Populus alba (white poplar): 118048156
Help
Entry
118048156 CDS
T07314
Name
(RefSeq) F-box/LRR-repeat protein 3 isoform X1
KO
K10268
F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
Organism
palz
Populus alba (white poplar)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
palz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
palz04121
]
118048156
Ubiquitin system [BR:
palz04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Multi subunit type E3
SCF complex
Target recognizing subunit (F-box)
118048156
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7885
LRR_6
LRR_4
F-box_5
LRR_8
LRR_NXF1-5
F-box
DUF3284
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118048156
NCBI-ProteinID:
XP_034913625
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(8754624..8758500)
Genome browser
AA seq
665 aa
AA seq
DB search
MKIQKTSQTNANNFFDLLSEEIIFTILDFTNTNPFDRKSFSLVCKSFYIAESKHRKNLKP
LRQEHLPRILNRYPNVSHLDLSLCLRLNNSSLTVISNICKDSLNSIDLSRSRSFSYNGLM
SLALNCKNLVSIDLSNATELRDAAAAAVAEAKNLERLWLVRCKLITDTGIGCIAVGCKKL
RLISLKWCIGVSDLGVGLIAVKCKEIRSLDLSYLQITNKCLPAILKLQYLESIALEGCFG
IDDDSLAALKHGCKSLKALNMSSCQNISHVGLSSLTGGAGGLRQAFAYGSPVTLALANSL
RSLAILQSVKLDGCPVTSAGLKAIGNWCISLGELSLSKCLGVTDEGLSSLVTKHKDLKKL
DITCCRKITDVSIAYITSSCTNLTSLRMESCTLVPSEAFVFIGQQCQFLEELDLTDNEID
DKGLKSISKCSKLSSLKIGICLNISDKGLSHIGMKCSKLAELDLYRSAGITDLGTLAICQ
GCSGLEMINMSYCIDVTDSSLLALSKCSRLNTFESRGCPLITSLGLAAIAAGCKQLNKLD
IKKCHNIGDAAMLQLAHFSQNLRQITLSYSSVTDVGLLALASISCLQSMTVLHLKGLTPS
GLSAALLACGGLTKVKLHVSFKSLLPQPLFEHLEARCCVFEWRDKEFQAELDPKCYKLQW
EDMAQ
NT seq
1998 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagatacaaaaaacctcacaaaccaacgccaacaacttcttcgatctcttgtctgaa
gagattatttttaccatcttagacttcactaacacaaacccttttgacagaaagtctttt
tctttagtttgcaagtcattttacattgcagaatcaaaacaccggaaaaatcttaaacct
ttacgacaagaacaccttccaagaattcttaacagatacccaaatgttagccatcttgat
ctttctttgtgtctacgactaaataacagttctttgacagttatatcaaatatttgcaaa
gattcattgaattctattgatctttctaggtcaaggtccttttcttataatgggttgatg
agtttggctttgaattgtaagaatttggtgagtattgacttgtctaatgcgactgagttg
agagatgcggcggcggctgcggtggcggaggctaagaatttggagaggttgtggttggtg
aggtgcaagttgattactgataccggaattggatgtattgctgttggttgcaagaagttg
aggttgattagcttgaaatggtgcataggtgttagtgatttaggggttggtttaattgct
gttaagtgtaaagagattagaagtttggatctctcttacttgcagattacaaataaatgt
ttaccagccattttgaaactacaatatcttgaatctatagctctagaaggatgctttggt
attgatgacgatagccttgctgccctcaaacacggctgcaagtcgctgaaggcactcaac
atgtcaagttgccagaacatcagtcatgttggcttatcatccttaacaggtggtgctgga
ggcctacggcaagccttcgcatatggctctcctgtcactctagctctggctaatagtttg
agaagtcttgccatattgcaatctgtcaagctagatggttgtcctgttacctctgctgga
ttaaaagctattggaaattggtgcatatcactaggcgagctgagcttgagtaaatgttta
ggagtgacagatgaaggtctctcttctcttgtaacaaagcacaaagacttgaagaagcta
gatataacatgctgtaggaagataactgatgtttctattgcctacatcacaagttcatgc
acgaatctcacttccctcagaatggagtcatgtaccttagttcctagtgaagcatttgtc
tttattggacagcaatgtcagtttcttgaagagcttgacttaacagataatgagattgat
gacaaaggtctgaagtccatttccaaatgttctaaactctcgagcttaaagataggaatt
tgcctaaacataagtgacaagggactttcacacataggcatgaagtgctcaaaacttgcc
gagcttgatttgtacaggtctgctggaataacagatttgggcactctcgcaatctgtcaa
ggttgctccggtcttgagatgataaatatgtcatattgtatcgacgttactgatagttcc
ttattagcactatcaaaatgctcaaggttaaacacatttgaaagtcgagggtgccctctt
atcacttctttaggtcttgcagccattgctgcggggtgtaagcagctcaataagctagac
ataaagaagtgtcacaacattggtgatgctgcaatgcttcagcttgctcacttttctcag
aacctcagacagattactttatcgtatagctcagttacagatgtggggctattggctctt
gccagcatcagctgtctgcaaagcatgacagtcctgcacttgaagggcttgactccaagt
ggattgtcagctgccttgttggcatgcggaggattaacaaaagtgaagctccacgtatct
tttaaatcgttgcttccacagcctctttttgaacatttggaagcacgttgttgtgtgttt
gagtggagagataaagagtttcaggctgaattagatccaaagtgctacaagttacagtgg
gaagacatggctcagtag
DBGET
integrated database retrieval system
