Populus alba (white poplar): 118056188
Help
Entry
118056188 CDS
T07314
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
palz
Populus alba (white poplar)
Pathway
palz03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
palz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
118056188
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
palz03019
]
118056188
Messenger RNA biogenesis [BR:
palz03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
118056188
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118056188
NCBI-ProteinID:
XP_034924225
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(13925677..13928059)
Genome browser
AA seq
417 aa
AA seq
DB search
MDSDEGKLFVGGIAWDTTEDTLRDHFNQYGEVSQVVIMRDKTTGRPRGFGFVVFSDPSVL
DPVLHDKHTIDGRTVEAKRALSREEQHTSSRTGSFNGGRGSGGAGDFRTKKIFVGGLPST
VTEDVFRQYFQSYGHVNDVVVMYDQQTQRPRGFGFITFDSEDAVDNVLQKTFHELNGKLV
EVKRALPKDANPGSEGRGSGYRSYGSAGANVNAADGRIDGNRYMQPQTSVGGYPPYSGYA
AHGYGYGAANSGVGYYGSYGVSGYGGGNAGYGTGVYGMSAAVKNSWSSQAPSSYGASGYG
ANAGYGAAFPWSASGSGGSASAPMGQYPAGASGYGNQGYGYGNYGGSDGPYSGGYGATGG
RAGNAPNGSASNGAGGGEQQGSGSYYGDSNGNSGYANEAWRSDPSQASGGYGGAHSR
NT seq
1254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggacgaaggaaagctgttcgtaggaggaatagcatgggacacaaccgaagac
acgctaagagaccacttcaaccagtacggtgaggtctctcaggttgtcataatgcgtgac
aaaaccactggtcgtcctcgtggctttggttttgtcgttttctccgatccctccgttcta
gatcctgttcttcacgataaacacaccatcgatggccgtactgtggaggcgaaaagggct
ttatcgagagaagaacagcatacatcatctagaaccgggagttttaatggtggtagaggc
tctggtggtgcaggagattttaggacgaaaaagatttttgttggtggcttgccttccacc
gtgacagaagatgtattccgtcaatattttcaaagttatggtcatgtaaatgatgttgta
gtaatgtatgaccagcagactcaaaggcctcgtggatttggatttatcaccttcgattct
gaagatgcagttgataatgtactccagaagacctttcatgagttgaatggtaaacttgta
gaggtaaaacgagcactcccgaaagatgcaaatccaggtagtgaggggcgtggtagtggc
tatcgtagttatggctccgcaggagccaatgtaaatgcagctgatggtcgaatcgatgga
aaccggtatatgcagccccaaacttctgtaggtggttacccaccttattctggatatgct
gctcatggttatggttatggagcagcaaacagtggagttggttattatggcagttatggt
gttagtggttatggtggtggaaatgctggttatggtacgggagtgtatggcatgtctgct
gctgtaaaaaatagttggagcagccaagctccttcgagttatggtgcttctggctatggt
gcaaatgcaggctatggggctgcattcccctggagtgcttctggtagcggcggttctgct
tctgctcctatgggtcaatatccagctggagcgtctgggtatggaaatcaaggctatggt
tatggtaattatggtggaagtgatggtccttattctggtggctatggagctactggaggg
cgtgctgggaatgctccaaatggcagtgccagcaatggagctggtgggggagagcaacag
gggagtgggagctactatggtgacagtaatgggaattcaggatatgcaaatgaagcctgg
aggtctgatccttcacaagcctctggtggttacggtggtgctcattcaagatag
DBGET
integrated database retrieval system
