Psychrobacter arcticus: Psyc_1194
Help
Entry
Psyc_1194 CDS
T00256
Name
(GenBank) putative secreted protein, autotransporter domain protein
Organism
par
Psychrobacter arcticus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
ESPR
PATR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAZ19045
UniProt:
Q4FSG3
LinkDB
All DBs
Position
complement(1430942..1434148)
Genome browser
AA seq
1068 aa
AA seq
DB search
MNHVYRVVFNRSLGVYQCVSELAKTCGKSSGKSSKTAAKNGFTLRALSTALFSVLGLSIA
SVTHATTYDNGAVNIVDNGYTIVDDIVKNDGTILKNNDVNTYNYMQMNGDQELPSRLLIT
DKGAVQTNQFIIYNNALVDIEAGGRLEANSIYTSNYYGPNNQQIASDTKINVNGSGSLLK
AQDWLSIRSQNSETTLTVENGGTVEANYLNIYSYSYFDENNQLTPADTSVNVDGSGSLLK
AQGWLSIGSRNSETTLTVENGGTVEANYLDIYSYNYYNQDNQPITTSKTNVNIDGSGSSL
KVQEDVRISSENSGTSTLTVKNGGTAEANSLGIYSYGYYYQDNQPITTGETSVNVDGLSS
SLKIQEDVRISSRNSGTSTLTIENGGTAEANNLYIGSDDYNNSTSTASKSVVNVSGNGSS
LTVNNLYAGIGGKGQVDVTDQGTLEVTRQLQLGGSDTEGANAVGELTVDNATLIAPATVV
GAFGSGTLNIVNNGVIKTQSIERFENSAKSEVNFDNGTLKLTGSQPELFRNFTGDNLINL
GAGGGTIDTAGFSAGLFEDTTLAGNGAVITGTGDFTKTGTGSLTMATTAKQWTGATNVKQ
GTLRLDGDYTMRDGEILGIGLNSLDDYGQLVVNGSADITEGQLNVNASEAVQRLNGATVW
NDIVRTSNLIGNFESVTDNSQLVGFVADYSTPNAVNLIMVRQDKFVDTIQNQANRTGLSL
AGVLDRSIDIRLANNTNELADALISSTIGFNQSQIAAAVNELQPLLMGASNRIITDANIV
ISNAITEHSLSSSKRGLWAQALGSNINHEEENGTTGYDADSYGGIVGIDTPINSNLNLGM
AVSYNDSDVDSDSQNLNHKMSAKSWQVLGYGNYAVSDATQVNFHAGAGRSNIEGERYLSI
LTDAVAQSDYDVDTLQAGFGIGHRIGTENRNITPFAQVNYAQAKSDSYRETGAGVYNFEV
DENTYESMRWTAGIKMSQALTPKIALTGQLAAAIENGDQRSDITASFISMPEDKFTTVGQ
EVGQEIGIAGIGIRYMPTANTTLSAGYRGEWRDNYDDQGANVALQITF
NT seq
3207 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccatgtttatcgtgttgtttttaaccgttctctaggtgtctatcaatgtgtatct
gaacttgccaaaacttgtggcaaatcttctgggaaatcatcaaaaaccgccgcaaaaaat
ggctttactttacgtgcgttatcaactgctctatttagcgtactcggactgagtatagcc
agtgtgactcatgccactacctatgacaatggcgcagtaaacattgtggataatgggtat
actatcgttgacgatatcgtaaaaaatgatggcaccattctgaagaataatgatgtgaat
acctataattatatgcagatgaatggtgatcaagagttaccttcacgtcttcttattaca
gacaaaggagcagtgcagactaaccagttcattatctataacaatgcattagtagatatt
gaagctggaggacgtttagaagctaactctatatatacgagtaactactacggcccaaat
aatcaacaaatagctagtgatactaaaattaatgtcaatggttcaggttcattactgaag
gcacaagattggctctcgattcgttctcaaaattcagaaaccacgcttactgtagaaaat
ggtggcacagtcgaagccaactatctaaatatatattcatatagctattttgatgaaaac
aatcaattaacacctgctgataccagtgtcaacgttgatggttcaggttcattactgaag
gcacaaggttggctctcgattggttctcgaaattcagaaaccacgcttactgtagaaaat
ggtggcacagtcgaagccaactatctagatatatattcatataattattacaatcaagat
aatcaaccaataacaactagcaagactaatgtcaacattgatggttcaggctcatccctg
aaggttcaagaagatgtgcgtatttcctctgaaaattcaggaacaagtacactgaccgta
aaaaatggtggcacagccgaagcaaactctctaggtatatactcatatggttattattat
caagataatcagccaataacaactggcgagactagtgtcaacgttgatggtttaagttca
tccctaaaaattcaagaagatgtgcgtattagctctcgaaattcagggacgagtacactt
actatagaaaatggcggtacggccgaagcaaacaatctatatataggctcggatgactat
aacaactctaccagcactgctagtaagagtgtcgtgaacgtcagtggtaatggctcatca
ctaactgtaaacaatctatacgctggtataggaggtaaaggtcaagttgatgttaccgat
caaggcacactagaagtgactcgtcagttgcagctcggtggctctgatactgaaggcgca
aacgcagtaggtgaattgacagtagataatgctactttgattgcgcccgctactgtcgta
ggtgcttttggcagcggtacattaaatattgttaataatggtgtcataaagactcaaagt
atcgaaagatttgagaactctgcaaaatcggaagtcaactttgataacggtacattaaaa
ttaacaggatctcagccagaattattcagaaacttcacgggtgacaacctcattaattta
ggtgcgggcggcggtacgattgatactgctggatttagcgcgggcttatttgaagacacc
actctagcaggtaatggcgcagtcattacaggtactggagacttcaccaagacaggtact
ggctctcttactatggccactactgccaaacagtggacaggtgctactaacgttaagcaa
ggtacactgcgcctcgatggcgactacaccatgcgtgatggtgaaatactaggtattggc
ctaaatagccttgatgactatggtcagcttgtcgtgaatggtagtgctgatatcacagag
ggtcaactcaatgtcaatgcctcagaggctgtacagaggctaaatggtgcgaccgtttgg
aatgatatcgtaagaacaagcaatcttattggtaatttcgaaagcgttactgataacagt
cagttagttggttttgtagcagactatagcactcctaatgctgtcaacctaataatggtg
cgccaagacaaattcgttgacactattcagaaccaagccaatcgtacaggactcagtctt
gctggcgttctagatcggagtattgatattcgattagccaataatactaatgagcttgcc
gatgctctcattagtagtactataggtttcaatcaatctcagattgctgctgctgttaat
gagctacaacccttactcatgggtgctagcaatcgtataattactgatgccaacatcgtt
attagcaatgccattactgagcatagcttgagctcttctaagcgtggactttgggcacaa
gcgcttggtagcaacattaatcacgaagaagaaaatggtactacaggttatgatgctgat
agctatggtggcatcgttggtattgacaccccgattaacagtaatttaaatcttggtatg
gctgtctcttataacgacagtgatgttgatagtgatagtcaaaacctaaaccataaaatg
agcgcaaaaagttggcaggtacttggttatggtaactatgccgttagtgatgctactcag
gttaatttccatgctggggcaggtagaagtaatatcgaaggcgagcgttacttgagcatt
ctaacagatgctgttgctcagtctgattatgatgtagatactcttcaagcgggatttggt
attggtcatcgaattggaacagaaaatcgcaatattacaccatttgcacaagttaattat
gcccaagcaaaaagtgatagctatcgtgaaacaggtgctggggtctataacttcgaagtt
gatgaaaacacctatgaatctatgcgttggacagcaggtataaaaatgtcgcaagcatta
acaccgaaaatagcgcttactggtcagctggctgccgctattgagaatggtgatcaacgc
tccgatattacagcaagctttatcagtatgccagaagacaagtttactactgtcggacaa
gaagtaggtcaggagataggcattgctggtatcggtatacgttatatgccaacagctaat
acaaccctctcagcaggttatcgtggtgagtggcgagataactatgatgatcaaggtgca
aacgttgcattgcagataacgttttaa
DBGET
integrated database retrieval system