| Entry |
|
|---|
| Name |
(RefSeq) ABC transporter C family member 13 isoform X1
|
|---|
| KO |
| K05674 | ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 10 |
|
|---|
| Organism |
palz Populus alba (white poplar)
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:palz00001]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
118054662
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:palz02000]
118054662
Transporters [BR:palz02000]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCC (CFTR/MRP) subfamily
ABCC1, 2, 3, 4, 5, 6, 10, 11, 12, 13 subgroups
118054662
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
Unknown
|
|---|
| AA seq |
1449 aa
MEFKKSLFCPNSPFVWEGNTFSECFDNLVPGFSANVVTIVIILVLAITRSNASRVPRISC
TEKAVFRFLPFLGALVSFMDLILLVNKELHGNFIAYHEWLFRSSQLIVWTVIIMSSMCTC
LHDVFCNRFLCFWWIMKSLLGILHLQRTFGSMEVMKCLKDSCVVLLDVMFGISINIIRIK
RASHKSSSMEDPLLSVYTDIEEGFHGDSGNAKSFWDHMTFRTITSVMNHGVIKQLGFDDL
LSLPNDMEPSTCHDKLSSCWRVQLSSPNPFFFKAIFCAYGWPYLCLGLLKVFNDFIGFAG
PLLLNKLIRFLQQDSMRWDGYLLALSLGLTSILKSFFDTQYSFLLGKLKLKLRSSIMTVI
YQKVLCVTQSERSKFSEGEIQTFMSVDADRTVNLCNSFHDMWSLPLQIGVALYLLYTQVK
FAFLSGLAITILLIPVNKWISELIASATEKMMKQKDERIRRTGEILTHIRTLKMYGWEHL
FSSWLMETRSSEVKHLATRKYLDAWCVFFWATTPTLFSLFTFGLFTLMGHQLDAATVFTC
LALFNNLISPLNSFPWVINGLIDAFISTRRLSRFLCCSEYKHVLKQKAECEDMAVIVDDA
SCTWSSSEEKQPNLVLNHVNLCLSKGSLVAIIGEVGSGKSSLLSAILGEMTLIHGSVHSS
GSVAYVPQVPWIMSGTIRDNILFGKNYDSRRYSDTIRACALDVDISLMAGGDMAHIGSKG
INLSGGQRARLALARAIYQGLDTFMLDDVLSAVDAQVARWILHNAILGPFMDQKTRILCT
HNVQAISSADMVVVMDKGQVTWAGSSADLAVSSYTAFSPQNEFDALSDVQGKELSMADSI
QVSHSHLPERDSNHVSEEVQEIVEAESRKEGRVELAVYKNYAAFSGWFITVVIFLSAILM
QASRNGNDLWLSFWVDTAGSSQIEYSISFYLVVLCIFCIINSALTLVRAFSFAFGGLRAA
VQVHNTLLNKLIDAPVQFFDQTPGGRILNRFSSDLYTIDDSLPFILNILLANFVGLLGIA
VILSYVQVFFLLLLLPFWFIYSKLQFFYRSTSRELRRLDSVSRSPIYATFTETLDGASTI
RAFKSEDFFMEKFIEHVTLYQRTSYSEIIASLWLSLRLQLLAAVIISFVALMAVIGSHDY
LPISFGTPGLVGLALSYAAPIVSLLGSFLTSFTETEKEMVSVERALQYMDIPQEELRGSQ
SLNLDWPFQGTIEFQNVMMRYMPSLPPALHGISFKVPGGMKVGVVGRTGAGKSSILNALF
RLTSIYSGCIVVDGLDITDVPVRDLRRRFAVVPQSPFLFEGSLRDNLDPFQMNNDLKIWD
ILEKCHVKEEVEAAGGLDIHVKESGSSFSVGQRQLLCLARALLKLSKVLCLDECTANVDT
KTASVLQSTIFSECRAMTVITIAHRISTVLNMDNILVLDRGNLVEQGNPQALLQDESSIF
SSFAKASTM |
|---|
| NT seq |
4350 nt +upstreamnt +downstreamnt
atggagttcaagaagtccctcttttgtcctaattctccctttgtatgggagggaaacaca
ttctcggagtgttttgataatttagttccaggattcagtgcgaacgttgtgaccattgtt
ataattttggtgcttgcaattactcgaagcaatgccagtcgagttcccaggataagttgt
acagagaaggctgtttttcgttttcttcctttcctgggagcacttgtctcatttatggac
ttgattttgcttgtgaataaagaacttcatggaaactttattgcatatcatgagtggctt
ttcagaagttctcaattgatagtctggacagttatcataatgtcatctatgtgtacctgc
ttacatgatgttttttgcaaccggttcctatgtttctggtggatcatgaaatcactatta
ggaatccttcatctgcaaagaacatttggttcaatggaggtcatgaaatgccttaaagac
agttgtgttgttttgttagatgtcatgtttggcatatcgatcaacattatcaggataaaa
cgggcatctcacaagagcagttcaatggaagatccacttctttctgtgtacacagacatc
gaggagggttttcatggagactctggaaatgctaagagcttttgggatcacatgacattc
agaactatcacttctgtgatgaatcatggagtcataaagcagcttggatttgacgattta
ctttcgctacctaatgacatggagccttctacctgtcatgataaattgtcaagctgctgg
agagttcagctgagcagtcctaaccctttcttctttaaagcaatcttttgtgcatacgga
tggccgtatctttgtcttggtctgcttaaggtgttcaatgactttattggttttgctgga
ccactgcttcttaataagctcattcggtttcttcagcaagattctatgcgatgggacggc
tatcttcttgcattatctttgggcctcacctctatcttaaaatccttttttgatacacaa
tactcgtttcttcttggaaaattgaagctaaagctacgatctagtatcatgacagtaatt
tatcagaaggtcctatgtgttacccaatcagagcgatcgaaattttctgagggggaaata
cagacatttatgtcagtagatgctgatcgaactgtcaacttgtgtaacagtttccatgat
atgtggagcttgcctttgcaaattggagtggcactgtatcttttgtatacacaagtcaag
tttgcctttctttctggactggccataaccatccttttgataccagtgaataaatggatt
tctgaattgattgcaagtgctactgagaaaatgatgaagcaaaaagatgagaggattaga
aggacaggagaaatcttgactcatattcgaactttaaagatgtatggctgggagcatctt
ttctctagctggctgatggagactagatcctcagaagtcaagcacttagctacacgaaaa
tatttggatgcctggtgtgtattcttctgggccacaacaccaactcttttctctttattc
acttttggactttttactttgatgggacatcaacttgatgctgcaacggtcttcacttgt
ctggctctgtttaataatttgatctctcctcttaattcattcccatgggtcattaatgga
ttaattgatgcctttatatcaactagacggttgagcaggttcctctgctgttcagaatac
aaacatgtactcaaacaaaaagctgaatgtgaagatatggctgtcatagtggatgatgct
tcttgtacttggtcaagcagtgaagaaaagcaaccaaatctggtgttgaatcatgtgaat
ctgtgcctttcaaagggttcattggttgcgataattggagaggttggttcaggtaaatca
tccttgttaagtgcaatactaggagaaatgacgctcatccatggatcagttcattcaagt
ggatctgtagcatatgtaccacaggttccgtggattatgtctggaacaatacgtgacaat
attttgtttgggaaaaattatgattcaagaagatattcagatacaatccgggcctgtgca
ttagatgttgatatttcactaatggctggaggtgacatggctcatattggatctaaggga
attaacttatctggtggacagagagctcgtcttgctttagcaagggccatttatcaaggg
ttggacacttttatgcttgatgatgtgctcagtgcagtcgatgcacaagttgctaggtgg
atcttacacaatgctattcttggtccttttatggaccaaaagactcgtattctttgcacc
cacaatgtacaggcaatttcttctgctgatatggtagttgtaatggataaaggacaagtg
acatgggctggaagttcagctgacttggcagtttcatcatatacagcattttctccccaa
aacgaatttgatgcactctctgatgttcaagggaaagaactgagcatggctgattctatt
caagtcagtcatagtcaccttcctgagagggattctaatcatgtttcagaggaagtacaa
gagatcgttgaggctgagtcacggaaagagggcagagttgaacttgctgtatacaagaat
tatgcagcattttctggttggttcatcacagttgtaatatttctctcagctattctaatg
caagcttctcgtaatggaaatgatctgtggctgtcattttgggttgacacggcagggagc
agtcagatagagtactcaatttccttttacctggttgtactctgtatattttgcattata
aattccgctctaacattggtaagagcattctcctttgcgtttggtgggttacgtgctgca
gttcaggtgcataatacattgcttaataagcttattgatgcacccgtacaattctttgat
caaacaccaggtggaagaatacttaacaggttttcttcagatctctacacaatagatgat
tctcttcccttcatcctcaacattctccttgccaattttgttggcctgttgggaatagca
gtaattttgtcatatgtgcaggtcttcttcttgcttctgctattgccattttggtttatc
tacagcaagctacagttcttttacagatcaacatcaagggaactgcgaaggctggacagt
gtttcacgttctccaatatatgcaaccttcacagagacactcgatggagcatccaccatt
agggcattcaagtctgaggactttttcatggagaaatttattgagcatgtgactttgtat
cagcgaacatcttactcagagataattgcaagtttgtggctttccctgcgtctccagttg
ttagcagcagttatcatctcatttgttgccctgatggctgttattggatctcatgactat
ttaccaatcagctttggcacccccgggctggtaggtttggctctctcatatgcagctcca
atcgtgtctctattaggaagtttcttaacaagtttcactgaaactgagaaggaaatggta
tctgttgagagagctcttcagtatatggacattccccaagaagaactcaggggatctcag
tctctgaatctagactggccatttcaaggaacgattgagtttcagaatgttatgatgaga
tatatgccgtctttgccacctgcactacatggaattagttttaaagttcctggagggatg
aaggttggagttgttgggagaacaggtgctggcaaatctagtattttgaatgcccttttt
cgcctaacttcaatatacagtggttgtattgtcgtggatggccttgacataactgatgtt
cctgttagagatctccgtcgacgctttgctgttgttcctcagagtccattcctatttgaa
gggtcattaagggataacctagatccattccagatgaataacgacttgaaaatctgggat
attctggagaaatgccatgtcaaagaggaagtagaagcagcaggcggactggatatccac
gtaaaggaatctggatcatccttttctgttgggcaaagacagctcctttgccttgcacgc
gctcttcttaaattgtccaaggtactgtgtttggatgagtgcacagccaatgttgacact
aaaacagcttcagtactacaaagtacaatattcagtgaatgcagggccatgacggtgatc
acgattgctcatcgcatttccacagttttgaacatggacaacatccttgttcttgaccgt
ggaaacctggttgagcaaggtaacccacaagctcttctacaagacgaatcctccatattt
tcaagttttgctaaagcttcaacaatgtag |
|---|
