Populus alba (white poplar): 118055575
Help
Entry
118055575 CDS
T07314
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
palz
Populus alba (white poplar)
Pathway
palz03015
mRNA surveillance pathway
palz03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
palz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
118055575
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
118055575
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
palz03041
]
118055575
Spliceosome [BR:
palz03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
118055575
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118055575
NCBI-ProteinID:
XP_034923430
LinkDB
All DBs
Position
1:32657454..32662530
Genome browser
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MSGMYGQDGDSGPPSYGGGGGYGGYGGDGGGRGGYGGRGGGGGGGRGGGGGGYGGHSQSR
GGGYQGGDRGGRGGGGRGGGRGGSGREGDWPCPKPGCGNLNFARRVACNKCGTPAPAAGQ
NDRSDGDGGYRGGSGGGYGGNRGGRGGDSYDGNRSSNYNDGSRGGGYDNRSGNRGGSYSG
NQGRDDSGYNQAPPPSLPSYGGGGGNYPPAPNSYGGNANYGMEAVPPPTSYTGGPTSYPP
SYGGPASGYGGDATGEVRSGGRGGQPGGYEGGRGGGGSRNQGGSGYGAAPADAPAKIKQC
DDNCDDTCDNARIYISNLPPDVTIEELRELFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDE
NGNNKGDACLAYEDPSAAHSAGGFYNNYDFRGYKINVAMAEKSAPRQPAHDHGGGRGGYG
GGGRRRDNFRDGGNSGPDRHQHGGNRSRPY
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctggtatgtatggtcaagacggtgattctggtcctccgtcttacggcggcggaggt
ggatacggaggttacggaggcgatggtggcggacgtggtggatatggtggtcgaggtggt
ggtggaggcgggggaagaggcggaggaggaggagggtatggtggtcattcgcaaagtcga
ggaggtggataccaaggaggagatcggggaggcagaggaggcggcggaagaggtggtggc
cgaggtggaagcggcagggaaggtgattggccttgccctaaaccaggttgtgggaatttg
aactttgcaagaagagttgcttgtaataaatgcggtactcctgctcctgctgctggccaa
aatgatcgcagtgatggtgatggtggttatagaggaggaagtggtggaggatatggtggt
aacagaggaggaaggggtggtgatagttatgatggtaatagaagtagtaattataacgac
ggaagcagaggaggtggttatgataatagaagtgggaatagaggtgggtcttacagtggt
aatcaaggaagagatgatagtggatacaatcaagctccaccaccatctctcccttcatat
ggtggtggtggaggtaattatccaccggctccgaactcgtatggtgggaatgctaattac
ggaatggaagcagttcctccacctacaagctatactggtggacccacatcataccctcca
tcttatggtggtcctgctagtggttatgggggtgatgctacaggtgaggtgaggagtggt
ggacgaggtggtcaacctggtgggtatgaaggtggacgtggtggtggtggttctcgaaat
cagggaggtagtggttatggggctgctcctgctgatgcccctgctaaaattaagcagtgc
gatgataattgtgatgatacttgtgacaatgcaagaatatatatatctaatttgccacct
gatgtgaccattgaagaactgagggaactttttggcggcattggacaagttggaaggatt
aagcagaagcggggctataaagatcaatggccctggaatataaagatatacactgatgag
aatggaaacaacaaaggtgatgcctgtttggcatatgaagacccatctgctgctcactct
gctggcggtttttacaacaattatgatttcaggggctataaaatcaatgttgcaatggca
gaaaagtcagctccgaggcaacctgcacatgaccatggtggtggtagaggtggctatggt
ggtggaggtcgacgcagggataatttccgagatggtgggaattctggtcctgacaggcat
caacatggtggaaatcgatcacgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
