgacc
attgaagaactgagagagctttttgctggaattggacaagttggaaggattaagcagaag
cggggttataaagatcaatggccctggaatataaagatatacacagatgagaagggaaac
aacaaaggcgatgcatgtttggcttatgaagacccatctgctgctcactctgctggcggt
ttttacaacaattatgacatgaggggctataaaatcaatgttgcaatggcagagaagtca
gccccgaggcagcctgcacatgaccacggcggtggtagaggtggctatggcggtggagat
cgacgtagggataactaccgagatggtggaaattctggcccagacaggcatcaacatggt
ggaaaccgatcacgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
