Populus alba (white poplar): 118057588
Help
Entry
118057588 CDS
T07314
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
palz
Populus alba (white poplar)
Pathway
palz03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
palz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
118057588
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
palz03019
]
118057588
Messenger RNA biogenesis [BR:
palz03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
118057588
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118057588
NCBI-ProteinID:
XP_034926110
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(12042156..12046128)
Genome browser
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEEKLGEYFTQYGDVLQTVVMKDKTTGRPRGFGFVVFADPSVL
DRVLQDTHTIDGRTVEAKRALSREEQQTNARAGNLNPGRNTSSGGNIRTKKIFVGGLPPT
LNDDGFRQYFEAFGLVTDVVIMYDQSTQRPRGFGFISFDSEDAVDRVLQTTFHDLNGKQV
EVKRALPKEANPGGGGRSMGGSYQSYGASGGNTNSYDGRMDSNRYMQPQGTGGGFPPYGS
SGYNAAGYGYGPASNGVGYGGYSSYTGAGAGYGGPAGAVYGNPNVPNPGYASGPPGAPRS
SWNSQGSSGYGAMGYGSAASWGASNAGAGSGPGSASAGQSPGGATGYGNQGYGYGSYGGN
DGSYVNPVGYGAVGGRSGGTSNSNAGGPGGAELQGSGGSYMGSGYGDANGNSGYGNASWR
SEQPQTSGNYGGPQANGPGGYGGGYGGSQARQAQQQ
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagctatttattggagggatttcatgggagacgtcagaggag
aagctcggagaatattttacgcaatacggcgacgttttgcagactgtcgttatgaaagat
aagaccactggtaggcctagaggctttggctttgtcgtttttgcagacccttccgttctc
gatagggttcttcaagatacgcacactattgatggtagaacggttgaggcaaagagggcg
ttatcaagagaggagcagcaaacgaatgccagggctggaaacttgaatcctggtagaaac
accagcagtggtggaaatattcggaccaaaaagatatttgttggaggattgcctcctact
ctaaatgatgatgggtttcgccagtattttgaagcctttggccttgtaactgatgtagta
ataatgtacgaccagagcacccagcgacctcgtggatttggttttatttcctttgattct
gaagatgcagttgaccgggtgttacagacaacattccacgatttgaatggtaagcaagtt
gaagtaaaacgagctcttcctaaagaggccaatcctggcgggggtggccgctctatgggt
ggcagttaccagagctacggtgcatctggtggcaacacaaactcatatgatggtcgaatg
gattcaaataggtatatgcagcctcaaggcactggaggtggttttcctccttatgggtca
tctggctataacgcagctggatatggatatggtcctgccagtaatggtgttggttatggt
ggctatagcagctacactggagctggtgctggttatgggggacctgcaggcgcggtctat
gggaatcctaatgttccaaatcctggctatgcaagcggtcctcctggggcacctagaagt
tcatggaacagtcaaggttcatctggctatggtgctatgggttatgggagtgctgcttct
tggggtgcttcaaatgctggtgctggcagtggtcctggttcagcgtctgctggtcaatct
cctggtggagccactggttatgggaatcaaggttatgggtatggtagttatggtggaaat
gatggatcttatgtgaatccagttgggtatggtgctgttggaggacgttctgggggcact
tcaaacagtaatgctggtggtcctggcggggcagaactacagggtagcggcggcagctac
atggggagtggatatggtgatgcaaatggaaattctgggtatggaaatgcatcatggaga
tcagagcaaccacaaacttctggaaattatgggggtcctcaagcaaatggtcctggtggt
tatggtggtggttatggtggttctcaggcccgacaagcccaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
